Mechanisms of fast transformations of Baikal biota: multidisciplinary approach

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

We discuss the current state of investigations concerning the impact of dramatic ecosystem rearrangements in Lake Baikal on the evolution of the lake’s biota, as well as the approaches that should be used to achieve further progress in this area.

Ключевые слова

Об авторах

D. Sherbakov

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Irkutsk State University

Автор, ответственный за переписку.
Email: sherb@lin.irk.ru
ORCID iD: 0000-0002-1410-392X
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033; Karl Marx Str., 1, Irkutsk, 664003

Yu. Bukin

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Irkutsk State University

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033; Karl Marx Str., 1, Irkutsk, 664003

L. Kravtsova

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

E. Romanova

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

E. Mincheva

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

T. Peretolchina

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

A. Poroshina

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Irkutsk State University

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033; Karl Marx Str., 1, Irkutsk, 664003

E. Sirotinina

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Irkutsk State University

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033; Karl Marx Str., 1, Irkutsk, 664003

M. Voylo

Limnological Institute, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: sherb@lin.irk.ru
Россия, Ulan-Batorskaya Str., 3, Irkutsk, 664033

Список литературы

  1. Bukin Yu.S., Pudovkina T.A., Sherbakov D.Yu. et al. 2007. Genetic flows in a structured one-dimensional population: simulation and real data on Baikalian polychaetes M. godlewskii. In Silico Biology 7: 277–284.
  2. Bukin Yu.S., Petunina J.V., Sherbakov D.Yu. 2018. The Mechanisms for Genetic Diversity of Baikal Endemic Amphipod Gmelinoides fasciatus: Relationships between the Population Processes and Paleoclimatic History of the Lake. Russian Journal of Genetics 54: 1059–1068. doi: 10.1134/S1022795418090053 (in Russian)
  3. Cormier A., Wattier R., Teixeira M. et al. 2018. The complete mitochondrial genome of Gammarus roeselii (Crustacea, Amphipoda): insights into mitogenome plasticity and evolution. Hydrobiologia: 1–14. doi: 10.1007/s10750-018-3578-z
  4. De Vargas C., Audic S., Henry N. et al. 2015. Eukaryotic plankton diversity in the sunlit ocean. Science 348: 1261605. doi: 10.1126/science.1261605
  5. Dynesius M., Jansson R. 2000. Evolutionary consequences of changes in species’ geographical distributions driven by Milankovitch climate oscillations. Proceedings of the National Academy of Sciences 97: 9115–9120.
  6. Fazalova V., Nevado B., Peretolchina T. et al. 2010. When environmental changes do not cause geographic separation of fauna: differential responses of Baikalian invertebrates. BMC evolutionary biology 10: 320. doi: 10.1186/1471-2148-10-320
  7. Gomanenko G.V., Kamaltynov R.M., Kuzmenkova Z.V. et al. 2005. Population structure of the Baikalian amphipod Gmelinoides fasciatus (Stebbing). Russian Journal of Genetics 41: 907–912. DOI: 10.1007%2Fs11177-005-0179-5. (in Russian)
  8. Grachev M.A., Vorobyova S.S., Likhoshway Y.V. et al. 1998. A high-resolution diatom record of the palaeoclimates of East Siberia for the last 2.5 My from Lake Baikal. Quaternary Science Reviews 17: 1101–1106. doi: 10.1016/S0277-3791(98)00048-1
  9. Izhboldina L.A. 2007. Guide and key to benthic and periphyton algae of Lake Baikal (meio- and macrophytes) with brief notes on their ecology. Novosibirsk: Nauka-Centre.
  10. Johnson M.S., Stankowski S. 2018. Extreme morphological diversity in a single species of Rhagada (Gastropoda: Camaenidae) in the Dampier Archipelago, Western Australia: review of the evidence, revised taxonomy and changed perspective. Journal of Molluscan Studies 84: 337–344. doi: 10.1093/mollus/eyy040
  11. Karabanov E., Williams D., Kuzmin M. et al. 2004. Ecological collapse of Lake Baikal and Lake Hovsgol ecosystems during the Last Glacial and consequences for aquatic species diversity. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology 209: 227–243. doi: 10.1016/j.palaeo.2004.02.017
