Биоорганическая химия
Журнал "Биоорганическая xимия" (Russian Journal of Bioorganic Chemistry) основан в 1975 году академиком Ю. А. Овчинниковым. Термином "биоорганическая химия" редколлегия журнала охватывает широкий круг научных проблем, связанных с изучением структуры и функции биомолекул.
Журнал предназначен для ученых, медицинских работников, преподавателей и студентов университетов, а также исследователей в промышленных, медицинских, сельскохозяйственных лабораториях и лабораториях экологического контроля.
В журнале публикуются статьи, посвященные исследованиям в области биоорганической химии, биохимии, молекулярной и клеточной биологии, геномики, протеомики, биоинформатики, иммунологии, молекулярной вирусологии, молекулярной эволюции и молекулярной биологии развития.
Журнал выходит 6 раз в год. Публикация статей в журнале "Биоорганическая химия" (Russian Journal of Bioorganic Chemistry) – бесплатная. Рукописи представляются в редакцию на русском языке и переводятся для английской версии группой высококвалифицированных переводчиков – специалистов в соответствующих областях биоорганической химии.
Рукописи российских и иностранных авторов или их симпозиальные доклады могут быть опубликованы на английском языке в русском издании. Журнал публикует обзоры, мини-обзоры, экспериментальные и теоретические работы, гипотезы, письма редактору (краткие сообщения).
Свидетельство о регистрации СМИ № 0110214 от 08.02.1993
Текущий выпуск
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Только для подписчиков
Том 51, № 6 (2025)
ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ
КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫЕ ПАНАЛЛЕРГЕНЫ В РАЗВИТИИ СЕНСИБИЛИЗАЦИИ И МЕТОДЫ ИХ ДИАГНОСТИКИ
Аннотация
Среди родственных белков растительного или животного происхождения, широко распространенных в природе, существуют семейства, способные вызывать в организме перекрестные IgE-опосредованные реакции. Такие семейства белков называют паналлергенами. Каждое семейство паналлергенов обладает своими физико-химическими и иммунобиологическими особенностями, что оказывает влияние на их аллергенные свойства. В настоящем обзоре описаны основные семейства паналлергенов, их структура, свойства, функции и возможные последствия сенсибилизации пациентов, а также современные методы молекулярной аллергодиагностики. В обзоре представлена сводная таблица по белковым семействам паналлергенов. Выбор способа лечения пациентов с аллергопатологией, подбор элиминационных мероприятий и аллерген-специфической иммунотерапии во многом зависят от точной и ранней диагностики аллергических заболеваний. Как и при любой патологии, при аллергических болезнях терапия эффективна только в том случае, когда она патогенетически обоснована, применяется комплексный подход и соблюдается последовательность в проведении лечебных мероприятий. Соответственно, знание семейств паналлергенов и их свойств позволяет более грамотно выявлять перекрестные реакции у пациентов с аллергопатологией и прицельно подбирать необходимое лечение.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1011-1026
1011-1026
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
ОЦЕНКА АДАПТИВНОГО ИММУННОГО ОТВЕТА ПРОТИВ ГРИППА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИНТЕТИЧЕСКИХ ПЕПТИДОВ
Аннотация
В данной работе апробирован метод оценки иммуногенности синтетических пептидов, который может лечь в основу метода клинической диагностики клеточного иммунного ответа против вируса гриппа А. Используемые пептиды идентичны по аминокислотному составу 9-мерным эпитопам поверхностных белков вирусов гриппа, актуальных для вакцинных штаммов Северного полушария сезона 2023–2024 гг., и представляют собой фрагмент (432–440 a.o.) Phe-Leu-Asp-Ile-Trp-Thr-Tyr-Asn-Ala гемагглютинина вируса гриппа А и фрагмент (454–462 a.o.) Leu-Leu-Trp-Asp-Thr-Val-Thr-Gly-Val нейраминидазы вируса гриппа В. Пептиды синтезировали классическими методами пептидной химии с использованием методов активированных эфиров и карбодиимидного метода в качестве основных способов конденсации. В клиническом исследовании участвовало 55 добровольцев в возрасте 20–26 лет. Уровень гамма-интерферона (IFN-γ) оценивали методом иммуноферментного анализа. Внутри групп добровольцев, имеющих различия в статусе вакцинации и инфекционного анамнеза, не было получено статистически значимых различий для всех парных сравнений концентраций IFN-γ в 55 случаях. Для проведения клинической диагностики иммунного ответа против вируса гриппа А необходима оптимизация данного метода.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1027-1037
