Нейрональная и мышечная дифференцировки клеток млекопитающих сопровождаются сменой экспрессирующихся изоформ PHF10

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Комплекс ремоделирования хроматина PBAF играет важнейшую роль в регуляции экспрессии генов в процессе дифференцировки тканей и при развитии организма. Специфичность взаимодействие комплекса с хроматином определяется наличием в ряде его субъединиц доменов, узнающих определенные модификации N-концевых последовательностей гистонов. PHF10, субъединица комплекса PBAF, содержит DPF-домен, являющийся уникальным доменом взаимодействия с хроматином. В клетках позвоночных также присутствует изоформа PHF10, не имеющая домена DPF. В данной работе показано, что при нейрональной и мышечной дифференцировке клеток человека и мыши меняется экспрессия изоформ PHF10: формы, не имеющие DPF, замещают формы, в которых он присутствует. Замена изоформ PHF10 в комплексе PBAF может влиять на его избирательность в регуляции генов дифференцирующихся клеток.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Д. О. Байрамова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук; Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта

Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва; Москва

А. М. Азиева

Научно-исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва

А. В. Феоктистов

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук; Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта

Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва; Москва

С. Г. Георгиева

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук

Email: so2615@gmail.com

академик РАН

Россия, Москва

Н. В. Сошникова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук; Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта

Автор, ответственный за переписку.
Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва; Москва

Список литературы

  1. Moshkin Y. M., et al. // Mol Cell Biol. 2012. V. 32. № 3. P. 675–688.
  2. Sokpor G., et al. // Front Mol Neurosci. 2017. V. 10. P. 243.
  3. Centore R. S., et al // Trends Genet. 2020. V. 36. № 12. P. 936–950.
  4. Singh A., et al. // Cell Biochem Biophys. 2023. V. 81. № 2. P. 167–187.
  5. Krasteva V., et al. // Exp Hematol. 2017. V. 48. P. 58–71.
  6. Brechalov A. V., et al. // Cell Cycle. 2014. V. 13 № 12. P. 1970–1979.
  7. Soshnikova N. V., et al. // Acta Naturae. 2020. V. 12. № 4. P. 57–65.
  8. Chugunov A. O., et al. // Int J Mol Sci. 2021. V. 22. № 20.
  9. Regadas I., et al. // Mol Cell. 2021. Vol. 81. № 8. P. 1766–1780.
  10. Viryasova G. M., et al .// Biochim Biophys Acta Mol Cell Res. 2019. V. 1866. № 12. P. 118525.
  11. Lessard J., et al // Neuron. 2007. V. 55. № 2. P. 201–215.
  12. Banga S. S., et al. // Cytogenet Genome Res. 2009. V. 126. № 3. P. 227–242.
  13. Tatarskiy V. V.et al. // Sci Rep. 2017. V. 7. № 1. P. 5645.
  14. GTEx Consortium // Nat Genet. 2013. V. 45. № 6. P. 580–585.
  15. Jing L., et al. // Bio Protoc. 2012. V. 2. № 10.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. (а) Схема изоформ PHF10. Обозначены характерные домены и мотивы изоформ PHF10. (б) Предсказан- ная структура PHF10-Pl (Q8WUB8) согласно Alpha Fold database (https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/Q8WUB8). (в) Экс- прессия изоформ PHF10-P, PHF10-S и их соотношение в различных тканях человека согласно базе данных GTEx (The Genotype-Tissue Expression (GTEx) Project data). По оси ординат TPM (количество транскриптов на миллион прочтений в образце).

Скачать (1MB)
Метаданные
3. Рис. 2. (а) и (б) Нейрональная дифференцировка клеток человека линии SH-SY5Y (А) и клеток мыши линии Neuro 2a (б): левая панель – визуализация с помощью негативного контрастирования фенотипа клеток в течение десяти дней дифференцировки; правая панель – Вестерн-блоттинг изоформ PHF10 без дифференцировки, в середине и по окончании дифференцировки. Изоформы обозначены справа. Слева показан маркер молекулярных масс – 55 и 70кДа. Окраска антителами к тубулину использовалась как контроль нанесения в обоих случаях.

Скачать (819KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Вестерн-блоттинг изоформ Phf10 в процессе миогенной дифференцировки клеток мыши линии С2С12. Изоформы обозначены справа. Слева пока- зан маркер молекулярных масс – 55 и 70кДа. Окра- ска антителами к белку Gapgh использовалась как контроль нанесения.

Скачать (199KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».