Комплекс TREX-2-ORC D. melanogaster участвует в ядерном экспорте МРНК гистонов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Белковый комплекс TREX-2-ORC D. melanogaster необходим для экспорта большей части синтезирующихся молекул поли(А)-содержащей мРНК из ядра в цитоплазму через ядерные поры. Однако, роль данного комплекса в экспорте других групп РНК остается неизвестным. Нами показано, что TREX-2-ORC участвует в ядерном экспорте мРНК гистонов: он ассоциирован с мРНП частицами гистонов, связывается с мРНК гистона H3 в 3’-концевой части кодирующей области и участвует в экспорте мРНК гистонов из ядра в цитоплазму.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

М. М. Куршакова

Институт Молекулярной Биологии им. В. А. Энгельгардта Российской Академии Наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: kursha@mail.ru
Россия, Москва

Ю. А. Якушева

Институт Молекулярной Биологии им. В. А. Энгельгардта Российской Академии Наук

Email: kursha@mail.ru
Россия, Москва

С. Г. Георгиева

Институт Молекулярной Биологии им. В. А. Энгельгардта Российской Академии Наук

Email: kursha@mail.ru

академик РАН

Россия, Москва

Список литературы

  1. Fischer T., Strasser K., Racz A., et al. // The EMBO journal. 2002. V. 21. № 21. P. 5843–5852.
  2. Rodríguez-Navarro S., Fischer T., Luo M. J., et al. // Cell. 2004. V. 116. № 1. P. 75–86.
  3. Jani D., Lutz S., Hurt E., et al. // Nucleic acids research. 2012. V. 40. № 10. P. 4562–4573.
  4. Jani D., Lutz S., Marshall N. J., et al. // Molecular cell. 2009. V. 33. № 6. P. 727–737.
  5. Ellisdon A. M., Dimitrova L., Hurt E. and Stewart M. // Nature structural & molecular biology. 2012. V. 19. № 3. P. 328–336.
  6. Dimitrova L., Valkov E., Aibara S., et al. // Structure. 2015. V. 23. № 7. P. 1246–1257.
  7. Jani D., Valkov E., Stewart M. // Nucleic acids research. 2014. V. 42. № 10. P. 6686–6697.
  8. Kurshakova M. M., Krasnov A. N., Kopytova D. V., et al. // The EMBO journal. 2007. V. 26. № 24. P. 4956–4965.
  9. Kopytova D., Popova Vol., Kurshakova M., et al. // Nucleic acids research. 2016. V. 44. № 10. P. 4920–4933.
  10. Bleichert F. // Current opinions in structural biology. 2019. V. 59. P. 195–204.
  11. Popova Vol., Brechalov A. // Nonreplicative functions of the origin recognition complex. 2018. V. 9. P. 460–473.
  12. Duronio R. J., Marzluff W. F. // RNA biology. 2017. V. 14. № 6. P. 726–738.
  13. Sun Y., Zhang Y., Aik W. S., et al. // Science. 2020b. V. 367. P. 700–703.
  14. Huang Y., Gattoni R., Stevenin J. and Steitz J. A. // Molecular Cell. 2003. V. 11. P. 837–843.
  15. Erkmann J. A., Sanchez R., Treichel N., et al. // RNA. 2005. V. 11. P. 45–58.
  16. Popova Vol.V., Georgieva S. G., Kopytova D. V. // Biochemistry and molecular biology journal. 2016. V. 2. P. 2–14.
  17. Куршакова М. М., Копытова Д. В., Георгиева С. Г. // Доклады АН. 2021. Т. 496. С. 66–69.
  18. Huang Y., Steitz J. A. // Molecular Cell. 2001. V. 7. P. 899–905.
  19. Fan J., Wang K., Du X., et al. // The EMBO Journal. 2019.
  20. Kopytova D. V., Orlova A. V., Krasnov A. N., et al. // Genes and Development. 2009. V. 24. P. 86–96.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис.1. TREX-2-ORC ассоциирован с мРНК гистонов. (а) Результаты иммуноосаждения мРНП частиц генов H2A, H3 и β-tubulin антителами к субъединицам TREX-2-ORC, в качестве отрицательного контроля использованы IgG. Результаты представлены в процентах от исходного материала. Все данные представлены как среднее ± стандартное отклонение, для сравнения контроля и эксперимента использовался t-критерий Стьюдента. (*) указывает на статистическую значимость с p-value <0.05, (**) указывает на статистическую значимость с p-value < 0.01. (б) Вестерн-блот анализ сосаждения H3 мРНП частиц с биотинилированным антисмысловым РНК-зондом к мРНК гистона H3 с использованием антител к Xmas-2, PCID2, ENY2, Orc3, Orc6, CPSF100, CPSF73. В отрицательном контроле (K-) использован РНК-зонд с антисмысловой последовательностью к РНК белка YFP. (в) Вестерн-блот анализ соосаждения белков с биотинилированными смысловыми РНК-зондами к последовательностям мРНК гистона H3: полноразмерной (H3), CDS1, CDS2, 3’UTR, с использованием антител к Xmas-2, PCID2, ENY2, Orc3, Orc6, CPSF100, CPSF73. В отрицательном контроле (K-) использован РНК-зонд с антисмысловой последовательностью к РНК YFP.

Скачать (469KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Эффект нокдауна субъединиц TREX-2-ORC на экспорт мРНК гистонов. (а) Вестер-блот анализ уровней экспрессии белков при РНК-интереференциях Xmas-2, Orc3 в S2 клетках при помощи соответствующих антител. В качестве выравнивающего контроля использовано окрашивание антителами к ламину Dm0. (б) Результаты им- муноосаждения мРНП частиц гистонов при РНК-интереференции Xmas-2 c антителами к субъединицам TREX-2- ORC, в качестве отрицательного контроля использованы IgG. Результаты представлены в процентах от исходного материала. Все данные представлены как среднее ± стандартное отклонение, для сравнения контроля и экспе- римента использовался t-критерий Стьюдента. (*) указывает на статистическую значимость c p-value < 0.05, (**) указывает на статистическую значимость c p-value<0.01. (в) Вестерн-блот анализ РНК-интереференций Xmas-2, Orc3, NXF1 с использованием антител к одноименным белкам. В качестве выравнивающего контроля использова- но окрашивание антителами к ламину Dm0. (г) FISH-гибридизация с антисмысловой РНК-пробой к H3 мРНК при РНК-интереференциях (РНКи) Xmas-2, Orc3, NXF1 в S2 клетках. В качестве отрицательного контроля (Контроль) проведена РНК-интерференция c дцРНК белка GFP. (д) Доля S2-клеток с нарушениями экспорта H3 мРНК при нокдаунах Xmas-2, Orc3, NXF1 или GFP (Контроль).

Скачать (683KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».