Филогенетический анализ кокцидий (Apicomplexa: Eimeriorina) у обыкновенной верховки Leucaspius delineatus (Heckel, 1843)

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Целью данной работы явилось проведение сравнительного анализа и реконструкции филогенетического положения кокцидий из пищеварительного тракта обыкновенной верховки Leucaspius delineatus (Heckel, 1843) из Иркутского водохранилища. Определение и сравнительный анализ полученных и имеющихся в генетических базах данных нуклеотидных последовательностей фрагмента гена cox1 продемонстрировали парафилию родов Eimeria и Goussia. Последовательности на филогенетическом древе сформировали отдельный кластер в основании древа. Таким образом, косвенно подтверждена гипотеза о том, что кокцидии рыб являются предками кокцидий других позвоночных животных. Обсуждается необходимость дополнительных исследований и проведения ревизии кокцидий у рыб р. Ангара и оз. Байкал.

Об авторах

Н. Н. Деникина

Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: denikina@lin.irk.ru
Россия, ул. Улан-Баторская, 3, Иркутск, 664033

Н. В. Кулакова

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

Email: denikina@lin.irk.ru
Россия, ул. Лермонтова, 132, Иркутск, 664033

Ю. С. Букин

Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук

Email: denikina@lin.irk.ru
Россия, ул. Улан-Баторская, 3, Иркутск, 664033

Т. Р. Хамнуева

Институт общей и экспериментальной биологии Сибирского отделения Российской академии наук

Email: denikina@lin.irk.ru
Россия, ул. Сахьяновой, 6, Улан-Удэ, 670047

Д. Р. Балданова

Институт общей и экспериментальной биологии Сибирского отделения Российской академии наук