1027-1037
6-МЕТИЛУРАЦИЛ В СИНТЕЗЕ МОНО- И ДИГИДРАЗОНОВ: СИНТЕЗ, ЦИТОТОКСИЧНОСТЬ И АНТИОКСИДАНТНАЯ АКТИВНОСТЬ
Аннотация
6-Метилурацил – важное соединение, активно участвующее в процессах клеточной регенерации. Его способность стимулировать рост и размножение клеток – ключевой фактор в процессе заживления тканей. Метилурацил ускоряет процесс восстановления кожи, что делает его применение незаменимым в дерматологии и хирургии для лечения ран, язв и ожогов. Гидразиды карбоновых кислот также представляют интерес благодаря уникальным координационно-химическим свойствам и находят применение в различных отраслях. В медицине гидразиды проявляют широкий спектр активности: они обладают противотуберкулезным, противовирусным и антибактериальным действием. Некоторые гетероциклические гидразоны проявили себя в качестве ингибиторов основной протеазы SARSCoV-2. Это подчеркивает важность изучения структурных и функциональных особенностей данных соединений. Синтез гидразонов с фрагментом 6-метилурацила представляет собой многообещающее направление в области фармацевтической химии и медицины, открывающее новые возможности для разработки инновационных лекарственных средств. В данной работе осуществлен синтез дигидразонов на основе дигидразидов карбоновых кислот (адипиновой, азелаиновой и себащиовой) с фрагментами 6-метилурацила. С помощью онлайн-версии экспертной системы OCHEM произведена оценка спектра биологической активности in silico, включая цитотоксичность, антиоксидантную активность, острую токсичность и гематотоксичность полученных соединений и препаратов сравнения. Исследования биологической активности показали, что полученные моно- и дигидразоны не обладают цитотоксическим действием по отношению к изученным линиям опухолевых клеток (НepG2, A549, MCF-7, HCT-116) и условно-нормальной клеточной линии HEK 293. При этом установлена умеренная избирательная цитотоксичность 6-метил-5-[(2-фенилгидразоно)метил]пиримидин-2,4(1H,3H)-диона в отношении колоректальной карциномы человека (клеточная линия HCT-116, IC50 = 71.75 ± 8.29) и условно-нормальной клеточной линии HEK 293 (IC50 = 19.35 ± 2.12). Антиоксидантную активность моно- и дигидразонов изучили с использованием методов восстановления Fe3+, катион-радикала ABTS и стабильного радикала DPPH в условиях in vitro. Выявлено соединение-лидер (3-(2-((6-метил-2,4-диоксо-1,2,3,4-тетрагидропиримидин-5-ил)метилен)гидразинил)бензойная кислота), сравнимое по антиоксидантной активности с аскорбиновой кислотой, для углубленного изучения.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1038-1050
1038-1050
ОСОБЕННОСТИ СИНТЕЗА И ИССЛЕДОВАНИЕ ТОКСИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ТРИПТОФАНСОДЕРЖАЩЕГО АНАЛОГА АРГИНИН-ВАЗОПРЕССИНА
Аннотация
Среди ранее исследованных аналогов C-концевого фрагмента аргинин-вазопрессина (АВП) большой интерес в качестве потенциальной фармацевтической субстанции представляет тетрапептид Ac-Trp-Pro-Arg-Gly-NH2, продемонстрировавший в опытах с грызунами антидепрессантоподобную и анксиолитическую (противогревожную) активность. В данной работе рассмотрены особенности синтеза триптофансодержащего аналога АВП, предложена новая "блочная" схема получения пептида, позволяющая нарабатывать его с большими выходами, чем было показано ранее. Также проведены токсикологические исследования тетрапептида Ac-Trp-Pro-Arg-Gly-NH2 in vitro и in vivo. Исследования in vitro продемонстрировали низкую цитотоксичность в отношении культуры клеток фибробластов кожи человека (IC50 > 1000 мкМ). Исследование острой токсичности в эксперименте на мышах ICR не выявило токсического действия тетрапептида Ac-Trp-Pro-Arg-Gly-NH2. Низкая токсичность тетрапептида, продемонстрированная в данном исследовании, делает перспективными дальнейшие исследования биологической активности, токсичности и механизмов действия триптофансодержащего аналога АВП с целью создания на его основе новых более безопасных и эффективных анксиолитиков и антидепрессантов.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1051-1062
