Visualization of data using the R programming language for repeated measurements in three observation groups

V. B. Grinevich; Гриневич В. Б.; G. F. Bunenkova; Буненкова Г. Ф.; D. Yu. Ivkin; Ивкин Д. Ю.; R. G. Guseinov; Гусейнов Р. Г.; V. V. Perepelitsa; Перепелица В. В.; I. A. Zavyalov; Завьялов И. А.; S. V. Popov; Попов С. В.; A. A. Karpov; Карпов А. А.; N. S. Bunenkov; Буненков Н. С.

doi:10.29296/25877305-2025-02-05

Визуализация данных с помощью языка программирования R при повторных измерениях в трех группах наблюдения

Авторы: Гриневич В.Б.¹, Буненкова Г.Ф.¹, Ивкин Д.Ю.², Гусейнов Р.Г.³^,4^,5, Перепелица В.В.³^,4, Завьялов И.А.⁵, Попов С.В.¹^,3^,4, Карпов А.А.⁶^,7, Буненков Н.С.³^,6^,8
Учреждения:
1. Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова Минобороны России
2. Санкт-Петербургский химико-фармацевтический университет Минздрава России
3. Клиническая больница Святителя Луки Минздрава России
4. Санкт-Петербургский медико-социальный институт
5. Санкт-Петербургский государственный университет
6. Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова Минздрава России
7. Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина)
8. Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П. Павлова Минздрава России
Выпуск: Том 36, № 2 (2025)
Страницы: 27-31
Раздел: Из практики
URL: https://ogarev-online.ru/0236-3054/article/view/294226
DOI: https://doi.org/10.29296/25877305-2025-02-05
ID: 294226

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Полный текст
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Задача статистической обработки данных и их представления не является сложной для специалистов в области статистики, однако может потребовать достаточно много времени и усилий от начинающих специалистов. В статье представлено преобразование базы данных, включающее транспозицию строк и столбцов с последующей визуализацией данных с использованием языка программирования R.