Email: denikina@lin.irk.ru
Россия, ул. Сахьяновой, 6, Улан-Удэ, 670047

Б. Э. Богданов

Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук

Email: denikina@lin.irk.ru
Россия, ул. Улан-Баторская, 3, Иркутск, 664033

Е. В. Дзюба

Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук

Email: denikina@lin.irk.ru
Россия, ул. Улан-Баторская, 3, Иркутск, 664033

Список литературы

  1. Белова Л.М., Крылов M.В. 2006. Кокцидии (Eimeriidae) рыб (Cypriniformes) континентальных вод России. Паразитология 40(5): 447-461.
  2. Богданов Б.Э. 2015. Изменчивость и статус внутривидовых форм песчаной широколобки Leocottus kesslerii (Scorpaeniformes: Cottidae). Вопросы ихтиологии. 55 (4): 386-396. doi: 10.7868/S0042875215030029
  3. Бычков И.В., Никитин В.М. 2015. Регулирование уровня озера Байкал: проблемы и возможные решения. География и природные ресурсы 2015(3): 5-16. doi: 10.1134/S1875372815030014
  4. ГОСТ 33219-2014. 2016. Руководство по содержанию и уходу за лабораторными животными. Правила содержания и ухода за рыбами, амфибиями и рептилиями. M.: Стандартинформ.
  5. Деникина Н.Н., Кулакова Н.В., Букин Ю.С. и др. 2023. Первое обнаружение ДНК Caryophyllaeus laticeps (Pallas, 1781) у верховки Leucaspius delineatus (Heckel, 1843). Limnology and Freshwater Biology 2023 (1): 6-10. doi: 10.31951/2658-3518-2023-A-1-1
  6. Доровских Г.Н. 2019. Паразитофауна верховки обыкновенной Leucaspius delineatus (Heckel, 1843) из крупных речных систем европейского северо-востока России. Вестник Сыктывкарского университета. Серия 2. Биология. Геология. Химия. Экология 4(12): 77-89.
  7. Заика В.Е. 1965. Паразитофауна рыб озера Байкал. М.: Наука.
  8. Новохацкая О.В., Иешко Е.П., Стерлигова О.П. 2008. Характер многолетних изменений паразитофауны леща Abramis brama L. в эвтрофируемом водоеме. Паразитология 42(4): 308-317.
  9. Пугачев О.Н., Крылов М.В., Белова Л.М. 2012. Кокцидии отряда Eimeriida рыб России и сопредельных территорий. – СПб., ЗИН РАН.
  10. Решетников А.Н., Голубцов А.С., Журавлев В.Б. и др. 2017. Расширение ареалов ротана Perccottus glenii, верховки Leucaspius delineatus и уклейки Alburnus alburnus в бассейне р. Обь. Сибирский экологический журнал 24(6): 696-707. doi: 10.15372/SEJ20170603
  11. Семерной В.П. 2001. Малощетинковые черви (Annelida: Oligochaeta) и эолосоматиды (Annelida: Aeolosomatidae). В книге: Тимошкин О.А. (Ред.), Аннотированный список фауны озера Байкал и его водосборного бассейна. Новосибирск: Наука: 377-427.
  12. Слынько Ю.В., Терещенко В.Г. 2014. Рыбы пресных вод Понто-Каспийского бассейна (разнообразие, фауногенез, динамика популяций, механизмы адаптаций). М.: Полиграф-Плюс.
  13. Соколов С.Г., Мошу А.Я. 2014. Goussia obstinata sp. n. (Sporozoa: Eimeriidae) – новый вид кокцидий из кишечника ротана Perccottus glenii Dybowski, 1877 (Perciformes: Odontobutidae). Паразитология 48(5): 382-392.
  14. Шульман С.С., Заика В.Е. 1964. Кокцидии рыб озера Байкал. Известия Сибирского отделения АН СССР, серия биологических и медицинских наук, 8: 126-130.
  15. Ali S., Samake J.N., Spear J. et al. 2022. Morphological identification and genetic characterization of Anopheles stephensi in Somaliland. Parasites & Vectors 15: 247. doi: 10.1186/s13071-022-05339-y
  16. Alyamkin G.V., Zhigileva O.N., Zhokhov A.E. 2022. Genetic variability of the Amur Sleeper (Perccottus glenii) and their parasite, cestode (Nippotaenia mogurndae), outside the natural area of distribution. Inland Water Biology 15: 179-188. doi: 10.1134/S1995082922010023
  17. Andreou D., Arkush K.D., Gue´gan J.-F. et al. 2012. Introduced pathogens and native freshwater biodiversity: a case study of Sphaerothecum destruens. PLoS ONE 7(5): e36998. doi: 10.1371/journal.pone.0036998
  18. Arisue N., Hashimoto T. 2015. Phylogeny and evolution of apicoplasts and apicomplexan parasites. Parasitology International 64: 254-259. doi: 10.1016/j.parint.2014.10.005
  19. Băncilă R.I., Skolka M., Ivanova P. et al. 2022. Alien species of the Romanian and Bulgarian Black Sea coast: state of knowledge, uncertainties, and needs for future research. Aquatic Invasions 17(3): 353-373. doi: 10.3391/ai.2022.17.3.02
  20. Bernery C., Bellard C.A., Courchamp F. et al. 2022. Freshwater fish invasions: a comprehensive review. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 53: 427-456. doi: 10.1146/annurev-ecolsys-032522-015551
  21. Couso-Pérez S., Ares-Mazás E., Gómez-Couso H. 2019. First molecular data on Eimeria truttae from brown trout (Salmo trutta). Parasitology Research 118: 2121-2127. doi: 10.1007/s00436-019-06320-y
  22. Dos Santos Q.M., Avenant-Oldewage A. 2022. Smallmouth yellowfish, Labeobarbus aeneus (Teleostei: Cyprinidae), as a potential new definitive host of the invasive parasite Atractolytocestus huronensis (Cestoda: Caryophyllidea) from common carp: example of recent spillover in South Africa? Aquatic Invasions 17(2): 259-276. doi: 10.3391/ai.2022.17.2.08
  23. Ellender B.R., Weyl O.L.F. 2014. A review of current knowledge, risk and ecological impacts associated with non-native freshwater fish introductions in South Africa. Aquatic Invasions 9: 117-132. doi: 10.3391/ai.2014.9.2.01