1051-1062
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА С-КОНЦЕВОГО ДОМЕНА ГЕМОЛИЗИНА II Bacillus cereus СТАБИЛИЗИРУЕТСЯ В СОСТАВЕ ПОЛНОРАЗМЕРНОГО ТОКСИНА
Аннотация
Гемолизин II (HlyII) – один из ключевых патогенных факторов Bacillus cereus, породоразующий токсин с пространственной структурой типа β-баррель, обладающий C-концевым удлинением из 94 a.o., обозначаемый как C-концевой домен HlyII (HlyIICTD). В данной работе проведен сайт-направленный мутагенез аминокислотных остатков, лежащих на поверхности белковой глобулы HlyIICTD. Методом иммуноферментного анализа показано, что моноклональные антитела HlyIIC-16 и HlyIIC-23, полученные против HlyIICTD, взаимодействовали с интактным HlyIICTD гораздо эффективнее, чем с полиоразмерным токсином и химерным белком – HlyIICTD, слитым с SlyD. Антитела HlyIIC-16 и HlyIIC-23 эффективно ингибировали взаимодействие друг друга с иммобилизованным HlyIICTD в иммуноферментном анализе, что свидетельствовало о близости их эпитопов на поверхности молекулы HlyIICTD. Для определения эпитопов HlyIIC-16 и HlyIIC-23 использовали фаговый дисплей, сайт-направленный мутагенев и клонирование генов отдельных частей молекулы HlyIICTD. Пространственное моделирование HlyIICTD, слитого с SlyD, с использованием программы AlphaFold позволило предположить расположение эпитопов HlyIIC-16 и HlyIIC-23 на участке Gly341–Gly364 белка HlyII. Продемонстрировано, что C-концевой домен может одновременно находиться в нескольких структурных состояниях (изоформах). В составе водорастворимой формы мономера полиоразмерного токсина наблюдается переход пространственной структуры HlyIICTD в стабильную форму.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1063-1074
1063-1074
НОВЫЕ КОНЪЮГАТЫ 3'-АЗИДО-3' ДЕЗОКСИТИМИДИНА И 2',3'-ДИДЕЗОКСИ- 3'-ТИАЦИТИДИНА НА ОСНОВЕ 1,3-(ДИПАЛЬМИТОИЛАМИНО)ПРОПАН-2-ОЛА: СИНТЕЗ И ИССЛЕДОВАНИЕ АНТИ-ВИЧ-АКТИВНОСТИ НА МОДЕЛЬНЫХ КЛЕТОЧНЫХ СИСТЕМАХ
Аннотация
Разработка пролекарств противовирусных нуклеозидов с изостерными производными природных липидов позволяет повысить биодоступность данных препаратов, модулировать эффективность их действия. В данной работе с использованием H-фосфонатного метода осуществлен синтез новых липофильных пролекарств 3’-азидо-3’-дезокситимидина (AZT), 2’,3’-дидезокси-3’-тиацитидина (ЗТС) на основе 1,3-(дипальмитоиламино)пропан-2-ола с функциональными фосфорными связями. Проведены исследования анти-ВИЧ-активности синтезированных соединений в отношении различных штаммов ВИЧ (HIV-1 MVP-899, HIV-1 RF) и цитотоксичности в отношении клеток MT-4. H-фосфонатдиэфирные и фосфодиэфирные конъюгаты проявили более низкую анти-ВИЧактивность, чем исходные нуклеозиды (EC50 = 0.59–3.04 мкМ), их преимущества включают низкую цитотоксичность (CC50 >100 мкм). Противовирусная активность амидофосфатных производных с эфирами L-α-аланина снижалась в ряду (tBu) > Me > (iPr) > Et, значения EC50 при этом составили 0.46, 4.60, 8.97 и 12.55 мкМ соответственно, эти соединения проявляли цитотоксичность, сходную с AZT (CC50 >50 мкм). Дополнительным преимуществом таких конъюгатов может служить возможность направленного транспорта в резервуары ВИЧ за счет энтероцит-опосредованного лимфатического транспорта, а также потенциального внутриклеточного высвобождения нуклеозидмонофосфата, что позволяет обойти первичное фосфорилирование нуклеозидов при их метаболизме до активной трифосфатной формы. Следовательно, разработка таких пролекарств может послужить основой для поиска лекарств с высокой эффективностью.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1075-1087
1075-1087
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ОРАНЖЕВО-КРАСНОГО ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО БИОМАРКЕРА DiB3-F53L
Аннотация
