Оптимальные возмущения систем с запаздывающим аргументом для управления динамикой инфекционных заболеваний на основе многокомпонентных воздействий

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Работа посвящена применению оптимальных возмущений для управления математическими моделями инфекционных заболеваний, сформулированными в виде систем нелинейных дифференциальных уравнений с запаздывающим аргументом. Разработан алгоритм вычисления возмущений начального состояния динамической системы с запаздыванием, обладающих максимальной амплификацией в заданной локальной норме с учетом значимости компонент возмущения. Для модели экспериментальной вирусной инфекции построены оптимальные возмущения для двух типов стационарных состояний, с низким и высоким уровнем вирусной нагрузки, отвечающих различным вариантам течения хронической вирусной инфекции.

Об авторах

Г А Бочаров

Институт вычислительной математики РАН; Российский университет дружбы народов

Email: gbocharov@gmail.com
119333, Москва, ул. Губкина, д. 8; 117198, Москва, ул. Миклухо-Маклая, д. 6

Ю М Нечепуренко

Институт вычислительной математики РАН; Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН

Email: yumnech@yandex.ru
125047, Москва, Миусская пл., д. 4

М Ю Христиченко

Институт вычислительной математики РАН; Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН

Email: micha.hrist@rambler.ru
125047, Москва, Миусская пл., д. 4

Д С Гребенников

Институт вычислительной математики РАН; Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН

