Технологии машинного обучения и искусственной нейронной сети в классификации посткератотомической деформации роговицы

Обложка

Цитировать

Аннотация

Обоснование. Тщательный анализ как оптических, так и анатомических свойств роговицы у пациентов после перенесённой передней радиальной кератотомии приобретает особое значение в выборе оптической силы интраокулярной линзы при хирургическом лечении катаракты и других видах оптической коррекции. Вариабельность клинической картины посткератотомической деформации определяет необходимость разработки её классификации и является важной задачей современной офтальмологии.

Цель разработать автоматизированную систему классификации посткератотомической деформации роговицы с использованием машинного обучения и искусственной нейронной сети на основе анализа численных значений топографических карт роговицы.

Материалы и методы. В качестве материала использовались обезличенные результаты анализа медицинской документации 250 пациентов в возрасте от 46 до 76 лет (средний возраст — 59,63±5,95 года). Проведён анализ 500 карт рельеф-топографии передней и задней поверхностей роговицы и 3 этапа машинного обучения классификации посткератотомической деформации.

Результаты. I этап — анализ рельеф-топографии передней и задней поверхностей роговицы — позволил зафиксировать численные значения элевации передней и задней поверхности роговицы в трёх кольцевидных зонах. На II этапе в ходе глубокого машинного обучения была выбрана и создана нейросеть прямого распространения. Установлены 8 вспомогательных параметров, описывающих форму передней и задней поверхностей роговицы. III этап сопровождался получением алгоритмов классификации посткератотомической деформации роговицы в зависимости от соотношения тестовой и обучающей выборок, которое варьировало от 75 до 91%.

Заключение. Разработана искусственная нейронная сеть, успешно решающая задачу классификации типов посткератотомической деформации роговицы с точностью 91%. Установлен потенциал для дальнейшего улучшения качества обучения данной нейронной сети. Применение алгоритмов искусственной нейронной сети может стать полезным инструментом автоматической классификации посткератотомической деформации роговицы у пациентов, перенёсших ранее радиальную кератотомию.

Об авторах

Екатерина Кирилловна Цыренжапова

Национальный медицинский исследовательский центр «Межотраслевой научно-технический комплекс “Микрохирургия глаза” имени академика С.Н. Фёдорова»

Email: katyakel@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6804-8268
SPIN-код: 1158-5233

MD

Россия, Иркутск

Ольга Ивановна Розанова

Национальный медицинский исследовательский центр «Межотраслевой научно-технический комплекс “Микрохирургия глаза” имени академика С.Н. Фёдорова»

Email: olgrozanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-3139-2409
SPIN-код: 6557-9123

д-р мед. наук

Россия, Иркутск

Татьяна Николаевна Юрьева

Национальный медицинский исследовательский центр «Межотраслевой научно-технический комплекс “Микрохирургия глаза” имени академика С.Н. Фёдорова»; Иркутский государственный медицинский университет; Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования

Email: tnyurieva@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-0547-7521
SPIN-код: 8457-5851

д-р мед. наук, профессор

Россия, Иркутск; Иркутск; Иркутск

Андрей Александрович Иванов

Национальный медицинский исследовательский центр «Межотраслевой научно-технический комплекс “Микрохирургия глаза” имени академика С.Н. Фёдорова»

Email: ivanov.andrei.med@yandex.ru
ORCID iD: 0009-0001-4235-9252

MD

Россия, Иркутск

Иван Сергеевич Розанов

ООО «Транснефть-Технологии»

Автор, ответственный за переписку.
Email: nauka@mntk.irkutsk.ru
ORCID iD: 0009-0001-7202-0428
Россия, Иркутск