Ключевые слова

язык программирования R, визуализация данных, повторные измерения

Полный текст

Открыть статью на сайте журнала

Об авторах

В. Б. Гриневич

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова Минобороны России

Email: gulnara533@gmail.com
SPIN-код: 1178-0242

доктор медицинских наук, профессор

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

Есипова О.Ю., Богданов В.К., Есипов А.С. и др. Разработка нового малообъемного оксигенатора и создание гидродинамического стенда для ex vivo перфузии легких на мелких животных. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2023; 25 (3): 106–12 [Esipova O.Y., Bogdanov V.K., Esipov A.S. et al. Development of a new low-volume oxygenator and creation of a hydrodynamic test bench for ex vivo lung perfusion in small animals. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2023; 25 (3): 106–12 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2022-2-94-101
Готье С.В., Цирульникова О.М., Пашков И.В. и др. Нормотермическая ex vivo перфузия изолированных легких в эксперименте с использованием отечественного перфузионного аппаратного комплекса. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2022; 24 (2): 94–101 [Gautier S.V., Tsirulnikova O.M., Pashkov I.V. et al. Normothermic ex vivo perfusion of isolated lungs in an experiment using a russian-made perfusion system. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2022; 24 (2): 94–101 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2022-2-94-101
Готье С.В., Пашков И.В., Богданов В.К. и др. Ex vivo перфузия донорских легких с использованием разработанного раствора с последующей ортотопичеcкой левосторонней трансплантацией легкого (экспериментальное исследование). Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2023; 25 (2): 158–66 [Gautier S.V., Pashkov I.V., Bogdanov V.K. et al. Normothermic ex vivo lung perfusion using a developed solution followed by orthotopic left lung transplantation (experimental study). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2023; 25 (2): 158–66 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2023-2-158-166
Комок В.В., Буненков Н.С., Белый С.А. и др. Оценка эффективности комбинированного лечения ишемической болезни сердца – аортокоронарное шунтирование, трансплантация аутологичных мононуклеаров костного мозга: Результаты рандомизированного, слепого, плацебо контролируемого исследования. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2019; 21 (4): 54–66 [Komok V.V., Bunenkov N.S., Beliy S.A. et al. Evaluation of the effectiveness of combined treatment of coronary heart disease – coronary artery bypass grafting, transplantation of autologous bone marrow mononuclear cells: a randomized, double-blind, placebo-controlled study. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2019; 21 (4): 54–66 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2019-4-54-66
Комок В.В., Буненков Н.С., Белый С.А. и др. Оценка безопасности трансплантации аутологичных мононуклеаров костного мозга в комбинированном лечении ишемической болезни сердца результаты рандомизированного, слепого, плацебо контролируемого исследования (TAMIS). Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2019; 21 (2): 112–20 [Komok V.V., Bunenkov N.S., Beliy S.A. et al. Assessment of safety of additional transplantation of autologous bone marrow mononuclear cells in the combined treatment of coronary heart disease. Results from a randomized, blind, placebo-controlled trial (TAMIS). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2019; 21 (2): 112–20 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2019-2-112-120
Готье С.В., Цирульникова О.М., Пашков И.В. и др. Оценка эффективности разработанного перфузионного раствора для нормотермической ex vivo перфузии легких по сравнению со Steen Solution™ (экспериментальное исследование). Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2021; 23 (3): 82–9 [Gautier S.V., Tsirulnikova O.M., Pashkov I.V. et al. Evaluation of the efficacy of a novel perfusion solution for normothermic ex vivo lung perfusion compared with Steen solution™ (animal experimental study). Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2021; 23 (3): 82–9 (in Russ.)]. doi: 10.15825/1995-1191-2021-3-82-89
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: сравнение групп. Медицинский академический журнал. 2019; 19 (4): 33–40 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: multiple comparisons. Medical academic journal. 2019; 19 (4): 33–40 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ17736
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: корреляционный анализ. Медицинский академический журнал. 2020; 20 (1): 51–6 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: correlation analysis. Medical academic journal. 2020; 20 (1): 51–6 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ17737
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Белый С.А. и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: начало работы. Медицинский академический журнал. 2019; 19 (3): 27–36 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Beliy S.A. et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: getting started. Medical academic journal. 2019; 19 (3): 27–36 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ19327-36
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. SAS Enterprise guide 6.1: cравнение независимых групп по качественным признакам. Медицинский академический журнал. 2020; 20 (1): 89–98 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. Sas enterprise guide 6.1: independent groups comparison for nominal data. Medical academic journal. 2020; 20 (3): 89–98 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ34127
Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В. и др. Оценка прогностического значения биомаркера и определение его верхней границы нормы. Медицинский академический журнал. 2020; 20 (2): 79–86 [Bunenkov N.S., Bunenkova G.F., Komok V.V. et al. Evaluating of prognostic value of biomarker and upper reference limit calculating. Medical academic journal. 2020; 20 (2): 79–86 (in Russ.)]. doi: 10.17816/MAJ26271
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Визуализация исследовательских данных с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (8): 52–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Visualization of biomedical data using R. Human Ecology. 2018; 25 (8); 52–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-8-52-64
