Сравнительный анализ ассоциации полиморфизма rs9939609 гена FTO у пациентов с сахарным диабетом 2-го типа в татарской и якутской популяциях

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Обоснование. Один из важнейших полиморфизмов генов, который может отвечать за развитие инсулинорезистентности, – полиморфный маркер rs9939609 гена FTO.

Цель. Провести молекулярно-генетический анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфизма rs9939609 гена FTO, ассоциированного с риском развития сахарного диабета 2-го типа (СД 2), у пациентов с СД 2 в якутской и татарской популяциях.

Материалы и методы. В исследовании приняли участие лица с СД 2 из популяции якутской национальности Республики Саха (Якутия) ФГБНУ ЯНЦ КМП, г. Якутск (n=132) и татарской популяции – жители Республики Татарстан (n=134). Молекулярно-генетический анализ полиморфизма rs9939609 гена FTO проведен на базе центральной научно-исследовательской лаборатории ФГБОУ ВО «Казанский ГМУ» и в лаборатории наследственной патологии отдела молекулярной генетики ФГБНУ ЯНЦ КМП. Статистическая обработка данных проведена с использованием программ GraphPad InStat, Microsoft Excel 2007.

Результаты. Частота генотипа АА полиморфизма rs9939609 гена FTO в группе СД 2 в татарской популяции отличалась от собственной контрольной выборки: 30,1% против 14,1% (p=0,00000006), а также от европейской группы контроля из базы данных 1000GENOME: 30,1% против 19,9% (p=0,0006). Частота рискового аллеля в группе СД 2 в якутской популяции оказалась статистически значимо выше, чем в восточноазиатской контрольной группе из базы данных 1000GENOME (27,7% против 16,9%; p=0,00007), в то время как относительно собственной здоровой группы контроля достоверных отличий не выявлено.

Заключение. Чем больше азиатского компонента в геноме популяции, тем в меньшей степени она предрасположена к ожирению и СД 2. Полиморфизм rs9939609 гена FTO ассоциирован с риском развитием СД 2 в татарской популяции, в популяции якутов взаимосвязи не выявлено.

Об авторах

Фарида Вадутовна Валеева

ФГБОУ ВО «Казанский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: val_farida@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6000-8002

д-р мед. наук, проф., зав. каф. эндокринологии 

Россия, Казань

Надежда Ивановна Павлова

ФГБНУ «Якутский научный центр комплексных медицинских проблем»

Email: solnishko_84@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0001-7862-1876

канд. биол. наук, вед. науч. сотр. – рук. лаб. наследственной патологии отд. молекулярной генетики

Россия, Якутск

Алексей Алексеевич Бочуров

ФГБНУ «Якутский научный центр комплексных медицинских проблем»

Email: binbaher@mail.ru
ORCID iD: 0009-0008-5414-4102

мл. науч. сотр. лаб. наследственной патологии отд. молекулярной генетики

Россия, Якутск

Алексей Васильевич Крылов

ФГБНУ «Якутский научный центр комплексных медицинских проблем»

Email: alexkrulovwork@gmail.com
ORCID iD: 0009-0005-5977-5518

мл. науч. сотр. лаб. наследственной патологии отд. молекулярной генетики

Якутск

Любовь Ахмедовна Сыдыкова

ФГАОУ ВО «Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова»

Email: sydlub@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-8377-7012

канд. мед. наук, доц., зав. каф. пропедевтической и факультетской терапии с эндокринологией и лечебной физкультурой Медицинского института

Якутск

Владислав Амирович Алексеев

ФГБНУ «Якутский научный центр комплексных медицинских проблем»

Email: vldslvalekseev@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-6751-6210

мл. науч. сотр. Арктического центра

Россия, Якутск

Камиля Булатовна Хасанова

ФГБОУ ВО «Казанский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: kamilya_khasanova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-1825-487X

ассистент каф. эндокринологии

Россия, Казань

Ильдус Ильясович Ахметов

ФГБОУ ВО «Казанский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: genoterra@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6335-4020

д-р мед. наук, ст. науч. сотр. отд. молекулярной генетики центральной научно-исследовательской лаб. 

