MOLECULAR-GENETIC ANALYSIS OF THE DIP1 REGULATOR GENE IN VARIOUS SPECIES OF DROSOPHILA


Cite item

Full Text

Abstract

The DIP1 is a regulator gene of D. melanogaster with an unknown function. As a result of mRNA alternative splicing, at least 6 coding sequences are formed (DIP1-c/Klett-c, DIP1-b/ Klett-d, DIP1-d, DIP1-а, Klett-a, and Klett-b). Structure and expression of DIP1 homologues in various species of the melanogaster subgroup, such as D. melanogaster, D. sechellia, D. mauritiana, D. simulans, D. erecta,and D. yakuba, have been analyzed. In D. sechellia, D. simulans, and D. mauritiana we found alterations, which affected expression of the DIP1 homologues in contrast to D. melanogaster, D. erecta, and D. yakuba. These alterations have to do with splicing of the first alternative exon. It has been demonstrated that DIP1 homologues of D. sechellia, D. simulans and D. mauritiana do not code for Klett-а and Klett b forms.

About the authors

Lidiya N Nefedova

M.V. Lomonosov Moscow State University , Moscow, RF

Email: lidia_nefedova@mail.ru

Dmitry O Korostin

M.V. Lomonosov Moscow State University , Moscow, RF

Maria V Potapova

M.V. Lomonosov Moscow State University , Moscow, RF

Email: maria_potapova@mail.ru

Natalia I Romanova

M.V. Lomonosov Moscow State University , Moscow, RF

Alexander I Kim

M.V. Lomonosov Moscow State University , Moscow, RF

Email: aikim57@mail.ru

References

  1. Ким А. И., Беляева Е. С., Ларкина З. Г., Асланян М. М., 1989. Генетическая нестабильность и транспозиции мобильного элемента GYPSY (МДГ4) в мутаторной линии Drosophila melanogaster//Генетика. Т. 25. № 10. С. 1747-1756.
  2. Нефедова Л. Н., Романова Н. И., Ким А. И., 2007. Особенности структурной организации гена DIP1 в линиях Drosophila melanogaster, мутантных по гену flamenco//Генетика. №. 1. Т. 43. С. 71-78.
  3. Nefedova L. N., Romanova N. I., Kim A. I. Structural organization characteristics of the DIP1 gene in Drosophila melanogaster strains mutant for the flamenco gene//Russian journal Genetika. 2007. Vol. 43. N 1. P. 56-63.
  4. Bondos S. E., Catanese D. J. Jr., Tan X. X. et al., 2004. Hox transcription factor ultrabithorax Ib physically and genetically interacts with disconnected interacting protein 1, a double-stranded RNA-binding protein//J. Biol. Chem. Vol. 279. N 25. P. 26433-26444.
  5. De Felice B., Wilson R. R., Mondola P. et al., 2003. Characterization of DIP1, a novel nuclear protein in Drosophila melanogaster//Biochem. Biophys. Res. Commun. Vol. 307. N 2. P. 224-228.
  6. DeSousa D., Mukhopadhyay M., Pelka P. et al., 2003. A novel double-stranded RNA-binding protein, disco interacting protein 1 (DIP1), contributes to cell fate decisions during Drosophila development//J. Biol. Chem. Vol. 278. N 39. P. 38040-38050.
  7. Feschotte C., 2008. Transposable elements and the evolution of regulatory networks//Nat. Rev. Genet. Vol. 9. N 5. P. 397-405.
  8. Jeffs P. S., Holmes E. C., Ashburner M., 1994. The molecular evolution of the alcohol dehydrogenase and alcohol dehydrogenase-related genes in the Drosophila melanogaster species group//Mol. Biol. Evol. Vol. 11. N 2. Р. 287-304.
  9. Krauss V., O'Grady M., Hoffmann J. et al., 2001. KLETT, a drosophila chromatin protein with dsRNAbinding motifs interacts with the heterochromatin-associated SU(VAR)3-9 protein//17th Europ. Dros. Res. Conf. Book of abstracts. Scotland. P. 8.
  10. Lee K. J., Mukhopadhyay M., Pelka P. et al., 1999. Disconnected: a locus required for neuronal pathway formation in the visual system of Drosophila//Dev. Biol. Vol. 214. P. 385-398.
  11. Prudhomme N., Gans M., Terzian C. et al., 1995. Flamenco, a gene controlling the gypsy retrovirus of Drosophila melanogaster//Genetics. Vol. 139. P. 697-711.
  12. Robert V., Prud'homme N., Kim A. et al., 2001. Characterization of the flamenco region of the Drosophila melanogaster genome//Genetics. Vol. 158. P. 701-713.
  13. Saunders L. R., Barber G. N., 2003. The dsRNA binding protein family: critical roles, diverse cellular functions//FASEB J. Vol. 17. N 9. P. 961-983.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2009 Nefedova L.N., Korostin D.O., Potapova M.V., Romanova N.I., Kim A.I.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».