Microbiota of the upper respiratory tract in children with chronic adenoiditis

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Background. Routine application of the GC-MS method to assess the URT microbiota can potentially improve the efficacy and safety of treatment for chronic respiratory diseases.

Aim. To perform a comparative analysis of the microbiota from the surface of the pharyngeal tonsil, from the deep parts of the nose, and saliva in children with chronic adenoiditis.

Materials and methods. The study included 90 patients with chronic adenoiditis (CA) and/or pharyngeal tonsil hypertrophy (PTH). All study participants had swabs taken from the surface of the pharyngeal tonsil, from the deep parts of the nasal cavity, and saliva as a biological fluid of the oral cavity. Microorganisms were identified by specific fatty acids using GC-MS to assess the composition of the microbial community on the surface of the pharyngeal tonsil.

Results. The study showed that the microbiota of the nasopharynx is identical in its qualitative composition to microorganisms from the deep parts of the nose. However, according to the results of the analysis of microbial markers of saliva, the oral microbiota showed significant differences in the quantitative and qualitative composition of microorganisms compared with the nasopharyngeal microbiota.

Conclusion. The introduction of the GC-MS method for assessing the URT microbiota enables its monitoring in clinical practice for the treatment of chronic respiratory system diseases without disturbing the ecology of the mucous membranes and the whole body.

About the authors

Irina V. Andriyanova

Voino-Yasenetsky Krasnoyarsk State Medical University

Author for correspondence.
Email: irina-doc@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4917-9358

Cand. Sci. (Med.)

Russian Federation, Krasnoyarsk

Natalya A. Ilyenkova

Voino-Yasenetsky Krasnoyarsk State Medical University

Email: ilenkova1@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-8058-7806

D. Sci. (Med.), Prof.

Russian Federation, Krasnoyarsk

Sergey G. Vakhrushev

Voino-Yasenetsky Krasnoyarsk State Medical University

Email: vsg20061@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7774-0969

D. Sci. (Med.), Prof.

Russian Federation, Krasnoyarsk

Natalia Iu. Romanova

Voino-Yasenetsky Krasnoyarsk State Medical University

Email: medfizika@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-8520-4314

Cand. Sci. (Ph.-Math.)

Russian Federation, Krasnoyarsk

References

  1. Bassis CM, Erb-Downward JR, Dickson RP, et al. Analysis of the upper respiratory tract microbiotas as the source of the lung and gastric microbiotas in healthy individuals. MBio. 2015;6(2):00037-15. doi: 10.1128/mBio.00037-15
  2. Андриянова И.В., Вахрушев С.Г., Каширцева И.А., Казакова О.Э. Результаты сравнительного исследования микробиоты носоглотки детей с хроническим аденоидитом по данным микробиологического исследования и масс-спектрометрии по микробным маркерам. Российская отоларингология. 2015;5(78):9-15 [Andriyanova IV, Vakhrushev SG, Kashirtseva IA, Kazakova OE. Results of comparative research of children nasopharynx microbiota with chronic adenoiditis by microbiological tests and mass spectrometry by microbial markers. Russian otorhinolaryngology. 2015;5(78):9-15 (in Russian)].
  3. Brook I, Gober AE. Resistance to antimicrobials used for therapy of otitis media and sinusitis: effect of previous antimicrobial therapy and smoking. Ann Otol Rhinol Laryngol. 1999;108(7):645-7. doi: 10.1177/000348949910800704
  4. Осипов Г.А. Хромато-масс-спектрометрический анализ микроорганизмов и их сообществ в клинических пробах при инфекциях и дисбиозах. Химический анализ в медицинской диагностике. М.: Наука, 2010 [Osipov GA. Chromatography-mass-spectrometric analysis of microorganisms and their associations in clinical trials of the infections and dysbiosis. Chemical analysis in medical diagnosis. Moscow: Nauka, 2010 (in Russian)].
  5. Цветков Э.А. Аденотонзиллиты и их осложнения у детей. СПб: Элби-СПб, 2003 [Tsvetkov EA. Adenotonsillitis and their complications in children. Saint Petersburg: Elbi-SPb, 2003 (in Russian)].
  6. Русецкий Ю.Ю., Седых Т.К., Чернышенко И.О., Смирнова В.А. Сравнительное бактериологическое исследование микрофлоры поверхности и биоптатов миндалин у детей с патологией лимфоаденоидного глоточного кольца. Педиатрия им. Г.Н. Сперанского. 2012;91(2):52-6 [Rusetsky IuIu, Sedykh TK, Chernyshenko IO, Smirnova VA. Comparative bacteriological study of the microflora of the surface and biopsies of the tonsils in children with pathology of the lymphadenoid pharyngeal ring. Pediatria n.a. G.N. Speransky. 2012;91(2):52-6 (in Russian)].
  7. Проходная В.А., Чибичян Е.Х., Ломова А.С., Косых А.Ю. Методические подходы к сбору и исследованию биологических жидкостей ротовой полости в рамках преподавания пропедевтики стоматологических болезней. Главный врач Юга России. 2018;1(59):43-6 [Prokhodnaya VA, Chibichyan EH, Lomova AS, Kosykh AYu. Methodological approaches to the collection and study of biological fluids of the oral cavity in the framework of teaching propaedeutics of dental diseases. Chief Physician of the South of Russia. 2018;1(59):43-6 (in Russian)].
  8. Гланц С. Медико-биологическая статистика. М.: Практика, 1998 [Glants S. Medico-biological statistics. Moscow: Praktika, 1998 (in Russian)].
  9. Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ STATISTICA. М.: МедиаСфера, 2002 [Rebrova OIu. Statistical analysis of medical data. Application of the STATISTICA application software package. Moscow: MediaSphere, 2002 (in Russian)].
  10. Тулупов Д.А., Карпова Е.П. О роли бактериальной микрофлоры в этиологии хронического аденоидита у детей. Вопросы современной педиатрии. 2014;13(1):172-5 [Tulupov DA, Karpova EP. On the role of bacterial microflora in etiology of chronic adenoiditis in children. Current Pediatrics. 2014;13(1):172-5 (in Russian)]. doi: 10.15690/vsp.v13i1.930
  11. Dickson RP, Erb-Downward JR, Freeman CM, et al. Bacterial topography of the healthy human lower respiratory tract. MBio. 2017;8(1):1262-79.e2. doi: 10.1128/mBio.02287-16
  12. Андриянова И.В., Вахрушев С.Г., Каширцева И.А., Казакова О.Э. Результаты сравнительного исследования микробиоты носоглотки детей с хроническим аденоидитом по данным микробиологического исследования и масс-спектрометрии по микробным маркерам. Российская отоларингология. 2015;5(78):9-15 [Andriyanova IV, Vakhrushev SG, Kashirtseva IA, Kazakova OE. The results of comparative research of children nasopharynx microbiota with chronic adenoiditis by microbiological tests and mass spectrometry by microbial markers. Russian otorhinolaryngology. 2015;5(78):9-15 (in Russian)].

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2. Fig. 1.

Download (325KB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2023 Consilium Medicum

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».