Россия, Казань

Татьяна Александровна Киселева

ФГБОУ ВО «Казанский государственный медицинский университет» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: tattiana@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-8959-093X

канд. мед. наук, доц. каф. эндокринологии 

Россия, Казань

Список литературы

  1. Дедов И.И., Шестакова М.В., Викулова О.К., и др. Эпидемиологические характеристики сахарного диабета в Российской Федерации: клинико-статистический анализ по данным регистра сахарного диабета на 01.01.2021. Сахарный диабет. 2021;24(3):204-21 [Dedov II, Shestakova MV, Vikulova OK, et al. Epidemiological characteristics of diabetes mellitus in the Russian Federation: clinical and statistical analysis according to the federal diabetes register data of 01.01.2021. Diabetes Mellitus. 2021;24(3):204-21 (in Russian)]. doi: 10.14341/DM12759
  2. Дедов И.И., Шестакова М.В., Викулова О.К., и др. Сахарный диабет в Российской Федерации: распространенность, заболеваемость, смертность, параметры углеводного обмена и структура сахароснижающей терапии по данным Федерального регистра сахарного диабета, статус 2017 г. Сахарный диабет. 2018;21(3):144-59 [Dedov II, Shestakova MV, Vikulova OK, et al. Diabetes mellitus in Russian Federation: prevalence, morbidity, mortality, parameters of glycaemic control and structure of hypoglycaemic therapy according to the Federal Diabetes Register, status 2017. Diabetes Mellitus. 2018;21(3):144-59 (in Russian)]. doi: 10.14341/DM9686
  3. Ingelsson E, McCarthy MI. Human Genetics of Obesity and Type 2 Diabetes Mellitus: Past, Present, and Future. Circ Genom Precis Med. 2018;11(6):e002090. doi: 10.1161/CIRCGEN.118.002090
  4. Park KS. The Search for Genetic Risk Factors of Type 2 Diabetes Mellitus. Diabetes Metab J. 2011;35(1):12-22. doi: 10.4093/dmj.2011.35.1.12
  5. Krentz NAJ, Gloyn AL. Insights into pancreatic islet cell dysfunction from type 2 diabetes mellitus genetics. Nat Rev Endocrinol. 2020;16(4):202-12. doi: 10.1038/s41574-020-0325-0
  6. Ruchat SM, Weisnagel SJ, Vohl MC, et al. Evidence for interaction between PPARG Pro12Ala and PPARGC1A Gly482Ser polymorphisms in determining type 2 diabetes intermediate phenotypes in overweight subjects. Exp Clin Endocrinol Diabetes. 2009;117(9):455-9. doi: 10.1055/s-0029-1216352
  7. Stratigopoulos G, Padilla SL, LeDuc CA, et al. Regulation of FTO/Ftm gene expression in mice and humans. Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol. 2008;294(4):R1185-6. doi: 10.1152/ajpregu.00839.2007
  8. Кучер А.Н. Ген FTO и болезни: значимость генетического полиморфизма, эпигенетических модификаций и средовых факторов. Генетика. 2020;56:1025-43 [Kucher A. The FTO Gene and Diseases: The Role of Genetic Polymorphism, Epigenetic Modifications, and Environmental Factors. Russian Journal of Genetics. 2020;56:1025-43 (in Russian)]. doi: 10.1134/S1022795420090136
  9. Wåhlén K, Sjölin E, Hoffstedt J, et al. The common rs9939609 gene variant of the fat mass- and obesity-associated gene FTO is related to fat cell lipolysis. J Lipid Res. 2008;49(3):607-11. doi: 10.1194/jlr.M700448-JLR200
  10. Kurtanov KhA, Sydykova LA, Ivanova ON, et al. The study of the FTO gene in Yakut population suffering from type 2 diabetes mellitus. Wulfenia Journal. 2018;25(4):113-22.