  24. Jastrzębski M. 1984. Coccidiofauna of cultured and feral fishes in fish farms. Wiadomosci parazytologiczne T. XXX, NR 2: 141-163
  25. Jirků M., Jirků M., Oborník M. et al. 2009. Goussia Labbé, 1896 (Apicomplexa, Eimeriorina) in Amphibia: diversity, biology, molecular phylogeny and comments on the status of the genus. Protist 160: 123-136. doi: 10.1016/j.protis.2008.08.003
  26. Jirsa F., Konecny R., Frank C. 2008. The occurrence of Caryophyllaeus laticeps in the nase Chondrostoma nasus from Austrian rivers: possible anthropogenic factors. Journal of Helminthology 82(1): 53-58. doi: 10.1017/S0022149X07873548
  27. Kaminskas S. 2021. Alien pathogens and parasites impacting native freshwater fish of southern Australia: a scientific and historical review. Australian Zoologist 41 (4): 696-730. doi: 10.7882/AZ.2020.039
  28. Kirjušina M., Vismanis K. 2007. Checklist of the parasites of fishes of Latvia. Technical Paper no. 369/3. FAO Fisheries, Rome.
  29. Kulakova N.V., Bukin Yu.S., Denikina N.N. et al. 2022. Comparative analysis and reconstruction of phylogenetic position of sunbleak Leucaspius delineatus (Heckel, 1843) from the Irkutsk Reservoir. Limnology and Freshwater Biology 5: 1639-1642. doi: 10.31951/2658-3518-2022-A-5-1639
  30. Kumar S., Stecher G., Tamura K. 2016. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution 33: 1870-1874. doi: 10.1093/molbev/msw054
  31. Le S.Q., Gascuel O. 2008. An improved general amino acid replacement matrix. Molecular Biology and Evolution 25 (7): 1307-1320. doi: 10.1093/molbev/msn067
  32. Leray M., Yang J.Y., Meyer C.P. et al. 2013. A new versatile primer set targeting a short fragment of the mitochondrial COI region for metabarcoding metazoan diversity: application for characterizing coral reef fish gut contents. Frontiers in Zoology 10(34): P. 1-13. doi: 10.1186/1742-9994-10-34
  33. Liu D., Brice B., Elliot A. et al. 2021. Morphological and molecular characterization of Isospora amphiboluri (Apicomplexa: Eimeriidae), a coccidian parasite, in a central netted dragon (Ctenophorus nuchalis) (De Vis, 1884) in Australia. Parasitology International 84: P. 102386. doi: 10.1016/j.parint.2021.102386
  34. Molnar K., Ostoros G. 2007. Efficacy of some anticoccidial drugs for treating coccidial enteritis of the common carp caused by Goussia carpelli (Apicomplexa: Eimeriidae). Acta Veterinaria Hungarica 55: 67-76. doi: 10.1556/AVet.55.2007.1.7
  35. Molnár K., Ostoros G., Baska F. 2005. Cross-infection experiments confirm the host specificity of Goussia spp. (Eimeriidae: Apicomplexa) parasitizing cyprinid fish. Acta Protozoologica 44: 43-49.
  36. Molnár K., Ostoros G., Dunams-Morel D. et al. 2012. Eimeria that infect fish are diverse and are related to, but distinct from, those that infect terrestrial vertebrates. Infection, Genetics and Evolution 12 (8): P. 1810-1815. doi: 10.1016/j.meegid.2012.06.017
  37. Morrison D.A. 2009. Evolution of the Apicomplexa: where are we now? Trends in Parasitology 25: 375-382. doi: 10.1016/j.pt.2009.05.010
  38. Nei M., Kumar S. 2000. Molecular evolution and phylogenetics. Oxford University Press, New York.
  39. Ogedengbe M.E., El-Sherry S., Ogedengbe J.D. et al. 2018. Phylogenies based on combined mitochondrial and nuclear sequences conflict with morphologically defined genera in the eimeriid coccidian (Apicomplexa). International Journal for Parasitology 48: 59-69. doi: 10.1016/j.ijpara.2017.07.008
  40. Rosenthal B.M., Dunams-Morela D., Ostoros G. et al. 2016. Coccidian parasites of fish encompass profound phylogenetic diversity and gave rise to each of the major parasitic groups in terrestrial vertebrates. Infection, Genetics and Evolution 40: 219-227. doi: 10.1016/j.meegid.2016.02.018
  41. Tamura K., Nei M. 1993. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution 10: 512-526. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040023
  42. Truter M., Hadfield K.A., Smit N.J. 2023. Parasite diversity and community structure of translocated Clarias gariepinus (Burchell) in South Africa: Testing co-introduction, parasite spillback and enemy release hypotheses. International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife 20 170-179. doi: 10.1016/j.ijppaw.2023.02.004
  43. Xavier R., Severino R., Pérez-Losada M. et al. 2018. Phylogenetic analysis of apicomplexan parasites infecting commercially valuable species from the North-East Atlantic reveals high levels of diversity and insights into the evolution of the group. Parasites & Vectors 11(63): 1-12. doi: 10.1186/s13071-018-2645-7
  44. Zhu R., Chen K., Cai X. et al. 2022. The first wild record of invasive redhead cichlid, Vieja melanura (Günther, 1862), in Hainan Island, China. BioInvasions Records 11(1): 244-249. doi: 10.3391/bir.2022.11.1.25

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Деникина Н.Н., Кулакова Н.В., Букин Ю.С., Хамнуева Т.Р., Балданова Д.Р., Богданов Б.Э., Дзюба Е.В., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».