Рандомизированное машинное обучение и прогнозирование нелинейных динамических моделей c применением к эпидемиологической модели SIR

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В работе предлагается подход к оцениванию параметров нелинейных динамических моделей с помощью концепции Рандомизированного машинного обучения (РМО), основанной на переходе от детерминированных моделей к случайным (со случайными параметрами) с последующим оцениванием вероятностных распределений параметров и шумов по реальным данным. Главной особенностью данного метода является его эффективность в условиях малого количества реальных данных. В работе рассматриваются модели, сформулированные в терминах обыкновенных дифференциальных уравнений, которые преобразуются к дискретному виду для постановки и решения задачи энтропийной оптимизации. Применение предлагаемого подхода демонстрируется на задаче прогнозирования общего количества инфицированных COVID-19 с помощью динамическойэпидемиологической модели SIR. Для этого в работе строится рандомизированная модель SIR (R-SIR) с одним параметром, энтропийно-оптимальная оценка которого реализуется его функцией плотности распределения вероятностей, а также функциями плотности распределения вероятностей измерительных шумов в точках, в которых производится обучения. Далее применяется техника рандомизированного прогнозирования с фильтрацией шумов, основанная на генерации соответствующих распределений и построении ансамбля прогнозных траекторий с вычислением средней по ансамблю траектории. В работе реализуется вычислительный эксперимент с использованием реальных оперативных данных о заболеваемости в виде сравнительного исследования с известным методом оценивания параметров модели, основанным на методе наименьших квадратов. Полученные в эксперименте результаты демонстрируют существенное снижение средне-абсолютной процентной ошибки (MAPE) при по отношению к реальным наблюдениям на интервале прогноза, что показывают работоспособность предложенного метода и его эффективность в задачах рассматриваемого в работе типа.

Об авторах

А. Ю Попков

Федеральный исследовательский центр «Информатика и управление» Российской академии наук

Email: apopkov@isa.ru
улица Вавилова 44-2

Ю. А Дубнов

Федеральный исследовательский центр «Информатика и управление» Российской академии наук

Email: yury.dubnov@phystech.edu
улица Вавилова 44-2

Ю. С Попков

Федеральный исследовательский центр «Информатика и управление» Российской академии наук