  11. Ensembl genome browser. Available at :http://feb2023.archive.ensembl.org/Homo_sapiens/Variation/Population?db=core;r=16:53786115-53787115;v=rs9939609;vdb=variation;vf=730602335. Accessed: 19.03.2024.
  12. Бондарева Э.А., Махалин А.В., Попова Е.В., и др. Предрасположенность к ожирению среди различных этнических групп на территории России и Монголии, обусловленная полиморфизмом гена FTO. Вестник Московского университета. Серия XXIII Антропология. 2018;4:43-8 [Bondareva EA, Makhalin AV, Popova EV, et al. Obesity predisposition associated with FTO gene polymorphism among different ethnic groups of Russia and Mongolia. Moscow University Anthropology Bulletin. 2018;4:43-8 (in Russian)].
  13. Karasawa S, Daimon M, Sasaki S, et al. Association of the common fat mass and obesity associated (FTO) gene polymorphism with obesity in a Japanese population. Endocrine Journal. 2010;57(4):293-301. doi: 10.1507/endocrj.k09e-305
  14. Peng S, Zhu Y, Xu F, et al. FTO gene polymorphisms and obesity risk: a meta-analysis. BMC Med. 2011;9:71. doi: 10.1186/1741-7015-9-71
  15. Abbas S, Raza ST, Ahmed F, et al. Association of genetic polymorphism of PPARγ-2, ACE, MTHFR, FABP-2 and FTO genes in risk prediction of type 2 diabetes mellitus. J Biomed Sci. 2013;20(1):80. doi: 10.1186/1423-0127-20-80
  16. Frayling TM, Timpson NJ, Weedon MN, et al. A common variant in the FTO gene is associated with body mass index and predisposes to childhood and adult obesity. Science (New York, N.Y.). 2007;316(5826):889-94. doi: 10.1126/science.1141634
  17. Батурин А.К., Сорокина Е.Ю., Погожева А.В., и др. Изучение полиморфизма rs9939609 гена FTO у населения Свердловской области. Вопросы питания. 2012;81(5):28-32 [Baturin AK, Anohina O, Sorokina E, et al. The FTO rs9939609 polymorphism study in the Sverdlovsk area, Russia. Problems of Nutrition. 2012;81(5):28-32 (in Russian)].
  18. Бояринова М.А., Ротарь О.П., Костарева А.А., и др. Ассоциация rs9939609 полиморфизма гена FTO с метаболическим здоровьем у пациентов с ожирением в популяции жителей Санкт-Петербурга. Доктор.Ру. 2018;8(152):20-4 [Boyarinova MA, Rotar’ OP, Kostareva AA, et al. Association of rs9939609 FTO gene polymorphism. With metabolic health in ibese patients in St. Petersburg population. Doctor.Ru. 2018;8(152):20-4 (in Russian)]. doi: 10.31550/1727-2378-2018-152-8-20-24
  19. Авзалетдинова Д.Ш., Моругова Т.В., Шарипова Л.Ф., Кочетова О.В. Ассоциация полиморфных локусов предрасположенности к сахарному диабету 2 типа в различных этнических группах Российской Федерации. Сахарный диабет. 2021;24(3):262-72 [Avzaletdinova DS, Morugova TV, Sharipova LF, Kochetova OV. Association of polymorphic loci of susceptibility to diabetes mellitus type 2 in various ethnic groups of the Russian Federation. Diabetes Mellitus. 2021;24(3):262-72 (in Russian)]. doi: 10.14341/DM12531
  20. Павлова Н.И., Куртанов К.А., Соловьева Н.А., и др. Ассоциация полиморфизма rs9939609 гена FTO с развитием ожирения в якутской популяции. Современные проблемы науки и образования. 2018;5:34-43 [Pavlova NI, Kurtanov KA, Soloveva NA, et al. Association of polymorphism rs9939609 FTO gene with development of obesity in the Yakut population. Modern Problems of Science and Education. 2018;5:34-43 (in Russian)]. doi: 10.17513/spno.28020
