First experience of molecular typing and determining the antibiotic resistance of syphilis pathogen Treponema pallidum in the Russian Federation


如何引用文章

全文:

详细

The authors present the results of molecular typing and determining the antibiotic resistance of 190 T. pallidum strains sampled from primary and secondary syphilitic patients in the russian Federation in 2011—2012. molecular typing of T. pallidum strains was based on two variable gens: arp, tpr, and was supplemented with an analysis of gene tp0548 reading frame. Antibiotic resistance of syphilis strains was determined by means of sequencing the gene encoding 23S rRNA T. pallidum in such loci as A2058G and A2059G/C (resistance to macrolides), gene encoding 16S rRNA T. pallidum in locus G1058C, and determinant tetB (resistance to tetracyclines) as well as full-scale sequencing the genes encoding target proteins of β-lactams Tp47 and Tromp. As a result of molecular typing in the territory of the Russian Federation, ten subtypes of T. pallidum were revealed. Type 14 (98.4%) predominates; the share of subtype 14d/f is 91.03%; the share of subtypes 14d/Tand 14b/f, Type 14, was 2.10 and 3.16%, respectively; the share of all other subtypes (11d/f, 13d/f, 14a/a, 14a/f, 14d/g, 14d/c, 20d/f) was 0.53%. molecular markers of T. pallidum antibiotic resistance were revealed among the strains coming from the Central, Siberian and Volga federal regions of Russia: macrolides - three strains sampled in 2011; tetracyclines - two strains sampled in 2011 and one strain sampled in 2012.

作者简介

A Kubanova

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology, Ministry of Healthcare of the Russian Federation

академик РАМН, д.м.н., профессор, директор Korolenko str. 3, bldg 6, Moscow, 107076, Russia

A Kubanov

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology, Ministry of Healthcare of the Russian Federation

д.м.н., профессор, заместитель директора Korolenko str. 3, bldg 6, Moscow, 107076, Russia

N Frigo

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology, Ministry of Healthcare of the Russian Federation

д.м.н., заместитель директора Korolenko str. 3, bldg 6, Moscow, 107076, Russia

I Volkov

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology, Ministry of Healthcare of the Russian Federation

к.б.н., старший научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней Korolenko str. 3, bldg 6, Moscow, 107076, Russia

S Rotanov

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology, Ministry of Healthcare of the Russian Federation

Email: rotanov@cnikvi.ru
д.м.н., доцент, главный научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней Korolenko str. 3, bldg 6, Moscow, 107076, Russia

A Suvorova

State Research Center of Dermatovenereology and Cosmetology, Ministry of Healthcare of the Russian Federation

младший научный сотрудник отдела лабораторной диагностики ИППП и кожных болезней Korolenko str. 3, bldg 6, Moscow, 107076, Russia

参考

  1. Pillay A., Liu H., Chen C.Y. et al. Molecular subtyping of Treponema pallidum subspecies pallidum. Sex Transm Dis 1998; 25: 408—414.
  2. Pillay A., Liu H., Ebrahim S. et al. Molecular typing of Treponema pallidum in South Africa: cross-sectional studies. J Clin Microbiol 2002; 40: 256—258.
  3. Marra C.M., Sahi S.K., Tantalo L.C. et al. Enhanced Molecular Typing of Treponema pallidum: Geographical Distribution of Strain Types and Association with Neurosyphilis. J Infect Dis 2010; 202 (9): 1380—1388.
  4. Peng R.R., Wang A.L., Li J. et al. Molecular Typing of Treponema pallidum: A systematic review and metaanalysis. PLoS Negl Trop Dis. 2011 (Nov); 5 (11): e1273.
  5. Martin I.E., Gu W., Yang Y., Tsang R.S. Macrolide resistance and molecular types of Treponema pallidum causing primary syphilis in Shanghai, China. Clin Infect Dis 2009; 49: 515—521.
  6. Sutton M.Y., Liu H., Steiner B. et al. Molecular subtyping of Treponema pallidum in an Arizona County with increasing syphilis morbidity: use of specimens from ulcers and blood. J Infect Dis 2001; 183: 1601—1606.
  7. Martin I.E., Tsang R.S., Sutherland K. et al. Molecular typing of Treponema pallidum strains in western Canada: predominance of 14d subtypes. Sex Transm Dis 2010; 37: 544—548.
  8. Molepo J., Pillay A., Weber B. et al. Molecular typing of Treponema pallidum strains from patients with neurosyphilis in Pretoria, South Africa. Sex Transm Infect 2007; 83: 189—192.
  9. Florindo C., Reigado V., Gomes J.P. et al. Molecular typing of Treponema pallidum clinicalstrains from Lisbon, Portugal. J Clin Microbiol 2008; 46 (11): 3802—3803.
  10. Cole M.J., Chisholm S.A., Palmer H.M. et al. Molecular epidemiology of syphilis in Scotland. Sex Transm Infect 2009; 85: 447—451.
  11. Приказ Минздрава России № 327 от 25.07.2003 «Об утверждении протокола ведения больных «Сифилис».
  12. Duncan W.C. Failure of erythromycin to cure secondary syphilis in a patient infected with the human immunodeficiency virus. Arch Dermatol 1989; 125: 82—84.
  13. Hashisaki P., Wertzberger G.G., Conrad G.L., Nichols C.R. Erythromycin failure in the treatment of syphilis in a pregnant woman. Sex Transm Dis 1983; 10: 36—38.
  14. Stamm L.V., Bergen H.L. A point mutation associated with bacterial macrolide resistance is present in both 23S rRNA genes of an erythromycin-resistant Treponema pallidum clinical isolate. Antimicrob Agents Chemother 2000; 44: 806—807.
  15. Roberts M.C., Chung W.O., Roe D.E. Characterization of tetracycline and erythromycin resistance determinants in Treponema denticola. Antimicrob Agents Chemother 1996; 40 (7): 1690—1694.
  16. Roberts M.C. Update on acquired tetracycline resistance genes. FEMS Microbiol Lett 2005; 245 (2): 195—203.
  17. Norgard M.V., Miller J.N. Plasmid DNA in Treponema pallidum (Nichols): potential for antibiotic resistance by syphilis bacteria. Scince 1981; 213 (4507): 553—555.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载

版权所有 © Kubanova A.A., Kubanov A.A., Frigo N.V., Volkov I.A., Rotanov S.V., Suvorova A.A., 2013

Creative Commons License
此作品已接受知识共享署名 4.0国际许可协议的许可

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».