Adhesiveness of the specific phages to yersiniae cells assessed by optical trapping

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

In recent years, there has been increasing interest in using bacteriophages in the complex therapy of some infectious diseases. Objectively, it is related to the spread of antibiotic resistance and a small number of side effects triggered by phages applied locally and parenterally. Yersiniae are no exception to this rule, but their interaction with virions has not been studied thoroughly. In three types of lytic Yersiniae bacteriophages are used for diagnostic purposes, which differ in specificity, virulence, and morphological features. We evaluated the interaction force between phages and bacteriae by optical trapping.

Materials and methods. Live Yersinia pseudotuberculosis and Y. pestis cells with different LPS structure and preparations of three bacteriophages — Pokrovskaya’s phage, d’Herelle’s phage (also named as the pseudotuberculosis phage) and the phage L-413C were used. The Pokrovskaya’s phage is well studied and widely used in diagnostics, but the mechanism of its adsorption on Y. pestis and Y. pseudotuberculosis cells is not well-understood. The phage L-413C lyses plague bacteria, while d’Herrel’s phage can lyse both pathogens. Virions were linked to the surface of aminated glass. Optically trapped microbial cells were approached to the glass surface and then retracted in the opposite direction. The amplitude of the leap was recalculated into force through calibration coefficients. The primary data were processed in the program “R”; statistical analysis was performed using “Matlab 7.0” and “Statistica 12”

Results and discussion. The analysis of histograms revealed the presence of a specific component in the «Y. pseudotuberculosis–d’Herrell’s phage» (Fmean = 7.46±3.52 pN) system, as well as in all pairs involving plague microbe. In the latter case, the interaction forces were comparable: 8.64±3.83 pN for d’Herelle’s phage,11.03±4.22 pN for Pokrovskaya’s phage, and 10.42±4.79 pN for phage L-413C. The average detachment force from the substrate treated with bovine serum albumin (BSA) was comparable for both cell types. Our results convincingly prove an opportunity for using the optical trapping to estimate interaction force in other «bacterium–phage» systems.

About the authors

Ilya V. Konyshev

Institute of Physiology of the Komi Scientific Center of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences; Vyatka State University

Email: konyshevil@yandex.ru

PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Microbial Physiology, Associate Professor, Department of Biotechnology, Institute of Biology and Biotechnology

Russian Federation, 167982, Syktyvkar, 50, Pervomayskaya street; 610000, Kirov, 36, Moskovskaya street, VyatSU, Biotechnology Department, 513a

Lyubov G. Dudina

Institute of Physiology of the Komi Scientific Center of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences; Vyatka State University

Email: necdew@mail.ru

PhD (Biology), Junior Researcher, Laboratory of Physiology of Microorganisms, Associate Professor, Department of Biotechnology

Russian Federation, 167982, Syktyvkar, 50, Pervomayskaya street; 610000, Kirov, 36, Moskovskaya street, VyatSU, Biotechnology Department, 513a

Nadezhda A. Morozova

Vyatka State University

Email: nadymor2000@gmail.com

MD Student, Department of Biotechnology 

Russian Federation, 610000, Kirov, 36, Moskovskaya street, VyatSU, Biotechnology Department, 513a

Andrey A. Byvalov

Institute of Physiology of the Komi Scientific Center of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences; Vyatka State University

Author for correspondence.
Email: byvalov@nextmail.ru

MD, PhD, Professor, Senior Researcher of the Center of Excellence, head of the Laboratory of Microbial Physiology

Russian Federation, 167982, Syktyvkar, 50, Pervomayskaya street; 610000, Kirov, 36, Moskovskaya street, VyatSU, Biotechnology Department, 513a

