Индуцированная оптическая активность профлавина в комплексах с ДНК

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Профлавин (ПФ) – 2,6-диаминоакридин – является мутагеном и как один из красителей акридинового ряда способен образовывать комплексы с ДНК, что приводит как к появлению оптической активности в длинноволновой полосе поглощения красителя, так и к изменению оптической активности в УФ-области спектра, где наблюдается поглощение азотистых оснований ДНК. Экспериментальное исследование оптической активности в виде спектров кругового дихроизма (КД) показывает, что в видимой области спектра оптическая активность вызвана экситонным хромофор-хромофорным взаимодействием молекул красителя, образовавших комплекс с асимметричной спиральной молекулой ДНК. Появление дополнительного КД в УФ-области связано с экситонным взаимодействием коротковолновых оптических переходов молекул красителя с близкими по частотам УФ-переходами нуклеиновых оснований. Разложение спектров КД на компоненты позволяет выделить вклад от взаимодействия длинноволновых переходов красителя с коротковолновыми (УФ) переходами соседних хромофоров. В часности, обнаружен вклад от взаимодействия магнитного переходного момента хромофоров в высших колебательных состояниях с дипольными переходными моментами соседних хромофоров. Этот не описанный ранее эффект связан с нарушением плоскости симметрии ароматической системы красителя в высших колебательных состояниях, он отсутствует в области нулевой колебательной полосы. Построенная процедура разложения позволяет выделить из суммарных спектров КД вклады оптических взаимодействий, ранее описанных теоретически, что потенциально позволяет оценить геометрические параметры комплекса.

Об авторах

А. И. Полетаев

Федеральный исследовательский центр химической физики
им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: aip45@mail.ru
Россия, Москва

Список литературы

  1. Crick F.H., Barnett L., Brenner S. et al. // Nature. 1961. V. 192. P. 1227; https://doi.org/10.1038/1921227a0
  2. Стовбун С.В., Занин А.М., Скоблин А.А. и др. // Хим. физика. 2019. Т. 38. № 5. С. 54; https://doi.org/10.1134/S0207401X19040113
  3. Полетаев А.И. // Итоги науки и техники. Сер. “Молекулярная биология”. Т. 8. Ч. II. М.: ВИНИТИ, 1976. С. 180.
  4. Пронкин П.Г, Татиколов А.С. // Хим. физика. 2021. Т. 40. № 2. С. 3; https://doi.org/10.31857/S0207401X2102014X
  5. Терешкин Э.В., Терешкина К.Б., Коваленко В.В. и др. // Хим. физика. 2019. Т. 8. № 10. С. 48; https://doi.org/10.1134/S0207401X19100091
  6. Крупянский Ю.Ф. // Хим. физика. 2021. Т. 40. № 3. С. 60; https://doi.org/10.31857/S0207401X21030079
  7. Lerman L.S. // J. Mol. Biol. 1961. V. 3. P. 18.
  8. Lerman L.S. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1963. V. 49. P. 94.
  9. Гурский Г.В. // Биофизика. 1966. V. 11. P. 737.
  10. Ivanov V.I., Minchenkova L.E., Scholkina A.K. et al. // Biopolymers. 1973. V. 12. P. 89; https://doi.org/10.1002/bip.1973.360120109
  11. Rosenfeld L. // Z. Physik. 1928. V. 52. P. 161.
  12. Снатске Г. // Дисперсия оптического вращения и круговой дихроизм в органической химии. М.: Мир, 1970. С. 45.
  13. Kirkwood J.G. // J. Chem. Phys. 1937. V. 5. P. 479; https://doi.org/10.1063/1.1750060
  14. Tinoco I. // Adv. Chem. Phys. 1962. V. 4. P. 113.
  15. Moffitt W. // J. Chem. Phys. 1956. V. 25. P. 467.
  16. Woody R.W., Tinoco I. // Ibid. 1967. V. 46. P. 4927; https://doi.org/10.1063/1.1840658
  17. Tinoco I. // Rad. Res. 1963. V. 20. P. 133.
  18. Johnson W.C., Tinoco I. // Biopolymers. 1969. V. 7. P. 727; https://doi.org/10.1002/bip.1969.360080603
  19. Макаров В.Л., Полетаев А.И., Волькенштейн М.В. // Молекуляр. биология. 1977. Т. 11. С. 238.
  20. Kamiya M. // Biochim. Biophys. Acta. 1979. V. 562. P. 70; https://doi.org/10.1016/0005-2787(79)90127-8
  21. Kypr J., Kejnovska I., Renciuk D. et al. // Nucleic Acids Res. 2009. V. 37. P. 1713; https://doi.org/10.1093/nar/gkp026
  22. Schreibe R., Luong N., Fan Z. et al. // Nat. Commun. 2013. V. 4. P. 2948; https://doi.org/10.1038/ncomms3948
  23. Wang X., Tang Z. // Small. 2017. V. 13. P. 1601115; https://doi.org/10.1002/smll.201601115
  24. Shin S.W., Yuk J.S., Chun S.H. et al. // Nano Converg. 2020. V. 7. P. 2; https://doi.org/10.1186/s40580-019-0211-4
  25. Zimmer Ch., Wähnert U. // Prog. Biophys. Molec. Biol. 1986. V. 47. P. 31; https://doi.org/10.1016/0079-6107(86)90005-2
  26. Макаров В.Л., Полетаев А.И., Свешников П.Г. и др. // Молекуляр. биология. 1979. Т. 13. С. 450.
  27. Moore D.S., Wagner N.T. // Biopolymers. 1973. V. 12. № 1. P. 201; https://doi.org/10.1002/BIP.1974.360130512
  28. Langridge R., Marvin D.F., Seeds W.E. et al. // J. Mol. Biol. 1960. V. 2. P. 38; https://doi.org/10.1016/S0022-2836(60)80005-8
  29. Fuller W., Wilkins M.H.F., Wilson Y.R. et al. // Ibid. 1965. V. 12. P. 60; https://doi.org/10.1016/s0022-2836(65)80282-0
  30. Теренин А.Н. Фотоника молекул красителей и родственных органических соединений Л.: Наука, 1967.
  31. Франк-Каменецкий М.Д., Лукашин А.В. // Оптика и спектроскопия. 1971. Т. 30. С. 481.
  32. Иванов А.А., Пурецкий А.А., Лукашин А.В. и др. // Письма в ЖЭТФ. 1971. Т. 14. С. 419.
  33. Иванов А.А., Пурецкий А.А., Лукашин А.В. и др. // Оптика и спектроскопия. 1972. Т. 32. С. 481.
  34. Пермогоров В.И. // Молекуляр. биология. 1973. Т. 7. С. 20.
  35. Dalgleish D.G., Fujita H., Peacocke A.R. // Biopolimers. 1969. V. 8. P. 623; https://doi.org/10.1002/BIP.1969.360080506
  36. Преч Э., Бюльманн Ф., Аффольтер К. Определение строения органических соединений. Таблицы спектральных данных. М.: Мир, 2006.

Дополнительные файлы


© А.И. Полетаев, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».