Взаимодействие мРНК с с-концевым доменом PCID2, субъединицей комплекса TREX-2, необходимо для ее экспорта из ядра в цитоплазму у Drosophila melanogaster

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

После этапа транскрипции новосинтезированная мРНК экспортируется из ядра в цитоплазму и далее к месту трансляции. Комплекс TREX-2 принимает участие на этапе экспорта мРНК из ядра в цитоплазму. Этот комплекс у Drosophila melanogaster состоит из четырех белков: Xmas-2, PCID2, ENY2, Sem1p. В нашей работе мы показали, что делеция С-концевой последовательности PCID2 приводит к уменьшению взаимодействия белка с РНК и к нарушению экспорта мРНК из ядра в цитоплазму у D. melanogaster.

Об авторах

Ю. А. Вдовина

Федеральное Государственное Учреждение науки Институт молекулярной биологии Российской
академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: yuvdov2020@gmail.com
Российская Федерация, Москва

С. Г. Георгиева

Федеральное Государственное Учреждение науки Институт молекулярной биологии Российской
академии наук

Email: d_dmitrieva@mail.ru
Российская Федерация, Москва

Д. В. Копытова

Федеральное Государственное Учреждение науки Институт молекулярной биологии Российской
академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: d_dmitrieva@mail.ru
Российская Федерация, Москва

Список литературы

  1. Kopytova D., Popova V., Kurshakova M., et al. ORC interacts with THSC/TREX-2 and its subunits promote Nxf1 association with mRNP and mRNA export in Drosophila. // Nucleic acids research. 2016. V. 44. №10. P. 4920–4933.
  2. Kurshakova M.M., Krasnov A.N., Kopytova D.V., et al. SAGA and a novel Drosophila export complex anchor efficient transcription and mRNA export to NPC // EMBO Journal. 2007. V. 26, № 24. P. 14956–65.
  3. Stewart M. Structure and Function of the TREX-2 Complex. // Sub-cellular biochemistry. United States, 2019. V. 93. P. 461–470.
  4. Pascual-Garcia P., Govind C.K., Queralt E., al. Sus1 is recruited to coding regions and functions during transcription elongation in association with SAGA and TREX2. // Genes & development. United States, 2008. V. 22. № 20. P. 2811–2822.
  5. Georgieva S., Nabirochkina E., Dilworth F.J., et al. The novel transcription factor e(y)2 interacts with TAF(II)40 and potentiates transcription activation on chromatin templates. // Molecular and cellular biology. United States, 2001. V. 21. № 15. P. 5223–5231.
  6. Kopytova D.V., Orlova A.V., Krasnov A.N., et al. Multifunctional factor ENY2 is associated with the THO complex and promotes its recruitment onto nascent mRNA. // Genes & development. United States, 2010. V. 24. № 1. P. 86–96.
  7. Kurshakova M., Maksimenko O., Golovnin A., et al. Evolutionarily conserved E(y)2/Sus1 protein is essential for the barrier activity of Su(Hw)-dependent insulators in Drosophila. // Molecular cell. United States, 2007. V. 27. № 2. P. 332–338.
  8. Maksimenko O., Kyrchanova O., Bonchuk A., et al. Highly conserved ENY2/Sus1 protein binds to Drosophila CTCF and is required for barrier activity. // Epigenetics. 2014. V. 9. № 9. P. 1261–1270.
  9. Farny N.G., Hurt J.A., Silver P.A. Definition of global and transcript-specific mRNA export pathways in metazoans. // Genes & development. United States, 2008. V. 22. № 1. P. 66–78.
  10. Glukhova A.A., Kurshakova M.M., Nabirochkina E.N. et al. PCID2, a subunit of the Drosophila TREX-2 nuclear export complex, is essential for both mRNA nuclear export and its subsequent cytoplasmic trafficking // RNA Biology. United States, 2021. V. 18, № 11. P. 1969–1980.
  11. Jani D., Lutz S., Hurt E., et al. Functional and structural characterization of the mammalian TREX-2 complex that links transcription with nuclear messenger RNA export. // Nucleic acids research. England, 2012. V. 40. № 10. P. 4562–4573.
  12. Jani D., Lutz S, Marshall N.J., et al. Sus1, Cdc31, and the Sac3 CID region form a conserved interaction platform that promotes nuclear pore association and mRNA export. // Molecular cell. United States, 2009. V. 33. № 6. P. 727–737.
  13. Jani D., Valkov E., Stewart M. Structural basis for binding the TREX2 complex to nuclear pores, GAL1 localisation and mRNA export. // Nucleic acids research. England, 2014. V. 42. № 10. P. 6686–6697.
  14. Fischer T., Strasser K., Racz A., et al. The mRNA export machinery requires the novel Sac3p-Thp1p complex to dock at the nucleoplasmic entrance of the nuclear pores. // The EMBO journal. England, 2002. V. 21. № 21. P. 5843–5852.
  15. Gonzalez-Aguilera C., Tous C., Gomez-Gonzalez B., et al. The THP1-SAC3-SUS1-CDC31 complex works in transcription elongation-mRNA export preventing RNA-mediated genome instability. // Molecular biology of the cell. United States, 2008. V. 19. № 10. P. 4310–4318.
  16. Lu Q., Tang X., Tian G., et al. Arabidopsis homolog of the yeast TREX-2 mRNA export complex: components and anchoring nucleoporin. // The Plant journal: for cell and molecular biology. England, 2010. V. 61. № 2. P. 259–270.
  17. Rodríguez-Navarro S., Fischer T., Luo M.-J., et al. Sus1, a functional component of the SAGA histone acetylase complex and the nuclear pore-associated mRNA export machinery. // Cell. United States, 2004. V. 116. № 1. P. 75–86.
  18. Ellisdon A.M., Dimitrova L., Hurt E., et al. Structural basis for the assembly and nucleic acid binding of the TREX-2 transcription-export complex. // Nature structural & molecular biology. United States, 2012. V. 19. № 3. P. 328–336.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2.

Скачать (163KB)
3.

Скачать (384KB)

© Ю.А. Вдовина, С.Г. Георгиева, Д.В. Копытова, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».