Таксономическое и прикладное значение профилей утилизации белковых аминокислот бактерий Acinetobacter baumannii, Acinetobacter pittii, Acinetobacter nosocomialis


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Изучены профили утилизации 20 белковых аминокислот 118 штаммов A. baumannii, 9 штаммов A. pittii, 7 штаммов A. nosocomialis. Утилизация аминокислот определялась на минимальном солевом агаре с аминокислотой в качестве единственного источника азота и углерода. Видовая идентификация ацинетобактеров проводилась с помощью методики матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации с времяпролетной масс-спектрометрией с базой данных Biotyper (Bruker Daltonics Inc. Germany). У A. baumannii были выявлены14 профилей утилизации белковых аминокислот, из них первые 6 профилей включали 87,3% штаммов. Впервые установлено широкое распространение штаммов A. baumannii, которые не утилизируют L-гистидин - 56 (47,4%) штаммов. Признаки утилизации L-гистидина (His+) или отсутствия утилизации (His-) стабильно сохраняются у повторных штаммов, выделенных от пациентов. Предлагается подразделять все штаммы A. baumannii на два трофовара: «гистидинотрицательный трофовар His-», который не утилизирует L-гистидин в качестве единственного источника азота и углерода, и «гистидинположительный трофовар His+», который его утилизирует, что будет полезно для эпидемиологического надзора. У бактерий A. pittii и A. nosocomialis установлено близкое фенотипическое сходство с A. baumannii по профилям утилизации аминокислот, что подтверждает правомерность объединения этих видов в комплекс A. calcoaceticus-A. baumannii. У бактерий видов A. pittii и A. nosocomialis нет гистидинотрицательного трофовара His-, что отличает их от вида A. baumannii.

Об авторах

Е П Сиволодский

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова; Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

Е В Зуева

Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Пат. № 2660567 Российская Федерация, МПК C12 Q1/04. Способ выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii / Е.П. Сиволодский; опубл. 06.07. 2018, Б и № 19. - С. 24-26.
  2. Сиволодский Е.П. Таксономическое значение профилей ути- лизации белковых аминокислот бактерий рода Klebsiella / E.П. Сиволодский, В.Д. Бадиков, Е.В. Зуева // Вестн. Росс. воен.-мед. акад. - 2016. - № 4 (56). -С.148-151.
  3. Carr, E.L. Seven novel species of Acinetobacter isolated from activated sludge / E.L. Carr [et al.] // Int. J. Sys. Evol. Microbiol. - 2003. - Vol. 53. - P. 953-963.
  4. Cosgaya, C. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries / C. Cosgaya [et al.] // Int. J. Sys. Evol. Microbiol. - 2016. - Vol. 66. - P. 4105-4111.
  5. Gerner-Smidt, P. Reliability of phenotypic test for identification of Acinetobacter species / P. Gerner-Smidt [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 1991. -Vol. 29, № 2. - P. 277-282.
  6. Nemec, A. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13U) / A. Nemec [et al.] // Res. Microbiol. - 2011. - Vol. 162, № 4. - P. 393-404.
  7. Sivolodskii, E.P. Application the profiles of amino acid utilization as the sole carbon and nitrogen sources for Pseudomonas taxonomy / E.P. Sivolodskii // Microbiology (Moscow). - 2009. - Vol. 78, № 6. - P. 711-716.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Сиволодский Е.П., Зуева Е.В., 2018

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).