Email: popkov@isa.ru
улица Вавилова 44-2

Список литературы

  1. Попков Ю.С., Дубнов Ю.А., Попков А.Ю. Прогнозирование развития эпидемии COVID-19 в странах Европейского союза с использованием энтропийно-рандомизированного подхода // Информатика и автоматизация, 2021, Т. 20, №5, c. 1010-1033, https://doi.org/10.15622/ia.20.5.1.
  2. van den Driessche P. Mathematical Epidemiology / ed. by Brauer F., van den Driessche P., Wu J. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2008. Vol. 1945 of Lecture Notes in Mathematics. P. 147–157. https://doi.org/10.1007/978-3-540-78911-6.
  3. Айвазян С.А., Мхитарян В.С. Прикладная статистика и основы эконометрики.— М.:Юнити, 1998.
  4. Лагутин М.Б. Наглядная математическая статистика. — Бином. Лаб. знаний, 2013.
  5. Боровков А.А. Математическая статистика. — М.:Наука, 1984.
  6. Bishop C. Pattern Recognition and Machine Learning (Information Science and Statistics), 2006. Springer, New York, 2006.
  7. Hastie T., Tibshirani R., Friedman J. The Elements of Statistical Learning: Data mining, Inference, and Prediction. Springer New York, 2009.
  8. Мерков А.Б. Распознавание образов. Введение в методы статистического обучения. М. : URSS, 2010.
  9. Попков Ю.С., Попков А.Ю., Дубнов Ю.А. Рандомизированное машинное обучение при ограниченных наборах данных: от эмпирической вероятности к энтропийной рандомизации. — М.: ЛЕНАНД, 2019. ISBN: 978-5-9710-5908-0.
  10. Попков Ю.С., Дубнов Ю.А. Энтропийно-робастное рандомизированное прогнозирование при малых объемах ретроспективных данных // Автоматика и телемеханика. 2016. № 5. С. 109–127.
  11. Попков А.Ю. Рандомизированное машинное обучение нелинейных моделей с применением к прогнозированию развития эпидемического процесса // Автоматика и телемеханика. 2021. № 6. С. 149–168. https://doi.org/10.31857/S0005231021060064.
  12. Popkov Y.S., Dubnov Y.A., Popkov A.Y. Introduction to the Theory of Randomized Machine Learning // Learning Systems: From Theory to Practice / ed. by Sgurev V., Piuri V., Jotsov V. Cham: Springer International Publishing, 2018. P. 199–220. ISBN: 978-3-319-75181-8. https://doi.org/10.1007/978-3-319-75181-8_10.
  13. Попков Ю.С., Попков А.Ю., Дубнов Ю.А. Элементы рандомизированного прогнозирования и его применение для предсказания суточной электрической нагрузки энергетической системы // Автоматика и телемеханика. 2020. С. 148–172. https://doi.org/10.1134/S0005231019070107.
  14. Kermack W.O., McKendrick A.G. Contributions to the Mathematical Theory of Epidemics // Proceedings of the Royal Society. 1927. Vol. 115A. P. 700–721.
  15. Muller G.R. Zeitschrift f¨ur allgemeine Mikrobiologie / In: The Population Dynamics of Infectious Diseases: Theory and Applications. 368 S., 135 Abb., 104 Tab. London-New York, Chapman and Hall, 1984, Vol. 24, no. 2. pp. 76–76. https://doi.org/10.1002/jobm.19840240203.
  16. Hethcote H.W. Three Basic Epidemiological Models // Applied Mathematical Ecology. Springer Berlin Heidelberg, 1989. pp. 119–144. https://doi.org/10.1007/978-3-642-61317-3_5.
  17. Peng L., Yang W., Zhang D., Zhuge C., Hong L. Epidemic analysis of COVID-19 in China by dynamical modeling // arXiv, 2020. 10.48550/ARXIV.2002.06563.
  18. Yang W., Zhang D., Peng L., Zhuge C., Hong L. Rational evaluation of various epidemic models based on the COVID-19 data of China // Epidemics, 2021. Vol. 37. p. 100501. https://doi.org/10.1016/j.epidem.2021.100501.
  19. Cheng C., Zhang D., Dang D., Geng J., Zhu P., Yuan M., Liang R., Yang H., Jin Y., Xie J., Chen S., Duan G. The incubation period of COVID-19: a global meta-analysis of 53 studies and a Chinese observation study of 11 545 patients // Infectious Diseases of Poverty, 2021. Vol. 10, no. 1. https://doi.org/10.1186/s40249-021-00901-9.
  20. Huang S., Li J., Dai C., Tie Z., Xu J., Xiong X., Hao X., Wang Z., Lu C. Incubation period of coronavirus disease 2019: New implications for intervention and control // International Journal of Environmental Health Research, 2021. P. 1–9. https://doi.org/10. 1080/09603123.2021.1905781.
  21. Li Q. et al. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus — Infected Pneumonia // New England Journal of Medicine, 2020. Vol. 382, no. 13. P. 1199–1207. https://doi.org/10.1056/nejmoa2001316.
  22. Nie X. et al. Epidemiological Characteristics and Incubation Period of 7015 Confirmed Cases With Coronavirus Disease 2019 Outside Hubei Province in China // The Journal of Infectious Diseases, 2020. Vol. 222, no. 1. pp. 26–33. https://doi.org/10.1093/infdis/jiaa211.
  23. Guidotti E., Ardia D. COVID-19 Data Hub // Journal of Open Source Software. 2020. Vol. 5, no. 51. P. 2376. https://doi.org/10.21105/joss.02376.
  24. COVID-19 Data Hub. https://www.covid19datahub.io. 2021. Accessed: 2022-06-20.
  25. Флах П. Наука и искусство построения алгоритмов, которые извлекают знания из данных. ДМК Пресс, 2015.
  26. Rubinstein R.Y., Kroese D.P. Simulation and the Monte Carlo method. John Wiley & Sons, 2007. Vol. 707.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».