Population genetic structure of HLA-G gene in North-west Region of Russian Federation

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Background. HLA-G is a non-classical MHC class Ib molecule predominantly expressed in cytotrophoblasts and under pathological conditions also in chronically inflamed and in malignant tissues. Polymorphic sites present in coding and non-coding regions of the HLA-G gene may potentially affect all of these biological features. Materials and methods: Using the PCR method we have studied polymorphism of HLA G gene (alleles G*0101-G0107, -725C/G , 3741del/ins14.) in 118 people aged from 20 till 40 years of the North-West Region of Russia (St. Petersburg). Results: To determine the common alleles of the HLA-G gene the system of allele-specific PCR primers was elaborated. We have determined HLA-G allele distribution in North-west Region of Russian Federation. The minor allele frequencies varied in wide ranges - from 0 % to 39 %. The genetic distances among the Spanish, Chinese, Japanese, Danish, Indian, African Shona, Brazilian, Polish, German and North-west Region of Russian Federation were calculated. Conclusion: The evaluation of alleles rates in North-west of Russian Federation and in populations of other countries revealed the similarity in alleles G*0101-G0107 and polymorphism 3741del/ins14 distribution among the Danish, German and North-west Region populations.

About the authors

Arseniy Pavlovich Alenichev

Saint Petersburg State University

Email: senyaa@list.ru
Student, Department of genetics and biotechnology

Yuliya Almazovna Nasykhova

D. O. Ott Research Institute of Obstetrics and Gynecology, RAMS

Email: yulnasa@gmail.com
Scientist (PhD), laboratory of prenatal diagnosis of congenital and inherited diseases

Tatyana Eduardovna Ivashchenko

D. O. Ott Research Institute of Obstetrics and Gynecology, RAMS

Email: tivashchenko2011@mail.ru
leading researcher (PhD, professor), laboratory of prenatal diagnosis of congenital and inherited diseases

Vladislav Sergeyevich Baranov

D. O. Ott Research Institute of Obstetrics and Gynecology, RAMS

Email: baranov@vb2475.spb.edu
head of the laboratory (MD, professor), laboratory of prenatal diagnosis of congenital and inherited diseases

References

  1. Castro M. J., Morales P., Fernández-Soria V., et al. (1996) Allelic diversity at the primate Mhc-G locus: exon 3 bears stop codons in all Cercophitecinae sequences.Immunogenetics]. Vol. 43. P. 327.
  2. Donadi E. A., Castelli E. C., Arnaiz-Villena A. et al. (2011). Implications of the polymorphism of HLA-G on its function, regulation, evolution and disease association], Cellular and molecular life sciences: CMLS. Vol. 68 (3). P. 369-395.
  3. Glas J., Török H. P, Tonenchi L. et al. (2007). The 14-bp deletion polymorphism in the HLA-G gene displays significant differences between ulcerative colitis and Crohn’s disease and is associated with ileocecal resection in Crohn's disease], International immunology. Vol. 19 (5). P. 621-626.
  4. Hviid T. V. F., Hylenius S., Lindhard A., Christiansen O. B. (2004). Association between human leukocyte antigen-G genotype and success of in vitro fertilization and pregnancy outcome], Tissue antigens. Vol. 64 (1). P. 66-69
  5. Jiang, Yuting, Shougong Chen, Shasha Jia et al. (2011). Association of HLA-G 3’ UTR 14-bp insertion/deletion polymorphism with hepatocellular carcinoma susceptibility in a Chinese population], DNA and cell biology. Vol. 30 (12). P. 1027-1032.
  6. Killeen, Peter R. (2005). An alternative to null-hypothesis significance tests], Psychological science. Vol. 16 (5). P. 345-353.
  7. Loustau M., Wiendl H., Ferrone S., Carosella E. D. (2013). HLA-G 2012 conference: the 15-year milestone update], Tissue antigens. Vol. 81 (3). P. 127-136.
  8. Moreau P., Contu L., Alba F. et al. (2008). HLA-G gene polymorphism in human placentas: possible association of G*0106 allele with preeclampsia and miscarriage], Biology of reproduction. Vol. 79 (3). P. 459-467.
  9. Ober C., Billstrand C., Kuldanek S., Tan Z. (2006). The miscarriage-associated HLA-G -725G allele influences transcription rates in JEG-3 cells], Human reproduction (Oxford, England). Vol. 21 (7). P. 1743-178.
  10. Ober C., Aldrich C. L., Chervoneva I. et al. (2003). Variation in the HLA-G promoter region influences miscarriage rates], American journal of human genetics. Vol. 72 (6). P. 1425-1435.
  11. Rousseau P., Le Discorde M., Mouillot G. et al. (2003). The 14 bp deletion-insertion polymorphism in the 3’ UT region of the HLA-G gene influences HLA-G mRNA stability], Human immunology. Vol. 64 (11): 1005-1010
  12. Sipak-Szmigiel, Cybulski O. C., Wokołorczyk D. et al. (2009). HLA-G polymorphism and in vitro fertilization failure in a Polish population], Tissue antigens. Vol. 73 (4). P. 348-352.
  13. Tripathi P., Abbas A., Naik S., Agrawal S. (2004). Role of 14-bp deletion in the HLA-G gene in the maintenance of pregnancy], Tissue antigens. Vol. 64 (6). P. 706-710.
  14. Veit, Degani T., Vianna P. et al. (2008). Association of the HLA-G 14-bp insertion/deletion polymorphism with juvenile idiopathic arthritis and rheumatoid arthritis], Tissue antigens. Vol. 71 (5). P. 440-446.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2014 Alenichev A.P., Nasykhova Y.A., Ivashchenko T.E., Baranov V.S.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».