Бактерии Escherichia coli и Micrococcus luteus активируют ген CG45045 в линии клеток S2 дрозофилы

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Гуморальная иммунная система дрозофилы, наиболее изученная среди эукариот, активируется каноническими сигнальными путями IMD и Toll. Недавно выявлены новые потенциальные регуляторы врожденного иммунного ответа, такие как длинные некодирующие РНК (днРНК) и гены, кодирующие короткие полипептиды. Клетки S2, будучи макрофагоподобной клеточной линией, используются как модельная система для изучения молекулярных механизмов активации генов иммунного ответа. Мы использовали эту линию клеток для анализа влияния бактерий Escherichia coli и Micrococcus luteus на транскрипцию днРНК-CR30055 и генов CG45045 и CG44404, кодирующих короткие полипептиды. Обнаружено, что патогены активируют только CG45045, тогда как уровни транскрипции CR30055 и CG44404 остаются неизменными. Также не наблюдалось активации гена Cecropin C и некоторых генов семейства Bomanin, что указывает на различия в паттернах активации генов иммунного ответа в клетках S2 и взрослых мухах. При этом наиболее высокая активация CG45045 наблюдалась между 6 и 12 часами инкубации клеток с патогенами. Паттерны активации CG45045 после воздействия E. Coli и M. Luteus были схожими, что может указывать на общие механизмы активации транскрипции этого гена. Таким образом, CG45045 может быть новым геном, вовлеченным в гуморальный иммунный ответ дрозофилы.

Об авторах

Ю. А. Полунина

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук

Email: k-z-m@mail.ru
Россия, Москва

А. Э. Праведникова

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук

Email: k-z-m@mail.ru
Россия, Москва

М. Гасса

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук

Email: k-z-m@mail.ru
Россия, Москва

П. Г. Георгиев

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук

Email: k-z-m@mail.ru

академик РАН

Россия, Москва

Ю. В. Шидловский

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук

Email: k-z-m@mail.ru
Россия, Москва

З. М. Качаев

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: k-z-m@mail.ru
Россия, Москва

Список литературы

  1. Govind S. , Innate immunity in Drosophila: Pathogens and pathways, Insect science, 15 (2008) 29-43.
  2. Buchon N., Silverman N., Cherry S. Immunity in Drosophila melanogaster – from microbial recognition to whole-organism physiology, Nature reviews. Immunology, 14 (2014) 796-810. doi: 10.1038/nri3763
  3. Westlake H., Lemaitre M.A. B The Drosophila Immunity Handbook EPFL Press2024.
  4. Valanne S., Salminen T.S., Järvelä-Stölting M. et al., Immune-inducible non-coding RNA molecule lincRNA-IBIN connects immunity and metabolism in Drosophila melanogaster, PLoS pathogens, 15 (2019) e1007504.
  5. Atianand M.K., Fitzgerald K.A. Long non-coding RNAs and control of gene expression in the immune system, Trends in molecular medicine, 20 (2014) 623–631.
  6. Zhou H., Ni J., Wu S. et al., lncRNA-CR46018 positively regulates the Drosophila Toll immune response by interacting with Dif/Dorsal, Developmental and comparative immunology, 124 (2021) 104183.
  7. Leulier F., Parquet C., Pili-Floury S. et al. The Drosophila immune system detects bacteria through specific peptidoglycan recognition, Nature immunology, 4 (2003) 478–484.
  8. Kaneko T., Golenbock D., Silverman N. Peptidoglycan recognition by the Drosophila Imd pathway, Journal of endotoxin research, 11 (2005) 383–389.
  9. Lindsay S.A., Lin S.J.H., Wasserman S.A. Short-Form Bomanins Mediate Humoral Immunity in Drosophila, Journal of innate immunity, 10 (2018) 306–314.
  10. Gramates L.S., Agapite J., Attrill H., et al. FlyBase: a guided tour of highlighted features, Genetics, 220 (2022).
  11. Hanson M.A., Lemaitre B. Antimicrobial peptides do not directly contribute to aging in Drosophila, but improve lifespan by preventing dysbiosis, Disease models & mechanisms, 16 (2023).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».