No 3 (2021)

Articles

Identification of Baikal phytoplankton inferred from computer vision methods and machine learning

Lysenko А.V., Oznobikhin М.S., Kireev Е.А., Dubrova K.S., Vorobyeva S.S.

Abstract

This study discusses the problem of phytoplankton classification using computer vision methods and convolutional neural networks. We created a system for automatic object recognition consisting of two parts: analysis and primary processing of phytoplankton images and development of the neural network based on the obtained information about the images. We developed software that can detect particular objects in images from a light microscope. We trained a convolutional neural network in transfer learning and determined optimal parameters of this neural network and the optimal size of using dataset. To increase accuracy for these groups of classes, we created three neural networks with the same structure. The obtained accuracy in the classification of Baikal phytoplankton by these neural networks was up to 80%.

Limnology and Freshwater Biology. 2021;(3):1143-1146
pages 1143-1146 views

Optical characteristics of water at the mouth of the Ob River

Akulova O.B., Bukaty V.I., Kirillov V.V.

Abstract

As a result of the field studies (August 25 – September 1, 2020), new data were obtained on the optical characteristics of water at the Ob River mouth near the Salemal village (Yamal region, Yamal-Nenets Autonomous Okrug) during the lowest water level and the maximum development of hydrobiocenoses. We calculated the light attenuation coefficient Ɛ(λ) in the spectral range from 400 to 800 nm, which varied from 1.5 to 21.5 m–1 during the study period, and the light absorption by yellow substance κys(λ) from 0.1 to 12.2 m–1. Concentrations of yellow substance Cys and chlorophyll а Chl were determined. For instance, chlorophyll а concentrations in water samples taken at different stations of the Ob River ranged from 12.5 to 22.7 mg∙m–3. The maximum content of chlorophyll а in our case was recorded at a depth of 14 m (station 5.3), which was 22.7 mg∙m–3. The yellow substance concentration determined optically by the calculated yellow substance light absorption coefficient at wavelength λ=450 nm ranged within 18.8 and 26.9 g∙m–3 with an average value of 22.1 g∙m–3. The average value of κys(λ) at λ=450 nm over the study period was 4.7 m–1.

Limnology and Freshwater Biology. 2021;(3):1147-1151
pages 1147-1151 views

Length-weight relationship and condition factor of endemic genus Seminemacheilus (Teloestei=Nemacheilidae) for Turkey

Seçer B., Sungur S., Çiçek Е., Mouludi-Saleh A., Eagderi S.

Abstract

This study was aimed to determine the length-weight relationships and Fulton’s condition factors of the genus Seminemacheilus that is endemic for Turkey. The specimens were collected from 2017 to 2019 using an electrofishing device (SAMUS 1000MP). The total length and the total weight of the examined specimens ranged from 3.5 to 9.1 cm and from 0.31 to 7.52 g, respectively. Based on the results, the growth coefficient values b ranged from 2.56 (S. ispartensis) to 3.48 (S. attalicus). Also, the condition factor of the studied fishesranged from 0.77 (S. dursunavsari) to 1.11 (S. attalicus). This study represents the first reports of length-weight relationship data for S. ahmeti, S. attalicus, S. dursunavşari, S. ekmekciae, and S. ispartensis from Turkish inland waters and four new maximum total lengths for the Seminemacheilus species. The results of this study provide useful information for further fisheries management, fish population dynamic studies and comparisons in future studies.

Limnology and Freshwater Biology. 2021;(3):1152-1155
pages 1152-1155 views

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».