Identification of a highly conserved region critical for the functionality of the CP190 protein in Drosophila melanogaster

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

The CP190 protein binds to both housekeeping gene promoters and insulator/boundary elements and plays a critical role in their activity. The aim of this work was to study the effect of deletions in highly conserved regions of the CP190 protein on its functionality. It was shown that deletion of the sequence from 664 to 700 aa leads to a lethal phenotype. Thus, a new region was identified in CP190 that plays an important role in the interaction of the CP190 protein with as yet unidentified partner proteins, stabilization of protein complexes formed by CP190 and their recruitment to chromatin.

作者简介

L. Melnikova

Institute of Gene Biology, Russian Academy of Sciences

Email: lsm73@mail.ru
Moscow, Russian Federation

K. Balagurov

Institute of Gene Biology, Russian Academy of Sciences

Email: lsm73@mail.ru
Moscow, Russian Federation

P. Georgiev

Institute of Gene Biology, Russian Academy of Sciences

Email: lsm73@mail.ru
Moscow, Russian Federation

A. Golovnin

Institute of Gene Biology, Russian Academy of Sciences

Email: lsm73@mail.ru
Moscow, Russian Federation

参考

  1. Uyehara C.M., Apostolou E. 3D enhancer-promoter interactions and multi-connected hubs: Organizational principles and functional roles // Cell Rep. 2023. P. 112068.
  2. Karpinska M.A., Oudelaar A.M. The role of loop extrusion in enhancer-mediated gene activation // Curr Opin Genet Dev. 2023. V. 79. P. 102022.
  3. Serebreni L., Stark A. Insights into gene regulation: From regulatory genomic elements to DNA-protein and protein-protein interactions // Curr Opin Cell Biol. 2021. V. 70. P. 58–66.
  4. Vo Ngoc L., Kassavetis G.A., Kadonaga J.T. The RNA Polymerase II Core Promoter in Drosophila // Genetics. 2019. V. 212. № 1. P. 13–24.
  5. Kyrchanova O.V., Bylino O.V., Georgiev P.G. Mechanisms of enhancer-promoter communication and chromosomal architecture in mammals and Drosophila // Front Genet. 2022. V. 13. P. 1081088.
  6. Maharjan M., McKowen J.K., Hart C.M. Overlapping but Distinct Sequences Play Roles in the Insulator and Promoter Activities of the Drosophila BEAF-Dependent scs’ Insulator // Genetics. 2020. V. 215. № 4. P. 1003–1012.
  7. Bartkuhn M., Straub T., Herold M., et al. Active promoters and insulators are marked by the centrosomal protein 190 // EMBO J. 2009. V. 28. № 7. P. 877–88.
  8. Plevock K.M., Galletta B.J., Slep K.C., et al. Newly Characterized Region of CP190 Associates with Microtubules and Mediates Proper Spindle Morphology in Drosophila Stem Cells // PLoS One. 2015. V. 10. № 12. P. e0144174.
  9. Oliver D., Sheehan B., South H., et al. The chromosomal association/dissociation of the chromatin insulator protein Cp190 of Drosophila melanogaster is mediated by the BTB/POZ domain and two acidic regions // BMC cell biology. 2010. V. 11. P. 101.
  10. Bonchuk A., Balagurov K., Georgiev P. A structural view of evolution, multimerization, and protein-protein interactions // Bioessays. 2023. V. 45. № 2. P. e2200179.
  11. Sabirov M., Kyrchanova O., Pokholkova G.V., et al. Mechanism and functional role of the interaction between CP190 and the architectural protein Pita in Drosophila melanogaster // Epigenetics Chromatin. 2021. V. 14. № 1. P. 16.
  12. Kyrchanova O., Klimenko N., Postika N., et al. Drosophila architectural protein CTCF is not essential for fly survival and is able to function independently of CP190 // Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2021. V. 1864. № 10. P. 194733.
  13. Melnikova L., Kostyuchenko M., Molodina V., et al. Interactions between BTB domain of CP190 and two adjacent regions in Su(Hw) are required for the insulator complex formation // Chromosoma. 2018. V. 127. № 1. P. 59–71.
  14. Golovnin A., Melnikova L., Babosha V., et al. The N-Terminal Part of Drosophila CP190 Is a Platform for Interaction with Multiple Architectural Proteins // Int J Mol Sci. 2023. V. 24. № 21. P. 15917.
  15. Bag I., Chen S., Rosin L.F., et al. M1BP cooperates with CP190 to activate transcription at TAD borders and promote chromatin insulator activity // Nat Commun. 2021. V. 12. № 1. P. 4170.
  16. Bohla D., Herold M., Panzer I., et al. A functional insulator screen identifies NURF and dREAM components to be required for enhancer-blocking // PLoS One. 2014. V. 9. № 9. P. e107765.
  17. Kwon S.Y., Grisan V., Jang B., et al. Genome-Wide Mapping Targets of the Metazoan Chromatin Remodeling Factor NURF Reveals Nucleosome Remodeling at Enhancers, Core Promoters and Gene Insulators // PLoS Genet. 2016. V. 12. № 4. P. e1005969.
  18. Ali T., Krüger M., Bhuju S., et al. Chromatin binding of Gcn5 in Drosophila is largely mediated by CP190 // Nucleic Acids Res. 2017. V. 45. № 5. P. 2384–2395.
  19. Chen S., Rosin L.F., Pegoraro G., et al. NURF301 contributes to gypsy chromatin insulator-mediated nuclear organization // Nucleic Acids Res. 2022. V. 50. № 14. P. 7906–7924.
  20. Butcher R.D., Chodagam S., Basto R., et al. The Drosophila centrosome-associated protein CP190 is essential for viability but not for cell division // Journal of cell science. 2004. V. 117. № Pt 7. P. 1191–9.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».