Search and verification of Betula nana L. hybrid samples in the Urals

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Using the flow cytometry method, hybrid samples were verified in B. nana populations, most of which were identified in the northern part of the Ural Mountains. Analysis of the ITS1 region nucleotide sequences obtained using the Sanger method showed low differentiation of B. nana and B. pubescens species associated with current and ancestral hybridization processes. Analysis of intragenomic polymorphism of ITS1 sequences using Illumina technology revealed the presence of rDNA of both B. nana and B. pubescens in first-generation interspecific hybrids genome.

About the authors

S. O. Medvedeva

Botanical Garden, UrB RAS, Ekaterinburg, Russian Federation

Email: so.medvedeva@gmail.com

O. E. Cherepanova

Botanical Garden, UrB RAS, Ekaterinburg, Russian Federation

I. V. Petrova

Botanical Garden, UrB RAS, Ekaterinburg, Russian Federation

A. Y. Teptina

Ural Federal University, Ekaterinburg, Russian Federation

References

  1. Медведева С.О., Черепанова О.Е. Таксономические вопросы рода Betula // Сибирский лесной журнал. 2023. № 2. C. 65–75
  2. Anamthawat-Jónsson, K. Hybrid introgression: the outcomes of gene flow in birch // ScienceAsia. 2019. V.45. No. 3. P. 203
  3. Cherepanova O., Medvedeva S., Filippov E. et al. Biodiversity Evolution of a Shrub Betula nana L. Populations in the Urals // International Journal of Forestry Research. 2024. 2644583.
  4. White T.J., Bruns T., Lee S., et al. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis M.A., Gelfland D.H., Sninsky J.J., White T.J., eds. PCR protocols: a guide to methods and applications. New York: Academic Press, 1990.
  5. Callahan B.J., McMurdie P.J., Rosen M.J., et al. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data // Nature Methods. 2016. No. 13.
  6. Anamthawat-Jónsson K., Thórsson T., Temsch E. M. et al. Icelandic Birch Polyploids — The Case of a Perfect Fit in Genome Size // Journal of Botany. 2010. 347254.
  7. Jetlund S. Introgressive hybridization between the birch species (Betula pubescens ssp. tortuosa) and Betula nana in the mountains in Gudbrandsdalen, Norway // Norw J Agr Sci. 1994. No. 18, P. 15–18.
  8. Wang N., McAllister H.A., Bartlett P.R. et al. Molecular phylogeny and genome size evolution of the genus Betula (Betulaceae) // Ann Bot-London. 2016. No. 117
  9. Sun K., Ma R., Chen X., Li C. et al. Hybrid origin of the diploid species Hippophae goniocarpa evidenced by the internal transcribed spacers (ITS) of nuclear rDNA // Belg. J. Bot. 2013. V.136. No. 1. P. 91-96
  10. Osuna-Mascaro C., de Casas R. R., Berbel M., et al. Lack of ITS sequence homogenization in congeneric plant species with different ploidy levels // bioRxiv. 2022.
  11. Пунина Е.О., Мачс Э.М., Носов Н.Н., и др. NGS-секвенирование (Illumina) как инструмент для определения геномного состава и таксономической принадлежности видов и межвидовых гибридов на примере злаков трибы Ячменевых (Hordeeae) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2023. Т. 22, № 2. С. 276–286
  12. Belyakov E.A., Mikhaylova Y.V., Machs E.M., et al. Hybridization and diversity of aquatic macrophyte Sparganium L. (Typhaceae) as revealed by high-throughput nrDNA sequencing // Scientific Reports. 2022. V. 12. No. 1. P. 21610.
  13. Turchetto C., Segatto A.L., Beduschi J., Bonatto S.L., Freitas L.B. Genetic differentiation and hybrid identification using microsatellite markers in closely related wild species // AoB Plants. 2015. V. 7.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».