Первый опыт молекулярного типирования и определения антибиотикорезистентности штаммов возбудителя сифилиса Treponema pallidum в Российской Федерации


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Представлены результаты молекулярного типирования и определения антибиотикорезистентности 190 штаммов T. pallidum, полученных на территории Российской Федерации в 2011—2012 гг. от больных первичным и вторичным сифилисом. Молекулярное типирование штаммов T. pallidum проведено по двум вариабельным генам T. pallidum: arp, tpr и дополнено анализом последовательности рамки считывания гена tp0548. Определение антибиотикорезистентности штаммов возбудителя сифилиса проводилось путем секвенирования гена, кодирующего 23S rRNA T. pallidum в позициях A2058G и A2059G/C (резистентность к макролидам), гена, кодирующего 16S rRNA T. pallidum в позиции G1058C, и определения детерминанты tetB (резистентность к тетрациклинам), а также путем полноразмерного секвенирования генов, кодирующих белки-мишени ß-лактамов Tp47 и Tromp. В результате молекулярного типирования на территории Российской Федерации выявлено 10 субтипов T. pallidum. Установлено, что доминирующим является молекулярный тип 14 (98,4%), подтип 14d/f (91,03%); доля субтипов 14d/T и 14b/f молекулярного типа 14 составила: 2,10 и 3,16% соответственно; на долю каждого из остальных субтипов (11d/f, 13d/f, 14a/a, 14a/f, 14d/g, 14d/c, 20d/f) приходилось по 0,53%. Молекулярные маркеры резистентности T. pallidum к антибиотикам выявлены у штаммов, полученных из Центрального, Сибирского и Приволжского федеральных округов России: к макролидам — в трех штаммах, полученных в 2011 г.; к тетрациклинам — в двух штаммах, полученных в 2011 г., и в одном штамме, полученном в 2012 г.

Об авторах

А А Кубанова

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России

академик РАМН, д.м.н., профессор, директор 107076, Москва, ул. Короленко, д. 3, стр. 6

А А Кубанов

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России

д.м.н., профессор, заместитель директора 107076, Москва, ул. Короленко, д. 3, стр. 6

Н В Фриго

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России

д.м.н., заместитель директора 107076, Москва, ул. Короленко, д. 3, стр. 6

И А Волков

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России

к.б.н., старший научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней 107076, Москва, ул. Короленко, д. 3, стр. 6

С В Ротанов

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России

Email: rotanov@cnikvi.ru
д.м.н., доцент, главный научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней 107076, Москва, ул. Короленко, д. 3, стр. 6

А А Суворова

ФГБУ «Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии» Минздрава России

младший научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней 107076, Москва, ул. Короленко, д. 3, стр. 6

Список литературы

  1. Pillay A., Liu H., Chen C.Y. et al. Molecular subtyping of Treponema pallidum subspecies pallidum. Sex Transm Dis 1998; 25: 408—414.
  2. Pillay A., Liu H., Ebrahim S. et al. Molecular typing of Treponema pallidum in South Africa: cross-sectional studies. J Clin Microbiol 2002; 40: 256—258.
  3. Marra C.M., Sahi S.K., Tantalo L.C. et al. Enhanced Molecular Typing of Treponema pallidum: Geographical Distribution of Strain Types and Association with Neurosyphilis. J Infect Dis 2010; 202 (9): 1380—1388.
  4. Peng R.R., Wang A.L., Li J. et al. Molecular Typing of Treponema pallidum: A systematic review and metaanalysis. PLoS Negl Trop Dis. 2011 (Nov); 5 (11): e1273.
  5. Martin I.E., Gu W., Yang Y., Tsang R.S. Macrolide resistance and molecular types of Treponema pallidum causing primary syphilis in Shanghai, China. Clin Infect Dis 2009; 49: 515—521.
  6. Sutton M.Y., Liu H., Steiner B. et al. Molecular subtyping of Treponema pallidum in an Arizona County with increasing syphilis morbidity: use of specimens from ulcers and blood. J Infect Dis 2001; 183: 1601—1606.
  7. Martin I.E., Tsang R.S., Sutherland K. et al. Molecular typing of Treponema pallidum strains in western Canada: predominance of 14d subtypes. Sex Transm Dis 2010; 37: 544—548.
  8. Molepo J., Pillay A., Weber B. et al. Molecular typing of Treponema pallidum strains from patients with neurosyphilis in Pretoria, South Africa. Sex Transm Infect 2007; 83: 189—192.
  9. Florindo C., Reigado V., Gomes J.P. et al. Molecular typing of Treponema pallidum clinicalstrains from Lisbon, Portugal. J Clin Microbiol 2008; 46 (11): 3802—3803.
  10. Cole M.J., Chisholm S.A., Palmer H.M. et al. Molecular epidemiology of syphilis in Scotland. Sex Transm Infect 2009; 85: 447—451.
  11. Приказ Минздрава России № 327 от 25.07.2003 «Об утверждении протокола ведения больных «Сифилис».
  12. Duncan W.C. Failure of erythromycin to cure secondary syphilis in a patient infected with the human immunodeficiency virus. Arch Dermatol 1989; 125: 82—84.
  13. Hashisaki P., Wertzberger G.G., Conrad G.L., Nichols C.R. Erythromycin failure in the treatment of syphilis in a pregnant woman. Sex Transm Dis 1983; 10: 36—38.
  14. Stamm L.V., Bergen H.L. A point mutation associated with bacterial macrolide resistance is present in both 23S rRNA genes of an erythromycin-resistant Treponema pallidum clinical isolate. Antimicrob Agents Chemother 2000; 44: 806—807.
  15. Roberts M.C., Chung W.O., Roe D.E. Characterization of tetracycline and erythromycin resistance determinants in Treponema denticola. Antimicrob Agents Chemother 1996; 40 (7): 1690—1694.
  16. Roberts M.C. Update on acquired tetracycline resistance genes. FEMS Microbiol Lett 2005; 245 (2): 195—203.
  17. Norgard M.V., Miller J.N. Plasmid DNA in Treponema pallidum (Nichols): potential for antibiotic resistance by syphilis bacteria. Scince 1981; 213 (4507): 553—555.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Кубанова А.А., Кубанов А.А., Фриго Н.В., Волков И.А., Ротанов С.В., Суворова А.А., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».