Генетическая модификация и маркировка клеточных линий


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Резюме. Несмотря на большие достижения в изучении биологии стволовых клеток, темных пятен по-прежнему остается немало. Решить данную проблему помогают методы генетической модификации, которые могут быть использованы для отслеживания линий различных клеток, в первую очередь стволовых. Рассмотрены различные методы биотехнологических исследований, позволяющие оценить варианты внедрения новых генов в клетки и даже целые организмы, а также методы контроля их экспрессии во времени и пространстве, их активацию, дифференцировку и снижение функциональной активности, экспрессию нескольких целевых генов. Описаны варианты с мультицистронными векторами, кодирующими несколько белков. Охарактеризованы варианты внедрения генов с использованием плазмид, электропорации, их недостатки и преимущества. Перспективным и наиболее безопасным является ретровирусный вектор с использованием лентивирусных переносчиков, способных генерировать дополнительные копии самого себя, что является очень важным в сфере безопасности биотехнологии. Для получения вирусного вектора используется линия упаковочных клеток, обычно 293T-клетки. Охарактеризованы перспективы использования аденовирусного и аденоассоциированного векторов. Достижением современных биотехнологических методов является система коротких палиндромных повторов, расположенных группами, являющаяся уникальным инструментом редактирования генома. В основе этой системы лежит процесс вырезания последовательностей дезоксирибонуклеиновой кислоты, являющихся постоянными и поддерживающихся клетками независимо от последующих делений или изменения состояния. Система позволяет генетикам и медицинским исследователям редактировать части генома путем удаления, добавления или изменения последовательных участков дезоксирибонуклеиновой кислоты.

Важной проблемой биотехнологических методов являются способы контроля экспрессии трансгенов. Сегодня достаточно эффективным является управление экспрессией с помощью фактора, присутствующего в самом векторе доставки гена и активного только в определенном типе клеток. Для регулирования экспрессии трансгена используется эндонуклеаза бактериофага P1, которая разрезает дезоксирибонуклеиновую кислоту только на конкретных участках. Данная система внедрена как в эукариотических, так и в прокариотических системах.

Об авторах

А. В. Москалев

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Автор, ответственный за переписку.
Email: vmeda-nio@mil.ru
Россия, Санкт-Петербург

