Method for identification of acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens and its subbiovars A and B

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

The aim of the study was to increase diagnostic sensitivity for identification of A. baumannii bv. tryptophandestruens bacteria and assess prevalence of this biovar and its subbiovars among A. baumannii clinical isolates. There were examined 210 primary strains of A. baumannii isolated in 2021–2022 at Bacteriological Laboratory of the Military Medical Academy named after S.M. Kirov, of which 42 strains were A. baumannii bv. tryptophandestruens. Tryptophandestruens biovar bacteria were identified by chromogenic biotransformation of sodium benzoate on a dense nutrient medium (g/l): peptone enzymatic 5.0; NaCl 5.0; FeCl3 6H2O (10% aqueous solution) 0.1–1 ml; bromothymol blue (1.6% aqueous solution) 3 ml; agar 15.0; NaOH (4% solution) 2.6–3 ml; distilled water 1 l; all components were dissolved by heating and added with sodium benzoate (CAS 532-32-1) 1.0–2.0; adjusted pH 7.2±0.2; sterilized at 121°С, poured into Petri dishes. Bacteria of subbiovars A and B of biovar tryptophandestruens were identified by chromogenic biotransformation of L-tryptophan using the same nutrient medium supplemented with L-tryptophan (1.0–2.0 g/l) instead of sodium benzoate. Both nutrient media were used simultaneously. The A. baumannii cultures studied were seeded with a loop on the media sectors in the form of a plaque, incubated aerobically at 37°С for 18–24 hours, and analyzed final data as follows: the presence of a dark brown color zone of the nutrient medium around bacterial lawn on sodium benzoate- and L-tryptophan-containing medium indicated detection of subbiovar A of the tryptophandestruens biovar; in case of dark brown zone on sodium benzoate- but not L-tryptophan-containing medium around bacterial lawn identified biovar tryptophandestruens subbiovar B. The study revealed for the first time the chromogenic biotransformation of sodium benzoate (benzoic acid) and its importance as a marker for the biovar tryptophandestruens A. baumannii. Two subbiovars A and B of the tryptophandestruens biovar were found. A method was developed to identify the biovar tryptophandestruens A. baumannii and its subbiovars A and B by chromogenic biotransformation of sodium benzoate and L-tryptophan, which enhances diagnostic sensitivity by detecting the subbiovar B. The frequency of tryptophandestruens biovar distribution among primary clinical isolates of A. baumannii in 2021–2022 was determined: out of 210 strains of A. baumannii were 42 (20.0±3.5%) strains of bv. tryptophandestruens including subbiovar A — 27 (12.9±2.3%), subbiovar B — 15 (7.1±1.7%).

About the authors

Evgeny P. Sivolodskii

Military Medical Academy named after S.M. Kirov; Saint-Petersburg Pasteur Institute

Email: es279@yandex.ru

DSc (Medicine), Professor of the Department of Microbiology, Senior Researcher, Laboratory of Molecular and Biological Technologies

Russian Federation, 194044, St. Petersburg, Akademika Lebedeva Street, 6; 197101, St. Petersburg, Mira Street, 14

Lyudmila A. Kraeva

Military Medical Academy named after S.M. Kirov; Saint-Petersburg Pasteur Institute

Email: lykraeva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9115-3250
SPIN-code: 4863-4001
Scopus Author ID: 23473821900
ResearcherId: H-1786-2012

DSc (Medicine), Head of the Laboratory of Medical Bacteriology, Professor of the Department of Microbiology

Russian Federation, 194044, St. Petersburg, Akademika Lebedeva Street, 6; 197101, St. Petersburg, Mira Street, 14

Elena V. Melnikova

Military Medical Academy named after S.M. Kirov

Email: es279@yandex.ru

Bacteriologist Laboratory of the Central Clinical Diagnostic Laboratory

Russian Federation, 194044, St. Petersburg, Akademika Lebedeva Street, 6

Galina V. Gorelova

Military Medical Academy named after S.M. Kirov

Author for correspondence.
Email: es279@yandex.ru

Head of the Laboratory of Bacteriology, Central Clinical Diagnostic Laboratory

Russian Federation, 194044, St. Petersburg, Akademika Lebedeva Street, 6

References

  1. Белобородова Н.В., Осипов А.А., Бедова А.Ю. Биологические свойства некоторых низкомолекулярных ароматических микробных метаболитов, ассоциированных с сепсисом // Антибиотики и химиотерапия. 2013. Т. 58, № 7–8. С. 48–61. [Beloborodova N.V., Osipov A.A., Belova A.Yu. Biological properties of some sepsis-associated low molecular aromatic microbial metabolism. Antibiotiki i khimioterapiya = Antibiotics and Chemotherapy,2013, vol. 58, no. 7–8, pp. 48–61 (In Russ.)]
  2. Сиволодский Е.П., Горелова Г.В., Богословская С.П., Зуева Е.В. Селективная синтетическая питательная среда «Ацинетобактер фенилаланин агар» для выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter caicoaceticus–Acinetobacter baumannii // Инфекция и иммунитет. 2020. Т. 10, № 5. С. 591–596. [Sivolodskii E.P., Gorelova G.V., Bogoslovskaja S.P., Zueva E.V. Selective syntetic growth medium «Acinetobacter phenylalanine agar» for isolation and identification of Acinetobacter calcoaceticus–Acinetobacter baumannii complex species. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of nfection and Immunity,2020, vol. 10, no. 5, pp. 591–596. (In Russ.)] doi: 10.15789/2020-7619-ASS-1177
  3. Сиволодский Е.П., Краева Л.А., Старкова Д.А., Михайлоов Н.В., Горелова Г.А. Acinetobacter baumannii bv. Tryptophandestruens bv. nov., выделенный из клинического материала // Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11, № 5. С. 965–972. [Sivolodskii E.P., Kraeva L.A., Starkova D.A., Mikhailov N.V., Gorelova G.V. Acinetobacter baumannii bv. Tryptophandestruens bv. nov., isolated from clinical samples. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity,2021, vol. 11, no. 5, pp. 965–972 (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-ABB-1676
  4. Kurnasov O., Jablonski L., Polanuyer B., Dorrestein P., Begley T., Osterman A. Aerobic tryptophan degradation pathway in bacteria: novel kynurenine formamidase. FEMS Microbiol. Lett.,2003, vol. 227, no. 2. pp. 213–227. doi: 10.1016/S0378-1097(03)00684-0.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2023 Sivolodskii E.P., Kraeva L.A., Melnikova E.V., Gorelova G.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».