Development diagnostic methods of bacterial blight of rice on based PCR

M S Egorova; Егорова Мария Сергеевна; A N Ignatov; Игнатов Александр Николаевич; E S Mazurin; Мазурин Евгений Сергеевич

doi:10.22363/2312-797X-2014-2-22-27

Усовершенствование методов диагностики возбудителя бактериального ожога риса на основе ПЦР

Авторы: Егорова М.С.¹, Игнатов А.Н.², Мазурин Е.С.¹
Учреждения:
1. ФГБУ Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
2. Российский университет дружбы народов
Выпуск: № 2 (2014)
Страницы: 22-27
Раздел: Статьи
URL: https://ogarev-online.ru/2312-797X/article/view/329297
DOI: https://doi.org/10.22363/2312-797X-2014-2-22-27
ID: 329297

Цитировать

Полный текст

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

На основе анализа оригинальных и ранее опубликованных последовательностей ДНК Xanthomonas oryzae pv. oryzae были разработаны праймеры для ПЦР «в реальном времени», позволяющие достоверно идентифицировать возбудителя бактериального ожога риса, без перекрестных реакций с близкородственными видами. Была оптимизирована среда для БИО-ПЦР YPGA, содержащая в качестве селектирующих факторов антибиотики циклогексимид 50 мг/л + цефазолин 30 мг/л + гентамицин 2 мг/л. Показано, что чувствительность праймеров при БИО-ПЦР с использованием оригинальной селективной питательной среды в 100 раз эффективнее прямого ПЦР анализа. Оптимизированная БИО-ПЦР диагностика возбудителя бактериального ожога риса позволяла обнаружить 50 КОЕ/мл семенного экстракта.