Б. Ю. Гумилевский

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Россия, Санкт-Петербург

А. В. Апчел

Северо-Западный медицинский учебный центр последипломного образования

Email: vmeda-nio@mil.ru
Россия, Санкт-Петербург

В. Н. Цыган

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Владимирская, Е.Б. Биологические основы и перспективы терапии стволовыми клетками / Е.Б. Владимирская, О.А. Майорова, С.А. Румянцев. – М.: Медицина и здоровье, 2007. – 392 с.
  2. Москалев, А.В. Общая иммунология с основами клинической иммунологии / А.В. Москалев, В.Б. Сбойчаков, А.С. Рудой. – М.: Гэотар-Медиа, 2015. – 351 с.
  3. Москалев, А.В. Аутоиммунные заболевания. Диагностика и лечение / А.В. Москалев [и др.]. – М.: Гэотар-Медиа, 2017. – 218 с.
  4. Ярилин, А. А. Иммунология / А.А. Ярилин. – М.: Гэотар-Медиа, 2010. – 957 с.
  5. Abbas, A.K. Cellular and Molecular Immunology. – 9-th edition / A.K. Abbas, A.H. Lichtman, S. Pillai. – Philadelphia, Pennsylvania: W. B. Saunders Company, 2018. – 565 p.
  6. Вhaya, D. CRISPR-Cas systems in bacteria and archaea: Versatile small RNAs for adaptive defense and regulation / D. Bbhay [et al.] // Annu. Rev. Genet. – 2011. – Vol. 45. – P. 273–297.
  7. Cai, L. Suppression of hepatocyte growth factor production impairs the ability of adipose-derived stem cells to promote ischemic tissue revascularization / L. Cai [et al.] // Stem Cells. – 2007. – Vol. 25. – P. 3234–3243.
  8. Dominici, M. Minimal criteria for defining multipotent mesenchymal stromal cells. The International Society for Cellular Therapy position statement / M. Dominici [et al.] // Cytotherapy. – 2006. – Vol. 8. – P. 315–317.
  9. Hilton, I.B. Epigenome editing by a CRISPR-Cas9 – based acetyltransferase activates genes from promoters and enhancers / I.B. Hilton [et al.] // Nat. Biotechnol. – 2015. – Vol. 33. – P. 510–517.
  10. Jeon, E.S. Sphingosylphosphorylcholine induces proliferation of human adipose tissue derived mesenchymal stem cells via activation of JNK / E.S. Jeon [et al.] // J. Lipid Res. – 2006. – Vol. 47. – P. 653–664.
  11. Gilbert, L.A. CRISPR–mediated modular RNA-guided regulation of transcription in eukaryotes / L.A. Gilbert [et al.] // Cell, – 2013. – Vol. 154. – P. 442–451.
  12. Kern, S.E. Comparative analysis of mesenchymal stem cells from bone marrow, umbilical cord blood, or adipose tissue / S.E. Kern [et al.] // Stem Cells. – 2006. – Vol. 24. – P. 1294–1301.
  13. Lee, J. Human adipose-derived stem cells display myogenic potential and perturbed function in hypoxic conditions / J. Lee [et al.] // Biochem. Biophys. Res. Commun. – 2006. – Vol. 341. – P. 882–888.
  14. Li, B. Adipose tissue stromal cells transplantation in rats of acute myocardial infarction / B. Li [et al.] // Coron Artery Dis. – 2007. – Vol. 18. – P. 221–227.
  15. Lipinski, M.J. Impact o f intracoronary cell therapy on left ventricular function in the setting of acute myocardial infarction: a collaborative systematic review and meta-analysis of controlled clinical trials / M.J. Lipinski [et al.] // J. Am. Coli. Cardiol. – 2007. – Vol. 50. – P. 1761–1767.
  16. McDonald, J.I. Reprogrammable CRISPR/Cas9-based system for inducing site-specific DNA methylation / J.I. McDonald [et al.] // Biol. Open. – 2016. – Vol. 5. – P. 866–874.
  17. Miyahara, Y. Monolayered mesenchymal stem cells repair scarred myocardium after myocardial infarction / Y. Miyahara [et al.] // Nat Med. – 2006. – Vol. 12, № 4. – P. 459–465.
  18. Olson, K. Contemporary clinical immunology and serology / K. Olson, E. De Nardin. – New Jersey: Upper Saddle River, 2013. – 439 p.
  19. Rose, N.R. The autoimmune diseases. – fith edition / N.R. Rose, I.R. Mackay. – Philadelphia, 2018. – 1265 p.
  20. Schaffler, A. Concise review: Adipose Tissue derived stromal cells – basic and clinical implications for novel cell-based therapies / A. Schaffler, C. Buchler // Stem Cells. – 2007. – Vol. 25. – P. 818–827.
  21. Sternberg, S.H. DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9 / S.H. Sterberg // Nature. – 2014. – Vol. 507. – P. 62–67.
  22. Thakore, P.I. Highly specific epigenome editing by CRISPR-Cas9 repressors for silencing of distal regulatory elements / P.I. Thakore [et al.] // Nat. Methods. – 2015. – Vol. 12. – P. 1143–1149.
  23. Wu, Y. Mesenchymal stem cells enhance wound healing through differentiation and angiogenesis / Y. Wu [et al.] // Stem Cells. – 2007. – Vol. 25. – P. 2648–2659.
  24. Zabriskie, J.B. Essential clinical immunology / J.B. Zabriskie – N. Y., 2009. – 362 p.
  25. Zetsche, B. Cpf1 is a single RNA – guided endonuclease of a class 2 CRISPR-Cas system / B. Zetsche [et al.] // Cell. – 2016. – Vol. 163. – P. 759–771.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Схема строения бицистронных векторов на ВСПР и 2А- последовательностей: а – экспрессия плазмид млекопитающих; б – внутренний участок посадки рибосом и 2А-последовательности; в – геном ретровируса. LTR – long terminal repeat (длинные концевые повторы). В векторе гены gag (капсидный белок), pol (обратная транскриптаза) и env оболочечный белок) заменяются интересующим геном; г – вектор лентивирусов. RRE – Rep response element (элемент ответа), cPPT – polypurine region (область полипурина), CMV – promoter for gene of interest (промотер гена «интереса»), WPRE – enhancer sequence (усиливающие последовательности); д – ITR – inverted terminal repeat (инвертированные терминальные повторы), E1–4 are early expressed genes (ранняя экспрессия генов, L1–5 are late genes (поздняя экспрессия генов). В векторе первого поколения ген E1, необходимый для репликации, заменяется вставкой; е – геном AAV. Повтор ITR. Два гена вектора заменяются геном «интереса»

Скачать (160KB)
3. Рис. 2. Варианты транскрипции: а – P – промоутер; TA – тетрациклиновый активатор; DOX – доксициклин; ТRЕ – элемент реакции Тет; GOI – ген «интереса»; б – TSP – тканевый промоутер; UP – убиквитарный промоутер; в – ТАМ – тамоксифен; г – RISC РНК индуцированный подавляющий комплекс; AGO2 – Argonaute 2 (эндонуклеаза, белковый комплекс); д – CRISPR-Cas9. PAM – смежный мотив протосканера, sgRNA – одноцепочечная РНК, DSB – двухцепочечный разрыв; Non-homologous end joining (NHEJ) – негомологичный конец присоединения; homologous recombination (HR) – гомологичная рекомбинация

Скачать (177KB)

© Москалев А.В., Гумилевский Б.Ю., Апчел А.В., Цыган В.Н., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».