  12. Khanaev I.V., Kravtsova L.S., Maikova O.O. et al. 2018. Current state of the sponge fauna (Porifera: Lubomirskiidae) of Lake Baikal: Sponge disease and the problem of conservation of diversity. Journal of Great Lakes Research 44: 77–85. doi: 10.1016/j.jglr.2017.10.004
  13. Kravtsova L.S., Kamaltynov R.M., Karabanov E.B. et al. 2004. Macrozoobenthic communities of underwaterlandscapes in the shallow-water zone of southern Lake Baikal. Hydrobiologia 522: 193–205. doi: 10.1023/B:HYDR.0000029979.68265.3e
  14. Kravtsova L.S., Izhboldina L.A., Khanaev I.V. et al. 2014. Nearshore benthic blooms of filamentous green algae in Lake Baikal. Journal of Great Lakes Research 40: 441–448. doi: 10.1016/j.jglr.2014.02.019.
  15. Kulakova N.V., Sakirko M.V., Adelshin R.V. et al. 2018. Brown rot syndrome and changes in the bacterial community of the Baikal sponge Lubomirskia baicalensis. Microbial ecology 75: 1024–1034. doi: 10.1007/s00248-017-1097-5
  16. Kuzmin M.I., Karabanov E.B., Kavai T. et al. 2001. Deepwater drilling in Baikal: main results: main results. Russian Geology and Geophysics 42: 8–34. (in Russian)
  17. Leray M., Knowlton N. 2015. DNA barcoding and metabarcoding of standardized samples reveal patterns of marine benthic diversity. Proceedings of the National Academy of Sciences 112: 2076–2081. doi: 10.1073/pnas.1424997112
  18. Leray M., Knowlton N. 2016. Censusing marine eukaryotic diversity in the twenty-first century. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 5: 371. doi: 10.1098/rstb.2015.0331
  19. Mackay A.W. 2007. The paleoclimatology of Lake Baikal: a diatom synthesis and prospectus. Earth-Science Reviews 82: 181–215. doi: 10.1016/j.earscirev.2007.03.002
  20. Margalef R. 1978. Life-forms of phytoplankton as survival alternatives in an unstable environment. Oceanologica acta 1: 493–509.
  21. Ravin N.V., Galachyants Y.P., Mardanov A.V. et al. 2010. Complete sequence of the mitochondrial genome of a diatom alga Synedra acus and comparative analysis of diatom mitochondrial genomes. Current Genetics 56: 215–223. doi: 10.1007/s00294-010-0293-3.
  22. Romanova E.V., Kravtsova L.S., Izhboldina L.A. et al. 2013. Identification of filamentous green algae from an area of local biogenic pollution of Lake Baikal (Listvennichnyy bay) using SSU 18S rDNA molecular marker. Ecological genetics 11: 23–33. doi: 10.17816/ecogen11423-33 (in Russian)
  23. Romanova E.V., Aleoshin V.V., Kamaltynov R.M. et al. 2016. Evolution of mitochondrial genomes in Baikalian amphipods. BMC genomics 17: 1016. doi: 10.1186/s12864-016-3357-z
  24. Sauvadet A.L., Gobet A., Guillou L. 2010. Comparative analysis between protist communities from the deep-sea pelagic ecosystem and specific deep hydrothermal habitats. Environmental microbiology 12: 2946–2964. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02272.x
  25. Sherbakov D.Y. 1999. Molecular phylogenetic studies on the origin of biodiversity in Lake Baikal. Trends in ecology and evolution 14: 92–95. doi: 10.1016/S0169-5347(98)01543-2
  26. Semovski S.V., Verheyen E., Sherbakov D.Y. 2004a. Simulating the evolution of neutrally evolving sequences in a population under environmental changes. Ecological modelling 176: 99–107. doi: 10.1016/j.ecolmodel.2003.07.013
  27. Semovski S.V., Verheyen E., Sherbakov D.Yu. 2004b. Genetic traces of environmental variations in Ancient Lakes. NATO Science Series IV: Earth and Environmental Science 36: 341–358.
  28. Timoshkin O.A. 1997. Biodiversity of Baikal fauna: state-of-the-art (Preliminary analysis). In: Wada E., Timoshkin O.A., Fujita N., Tanida K. (Eds.), New scope on boreal ecosystems in East Siberia. Novosibirsk: Scientific publishing center of the UIGGM SB RAS, pp. 35–76.
  29. Wongsawad P., Peerapornpisal Y. 2015. Morphological and molecular profiling of Spirogyra from northeastern and northern Thailand using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. Saudi journal of biological sciences 22: 382–389. doi: 10.1016/j.sjbs.2014.10.004

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Sherbakov D., Bukin Y., Kravtsova L., Romanova E., Mincheva E., Peretolchina T., Poroshina A., Sirotinina E., Voylo M., 2025

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».