Email: dmitry.ew@gmail.com
125047, Москва, Миусская пл., д. 4

Список литературы

  1. Беллман Р., Кук К. Л. Дифференциально-разностные уравнения. - М.: Мир, 1967.
  2. Бочаров Г. А., Марчук Г. И. Прикладные проблемы математического моделирования в иммунологии// Журн. выч. мат. и мат. физ. - 2000. - 40. - С. 1905-1920.
  3. Дементьев В. Г., Лебедев В. И., Нечепуренко Ю. М. Спектральный анализ модели ядерного реактора с запаздывающими нейтронами// В сб. «Алгоритмы и программы для нейтронно-физических расчетов ядерных реакторов». - Обнинск: ФЭИ, 1999. - С. 143-150.
  4. Марчук Г. И. Математические модели в иммунологии. - М.: Наука, 1980.
  5. Марчук Г. И. Математические модели в иммунологии. Вычислительные методы и эксперименты. - М.: Наука, 1991.
  6. Марчук Г. И., Бербенцова Э. П. Острые пневмонии. Иммунология, оценка тяжести, клиника, лечение. - М.: Наука, 1989.
  7. Поляк Б. Т., Хлебников М. В., Щербаков П. С. Управление линейными системами при внешних возмущениях. - Москва: ЛЕНАНД, 2014.
  8. Черешнев В. А., Бочаров Г. А., Ким А. В., Бажан С. И., Гайнова И. А., Красовский А. Н., Шмагель Н. Г., Иванов А. В., Сафронов М. А., Третьякова Р. М. Введение в задачи моделирования и управления динамикой ВИЧ инфекции. - М.-Ижевск: АНО Ижевский ин-т комп. иссл., 2016.
  9. Anderson E., Bai Z., Bischof C., Blackford S., Demmel J., Dongarra J., Du Croz J., Greenbaum A., Hammarling S., McKenney A., Sorensen D. LAPACK users guide. - Philadelphia: SIAM, 1999.
  10. Bocharov G. A. Modelling the dynamics of LCMV infection in mice: conventional and exhaustive CTL responses// J. Theor. Biol. - 1998. - 192, № 3. - C. 283-308.
  11. Bocharov G. A., Marchuk G. I., Romanyukha A. A. Numerical solution by LMMs of stiff delay differential systems modelling an immune response// Numer. Math. - 1996. - 73, № 2. - С. 131-148.
  12. Bocharov G. A., Nechepurenko Yu. M., Khristichenko M. Yu., Grebennikov D. S. Maximum response perturbation-based control of virus infection model with time-delays// Russ. J. Numer. Anal. Math. Modelling. - 2017. - 32. - С. 275-291.
  13. Boiko A. V., Dovgal A. V., Grek G. R., Kozlov V. V. Physics of Transitional Shear Flows: Instability and Laminar-Turbulent Transition in Incompressible Near-Wall Shear Layers. - Berlin: Springer, 2011.
  14. Boiko A. V., Nechepurenko Y. M., Sadkane M. Fast computation of optimal disturbances for duct flows with a given accuracy// Comput. Math. Math. Phys. - 2010. - 50, № 11. - С. 1914-1924.
  15. Boiko A. V., Nechepurenko Yu. M., Sadkane M. Computing the maximum amplification of the solution norm of differential-algebraic systems// Comput. Math. Model. - 2012. - 23, № 2. - С. 216-227.
  16. Chereshnev V. A., Bocharov G., Bazhan S., Bachmetyev B., Gainova I., Likhoshvai V., Argilaguet J. M., Martinez J. P., Rump J. A., Mothe B. et al. Pathogenesis and treatment of HIV infection: the cellular, the immune system and the neuroendocrine systems perspective// Int. Rev. Immunol. - 2013. - 32, № 3. - С. 282-306.
  17. Ciurea A., Klenerman P., Hunziker L., Horvath E., Odermatt B., Ochsenbein A. F., Hengartner H., Zinkernagel R. M. Persistence of lymphocytic choriomeningitis virus at very low levels in immune mice// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1999. - 96, № 21. - С. 11964-11969.
  18. Crawford A., Angelosanto J. M., Kao C., Doering T. A., Odorizzi P. M., Barnett B. E., Wherry E. J. Molecular and transcriptional basis of CD4+ T cell dysfunction during chronic infection// Immunity. - 2014. - 40, № 2. - С. 289-302.
  19. Csete M. E., Doyle J. C. Reverse engineering of biological complexity// Science. - 2002. - 295, № 5560. - С. 1664-1669.
  20. Germain R. N., Meier-Schellersheim M., Nita-Lazar A., Fraser I. D. Systems biology in immunology: a computational modeling perspective// Annu. Rev. Immunol. - 2011. - 29. - С. 527-585.
  21. Golub G. H., Van Loan C. F. Matrix Computations. - Baltimore: The John Hopkins University Press, 1996.
  22. Gurdasani D., Iles L., Dillon D. G., Young E. H., Olson A. D., Naranbhai V., Fidler S., Gkrania-Klotsas E., Post F. A., Kellam P. et al. A systematic review of definitions of extreme phenotypes of HIV control and progression// AIDS. - 2014. - 28, № 2. - С. 149-162.
  23. Hairer E., Wanner G. Solving ordinary differential equations. - Berlin: Springer-Verlag, 1996.
  24. Henningson D. S., Reddy S. C. On the role of linear mechanisms in transition to turbulence// Phys. Fluids A. - 1994. - 6, № 3. - С. 1396-1398.
  25. Higham A. V. The scaling and squaring method for the matrix exponential revisited// SIAM J. Matrix Anal. Appl. - 2005. - 26, № 4. - С. 1179-1193.
  26. Kent S. J., Reece J. C., Petravic J., Martyushev A., Kramski M., De Rose R., Cooper D. A., Kelleher A. D., Emery S., Cameron P. U. et al. The search for an HIV cure: tackling latent infection// Lancet Infect. Dis. - 2013. - 13, № 7. - С. 614-621.
  27. Kitano H. Systems biology: a brief overview// Science. - 2002. - 295, № 5560. - С. 1662-1664.
  28. Kitano H. Biological robustness// Nat. Rev. Genet. - 2004. - 5, № 11. - С. 826-837.
  29. Kitano H. Biological robustness in complex host-pathogen systems. - Basel: Birkha¨user, 2007. - С. 239- 263.
  30. Kotsarev A., Lebedev V., Shishkov L., Nechepurenko Yu., Dementiev V. Spectral analysis of VVER-1000 reactor model at high negative reactivities// Proceedings of the Ninth Symposium of AER, 4-8 October, Slovakia, 1999. - Budapest: Kiadja a KFKI Atomenergia Kutato Intezet, 1999. - С. 453-468.
  31. Ludewig B., Stein J. V., Sharpe J., Cervantes-Barragan L., Thiel V., Bocharov G. A global imaging view on systems approaches in immunology// Eur. J. Immunol. - 2012. - 42. - С. 3116-3125.
  32. Luzyanina T., Engelborghs K., Ehl S., Klenerman P., Bocharov G. Low level viral persistence after infection with LCMV: a quantitative insight through numerical bifurcation analysis// Math. Biosci. - 2001. - 173, № 1. - С. 1-23.
  33. Marchuk G. I. Mathematical Modelling of Immune Response in Infectious Diseases. - Dordrecht: Kluwer, 1997.
  34. Marchuk G. I., Nisevich N. I. (ed.) Mathematical Methods in Clinical Practice. - Oxford: Pergamon Press Ltd., 1980.
  35. Moskophidis D., Lechner F., Pircher H., Zinkernagel R. M. Virus persistence in acutely infected immunocompetent mice by exhaustion of antiviral cytotoxic effector T cells// Nature. - 1993. - 362.- С. 758-758.
  36. Nechepurenko Yu. M., Sadkane M. A low-rank approximation for computing the matrix exponential norm// SIAM J. Matrix. Anal. Appl. - 2011. - 32, № 2. - С. 349-363.
  37. Nechepurenko Yu. M., Sadkane M. Computing humps of the matrix exponential// J. Comput. Appl. Math. - 2017. - 319. - С. 87-96.
  38. Reshotko E. Transient growth: A factor in bypass transition// Phys. Fluids. - 2001. - 13, № 5. - С. 1067- 1075.
  39. Takeuchi Y., Adachi N., Tokumaru H. The stability of generalized Volterra equations// J. Math. Anal. Appl. - 1978. - 62. - С. 453-473.
  40. Weyl H. The Classical Groups: Their Invariants and Representations. - Princeton: Princeton University Press, 2016.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).