Искусственный интеллект в иммунодиагностике хронического пародонтита

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Искусственный интеллект используется для диагностики различных заболеваний полости рта. В области клинической лабораторной диагностики алгоритмы машинного обучения применяются в интерпретации сложных биохимических данных. Точную диагностическую информацию о пародонтите можно получить при создании комбинации соответствующих биомаркеров с необходимой чувствительностью и специфичностью. Целью настоящего исследования стал поиск значимых инфекционно-иммунологических клинико-лабораторных данных на основе алгоритма машинного обучения при хроническом пародонтите. Для этого обследовано 124 пациента в возрасте от 40 до 70 лет с диагнозом «Хронический пародонтит», которым методом ПЦР в реальном времени провели исследование кармана пародонта на ДНК вирусов герпеса человека и бактериальную пародонтопатогенную микрофлору Аggregatibacter actinomycetemcomitans, Fusobacterium nucleatum, Tannerella forsythia, Treponema denticola, Prevotella intermedia, Porphyromonas endodontalis, Porphyromonas gingivalis. Также изучались матричные РНК провоспалительных цитокинов и другие маркеры хронизации воспалительного процесса: IL-1β, IL-10, IL-18, TNFα, TLR4, GATA3, CD68. В пробе зубодесневой жидкости определяли TNFα, IFNγ, IL-1β, IL-4, IL-6, IL-10, IL-18, VEGF. Иммунные клетки ротовой полости оценивали по содержанию CD3+, CD4+, CD8+, CD3+HLA-DR+, CD64+CD16+CD14, Treg CD4+CD25+CD127+low, T-NK CD3+CD16+CD56+, NK CD3CD16+CD56+, СD14+, СD14+HLA-DR+, CD19+, CD19+HLA-DR+, B1 CD19+CD5+B27, B2 CD19+CD5B27, CD19+CD5B27+. Для оценки данных использовалось машинное обучение «random forest». Была выявлена связь между патогенной микрофлорой и характером иммунного ответа. Преобладал провоспалительный компонент, выраженный в экспрессии мРНК IL-1β, TNFα, IFNγ в иммунном ответе на агрессивные пародонтопатогены: Treponema denticola, Fusobacterium nucleatum и др. Алгоритм машинного обучения «random forest» выбрал из множества данных корреляционные отношения r ≥ 0,5 (как положительные, так и отрицательные) для проведения дальнейшего анализа оператором. Модель машинного обучения «random forest» на 10% с учителем показала следующие значимые сочетания данных: VEGF, CD3+, CD14+HLA-DR, CD19+CD5CD27+, а также мРНК TLR4, IL-1b, IL-10, TNFa, IL-18. Развитие примененной модели «random forest» машинного обучения с учителем уже на 25% показала отличия: P. endodontalis, GATA3, CD3+, CD14+, CD19+CD5CD27+, а также мРНК TLR4, TNFa, IL-1b, IL-10, IL-18. Поиск значимых инфекционно-иммунологических клинико-лабораторных данных на основе алгоритма машинного обучения при хроническом пародонтите показал значимость в развитии остеодеструктивного воспалительного процесса мРНК провоспалительных цитокинов, моноцитов, Т-лимфоцитов и В-клеток памяти. Для поиска взаимосвязей инфекционного иммунопатологического процесса может применяться машинное обучение с учителем на базе модели «random forest», что позволяет статистически обрабатывать большие массивы данных и выявлять неявные причинно-следственные факторы.

Об авторах

Валерий Павлович Мудров

ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России; ГБУ Диагностический клинический центр № 1 Департамента здравоохранения г. Москвы

Автор, ответственный за переписку.
Email: vpmudrov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1129-8335
SPIN-код: 4934-3745
Scopus Author ID: 934044
ResearcherId: ABD-8217-2020

к.м.н., ассистент кафедры медицинской биохимии и иммунопатологии академического образовательного центра фундаментальной и трансляционной медицины (АОЦФТМ); врач клинической лабораторной диагностики 

Россия, 125284, Москва, ул. Поликарпова, 1/10; Москва

Список литературы

  1. Cabitza F., Banfi G. Machine learning in laboratory medicine: waiting for the flood? Clin. Chem. Lab. Med., 2018, vol. 56, no. 4, pp. 516–524. doi: 10.1515/cclm-2017-0287
  2. De Bruyne S., Speeckaert M.M., Van Biesen W., Delanghe J.R. Recent evolutions of machine learning applications in clinical laboratory medicine. Crit. Rev. Clin. Lab. Sci., 2021, vol. 58, no. 2, pp. 131–152. doi: 10.1080/10408363.2020.1828811
  3. Lee J.-H., Kim D.-Н., Jeong S.-N., Choi S.-H. Diagnosis and prediction of periodontally compromised teeth using a deep learning-based convolutional neural network algorithm. J. Periodontal. Implant. Sci., 2018, vol. 48, no. 2, pp. 114–123. doi: 10.5051/jpis.2018.48.2.114
  4. Mupparapu M., Wu C.W., Chen Y.C. Artificial intelligence, machine learning, neural networks, and deep learning: futuristic concepts for new dental diagnosis. Quintessence Int., 2018, vol. 49, no. 9, pp. 687–688. doi: 10.3290/j.qi.a41107
  5. Nakano Y., Suzuki N., Kuwata F. Predicting oral malodour based on the microbiota in saliva samples using a deep learning approach. BMC Oral Health, 2018, vol. 18, pp. 128–135. doi: 10.1186/s12903-018-0591-6
  6. Patil S., Albogami S., Hosmani J., Mujoo S., Kamil M.A., Mansour M.A., Abdul H.N., Bhandi S., Ahmed S.S.S.J. Artificial intelligence in the diagnosis of oral diseases: applications and pitfalls. Diagnostics (Basel), 2022, vol. 12, no. 5: 1029. doi: 10.3390/diagnostics12051029
  7. Revilla-León M., Gómez-Polo M., Barmak A.B., Inam W., Kan J.Y.K., Kois J.C., Akal O. Artificial intelligence models for diagnosing gingivitis and periodontal disease: a systematic review. J. Prosthet. Dent., 2022, S0022-3913(22)00075-0. doi: 10.1016/ j.prosdent.2022.01.026

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рисунок 1. Значимые параметры хронического пародонтита по результатам «машинного обучения» при обучении с учителем на 10%

Скачать (80KB)
3. Рисунок 2. Значимые параметры хронического пародонтита по результатам «машинного обучения» при обучении с учителем на 25%

Скачать (74KB)

© Мудров В.П., 2022

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».