Структура устойчивости к антимикробным препаратам и факторы вирулентности клинических изолятов энтерококка в Пакистане

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Настоящее исследование было разработано для определения у разных видов энтерококков профиля устойчивости к антибиотикам, выявления устойчивости к противомикробным препаратам и генов, связанных с вирулентностью. Материалы и методы. Всего было собрано 150 изолятов энтерококков из различных клинических образцов. Эти изоляты были идентифицированных с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР). Тестирование чувствительности к антибиотикам и определение минимальной ингибирующей концентрации (МИК) ванкомицина проводились в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI). Серия реакций ПЦР использовалась для скрининга генов устойчивости к ванкомицину (vanA, vanB и vanD) и генов вирулентности (esp, ace, asa1, gelE и cylA) среди видов ванкомицинрезистентных энтерококков (ВРЭ). Результаты. Выделенные штаммы энтерококков включали 62,6% E. faecalis, 33,4% E. faecium и 4% других видов. В целом энтерококки показали высокий уровень устойчивости: 94% — к эритромицину, за которым следуют ципрофлоксацин (82,6%), левофлоксацин (70%) и ванкомицин (16%). 57,4% изолятов были получены от госпитализированных пациентов, 96% изолятов энтерококков имели множественную лекарственную устойчивость. МИК для ВРЭ штаммов большинства изолятов варьировали в диапазоне от 32 мкг/мл до 256 мкг/мл. ВРЭ фенотипы в виде vanA, vanB и vanD были обнаружены у 29,2%, 37,5% и 33,3% изолятов соответственно. В отношении факторов вирулентности, получены следующие распределения: esp — 16,6%, asa1 — 70,8%, gelE — 25%, ace — 33,3% и cylA — 25%. Заключение. Большинство изолятов были E. faecalis и имели множественную лекарственную устойчивость. ВРЭ изоляты несли гены устойчивости к противомикробным препаратам и гены, связанные с вирулентностью, а фенотипы vanA, vanB, vanD были наиболее распространены среди ВРЭ изолятов.

Об авторах

Д. Улла

Университет Харипура

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

магистр философии, преподаватель, кафедра медицинских лабораторных технологий, факультет фундаментальных и прикладных наук

Пакистан, КПК

А. Азиз

Университет Харипура

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

магистр философии, преподаватель, кафедра медицинских лабораторных технологий, факультет фундаментальных и прикладных наук

Пакистан, КПК

А. Улла

Университет Харипура

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

магистр философии, преподаватель, кафедра медицинских лабораторных технологий, факультет фундаментальных и прикладных наук

Пакистан, КПК

И. Улла

Университет Харипура

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

магистр философии, преподаватель, кафедра медицинских лабораторных технологий, факультет фундаментальных и прикладных наук

Пакистан, КПК

А. Джаббар

Университет Харипура

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

ассистент, кафедра медицинских лабораторных технологий, факультет фундаментальных и прикладных наук

КПК

М. Умейр

Хайберский медицинский университет

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

магистр философии, преподаватель, Институт парамедицинских наук (IPMS)

Пакистан, Пешавар, КПК

М. Улла

Хайберский медицинский университет

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

ассистент

Пешавар, КПК

Х. Улла

Группа Сайду клинической больницы

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

магистр философии, преподаватель

Пакистан, Сайду-Шариф, Сват, КПК

М. Улла

Хайберский медицинский университет

Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

магистр философии, преподаватель

Пакистан, Пешавар, КПК

Ихсан Али

Хайберский медицинский университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: ihsan.ipms@kmu.edu.pk

доцент кафедры медицинских лабораторных технологий, Институт парамедицинских наук (IPMS)