Гржибовский А.М., Иванов С.В., Горбатова М.А. Однофакторный линейный регрессионный анализ с использованием программного обеспечения STATISTICA и SPSS. Наука и Здравоохранение. 2017; 2: 5–33 [Grjibovski A.M., Ivanov S.V., Gorbatova M.A. Univariate regression analysis using Statistica and SPSS software. Science and Healthcare. 2017; 2: 5–33 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Порядковая регрессия в программной среде R - краткие рекомендации для магистрантов и докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здравоохранение». West Kazakhstan medical journal. 2019; 3 (61): 145–53 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Ordinal regression in the R software environment - brief recommendations for undergraduates and doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 3 (61): 145–53 (in Russ.)].
Кригер Е.А., Драчев С.Н., Митькин Н.А. и др. Расчет необходимого объема выборки с использованием программы G*POWER. Морская медицина. 2023; 8 (2): 111–25 [Krieger E.A., Drachev S.N., Mitkin N.A. et al. Sample size calculation using G*POWER software. Marine Medicine. 2023; 8 (2): 111–25 (in Russ.)]. doi: 10.22328/2413-5747-2023-9-2-111-125
Гржибовский А.М., Горбатова М.А., Наркевич А.Н. и др. Необходимый объем выборки для сравнения долей в двух независимых группах. Морская медицина. 2020; 6 (3): 76–83 [Grjibovski A.M., Gorbatova M.A., Narkevich A. N. et al. Required sample size for comparing proportions in two independent samples. Marine Medicine. 2020; 6 (3): 76–83 (in Russ.)]. doi: 10.22328/2413-5747-2020-6-3-76-83
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Квантильная регрессия в программной среде R: краткие рекомендации для докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здоровье». West Kazakhstan medical journal. 2019; 4 (61): 194–202 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Quantile regression in the r software environment: brief recommendations for doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 4 (61): 194–202 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Множественная логистическая регрессия для бинарной переменной отклика в программной среде R-краткие специальности «Медицина» и «Общественное здравоохранение». West Kazakhstan medical journal. 2019; 2 (61): 83–90 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Multiple logistic regression for a binary response variable in the R software environment-short specialties "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 2 (61): 83–90 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Анализ главных компонент и факторный анализ в программной среде R. West Kazakhstan medical journal. 2020; 1 (62): 6–14 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Analysis of the main components and factor analysis in the software environment R. West Kazakhstan medical journal. 2020; 1 (62): 6–14 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Анализ пропорциональных рисков в программной среде R: практические рекомендации для докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здоровье». West Kazakhstan medical journal. 2020; 2 (62): 95–103 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Analysis of proportional risks in the R software environment: practical recommendations for doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2020; 2 (62): 95–103 (in Russ.)].
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Корреляционный и простой линейный регрессионный анализ с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (12): 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Correlation and simple regression analysis using R. Human Ecology. 2018; 25 (12): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-12-55-64
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Основы работы в программной среде R при анализе исследовательских данных. Экология человека. 2018; 25 (7): 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Basic principles of biomedical data analysis in R. Human Ecology. 2018; 25 (7): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-7-55-64
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Расчет показателей описательной статистики с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (9): 55–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Descriptive statistics using R. Human Ecology. 2018; 25 (9): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-9-55-64
Егошин В.Л., Иванов С.В., Саввина Н.В. и др. Анализ непрерывных данных с использованием программной среды R. Экология человека. 2018; 25 (11): 51–64 [Egoshin V.L., Ivanov S.V., Savvina N.V. et al. Analysis of continuous data using R. Human Ecology. 2018; 25 (11): 51–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2018-11-51-64
Гржибовский А.М. Анализ номинальных данных (независимые наблюдения). Экология человека. 2008; 6 (10): 58–68 [Grjibovski A.M. Nominal data analysis (independent observations). Human Ecology. 2008; 6 (10): 58–68 (in Russ.)].
Гржибовский А.М. Типы данных, проверка распределения и описательная статистика. Экология человека. 2008; 1: 52–8 [Grjibovski A. M. Data types, control of distribution and descriptive statistics. Human Ecology. 2008; 1: 58–68 (in Russ.)].
Унгуряну Т.Н., Гржибовский А.М. Краткие рекомендации по описанию, статистическому анализу и представлению данных в научных публикациях. Экология человека. 2011; 5: 55–60 [Unguryanu T.N., Grjibovski A.M. Brief recommendations on description, analysis and presentation of data in scientific papers. Human Ecology. 2011; 5: 55–60 (in Russ.)].
Гржибовский А.М., Гвоздецкий А.Н. Интерпретация величины р и альтернативы ее использованию в биомедицинских исследованиях. Экология человека. 2022; 29 (3): 209–18 [Grjibovski A.M., Gvozdeckii A.N. Interpretation of and alternatives to p-values in biomedical sciences. Human Ecology. 2022; 29 (3): 67–76 (in Russ.)]. doi: 10.17816/humeco97249
Наркевич А.Н., Виноградов К.А., Гржибовский А.М. Множественные сравнения в биомедицинских исследованиях: проблема и способы решения. Экология человека. 2020; 27 (10): 55–64 [Narkevich A.N., Vinogradov K.A., Grjibovski A.M. Multiple comparisons in biomedical research: the problem and its solutions. Human Ecology. 2020; 27 (10): 55–64 (in Russ.)]. doi: 10.33396/1728-0869-2020-10-55-64
Гржибовский А.М., Горбатова М.А., Наркевич А.Н., и др. Объем выборки для корреляционного анализа. Морская медицина. 2020; 6 (3): 101–6 [Grjibovski A.M., Gorbatova M.A., Narkevich A.N. et al. Required sample size for correlation analysis. Marine Medicine. 2020; 6 (1): 101–6 (in Russ.)]. doi: 10.22328/2413-5747-2020-6-1-101-106
Егошин В.Л., Саввина Н.В., Гржибовский А.М. Множественная линейная регрессия в программной среде R-краткие рекомендации для магистрантов и докторантов по специальности «Медицина» и «Общественное здравоохранение». West Kazakhstan medical journal. 2019; 1 (61): 4–15 [Egoshin V.L., Savvina N.V., Grzybowski A.M. Multiple linear regression in the R software environment-brief recommendations for undergraduates and doctoral students in the specialty "Medicine" and "Public Health". West Kazakhstan medical journal. 2019; 1 (61): 4–15 (in Russ.)].