  21. Насибулина Э.С., Шагимарданова Р.Р., Борисова А.В., Ахметов И.И. Ассоциация полиморфизма гена FTO с избыточной массой тела в российской популяции. Казанский медицинский журнал. 2012;93(5):823-6 [Nasibulina ES, Shagimardanova RR, Borisova AV, Ahmetov II. The association of the FTO gene polymorphism with overweight in Russian population. Kazan Medical Journal. 2012;93(5):823-6 (in Russian)]. doi: 10.17816/KMJ1720
  22. Шакирова А.Т., Егорова Э.С., Лутфуллин И.Я., и др. Ассоциация полиморфизма rs9939609 T/A гена FTO с избыточной массой тела в детской популяции Республики Татарстан. Вопросы детской диетологии. 2017;15(1):5-8 [Shakirova AT, Egorova ES, Lutfullin IYa, et al Association of polymorphism rs9939609 T/A of the FTO gene with overweight in the pediatric population of the Republic of Tatarstan. Pediatric Nutrition. 2017;15(1):5-8 (in Russian)]. doi: 10.20953/1727-5784-2017-1-5-8
  23. Валеева Ф.В., Хасанова К.Б., Созинова Е.А., и др. Анализ ассоциации полиморфизмов генов FTO, PPARG и PPARGC1A с нарушениями углеводного обмена. Казанский медицинский журнал. 2022;103(4):592-601 [Valeeva FV, Khasanova KB, Sozinova EA, et al. Analysis of the association of FTO, PPARG and PPARGC1A gene polymorphisms with carbohydrate metabolism disorders. Kazan Medical Journal. 2022;103(4):592-601 (in Russian)]. doi: 10.17816/KMJ2022-592
  24. Батурин А.К., Сорокина Е.Ю., Погожева А.В., и др. Изучение ассоциации полиморфизмов rs993609 гена FTO и rs659366 гена UCP2 с ожирением у населения Арктической зоны Российской Федерации. Вопросы питания. 2017;86(3):32-9 [Baturin AK, Sorokina EYu, Pogozheva AV, et al. The association of rs993609 FTO gene and rs659366 UCP2 gene polymorphisms with obesity among arctic Russian population. Problems of Nutrition. 2017;86(3):32-9 (in Russian)].
  25. Lemas DJ, Klimentidis YC, Wiener HH, et al. Obesity polymorphisms identified in genome-wide association studies interact with n-3 polyunsaturated fatty acid intake and modify the genetic association with adiposity phenotypes in Yup’ik people. Genes & Nutrition. 2013;8(5):495–505. doi: 10.1007/s12263-013-0340-z
  26. Батурин А.К., Сорокина Е.Ю., Погожева А.В., и др. Региональные особенности полиморфизма генов, ассоциированных с ожирением (rs9939609 гена FTO и Trp64Arg гена ADRB3) у населения России. Вопросы питания. 2014;83(2):35-41 [Baturin AK, Sorokina EYu, Pogozheva AV, et al. Regional features of obesity-associated gene polymorphism (rs9939609 FTO gene and gene Trp64Arg ADRB3) in Russian population. Problems of Nutrition. 2014;83(2):35-41 (in Russian)].
  27. Xue A, Wu Y, Zhu Z, et al. Genome-wide association analyses identify 143 risk variants and putative regulatory mechanisms for type 2 diabetes. Nat Commun. 2018;9(1):2941. doi: 10.1038/s41467-018-04951-w
  28. Балановская Е.В., Агджоян А.Т., Жабагин М.К., и др. Татары Евразии: своеобразие генофондов крымских, поволжских и сибирских татар. Вестник Московского университета. Серия XXIII Антропология. 2016;2:75-85 [Balanovska EV, Agdzhoyan AT, Zhabagin MK, et al. The Tatars of Eurasia: peculiarity of Crimean, Volga and Siberian tatar gene pools. Moscow University Anthropology Bulletin. 2016;2:75-85 (in Russian)].
  29. Харьков В.Н., Степанов В.А., Медведева О.А., и др. Происхождение якутов: анализ гаплотипов Y-хромосомы. Молекулярная биология. 2008;42(2):226-37 [Kharkov VN, Stepanov VA, Medvedeva OF, et al. The origin of Yakuts: analysis of the y-chromosome haplotypes. Molecular Biology. 2008;42(2):226-37 (in Russian)].
