Таксономическое и прикладное значение профилей утилизации белковых аминокислот бактерий Acinetobacter baumannii, Acinetobacter pittii, Acinetobacter nosocomialis


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Изучены профили утилизации 20 белковых аминокислот 118 штаммов A. baumannii, 9 штаммов A. pittii, 7 штаммов A. nosocomialis. Утилизация аминокислот определялась на минимальном солевом агаре с аминокислотой в качестве единственного источника азота и углерода. Видовая идентификация ацинетобактеров проводилась с помощью методики матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации с времяпролетной масс-спектрометрией с базой данных Biotyper (Bruker Daltonics Inc. Germany). У A. baumannii были выявлены14 профилей утилизации белковых аминокислот, из них первые 6 профилей включали 87,3% штаммов. Впервые установлено широкое распространение штаммов A. baumannii, которые не утилизируют L-гистидин - 56 (47,4%) штаммов. Признаки утилизации L-гистидина (His+) или отсутствия утилизации (His-) стабильно сохраняются у повторных штаммов, выделенных от пациентов. Предлагается подразделять все штаммы A. baumannii на два трофовара: «гистидинотрицательный трофовар His-», который не утилизирует L-гистидин в качестве единственного источника азота и углерода, и «гистидинположительный трофовар His+», который его утилизирует, что будет полезно для эпидемиологического надзора. У бактерий A. pittii и A. nosocomialis установлено близкое фенотипическое сходство с A. baumannii по профилям утилизации аминокислот, что подтверждает правомерность объединения этих видов в комплекс A. calcoaceticus-A. baumannii. У бактерий видов A. pittii и A. nosocomialis нет гистидинотрицательного трофовара His-, что отличает их от вида A. baumannii.

Об авторах

Е П Сиволодский

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова; Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

Е В Зуева

Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Пат. № 2660567 Российская Федерация, МПК C12 Q1/04. Способ выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii / Е.П. Сиволодский; опубл. 06.07. 2018, Б и № 19. - С. 24-26.
  2. Сиволодский Е.П. Таксономическое значение профилей ути- лизации белковых аминокислот бактерий рода Klebsiella / E.П. Сиволодский, В.Д. Бадиков, Е.В. Зуева // Вестн. Росс. воен.-мед. акад. - 2016. - № 4 (56). -С.148-151.
  3. Carr, E.L. Seven novel species of Acinetobacter isolated from activated sludge / E.L. Carr [et al.] // Int. J. Sys. Evol. Microbiol. - 2003. - Vol. 53. - P. 953-963.
  4. Cosgaya, C. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries / C. Cosgaya [et al.] // Int. J. Sys. Evol. Microbiol. - 2016. - Vol. 66. - P. 4105-4111.
  5. Gerner-Smidt, P. Reliability of phenotypic test for identification of Acinetobacter species / P. Gerner-Smidt [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 1991. -Vol. 29, № 2. - P. 277-282.
  6. Nemec, A. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13U) / A. Nemec [et al.] // Res. Microbiol. - 2011. - Vol. 162, № 4. - P. 393-404.
  7. Sivolodskii, E.P. Application the profiles of amino acid utilization as the sole carbon and nitrogen sources for Pseudomonas taxonomy / E.P. Sivolodskii // Microbiology (Moscow). - 2009. - Vol. 78, № 6. - P. 711-716.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Сиволодский Е.П., Зуева Е.В., 2018

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».