Расчетным методом молекулярной динамики (МД) изучена пространственная организация флуоресцентного белка DiB3-F53L – оранжево-красного флуоресцентного нековалентного комплекса генно-инженерного варианта бактериального белка липокалина Blc в комплексе с синтетическим GFP-подобным хромофором M739. Показано, что хромофор сильнее взаимодействует с мутированным белком DiB3-F53L по сравнению с нативным белком DiB3. Расчеты позволили установить аминокислотные остатки из окружения хромофора в сайте связывания, вносящие наибольший вклад в энергию взаимодействия хромофор–белок. Комплекс белка DiB3-F53L с хромофором M739 обладает повышенной яркостью флуоресценции по отношению к известному родительскому биомаркеру DiB3, что выдвигает его в число перспективных маркеров для лечения биологических объектов в клеточной биологии, а также в качестве стартового объекта для последующего дизайна новых более ярких биологических маркеров.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1088-1092
1088-1092
ОПРЕДЕЛЕНИЕ КОНЦЕНТРАЦИИ АНТИТЕЛ IgG И IgA МЕТОДОМ ПОЛЯРИЗАЦИИ ФЛУОРЕСЦЕНЦИИ С ПРИМЕНЕНИЕМ ФЛУОРЕСЦЕНТНО-МЕЧЕННЫХ РЕКОМБИНАНТНЫХ НАНОТЕЛ
Аннотация
Количественный, быстрый и высокопроизводительный анализ иммуноглобулинов IgG и IgA необходим для определения содержания этих белков и ассоциированных с ними молекул в физиологических жидкостях больных. Анализ этих белков необходим при диагностике дефицита специфических антител в качестве вспомогательного теста для выявления общего вариабельного иммунодефицита, а также для оценки степени риска пациентов с низким уровнем IgA. Определение содержания IgG может помочь при назначении ревакцинации пациентам и поддержки стратегии их лечения, использоваться для мониторинга гуморальной иммунной системы пациента, а также при разработке и последующем производстве большинства терапевтических антител в биофармацевтике. Миниатюрные рекомбинантные однодоменные антитела (нанотела) обладают рядом преимуществ перед классическими антителами, таких как относительная простота их наработки, высокая стабильность в широком диапазоне значений температуры и pH, способность узнавать высокоспецифические конформационные эпитопы целевого белка, а также возможность использования их в качестве зондов для детекции более крупных целевых белков-антигенов в методе поляризации флуоресценции. Получены и охарактеризованы флуоресцентно-меченные нанотела FITC-anti-IgG и FITC-anti-IgA к IgG и IgA человека. Определены Kd комплексов FITC-anti-IgG*IgG и FITC-anti-IgA*IgA, подтверждающие высокую аффинность иммунореагентов. Показана возможность специфичного определения содержания IgG и IgA в сыворотке крови человека в диапазоне 35–120 мкг/мл (для IgA) и 75–260 мкг/мл (для IgG). Протестированы 18 сывороток человека на содержание IgG и IgA, количество антител в образцах подтверждено определением с использованием коммерческих иммуноферментных наборов. Показано, что FITC-anti-IgG и FITC-anti-IgA не взаимодействуют с другими белками человека: альбумином, плазминогеном, фибриногеном, лактоферрином и трансферрином. Тестирование сывороток человека и животных с FITC-anti-IgG и FITC-anti-IgA продемонстрировало специфичное связывание с антисыворотками человека и обезьяны, но не с сыворотками животных: быка, собаки, кошки, кролика и овцы. Таким образом, метод FPIA может быть использован для быстрого и специфичного определения IgG и IgA человека.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1093-1105
1093-1105
СИНТЕЗ И БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ПРОИЗВОДНЫХ ПИРИДОКСИНА, СОДЕРЖАЩИХ 1,3-ОКСАЗОЛИДИН-2-ОНОВЫЕ ФРАГМЕНТЫ
Аннотация
Синтезирована библиотека из 11 производных пиридоксина с 1,3-оксазолидин-2-оновыми фрагментами во втором, пятом и шестом положениях. Исследования антибактериальной активности полученных соединений на 6 эталонных и 6 клинических штаммах грамположительных бактерий и цитотоксичности в отношении условно нормальных клеток человека in vitro позволили выявить высокоактивное и малотоксичное соединение-лидер, содержащее 1,3-оксазолидин-2-оновый фрагмент в пятом положении пиридоксина. Дальнейшие углубленные исследования этого соединения в отношении бактериальных биопленок S. aureus и E. facetum продемонстрировали сопоставимую, а в ряде случаев превосходящую лекарственный препарат линезолид эффективность. При этом, в отличие от линезолида, соединение-лидер не проявляет мутагенного действия в тесте Эймса и обладает высокой безопасностью при внутрижелудочном введении мышам (ЛД50 >2000 мг/кг).
