Применение метода nucleic acid sequence-based amplification в реальном времени (nasba-real-time) для диагностики урогенитальной хламидийной инфекции

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Целью данного исследования явилась оценка метода NASBA-Real- Time (Nucleic Acid Sequence-Based Amplification в реальном времени) для диагностики урогенитальной хламидийной инфекции. Всего были обследованы 193 пациента в возрасте от 16 до 42 лет (средний возраст 22,8 года), при этом большинство из них имели симптомы урогенитальной инфекции. Соскобы эпителия цервикального канала у женщин и уретры у мужчин были исследованы методами культуры клеток, полимеразной цепной реакции (ПЦР) и NASBA-Real-Time. Хламидийная инфекция была диагностирована у 29 пациентов (15 %): у 21 из них хламидии были обнаружены всеми тремя методами, тогда как 8 проб были отрицательными

в культуре. Рассчитанная диагностическая чувствительность обоих молекулярных методов составила 100 %, культурального - 78,4 %. Прогностическая значимость отрицательных результатов для ПЦР и NASBA составила 100 %, для КК - 95,3 %. Специфичность, а также прогностическая значимость положительных результатов всех трех методов равнялась 100 %. Таким образом, новый тест на основе метода NASBA в реальном времени обладает высокой чувствительностью и специфичностью и может быть рекомендован в качестве подтверждающего метода для диагностики урогенитальной хламидийной инфекции.

Ключевые слова

Об авторах

Е. В. Шипицына

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии имени Д.О. Отта

Автор, ответственный за переписку.
Email: info@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

А. М. Савичева

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии имени Д.О. Отта

Email: info@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

Н. Е. Воробьева

Государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова

Email: info@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

Е. В. Соколовский

Государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова

Email: info@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

А. Е. Гущин

ФГУН Центральный Научно исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: info@eco-vector.com
Россия, Москва

П. Г. Рыжих

ФГУН Центральный Научно исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: info@eco-vector.com
Россия, Москва

Г. А. Шипулин

ФГУН Центральный Научно исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: info@eco-vector.com
Россия, Москва

П. Н. Кротин

Молодежный центр «Ювента»

Email: nfo@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

Л. В. Меркулова

Молодежный центр «Ювента»

Email: nfo@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

О. Ю. Ландина

Молодежный центр «Ювента»

Email: nfo@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. An Q., Radcliffe G., Vassallo R., et al. Infection with a plasmid- free variant of chlamydia related to Chlamydia trachomatis identified by using multiple assays for nucleic acid detection//J. Clin. Microbiol. - 1992. - Vol. 30. - P. 2814-2821.
  2. Battle T.J., Golden M.R., Suchland K.L., et al. Evaluation of laboratory testing methods for Chlamydia trachomatis infection in the era of nucleic acid amplification//J. Clin. Microbiol. - 2001. - Vol. 39. - P. 2924-2927.
  3. Black C.M., Marrazzo J., Jonson R.E., et al. Head-to-head multicenter comparison of DNA probe and nucleic acid amplification tests for Chlamydia trachomatis infection in women performed with an improved reference standard//J. Clin. Microbiol. — 2002. - Vol. 40. - P. 3757-3763.
  4. Deiman B., van Aarle P., Sillekens P. Characteristics and applications of nucleic acid sequence-based amplification (NASBA)//Mol. Biotech. - 2002. - Vol. 20. - P. 163-179.
  5. Johnson R.E., Newhall W.J., Papp J.R., et al. Screening tests to detect Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae infections//Morbid. Mortal. Weekly Reports. - 2002. - Vol. 51 (RR-15). - P. 1-38.
  6. Leone G., van Schijndel H., van Gemen B., et al. Molecular beacon probes combined with amplification by NASBA enable homogeneous, real-time detection of RNA//Nucleic Acids Res. - 1998. - Vol. 26. - P. 2150-2156.
  7. Mahony J.B., Song X., Chong S., et al. Evaluation of the NucliSens Basic kit for detection of Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae in genital tract specimens using nucleic acid sequence-based amplification of 16S rRNA//J. Clin. Microbiol. - 2001. - Vol. 39. - P. 1429- 1435.
  8. McAdam A.J. Discrepant analysis: how can we test a test?//J. Clin. Microbiol. - 2000. - Vol. 43. - P. 2027-2029.
  9. Morre S., Sillekens P., Jacobs M.V., et al. RNA amplification by nucleic acid sequence-based amplification with an internal standard enables reliable detection of Chlamydia trachomatis in cervical scrapings and urine samples//J. Clin. Microbiol. - 1996. - Vol. 34. - P. 3108-3114.
  10. Newhall W.J., Johnson R.E., Delisle S. et al. Head-to-head evaluation of five Chlamydia tests relative to a quality-assured culture standard//J. Clin. Microbiol. - 1999. - Vol. 37. - P. 681-685.
  11. Stary A. Diagnosis of genital chlamydial infections in the era of amplification technologies//In: Proceedings of the Fifth Meeting of the Society for Chlamydia Research (Deak J. ed.). - Budapest: University of Szeged. - 2004. - P. 61-63.
  12. Weusten J.J., Carpay W.M., Oosterlaken T. et al. Principles of quantification of viral load using Nucleic Acid Sequence-Based Amplification in combination with homogeneous detection using molecular beacons//Nucleic Acids Res. - 2002. - Vol. 30.-P. 6-26.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО «Эко-Вектор», 2005



Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».