ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДОВ МУЗЕОГЕНОМИКИ ДЛЯ ОБСЛЕДОВАНИЯ ИСТОРИЧЕСКОЙ КОЛЛЕКЦИИ АРГАСОВЫХ КЛЕЩЕЙ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Проведена оценка состояния и пробное обследование образцов из исторической коллекции Аргасовых клещей академика Е.Н. Павловского, собранной во время экспедиций Среднюю и Центральную Азию с 1934 по 1955 гг., с целью определения возможности выявления в них полинуклеотидных последовательностей, специфичных для клещей Argasidae и возбудителей наиболее распространенных клещевых инфекций. В работе использована технология выделения ДНК и полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ) коммерческими наборами компании «Вектор-Бест», Россия. Рост кривой накопления (Ct) происходил на 30-40 цикле амплификации консервативного участка митохондриальной ДНК, что свидетельствуют о том, что музейные образцы пригодны для дальнейших исследований и изучения генома клещей. При обследовании материала от 48 экземпляров клещей (имаго O. papillipes), собранных с 1936 по 1948 гг, генетические маркеры клещевых инфекций были выявлены в 10 образцах. Из них 8 проб дали положительные результаты на наличие фрагментов нуклеиновых кислот возбудителей клещевых риккетсиозов (Rickettsia species). В одной из проб обнаружены генетические маркеры возбудителей болезни Лайма (Borrelia burgdorferi s.l.). В одном случае выявлены фрагменты ДНК, специфичные для возбудителей Ку-лихорадки (Coxiella burnetii). Полученные данные свидетельствуют о высокой научной значимости коллекции академика Е.Н.Павловского в современных условиях. Уникальный биологический материал может быть использован для изучения структуры и эволюции генома клещей сем. Argasidae, а также этиологии и распространения передаваемых ими инфекций.

Об авторах

Д. Д Глушенко

ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» МО РФ

Санкт-Петербург, Россия

П. А Соловьева

ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» МО РФ

Санкт-Петербург, Россия

А. И Ракин

ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» МО РФ

Санкт-Петербург, Россия

Список литературы

  1. Балашов, Ю.С. Экспериментальная межвидовая гибридизация Аргасовых клещей Ornithodoros papillipes, O. tartakovskyi, O. verrucosus (Argasidae, Ixodoidea) / Ю.С. Балашов // Паразитология. - 1970. - Т.6, №3. - С.274-282.
  2. Бондаренко, Е.И. Выявление генетических маркеров возбудителей клещевых риккетсиозов в ПЦР с помощью наборов реагентов «РеалБест ДНК Rickettsia species» и «РеалБест ДНК Rickettsia sibirica / Rickettsia heilongjiangensis» / Е.И. Бондаренко, Л.Д. Щучинова, Д.И. Тимофеев [и др.] // Новости «Вектор-Бест». - 2018. - №1(87). - С.2-10.
  3. Кербабаев, Э.Б. Кровососущие клещи семейства Argasidae Canestrini 1890 на территории бывшего СССР / Э.Б. Кербабаев // Российский паразитологический журнал. - 2012. - №2. - С.16-29.
  4. Мокроусов, В.Н. Советские эпидемиолого-паразитологические экспедиции в Иран в 1941-1943 гг. / В.Н. Мокроусов, В.Ю. Кравцов, Л.Л. Кравцова // Военно-медицинский журнал. - 2018. - Т.339, №9. - С.82-87.
  5. Никитин, А.Ф. К истории кафедры биологии и паразитологии (малоизвестные страницы) / А.Ф. Никитин. - СПб.: ВМедА, 1998. - 50 с.
  6. Павловский, Е.Н. Распространение Ornithodoros papillipes в связи с эпидемиологией клещевого рекурренса в юго-восточном Таджикистане / Е.Н. Павловский, Г.Я. Змеев // Труды Таджикской базы АН СССР. - 1939. - С.11.
  7. Петрищева, П.А. Клещевой возвратный тиф / П.А. Петрищева, А.Н. Скрынник / География природноочаговых болезней человека в связи с задачами их профилактики. - М.: Медицина, 1968. - С.95-119.
  8. Тимофеев, Д.И. Экстракция нуклеиновых кислот из клещей: проблемы и возможности стандартизации / Д.И. Тимофеев, Н.В. Фоменко, М.К. Иванов // Сибирский медицинский журнал. - 2012. - №4. - С.45-48.
  9. Тимофеев, Д.И. Новые наборы реагентов для выявления нуклеиновых кислот вируса клещевого энцефалита и боррелий комплекса Borrelia burgdorferi s.l. методом ПЦР с детекцией в режиме реального времени / Д.И. Тимофеев, Е.И. Бондаренко, Н.Г. Топычканова [и др.] // Новости «Вектор-Бест». - 2014. - №1(71). - С.2-11.
  10. Durden, L.A. The U.S. National Tick Collection: A Vital Resource for Systematics and Human and Animal Welfare / L.A. Durden, J.E. Keirans, J.H. Oliver // American entomologist. - 1996. - Vol.42, №4. - P.239-249.
  11. Hoogstraal, H. Argasid and Nuttalliellid ticks as parasites and vectors / H. Hoogstraal // Adv. Parasitol. - 1985. - Vol.24. - P.135-238.
  12. Kuo, C. Tick-borne pathogens in ticks collected from birds in Taiwan / C. Kuo, Y. Lin, C. Yao [et al.] // Parasites & Vectors. - 2017. - №10. - P.1-13.
  13. Laaksonen, M. Crowdsourcing-based nationwide tick collection reveals the distribution of Ixodes ricinus and I. persulcatus and associated pathogens in Finland / M. Laaksonen, E. Sajanti, J.J. Sormunen // Emerging Microbes & Infections. - 2017. - №6. - P.1-7.
  14. Persing, D.H. Detection of Borrelia burgdorferi DNA in museum specimens of Ixodes dammini ticks / D.H. Persing, S.R. Telford III, P.N. Rys [et al.] // Science (New York, N.Y.). - 1990. - Vol.249. - P.1420-1423.
  15. Tobolewski, J.I. Detection and identification of mammalian DNA from the gut of museum specimens of ticks / J.I. Tobolewski, MJ. Kaliszewski, R.K. Colwell [et al.] // J. Med. Entomol. - 1992. - №6. - P.1049-1051.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Глушенко Д.Д., Соловьева П.А., Ракин А.И., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».