Внутривидовая изменчивость серой крысы (Rattus norvegicus) в России по данным D-loop мтДНК

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Впервые для территории России проведено исследование внутривидовой структуры серой крысы (Rattus norvegicus) c использованием митохондриального маркера контрольного региона (D-loop) мтДНК. Проанализированы последовательности мтДНК из 8 регионов европейской и азиатской частей России. Выявлено три клады серых крыс, из них: в европейской части России – 1, в азиатской – 2. Cинантропный подвид – R. n. norvegicus представлен европейской и азиатской линиями. В европейскую линию вошли гаплотипы из регионов центральной части и юга России, в азиатскую – из Восточной Сибири и Дальнего Востока. Выделен в отдельную генетическую линию ранее описанный экзоатропный подвид – R. n. caraco с Дальнего Востока России.

Об авторах

А. Н. Мальцев

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН; Институт Дезинфектологии ФБУН«ФНЦГ им. Ф.Ф. Эрисмана» Роспотребнадзора

Автор, ответственный за переписку.
Email: mus-musculus@yandex.ru
Россия, Москва; Москва

И. В. Картавцева

Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения РАН

Email: mus-musculus@yandex.ru
Россия, Владивосток

В. В. Стахеев

Федеральный исследовательский центр ЮНЦ РАН

Email: mus-musculus@yandex.ru
Россия, Ростов-на-Дону

В. Ю. Комаров

Институт Дезинфектологии ФБУН «ФНЦГ им. Ф.Ф. Эрисмана» Роспотребнадзора

Email: mus-musculus@yandex.ru
Россия, Москва

Ю. А. Баженов

Институт природных ресурсов, экологии и криологии СО РАН

Email: mus-musculus@yandex.ru
Россия, Чита

Л. А. Хляп

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН

Email: mus-musculus@yandex.ru
Россия, Москва

Е. В. Котенкова

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН

Email: mus-musculus@yandex.ru
Россия, Москва

Список литературы

  1. Kucheruk V.V. Synanthropic rodents and their significance in the transmission of infections // Theoretical questions of natural foci diseases. Prague, 1965. P.353–366.
  2. Кучерук В.В., Кузиков И.В. Современный ареал серой крысы // Распространение и экология серой крысы и методы ограничения ее численности. М.: Наука.1985. С.17–52.
  3. Петросян В.Г., Хляп Л.А. Самые опасные инвазионные виды России (ТОП-100) / Ред. Дгебуадзе Ю.Ю., Петросян В.Г., Хляп Л.А. М.: Т-во научных изданий КМК, 2018. 688 с.
  4. Hedrich H.J. History, Strains and Models. In: Krinke GJ, Buton T, editors. The laboratory Rat (Handbook of Experimental Animals). London: Academic. Press, 2000. P. 1871–1895.
  5. Wu X., Wang Y. Fossil materials and migrations of Mus musculus and Rattus norvegicus // Research of China’s Frontier Archaeology. 2012. V.1. P. 1–9.
  6. Song Y., Lan Z., Kohn M.H. Mitochondrial DNA phylogeography of the Norway rat // PLOS ONE. 2014. V. 9. Issue 2. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088425.
  7. Zeng L., Ming C., Li Y.,Su L-Y., Su Y-H., et al. Out of Southern East Asia of the Brown Rat Revealed by Large-Scale Genome Sequencing // Molecular Biology Evolution. V. 35. P. 149–158.
  8. Кащенко Н.Ф. Крысы и их заместители в Западной Сибири и Туркестане // Ежегодник зоол. Музея АН. 1912 (1913). Т. 17. С. 370–390.
  9. Puckett E.E., Magnussen E., Khlyap L.A, Strand T.M., Lundkvist A., Munshi-South J. Genomic analyses reveal three independent introductions of the invasive brown rat (Rattus norvegicus) to the Faroe Islands // Heredity, 2020. V.124. P. 15–27.
  10. Wu D. On subspecific differentiation of brown rat (Rattus norvegicus Berkenhout) in China // Acta Theriologica Sinica, 1982. V. 2. P. 107–112.
  11. Wang Y.A. Сomplete checklist of mammal species and subspecies in China: a taxonomic and geographic reference. Beijing: China Forestry Publishing House. 2003. 394 p.
  12. Zhao L., Zhang J-X., Zhang Y.-H. Genetic boundary and gene flow between two parapatric subspecies of brown rats // Current Zoology. 2020. V. 66. P. 677–688.
  13. Аргиропуло А.И. Фауна СССР. Млекопитающие. Семейство Muridae – мыши. M.; Л.: Изд-во АН ССР, 1940. Т. 3. вып.5. 170 с.
  14. Вигоров Ю.Л. Сравнительная экология и изменчивость крыс Евразии. Екатеринбург: Наука, Урал. отделение, 1992. 144 с.
  15. Lack J., Hamilton M., Braun J., Mares M., Van Den Bussche R. Comparative phylogeography of invasive Rattus rattus and Rattus norvegicus in the U.S. reveals distinct colonization histories and dispersal // Biological Invasions. 2013. V.15. P. 1067–1087.
  16. Puckett E.E., Park J., Combs M. et al. Global population divergence and admixture of the brown rat (Rattus norvegicus) // Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 2016. V. 283(1841).20161762.doi: 10.1098/rspb.2016.1762.
  17. Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucleic Acids Symposium Series. 1999. V. 41. P. 95–98.
  18. Bandelt H-J., Forster P., Röhl A. Median-Joining Networks for Inferring Intraspecific Phylogenies // Molecular Biology Evolution. 1999. V. 16(1). P. 37–48.
  19. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. Mega X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms // Molecular Biology Evolution. 2018.V. 35. P. 1547–1549.doi: 10.1093/molbev/msy096

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».