Список литературы

  1. Issarti I., Consejo A., Jiménez-García M., et al. Computer aided diagnosis for suspect keratoconus detection // Comput Biol Med. 2019. Vol. 109. P. 33–42. doi: 10.1016/j.compbiomed.2019.04.024
  2. Chen X., Zhao J., Iselin K.C., et al. Keratoconus detection of changes using deep learning of colour-coded maps // BMJ Open Ophthalmol. 2021. Vol. 6, N 1. P. e000824. doi: 10.1136/bmjophth-2021-000824
  3. Feng R., Xu Z., Zheng X., et al. KerNet: A novel deep learning approach for keratoconus and sub-clinical keratoconus detection based on raw data of the pentacam HR system // IEEE J Biomed Health Inform. 2021. Vol. 25, N 10. P. 3898–3910. doi: 10.1109/JBHI.2021.3079430
  4. Gatinel D. Screening for subclinical keratoconus and prevention of corneal ectasia with SCORE analyzer software. In: Febbraro J.-L., Khan H.N., Koch D.D., editors. Surgical correction of astigmatism. Cham: Springer International Publishing, 2018. doi: 10.1007/978-3-319-56565-1_9
  5. Ruiz Hidalgo I., Rozema J.J., Saad A., et al. Validation of an objective keratoconus detection system implemented in a scheimpflug tomographer and comparison with other methods // Cornea. 2017. Vol. 36, N 6. P. 689–695. doi: 10.1097/ICO.0000000000001194
  6. Малюгин Б.Э., Сахнов С.Н., Аксенова Л.Е., Мясникова В.В. Применение искусственного интеллекта в диагностике и хирургии кератоконуса: систематический обзор // Офтальмохирургия. 2022. № 1. C. 77–96. EDN: PPQRWZ doi: 10.25276/0235-4160-2022-1-77-96
  7. Abdelmotaal H., Mostafa M.M., Mostafa A.N.R., et al. Classification of Color-Coded Scheimpflug Camera Corneal Tomography Images Using Deep Learning // Transl Vis Sci Technol. 2020. Vol. 9, N 13. P. 30. doi: 10.1167/tvst.9.13.30
  8. Dos Santos V.A., Schmetterer L., Stegmann H., et al. CorneaNet: fast segmentation of cornea OCT scans of healthy and keratoconic eyes using deep learning // Biomed Opt Express. 2019. Vol. 10, N 2. P. 622–641. doi: 10.1364/BOE.10.000622
  9. Kuo B.I., Chang W.Y., Liao T.S., et al. Keratoconus Screening Based on Deep Learning Approach of Corneal Topography // Transl Vis Sci Technol. 2020. Vol. 9, N 2. P. 53. doi: 10.1167/tvst.9.2.53
  10. Shi C., Wang M., Zhu T., et al. Machine learning helps improve diagnostic ability of subclinical keratoconus using Scheimpflug and OCT imaging modalities // Eye Vis (Lond). 2020. Vol. 7. P. 48. doi: 10.1186/s40662-020-00213-3
  11. Шухаев С.В., Мордовцева Е.А., Пустозеров Е.А., Кудлахмедов Ш.Ш. Применение сверточных нейронных сетей для определения эндотелиальной дистрофии Фукса // Офтальмохирургия. 2022. № S4. С. 70–76. EDN: WEZTKV doi: 10.25276/0235-4160-2022-4S-70-76
  12. Obaid H.S., Dheyab S.A., Sabry S.S. The impact of data pre-processing techniques and dimensionality reduction on the accuracy of machine learning // 2019 9th Annu. Inf. Technol. Electromechanical Eng. Microelectron. Conf. IEMECON. 2019. P. 279–283. doi: 10.1109/IEMECONX.2019.8877011
  13. Valdés-Mas M.A., Martín-Guerrero J.D., Rupérez M.J., et al. A new approach based on Machine Learning for predicting corneal curvature (K1) and astigmatism in patients with keratoconus after intracorneal ring implantation // Comput Methods Programs Biomed. 2014. Vol. 116. P. 39–47. doi: 10.1016/j.cmpb.2014.04.003
  14. Патент РФ на изобретение № RU 2793142 C1/ 29.03.2023. Розанова О.И., Цыренжапова Е.К., Юрьева Т.Н., и др. Способ оценки рельефа передней и задней поверхности роговицы.
  15. Arbelaez M.C., Versaci F., Vestri G., et al. Use of a Support Vector Machine for Keratoconus and Subclinical Keratoconus Detection by Topographic and Tomographic Data // Ophthalmology. 2012. Vol. 119, N 11. P. 2231–2238. doi: 10.1016/j.ophtha.2012.06.005
  16. Ruiz Hidalgo I., Rodriguez P., Rozema J.J., et al. Evaluation of a Machine-Learning Classifier for Keratoconus Detection Based on Scheimpflug Tomography // Cornea. 2016. Vol. 35, N 6. P. 827–832. doi: 10.1097/ico.0000000000000834

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Контрольные точки поверхности роговицы: a — центр роговицы; b — парацентральная зона; c — периферическая зона, диаметром 6 мм.

Скачать (280KB)
3. Рис. 2. Процесс обработки набора данных.

Скачать (217KB)
4. Рис. 3. Схематичное представление искусственной нейронной сети последней итерации.

Скачать (114KB)
5. Рис. 4. Интерфейс консольного приложения работы с нейросетью (красным отмечен не только неправильный ответ нейросети, но и его коррекция).

Скачать (222KB)
6. Рис. 5. График зависимости обученности от эпохи: a — до оптимизации; b — после оптимизации.

Скачать (144KB)
7. Рис. 6. Постепенное обучение нейросети и последующая проверка модели на контрольных точках.

Скачать (332KB)
8. Рис. 7. Соотношение ошибок по определению типов посткератотомической деформации роговицы.

Скачать (96KB)
9. Таблица 1

Скачать (30KB)
10. Таблица 1-2

Скачать (30KB)
11. Таблица 2

Скачать (30KB)
12. Таблица 2-2

Скачать (28KB)
13. Таблица 3

Скачать (30KB)
14. Таблица 3-2

Скачать (30KB)
15. Таблица 4

Скачать (30KB)
16. Таблица 4-2

Скачать (31KB)
17. Таблица 5

Скачать (33KB)
18. Таблица 5-2

Скачать (35KB)
19. Таблица 6

Скачать (27KB)
20. Таблица 6-1

Скачать (32KB)
21. Таблица 6-2

Скачать (31KB)

© Эко-вектор, 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».