На конференции 1996 г. «Высшая школа: Гуманитарные науки и гуманистическая основа воспитания» было принято решение о создании Забайкальского отделения Академии гуманитарных наук в г. Чите с целью развития гуманитарных направлений науки Забайкалья, объединения и поддержки, главным образом, молодых ученых региона. Открытие отделения состоялось на следующий год, председателем был избран академик АГН, д-р ист. наук М.В. Константинов. Результатами деятельности Забайкальского отделения АГН явился ряд научных и теоретико-практических мероприятий, включающих издание научного журнала.
Первоначально журнал носил название «Вестник Забайкальского отделения Академии гуманитарных наук», первый номер которого вышел в 1997 г. Это стало возможным благодаря инициативе научных сотрудников Забайкальского государственного педагогического университета им. Н. Г. Чернышевского (ныне Забайкальский государственный университет) во главе с главным редактором канд. филос. наук Д. А. Крыловым и заместителем главного редактора канд. филос. наук В.В. Куликовым.
В первую редакционную коллегию вошли: С.Э. Аршинская, Л.И. Коновалова, В.В. Попов, Б.Д. Семашкин; ответственный секретарь – И.Н. Макарова. Членами редакционного совета являлись: В.А. Абрамов, А.О. Баринов, Ф.Ф. Бигзаев, Т.В. Воронченко, Б.В. Емельянов, В.К. Колосов, О.В. Кузнецов, В.В. Мазалов, В.В. Мантатов, А.В. Павлов, П.Б. Попов, Д.Э. Селютин и А.С. Чупров. Сопредседателями совета выступили глава администрации Читинской области Р.Ф. Гениатулин, ректор Забайкальского государственного педагогического университета им. Н.Г. Чернышевского (ЗабГПУ) В.П. Горлачев и проректор по научной работе ЗабГПУ М.В. Константинов.
Полиграфические работы выполнялись на базе издательского подразделения вуза во главе с Г.Т. Черняком. Впоследствии состав совета и членов редколлегии неоднократно изменялся. В мае 1999 г. на 5-летней отчетно-выборной конференции АГН в Санкт-Петербурге «Гуманитарный вектор» был отмечен Петербургской премией Академии гуманитарных наук. «Гуманитарный вектор» издавался два раза в год. В марте 2001 г. журнал был зарегистрирован в Министерстве печати. В нем печатались статьи не только российских, но и зарубежных ученых.
Постоянными разделами журнала стали: «Философия», «Педагогика и психология», «Забайкальский меридиан», «Исторический пантеон», «Abovo» – в рубрике публиковались статьи аспирантов и талантливых студентов, «Опыт, методика, программы», «Отдел рецензий» и «Научная жизнь». Своеобразие научному журналу придавала ведомая В.В. Куликовым рубрика «Философская поэзия России». В перспективе планировалось создание специализированного молодежного приложения, которое и было издано в 2003 г. как альманах «В мире науки» при поддержке Комитета профессионального образования, науки и молодежной политики Читинской области. Из-за финансово-организационных проблем в том же году выпуск журнала прекратился. Но после четырехлетнего перерыва 19 сентября 2007 г. вышел очередной номер журнала.
С 2008 г. журнал «Гуманитарный вектор» выпускается в рамках Лаборатории по исследованию межличностных и межгрупповых отношений (зав. лаб. д-р филос. наук Н.Д. Субботина). Как и в начале своего пути, основной специализацией журнала остаются: публикация научных статей, исследовательских и методических материалов по гуманитарным дисциплинам.
В настоящее время «Гуманитарный вектор» выпускается Издательским комплексом ЗабГУ, изменились тематические направления, обновлен состав редакционной коллегии, статьи рецензируются. Журнал входит в перечень ВАК, включен в систему РИНЦ.