Характеристика генетической структуры популяции Северо-западного региона РФ по гену HLA-G

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение: Ген HLA-G относится к неклассическим генам системы HLA и экспрессируется тканеспецифично клетками трофобласта, клетками тимуса и стволовыми клетками. Полиморфные изменения гена HLA-G, часть из которых является функционально значимыми, затрагивают как кодирующие, так и некодирующие области гена. Материалы и методы: Используя метод полимеразной цепной реакции мы изучили полиморфизм гена HLA-G (аллели G*0101-G0107, -725C/G, 3741del/ins14.) у 118 человек в возрасте от 20 до 40 лет в Северо-Западном регионе РФ (Санкт-Петербург). Результаты: Разработана система праймеров для мультиплексной аллельспецифической ПЦР, позволяющей определять основные аллели гена HLA-G. Определены особенности распределения аллелей гена HLA-G у жителей Северо-Западного региона РФ. Сравнительный анализ распределения частот аллелей между популяционной выборкой Северо-Западного региона РФ и популяциями других стран показал сходство между популяциями Дании, Германии и Северо-Запада РФ по аллелям G*0101-G0107 и полиморфизму 3741del14/ins14. Проведен кластерный анализ и рассчитаны генетические расстояния между популяциями Испании, Китая, Японии, Дании, Индии, Африканских Шона, Бразилии, Германии, Польши и популяцией Северо-Запада РФ. Заключение: Показано сходство распределения частот аллелей G*0101-G0107 и полиморфизма 3741del/ins14 популяции Северо-Запада РФ и популяцией Дании и Германии.

Об авторах

Арсений Павлович Аленичев

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: senyaa@list.ru
студент, кафедра генетики и биотехнологии

Юлия Алмазовна Насыхова

ФГБУ НИИ акушерства и гинекологии им. Д. О. Отта Северо-Западного отделения РАМН

Email: yulnasa@gmail.com
к. б. н., научный сотрудник, лаборатория пренатальной диагностики наследственных и врожденных заболеваний человека

Татьяна Эдуардовна Иващенко

ФГБУ НИИ акушерства и гинекологии им. Д. О. Отта Северо-Западного отделения РАМН

Email: tivashchenko2011@mail.ru
д. б. н., профессор, в. н. с., лаборатория пренатальной диагностики врожденных и наследственных заболеваний

Владислав Сергеевич Баранов

ФГБУ НИИ акушерства и гинекологии им. Д. О. Отта Северо-Западного отделения РАМН

Email: baranov@vb2475.spb.edu
д. м. н., профессор, член-корр. РАМН, лаборатория пренатальной диагностики врожденных и наследственных заболеваний

Список литературы

  1. Castro M. J., Morales P., Fernández-Soria V., et al. (1996) Allelic diversity at the primate Mhc-G locus: exon 3 bears stop codons in all Cercophitecinae sequences.Immunogenetics]. Vol. 43. P. 327.
  2. Donadi E. A., Castelli E. C., Arnaiz-Villena A. et al. (2011). Implications of the polymorphism of HLA-G on its function, regulation, evolution and disease association], Cellular and molecular life sciences: CMLS. Vol. 68 (3). P. 369-395.
  3. Glas J., Török H. P, Tonenchi L. et al. (2007). The 14-bp deletion polymorphism in the HLA-G gene displays significant differences between ulcerative colitis and Crohn’s disease and is associated with ileocecal resection in Crohn's disease], International immunology. Vol. 19 (5). P. 621-626.
  4. Hviid T. V. F., Hylenius S., Lindhard A., Christiansen O. B. (2004). Association between human leukocyte antigen-G genotype and success of in vitro fertilization and pregnancy outcome], Tissue antigens. Vol. 64 (1). P. 66-69
  5. Jiang, Yuting, Shougong Chen, Shasha Jia et al. (2011). Association of HLA-G 3’ UTR 14-bp insertion/deletion polymorphism with hepatocellular carcinoma susceptibility in a Chinese population], DNA and cell biology. Vol. 30 (12). P. 1027-1032.
  6. Killeen, Peter R. (2005). An alternative to null-hypothesis significance tests], Psychological science. Vol. 16 (5). P. 345-353.
  7. Loustau M., Wiendl H., Ferrone S., Carosella E. D. (2013). HLA-G 2012 conference: the 15-year milestone update], Tissue antigens. Vol. 81 (3). P. 127-136.
  8. Moreau P., Contu L., Alba F. et al. (2008). HLA-G gene polymorphism in human placentas: possible association of G*0106 allele with preeclampsia and miscarriage], Biology of reproduction. Vol. 79 (3). P. 459-467.
  9. Ober C., Billstrand C., Kuldanek S., Tan Z. (2006). The miscarriage-associated HLA-G -725G allele influences transcription rates in JEG-3 cells], Human reproduction (Oxford, England). Vol. 21 (7). P. 1743-178.
  10. Ober C., Aldrich C. L., Chervoneva I. et al. (2003). Variation in the HLA-G promoter region influences miscarriage rates], American journal of human genetics. Vol. 72 (6). P. 1425-1435.
  11. Rousseau P., Le Discorde M., Mouillot G. et al. (2003). The 14 bp deletion-insertion polymorphism in the 3’ UT region of the HLA-G gene influences HLA-G mRNA stability], Human immunology. Vol. 64 (11): 1005-1010
  12. Sipak-Szmigiel, Cybulski O. C., Wokołorczyk D. et al. (2009). HLA-G polymorphism and in vitro fertilization failure in a Polish population], Tissue antigens. Vol. 73 (4). P. 348-352.
  13. Tripathi P., Abbas A., Naik S., Agrawal S. (2004). Role of 14-bp deletion in the HLA-G gene in the maintenance of pregnancy], Tissue antigens. Vol. 64 (6). P. 706-710.
  14. Veit, Degani T., Vianna P. et al. (2008). Association of the HLA-G 14-bp insertion/deletion polymorphism with juvenile idiopathic arthritis and rheumatoid arthritis], Tissue antigens. Vol. 71 (5). P. 440-446.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Аленичев А.П., Насыхова Ю.А., Иващенко Т.Э., Баранов В.С., 2014

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).