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1106-1132
1106-1132
СИНТЕЗ И АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ АКТИВНОСТЬ ЭТИНИЛЬНЫХ И АЗИДО-ПРОИЗВОДНЫХ N4-ДОДЕЦИЛАМИНО-2'-ДЕЗОКСИЦИТИДИНА
Аннотация
Разработаны методы получения новых производных N4-додециламино-2'-дезоксицитидина и цитидина. Новые производные содержат 5-этинильную, 5-(проп-2-ин-1-ил)оксиметильную или 5'-азидо-группы, необходимые для введения красителей in vitro с использованием методов клик-химии. Полученные соединения (III), (VIII), (XIII), (XVI), как и N4-додециламино-2'-дезоксицитидин, показали значительную антибактериальную активность в отношении грамположительных бактерий. Новые нуклеозиды могут быть использованы для визуализации их субклеточной локализации с целью определения возможного механизма действия антибактериальных агентов подобного рода.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1133-1141
1133-1141
N4-(ω-АМИНОАЛКИЛ)- И N4-(ω-ДАНСИЛАМИНОАЛКИЛ)5-МЕТИЛ-2'-ДЕЗОКСИЦИТИДИНЫ
Аннотация
Синтезированы новые производные N4-(додецил)-5-метил-2'-дезоксицитидина, содержащие терминальные аминогруппы в алкильном линкере. Показано, что они могут быть удобными синтонами для последующего введения дансильных флюорофорных групп. Одно из N4-ω-дансиламиноалкильных производных показало умеренную противобактериальную активность в отношении штамма Mycobacterium smegmatis и может быть использовано для изучения субклеточной локализации данного рода соединений
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1142-1147
1142-1147
КОМПОЗИЦИОННЫЕ АЭРОГЕЛЬНЫЕ МАТЕРИАЛЫ С ГЕМОСТАТИЧЕСКИМ ЭФФЕКТОМ НА ОСНОВЕ АЛЬГИНАТА И ХИТОЗАНА
Аннотация
В настоящее время во всем мире наблюдается высокий спрос на новые эффективные гемостатические материалы. Перспективны для этих целей – высокопористые органические аэрогели на основе полисахаридов морского происхождения, таких как альгинат натрия и хитозан, которые благодаря своей развитой структуре и природному происхождению обладают такими важными свойствами, как биосовместимость, биодеградируемость, нетоксичность, химическая инертность, волокнистость, механическая прочность и нерастворимость в воде. В настоящей работе на основе комплекса альгината и хитозана с введением активных добавок (магнетит и ватерит) были получены композиционные аэрогельные материалы, и изучены их потребительские свойства с целью оценки возможности применения в качестве гемостатических материалов. Показано, что разработанные материалы характеризуются развитой микро- и мезопористой структурой, обеспечивающей высокую влагопоглощающую способность по отношению к физиологическому раствору, моделирующему pH крови теплокровных животных. Значение предельной впитывающей способности составило 67 и 43 г/г для материала, содержащего ватерит и магнетит, соответственно, что связано с различными в пористой структуре образцов. Результаты тестирования антимикробной активности материалов подтвердили возможность их использования для биомедицинских целей. Наиболее выражена антибактериальная активность материалов по отношению к грамположительным микроорганизмам Staphylococcus aureus и Bacillus subtilis, диаметры зон подавления роста которых достигали 24 ± 0.2 и 20 ± 0.2 мм. Проведенный сравнительный анализ гемостатической активности разработанных материалов в эксперименте in vivo показал, что материалы характеризуются высокой скоростью остановки кровотечений по сравнению с ватным тампоном: время свертывания крови в экспериментальной группе для материала, содержащего ватерит и магнетит, составило 32.6 и 49.6 с соответственно, что в 1.3–2 раза меньше, чем в контрольной группе. Выполненные исследования показали, что композиционные аэрогельные материалы на основе комплекса альгината натрия и хитозана с введением активных добавок (магнетит и ватерит) могут составить серьезную конкуренцию как на международном, так и на российском рынке гемостатических препаратов и медицинских изделий.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1148-1158