Пакистан, Пешавар, КПК

Список литературы

  1. Ahmed M.O., Baptiste K.E. Vancomycin-Resistant Enterococci: A Review of Antimicrobial Resistance Mechanisms and Perspectives of Human and Animal Health. Microb. Drug. Resist., 2018, vol. 24, no. 5, pp. 590–606. doi: 10.1089/mdr.2017.0147
  2. Alotaibi F.E., Bukhari E.E. Emergence of Vancomycin-resistant Enterococci at a Teaching Hospital, Saudi Arabia. Chin. Med. J. (Engl.), 2017, vol. 130, no. 3, pp. 340–346. doi: 10.4103/0366-6999.198923
  3. Arshadi M., Mahmoudi M., Motahar M.S., Soltani S., Pourmand M.R. Virulence determinants and antimicrobial resistance patterns of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolated from different sources in Southwest Iran. Iranian Journal of Public Health, 2018, vol. 47, no. 2: 264.
  4. Biswas P.P., Dey S., Sen A., Adhikari L. Molecular Characterization of Virulence Genes in Vancomycin-Resistant and Vancomycin-Sensitive Enterococci. J. Glob. Infect. Dis., 2016, vol. 8, no. 1, pp. 16–24. doi: 10.4103/0974-777X.176141
  5. Brown D.F., Hope R., Livermore D.M., Brick G., Broughton K., George R.C., Reynolds R.; BSAC Working Parties on Resistance Surveillance. Non-susceptibility trends among enterococci and non-pneumococcal streptococci from bacteraemias in the UK and Ireland, 2001-06. J. Antimicrob. Chemother., 2008, vol. 62, suppl. 2: ii75–85. doi: 10.1093/jac/dkn354
  6. CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. 30th ed. CLSI supplement M100. USA: Clinical and Laboratory Standards Institute, 2020. 332 p.
  7. Emaneini M., Hosseinkhani F., Jabalameli F., Nasiri M.J., Dadashi M., Pouriran R., Beigverdi R. Prevalence of vancomycin-resistant Enterococcus in Iran: a systematic review and meta-analysis. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2016, vol. 35, no. 9, pp. 1387–1392. doi: 10.1007/s10096-016-2702-0
  8. Emaneini M., Aligholi M., Aminshahi M. Characterization of glycopeptides, aminoglycosides and macrolide resistance among Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolates from hospitals in Tehran. Pol. J. Microbiol., 2008, vol. 57, no. 2, pp. 173–178.
  9. Facklam R.R., Collins M.D. Identification of Enterococcus species isolated from human infections by a conventional test scheme. J. Clin. Microbiol., 1989, vol. 27, no. 4, pp. 731–734. doi: 10.1128/jcm.27.4.731-734.1989
  10. Fath E.B., Bonakdar H.F., Eyni M., Ali G.M., Nakhjavani F.A., Kazemi B. Detection of vancomycin resistant enterococci (VRE) isolated from urinary tract infections (UTI) in Tehran, Iran. 2006. DARU, 2006, vol. 14, no. 3, pp. 141–145.
  11. Ghaziasgar F.S., Poursina F., Hassanzadeh A. Virulence factors, biofilm formation and antibiotic resistance pattern in Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolated from clinical and commensal human samples in Isfahan, Iran. Ann. Ig., 2019, vol. 31, no. 2, pp. 154–164. doi: 10.7416/ai.2019.2268
  12. Haghi F., Lohrasbi V., Zeighami H. High incidence of virulence determinants, aminoglycoside and vancomycin resistance in enterococci isolated from hospitalized patients in Northwest Iran. BMC Infect. Dis., 2019, vol. 19, no. 1: 744. doi: 10.1186/s12879-019-4395-3
  13. Heidari H., Emaneini M., Dabiri H., Jabalameli F. Virulence factors, antimicrobial resistance pattern and molecular analysis of Enterococcal strains isolated from burn patients. Microb. Pathog., 2016, vol. 90, pp. 93–97. doi: 10.1016/j.micpath.2015.11.017
  14. Hubble T.S., Hatton J.F., Nallapareddy S.R., Murray B.E., Gillespie M.J. Influence of Enterococcus faecalis proteases and the collagen-binding protein, Ace, on adhesion to dentin. Oral Microbiol. Immunol., 2003, vol. 18, no. 2, pp. 121–126. doi: 10.1034/j.1399-302x.2003.00059.x
  15. Jahansepas A., Ahangarzadeh Rezaee M., Hasani A., Sharifi Y., Rahnamaye Farzami M., Dolatyar A., Aghazadeh M. Molecular Epidemiology of Vancomycin-Resistant Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium Isolated from Clinical Specimens in the Northwest of Iran. Microb. Drug Resist., 2018, vol. 24, no. 8, pp. 1165–1173. doi: 10.1089/mdr.2017.0380
  16. Kafil H.S., Asgharzadeh M. Vancomycin-resistant enteroccus faecium and enterococcus faecalis isolated from education hospital of Iran. Maedica (Bucur), 2014, vol. 9, no. 4, pp. 323–327.
