Selective synthetic growth medium “Acinetobacter phenylalanine agar” for isolation and identification of Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex species

封面

如何引用文章

全文:

详细

The aim of the study was to carry out clinical and microbiological testing of selective growth medium Acinetobacter phenylalanine agar to isolate and identify bacterial species belonging to the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex (ACB complex). For this, 400 samples of clinical material (wound discharge, blood, urine, bronchoalveolar lavage) were examined in 2018 in the Clinical and Bacteriological Laboratory of the Military Medical Academy by using routine assays (seeding on blood agar growth medium, pure culture isolation and identification by using biochemical assays as well as VITEK 2 microbial identification system, bioMerieux) and plating together with growth medium Acinetobacter phenylalanine agar selective to Acinetobacter spp. owing to L-phenylalanine as a sole nitrogen and carbon source additional selected with trimethoprim. ACB complex Acinetobacters were identified 18–24 hours later after incubation at 37°C by emergence of typical colonies on selective medium. Control tests for cytochrome oxidase as well as oxidative/fermentation (OF)-glucose test by using peroxide-hydrogen microvolume method (for 1 h) allowed to rapidly distinguish ACB complex Acinetobacters from other bacteria as well as from Acinetobacter spp. unable to glucose oxidation. Next, species identity for all isolated Acinetobacter strains was established by using matrix-activated laser desorption/ionization with time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). It was found that by using novel vs. routine assay Acinetobacter spps. were isolated in 26 (18 samples — in monoculture, 8 — in association with Pseudomonas aeruginosa or Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae with tiny associate colonies) vs. 20 (7 — in monoculture, 13 — in association with Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella, Escherichia, Citrobacter, Providencia, Staphylococcus, Enterococcus, C. albicans). Using MALDI-TOF MS method revealed that 25 out of 26 Acinetobacter strains isolated on selective growth medium belonged to the ACB complex (A. baumannii — 23, A. pittii — 2), whereas one strain (A. baylyi) did not belong to ACB complex. Hence, the diagnostic specificity of the Acinetobacter phenylalanine agar synthetic growth medium for isolation and identification of the A. calcoaceticus — A. baumannii complex species comprised 96.2%, with diagnostic sensitivity exceeding that one for routine assay by 25%. Use of selective growth medium accelerates research by allowing to isolate and identify ACB complex Acinetobacter spp. 18–24 h later after plating clinical material. Selectivity of growth medium was potentially stable, as its major trophic selection factor did not depend on acquired bacterial antibiotic resistance, which is also suitable as a synthetic growth medium for standardized studies.

作者简介

E. Sivolodskii

S.M. Kirov Military Medical Academy;
St. Petersburg Pasteur Institute

Email: es279@yandex.ru

PhD, MD (Medicine), Professor of the Department of Microbiology, S.M. Kirov Military Medical Academy; Senior Researcher, St. Petersburg Pasteur Institute

St. Petersburg

俄罗斯联邦

G. Gorelova

S.M. Kirov Military Medical Academy

Email: elenagorelova@mail.ru

Bacteriologist, Microbiological Laboratory, Central Clinical Diagnostic Laboratory

St. Petersburg

俄罗斯联邦

S. Bogoslovskaya

S.M. Kirov Military Medical Academy

Email: telola@mail.ru

Bacteriologist, Microbiological Laboratory, Central Clinical Diagnostic Laboratory

St. Petersburg

俄罗斯联邦

E. Zueva

St. Petersburg Pasteur Institute

编辑信件的主要联系方式.
Email: elenazueva9@gmail.com

Zueva Elena V., PhD (Medicine), Senior Researcher, Laboratory of Molecular Immunology

197101, St. Petersburg, Mira str., 14

俄罗斯联邦

参考

  1. Патент № 2660567 Российская Федерация, МПК C12Q 1/04 (2006.01); C12N 1/20 (2006.01); C12R 1/02 (2006.01). Способ выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii: № 2017130632; заявлено 29.08.2017: опубликовано 06.07.2018 / Сиволодский Е.П. Патентообладатель: Сиволодский Е.П. 8 с.
  2. Сиволодский Е.П. Пероксидводородный микрообъемный метод ОФ-теста: экспрессное определение окисления и ферментации глюкозы грамотрицательными бактериями // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1991. № 1. С. 14–17.
  3. Сиволодский Е.П., Зуева Е.В. Таксономическое и прикладное значение профилей утилизации белковых аминокислот бактерий Acinetobacter baumannii, Acinetobacter pittii, Acinetobacter nosocomialis // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2018. № 4 (64). С. 113–116.
  4. Cosgaya C., Mari-Almirall M., Van Assche A., Fernandez-Orth D., Mosqueda N., Telli M., Huys G., Higgins P., Seifert H., Lievens B., Roca I., Vila J. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2016, vol. 66, pp. 4105–4111. doi: 10.1099/ijsem.0.001318
  5. Gerner-Smidt P., Tjernberg I., Ursing J. Reliablity of phenotypic tests for identification of Acinetobacter species. J. Clin. Microbiol., 1991, vol. 29, no. 2, pp. 277–282.
  6. Jawad A., Hawkey P.M., Heritage J., Shnelling A.M. Description of Leeds Acinetobacter medium, a new selective and differential medium for clinically important Acinetobacter spp. and comparison with Herella agar and Holton’s agar. J. Clin. Microbiol., 1994, vol. 32, no. 10, pp. 2353–2358.
  7. Nemec A., Krizova L., Maixnerova M., Sedo O., Brisse S., Higgins P.G. Acinetobacter seifertii sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex isolated from human clinical specimens. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2015, vol. 65, pp. 934–942. doi: 10.1099/ijs.0.000043
  8. Nemec A., Krizova L., Maixnerova M., Van der Reijden T.J., Deschaght P., Passet V., Veneechoutte M., Brisse S., Dijkshoorn L. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formeily Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13 TU). Res. Microbiol., 2011, vol. 162, pp. 393–404.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML

版权所有 © Sivolodskii E.P., Gorelova G.V., Bogoslovskaya S.P., Zueva E.V., 2020

Creative Commons License
此作品已接受知识共享署名 4.0国际许可协议的许可

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».