1148-1158
ОЦЕНКА ТОКСИЧНОСТИ, ГЕНОТОКСИЧНОСТИ И ЦИТОТОКСИЧНОСТИ ФЕНИЛЦИКЛОАЛКАНПОЛИКАРБОНОВЫХ КИСЛОТ: ИССЛЕДОВАНИЕ С Allium cepa И Chlorella vulgaris
Аннотация
Для оценки токсичности, цитотоксичности и генотоксичности поликарбоновых кислот, содержащих циклоалифатические фрагменты, был применен комплексный подход, основанный на использовании тестовых организмов (одноклеточная зеленая водоросль Chlorella vulgaris и лук Allium cepa). Соединения поликарбоновых кислот оценивались в концентрациях 1.0, 0.1, 0.001 и 0.001%. Показано, что поликислоты не были мутагенными для биопроб на основе лука Allium cepa, а высокие концентрации препаратов могут взывать увеличение частоты мутаций Chlorella vulgaris. Полученные результаты обосновывают необходимость дальнейших исследований для всесторонней оценки безопасности и потенциальной применимости данных соединений. Описанный подход может быть применен для получения быстрых, экономически эффективных и полезных дополнительных данных о различных типах токсичности in vitro для веществ с потенциальной биологической активностью.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1159-1166
1159-1166
АНАЛИЗ БЕЛОК-БЕЛКОВОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ CREBBP, НТТ и КМТ2D МЕТОДОМ ГЛАВНЫХ КОМПОНЕНТ
Аннотация
Транскрипционный коактиватор CREBBP (cyclic AMP response element binding protein-binding protein), нейроспецифический регулятор транскрипции НТТ (huntingtin) и гистон-лизиновая метилтрансфераза КМТ2D (lysine methyltransferase 2D) кооперативно участвуют в посттрансляционной модификации гистонов и регуляции дифференциальной экспрессии генов. Механизм межбелкового взаимодействия исследован слабо. Компьютерный анализ первичной структуры белков методом главных компонент выявил наличие максимально высокой корреляции между главными компонентами аминокислотных последовательностей в парах CREBBP–НТТ и CREBBP–КМТ2D с глутамином. Траектория первой главной компоненты CREBBP практически совпадает с графиком позиционной частоты глутамина вдоль молекулы белка. Показано, что во вторичной структуре CREBBP существенную долю занимают элементы E-strand (extended strand) с открытой конформацией пептидной цепи. Полилутаминовые тракты, локализованные на C-конце CREBBP, N-конце НТТ, N-, C-концах и в центре КМТ2D также имеют открытую конформацию, облегчающую образование межмолекулярных водородных связей. Предполагается, что полилутаминовые тракты C-конца CREBBP и N-конца НТТ непосредственно вовлечены в белок-белковый контакт CREBBP–НТТ. Аналогичная связь между полилутаминовыми трактами C-конца CREBBP и центрального региона КМТ2D фиксирует физическое взаимодействие в данной паре белков. Выявленные особенности исследованиям белков могут быть использованы для конструирования новых фармакологических препаратов физико-химическими методами.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1167-1174
1167-1174
ПИСЬМА РЕДАКТОРУ
АНАЛОГ ХРОМОФОРА БЕЛКА КАЕВЕ КАК ИНСТРУМЕНТ ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО МЕЧЕНИЯ ЯДРА И МИТОХОНДРИЙ ЖИВЫХ КЛЕТОК
Аннотация
Синтезирована серия из трех красителей – аналогов хромофора флуоресцентного белка Kaede с различными заместителями. По результатам флуоресцентной микроскопии был выявлен перспективный флуороген – 5-((Z)-2-(дифторборанил)-4-(диметиламино)-5-гидроксибензилиден)3-метил-2-((E)-2-(пиридин-4-ил)винил)-3,5-дигидро-4H-имидазол-4-он. Продемонстрировано использование этого красителя в широкопольной флуоресцентной микроскопии для одновременного селективного окрашивания ядра и митохондрий в живых клетках на примере клеточной линии Hel.a Kyoto. Полученное соединение может найти применение в области визуализации процессов живых систем.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1175-1180
1175-1180