  17. Kariyama R., Mitsuhata R., Chow J.W., Clewell D.B., Kumon H. Simple and reliable multiplex PCR assay for surveillance isolates of vancomycin-resistant enterococci. J. Clin. Microbiol., 2000, vol. 38, no. 8, pp. 3092–3095. doi: 10.1128/JCM.38.8.3092-3095.2000
  18. López-Salas P., Llaca-Díaz J., Morfin-Otero R., Tinoco J.C., Rodriguez-Noriega E., Salcido-Gutierres L., González G.M., Mendoza-Olazarán S., Garza-González E. Virulence and antibiotic resistance of Enterococcus faecalis clinical isolates recovered from three states of Mexico. Detection of linezolid resistance. Arch. Med. Res., 2013, vol. 44, no. 6, pp. 422–428. doi: 10.1016/j.arcmed.2013.07.003
  19. Pinholt M., Ostergaard C., Arpi M., Bruun N.E., Schønheyder H.C., Gradel K.O., Søgaard M., Knudsen J.D.; Danish Collaborative Bacteraemia Network (DACOBAN). Incidence, clinical characteristics and 30-day mortality of enterococcal bacteraemia in Denmark 2006–2009: a population-based cohort study. Clin. Microbiol. Infect., 2014, vol. 20, no. 2, pp. 145–151. doi: 10.1111/1469-0691.12236
  20. Reyes K., Bardossy A.C., Zervos M. Vancomycin-Resistant Enterococci: Epidemiology, Infection Prevention, and Control. Infect. Dis. Clin. North Am., 2016, vol. 30, no. 4, pp. 953–965. doi: 10.1016/j.idc.2016.07.009
  21. Sattari-Maraji A., Jabalameli F., Node Farahani N., Beigverdi R., Emaneini M. Antimicrobial resistance pattern, virulence determinants and molecular analysis of Enterococcus faecium isolated from children infections in Iran. BMC Microbiol., 2019, vol. 19, no. 1: 156. doi: 10.1186/s12866-019-1539-y
  22. Shokoohizadeh L., Ekrami A., Labibzadeh M., Ali L., Alavi S.M. Antimicrobial resistance patterns and virulence factors of enterococci isolates in hospitalized burn patients. BMC Res. Notes, 2018, vol. 11, no. 1: 1. doi: 10.1186/s13104-017-3088-5
  23. Shokouhi S., Darazam I.A., Javadi A., Rouhani M., Ghasemnejad M. Genotypic Characterization of Vancomycin-Resistant Enterococcus spp. In Tertiary Center, Iran. Infect. Disord. Drug. Targets, 2017, vol. 17, no. 2, pp. 90–94. doi: 10.2174/1871526517666170210164649
  24. Wardal E., Kuch A., Gawryszewska I., Żabicka D., Hryniewicz W., Sadowy E. Diversity of plasmids and Tn1546-type transposons among VanA Enterococcus faecium in Poland. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2017, vol. 36, no. 2, pp. 313–328. doi: 10.1007/s10096-016-2804-8
  25. Yang J.X., Li T., Ning Y.Z., Shao D.H., Liu J., Wang S.Q., Liang G.W. Molecular characterization of resistance, virulence and clonality in vancomycin-resistant Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis: a hospital-based study in Beijing, China. Infect Genet. Evol., 2015, vol. 33, pp. 253–260. doi: 10.1016/j.meegid.2015.05.012
  26. Yu J., Shi J., Zhao R., Han Q., Qian X., Gu G., Zhang X., Xu J. Molecular Characterization and Resistant Spectrum of Enterococci Isolated from a Haematology Unit in China. J. Clin. Diagn. Res., 2015, vol. 9, no. 6: DC04-7. doi: 10.7860/JCDR/2015/12864.6097
  27. Zhang Y., Du M., Chang Y., Chen L.A., Zhang Q. Incidence, clinical characteristics, and outcomes of nosocomial Enterococcus spp. bloodstream infections in a tertiary-care hospital in Beijing, China: a four-year retrospective study. Antimicrob. Resist. Infect. Control, 2017, vol. 6: 73. doi: 10.1186/s13756-017-0231-y
  28. Zhou W., Zhou H., Sun Y., Gao S., Zhang Y., Cao X., Zhang Z., Shen H., Zhang C. Characterization of clinical enterococci isolates, focusing on the vancomycin-resistant enterococci in a tertiary hospital in China: based on the data from 2013 to 2018. BMC Infect. Dis., 2020, vol. 20, no. 1, pp. 1–9.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Дополнительные материалы
Скачать (49KB)
Метаданные
3. Рисунок 1. Среднее распределение минимальных ингибирующих концентраций E. faecalis (E.fs) и E. faecium (E.fm) среди различных клинических образцов пациентов, посещавших больницу третичного уровня медицинской помощи в Пешаваре, Пакистан, с января 2020 г. по февраль 2021 г.

Скачать (186KB)
Метаданные

© Улла Д., Азиз А., Улла А., Улла И., Джаббар А., Умейр М., Улла М., Улла Х., Улла М., Али И., 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».