New cellular partners of HIV-1 integrase and their role in viral replication

Мұқаба

Дәйексөз келтіру

Толық мәтін

Ашық рұқсат Ашық рұқсат
Рұқсат жабық Рұқсат берілді
Рұқсат жабық Тек жазылушылар үшін

Аннотация

Cellular proteins, partners of viral enzymes, are involved in the replication of the human immunodeficiency virus type I (HIV-1) at various stages. Thus, the viral enzyme integrase, participating in several stages of the viral cycle, interacts with various cellular proteins. A number of them are already known, and for some the mechanism of action has been established, but the search for integrase cellular partners continues. In this work, the identification of cellular partners of HIV-1 integrase has been carried out by the cross-linking method followed by mass spectrometry (XL-MS). Twelve new potential integrase partners have been identified, and some of them have been examined for their effect on the early stages of HIV-1 replication.

Авторлар туралы

Y. Agapkina

Lomonosov Moscow State University, Department of Chemistry; Lomonosov Moscow State University, A.N. Belozersky Research Institute of Physico-Chemical Biology

Email: agapkina@belozersky.msu.ru
Moscow, Russian Federation; Moscow, Russian Federation

T. Ponomareva

Lomonosov Moscow State University, A.N. Belozersky Research Institute of Physico-Chemical Biology

Email: agapkina@belozersky.msu.ru
Moscow, Russian Federation

M. Vdovina

Lomonosov Moscow State University, Department of Chemistry

Email: agapkina@belozersky.msu.ru
Moscow, Russian Federation

R. Ziganshin

Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry

Email: agapkina@belozersky.msu.ru
Moscow, Russian Federation

A. Rozina

Lomonosov Moscow State University, A.N. Belozersky Research Institute of Physico-Chemical Biology

Email: agapkina@belozersky.msu.ru
Moscow, Russian Federation

A. Anisenko

Lomonosov Moscow State University, Department of Chemistry; Lomonosov Moscow State University, A.N. Belozersky Research Institute of Physico-Chemical Biology

Email: agapkina@belozersky.msu.ru
Moscow, Russian Federation; Moscow, Russian Federation

M. Gottikh

Lomonosov Moscow State University, Department of Chemistry; Lomonosov Moscow State University, A.N. Belozersky Research Institute of Physico-Chemical Biology

Хат алмасуға жауапты Автор.
Email: agapkina@belozersky.msu.ru
Moscow, Russian Federation; Moscow, Russian Federation

Әдебиет тізімі

  1. Fauci A.S. HIV and AIDS: 20 years of science // Nat Med. 2003. V. 9. № 7. P. 839–843.
  2. Lingappa J.R., Lingappa V.R., Reed J.C. Addressing Antiretroviral Drug Resistance with Host-Targeting Drugs-First Steps towards Developing a Host-Targeting HIV-1 Assembly Inhibitor // Viruses. 2021. V. 13. № 3. P. 451.
  3. Jäger S., Cimermancic P., Gulbahce N., et al. Global landscape of HIV-human protein complexes // Nature. 2011. V. 481. № 7381. P. 365–370.
  4. Schynkel T., Snippenberg W.V., Verniers K., et al. Interactome of the HIV-1 proteome and human host RNA // EMBO ReP. 2024. V. 25. P. 4078–4090.
  5. Delelis O., Carayon K., Saïb A., et al. Integrase and integration: biochemical activities of HIV-1 integrase // Retrovirology. 2008. V. 5. P. 114.
  6. Engelman A.N. and Maertens G.N. Retrovirus-Cell Interactions. Academic Press, San Diego, CA, P. 163–198. 2018.
  7. Rozina A., Anisenko A., Kikhai T., et al. Сomplex Relationships between HIV-1 Integrase and Its Cellular Partners // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 12341.
  8. Engelman A.N. and Kvaratskhelia M. Multimodal Functionalities of HIV-1 Integrase // Viruses. 2022. V. 14. P. 926.
  9. Ciuffi A., Llano M., Poeschla E., et al. A role for LEDGF/p75 in targeting HIV DNA integration // Nat Med. 2005. V. 11. P. 1287–1289.
  10. Yamamoto S.P., Okawa K., Nakano T., et al. Huwe1, a novel cellular interactor of Gag-Pol through integrase binding, negatively influences HIV-1 infectivity // Microbes Infect. 2011. V. 13. № 4. P. 339–349.
  11. Allouch A., Di Primio C., Alpi E., et al. The TRIM family protein KAP1 inhibits HIV-1 integration // Cell Host Microbe. 2011. V. 9. P. 484–495.
  12. Ait-Ammar A., Bellefroid M., Daouad F., et al. Inhibition of HIV-1 gene transcription by KAP1 in myeloid lineage // Sci ReP. 2021. V. 11. P. 2692.
  13. Hearps A.C., Jans D.A. HIV-1 integrase is capable of targeting DNA to the nucleus via an Importin α/β-dependent mechanism // Biochemical Journal. 2006. V. 398. № 3. P. 475–484. doi: 10.1042/bj20060466
  14. Dziuba N., Ferguson M.R., O’Brien W.A., et al. Identification of cellular proteins required for replication of human immunodeficiency virus type 1 // AIDS Res Hum Retroviruses. 2012. V. 28. P. 1329–1339.
  15. Yoder A., Yu D., Dong L., et al. HIV envelope-CXCR4 signaling activates cofilin to overcome cortical actin restriction in resting CD4 T cells // Cell. 2008. V. 134. P. 782–792.
  16. Speth C., Prohászka Z., Mair M., et al. A 60 kD heat-shock protein-like molecule interacts with the HIV transmembrane glycoprotein gp41 // Mol Immunol. 1999. V. 36. № 9. P. 619–628.
  17. Ha H.C., Juluri K., Zhou Y., et al. Poly(ADP-ribose) polymerase-1 is required for efficient HIV-1 integration // Proc Natl Acad Sci USA. 2001. V. 98. P. 3364–3368.
  18. Bueno M.T., Reyes D., Valdes L., et al. Poly(ADP-ribose) polymerase 1 promotes transcriptional repression of integrated retroviruses // J Virol. 2013. V. 87. № 5. P. 2496–2507.
  19. Ramakrishnan R., Liu H., Donahue H., et al. Identification of novel CDK9 and Cyclin T1-associated protein complexes (CCAPs) whose siRNA depletion enhances HIV-1 Tat function // Retrovirology. 2012. V. 9. P. 90.
  20. Knyazhanskaya E., Anisenko A., Shadrina O., et al. NHEJ pathway is involved in post-integrational DNA repair due to Ku70 binding to HIV-1 integrase // Retrovirology. 2019. V. 16. № 1. P. 30.

Қосымша файлдар

Қосымша файлдар
Әрекет
1. JATS XML
Жүктеу

© Russian Academy of Sciences, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».