References

  1. Лабинская А.С. Микробиология с техникой микробиологических исследований. М.: Медицина,1978. 394 с. [Labinskaya A.S. Microbiology and methods of microbiology. Moscow: Meditsina,1978. 394 p. (In Russ.)]
  2. Филиппов А.А., Эллиотт Дж.М., Бобров А.Г., Кириллина О.А., Мотин В.Л., Чейн П.С., Гарсия Э. Определение нуклеотидной последовательности генома чумного диагностического бактериофага L-413C // Проблемы особо опасных инфекций. 2005, № 2. С. 49–52. (Filippov A.A., Elliott J.M., Bobrov A.G., Kirillina O.A., Motin V.L., Cheyne P.S., Garcia E. Determination of the nucleotide sequence of the genome of the plague diagnostic bacteriophage L-413C. Problemy osobo opasnykh infektsiy = Problems of Particularly Dangerous Infections,2005, no. 2, pp. 49–52. (In Russ.)]
  3. Cabanel N., Bouchier C., Rajerison M., Carniel E. Plasmid-mediated doxycycline resistance in a Yersinia pestis strain isolated from a rat. Int. J. Antimicrob. Agents.,2008, vol. 51, pp. 249–254. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2017.09.015
  4. Capilla S., Ruiz J., Goñi P., Castillo J., Rubio M.C., Jiménez de Anta M.T., Gómez-Lus R., Vila J. Characterization of the molecular mechanisms of quinolone resistance in Yersinia enterocolitica O:3 clinical isolates. J. Antimicrob. Chemother.,2004, vol. 53, pp. 1068–1071. doi: 10.1093/jac/dkh22.5
  5. Cover T.L., Aber R.C. Yersinia enterocolitica. N. Engl. J. Med.,1989, vol. 321, pp. 16–24. doi: 10.1056/NEJM198907063210104
  6. Deacon A.G., Hay A., Duncan J. Septicemia due to Yersinia pseudotuberculosis — a case report. Clin. Microbiol. Infect.,2003, vol. 9, pp. 1118–1119. doi: 10.1046/j.1469-0691.2003.00746.x
  7. Filippov A.A., Sergueev K.V., He, Y., Huang X.-Z., Gnade B.T., Mueller A.J., Fernandez-Prada C.M., Nikolich M.P. Bacteriophage-resistant mutants in Yersinia pestis: identification of phage receptors and attenuation for mice. PLoS One,2011, vol. 6., no. 9: e25486. doi: 10.1371/journal.pone.0025486
  8. Filippov A.A., Sergueev K.V., He Y., Nikolich M.P. Bacteriophages capable of lysing Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis: efficiency of plating tests and identification of receptors in Escherichia coli K-12. Adv. Exp. Med. Biol.,2012, pp. 123–134. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_16
  9. Filippov A.A., Sergueev K.V., He Y., Huang X.Z., Gnade B.T., Mueller A.J., Fernandez-Prada C.M., Nikolich M.P. Bacteriophage therapy of experimental bubonic plague in mice. Adv. Exp. Med. Biol.,2012, vol. 954, pp. 337–348. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_41
  10. Filippov A.A., Sergueev K.V., Nikolich M.P. Can phage effectively treat multidrug-resistant plague? Bacteriophage,2012, vol. 2, pp. 186–189. doi: 10.4161/bact.22407
  11. Galimand M., Carniel E., Courvalin P. Resistance of Yersinia pestis to antimicrobial agents. Antimicrob. Agents Chemother.,2006, vol. 50, pp. 3233–3236. doi: 10.1128/AAC.00306-06
  12. Galindo C.L., Rosenzweig J.A., Kirtley M.L., Chopra A.K. Pathogenesis of Y. enterocolitica and Y. pseudotuberculosis in Human Yersiniosis. J. Pathog.,2011: 182051. doi: 10.4061/2011/182051
  13. Garcia E., Chain P., Elliott J.M., Bobrov A.G., Motin V.L., Kirillina O., Lao V., Calendar R., Filippov A.A. Molecular characterization of L-413C, a P2-related plague diagnostic bacteriophage. Virology,2008, vol. 372, no. 1, pp. 85–96. doi: 10.1016/ j.virol.2007.10.032
  14. Górski A., Międzybrodzki R., Jończyk-Matysiak E., Borysowski J., Letkiewicz S., Weber-Dąbrowska B. The fall and rise of phage therapy in modern medicine. Expert. Opin. Biol. Ther.,2019, vol. 19, pp. 1115–1117. doi: 10.1080/14712598.2019.1651287
  15. Hill A.A., Diehl G.E. The infectious cause of the chronic effect. Cell Host Microbe,2015, vol. 18, pp. 383–385. doi: 10.1016/ j.chom.2015.09.011
  16. Vagima Y., Gur D., Aftalion M., Moses S., Levy Y., Makovitzki A., Holtzman T., Oren Z., Segula Y., Fatelevich E., Tidhar A., Zauberman A., Rotem S., Mamroud E., Steinberger-Levy I. Phage therapy potentiates second-line antibiotic treatment against pneumonic plague. Viruses,2022, vol. 14: 688. doi: 10.3390/v14040688
  17. Zhao X., Skurnik M. Bacteriophages of Yersinia pestis. Adv. Exp. Med. Biol.,2016, vol. 918, pp. 361–375. doi: 10.1007/978-94-024-0890-4_13.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2023 Konyshev I.V., Dudina L.G., Morozova N.A., Byvalov A.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».