  30. Зуев Ю.А. Ранние тюрки: очерки истории и идеологии. Алматы: ДайкПресс, 2002; c. 338 [Zuev IuA. Ranniie tiurki: ocherki istorii i ideologii. Almaty Daik-Press, 2002; p. 338 (in Russian)].
  31. Ушницкий В.В. Теория татарского происхождения якутов. Золотоордынское обозрение. 2014;1(3):43-63 [Ushnitskii VV. Teoriia tatarskogo proiskhozhdeniia iakutov. Zolotoordinskoe obozrenie. 2014;1(3):43-63(in Russian)].
  32. Батурин А.К., Сорокина Е.Ю., Кешабянц Э.Э., и др. Оценка риска дефицита витамина D у жителей Российской Арктики в зависимости от полиморфизма rs9939609 гена FTO. Профилактическая медицина. 2019;22(2):57-61 [Baturin AK, Sorokina EYu, Keshabyants EE, et al. Risk assessment for vitamin D deficiency in the inhabitants of the Russian Arctic according to FTO rs9939609 polymorphism. Profilakticheskaya meditsina. 2019;22(2):57-61 (in Russian)]. doi: 10.17116/profmed20192202157
  33. Конюхова Е.В., Нгуен Ф.Н., Алимова Ф.К., Кравцова О.А. Разнообразие митохондриального генофонда в популяции поволжских татар Республики Татарстан. Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки. 2010;152(2):128-36 [Koniukhova EV, Nguen FN, Alimova FK, Kravtsova OA. Raznoobraziie mitokhondrial'nogo genofonda v populiatsii povolzhskikh tatar Respubliki Tatarstan. Uchenyie zapiski Kazanskogo universiteta. Seriia Estestvennyie nauki. 2010;152(2):128-36 (in Russian)].
  34. Богданова О.Г., Тармаева И.Ю., Сорокина Е.Ю., и др. Оценка риска избыточной массы тела у детей в зависимости от полиморфизма rs9939609 генa FTO. Анализ риска здоровью. 2023;1:55-62 [Bogdanova OG, Tarmaeva IYu, Sorokina EYu, et al. Assessment of health risks caused by overweight in children depending on the FTO gene rs9939609 polymorphism. Health Risk Analysis. 2023;1:55-62 (in Russian)]. doi: 10.21668/health.risk/2023.1.06
  35. Doaei S, Mosavi Jarrahi SA, Sanjari Moghadam A, et al. The effect of rs9930506 FTO gene polymorphism on obesity risk: a meta-analysis. Biomol Concepts. 2019;10(1):237-42. doi: 10.1515/bmc-2019-0025
  36. Поляков Л.М., Розуменко А.А., Осипова Л.П., и др. Липидный спектр сыворотки крови у представителей коренного и пришлого населения Ямало-Ненецкого автономного округа. Сибирский научный медицинский журнал. 2015;35(6):66-9 [Polyakov LM, Rozumenko AA, Osipova LP, et al. Serum lipid spectrum of indigenous and alien population of Yamalo-Nenets Autonomous Okrug. The Siberian Scientific Medical Journal. 2015;35(6):66-9 (in Russian)].
  37. Воробьева Н.А., Белова Н.И., Воробьева А.И. Особенности фенотипического и генотипического липидного статуса коренного этноса Арктики в условиях островного проживания. Атеротромбоз. 2020;(2):44-55 [Vorobyeva NA, Belova NI, Vorobyeva AI. Features of the phenotypic and genotypic lipid status of the indigenous ethnic group of the Arctic in the conditions of island living. Atherothrombosis. 2020;(2):44-55 (in Russian)]. doi: 10.21518/2307-1109-2020-2-44-55

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Частота встречаемости Т-аллеля полиморфизма rs9939609 гена FTO в разных популяциях.

Скачать (68KB)
Метаданные

© ООО "Консилиум Медикум", 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).