ИЗУЧЕНИЕ ЭТИОЛОГИИ ЗАБОЛЕВАНИЙ С ЛЕТАЛЬНЫМИ ИСХОДАМИ У ДЕТЕЙ В ОЧАГЕ ГРУППОВОЙ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ ШИГЕЛЛЁЗОМ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В доме инвалидов для детей с тяжёлой патологией нервной системы на фоне вспышки шигеллёза у 42 пострадавших, вызванного Shigella flexneri 2a, были отмечены 4 летальных исхода среди детей, госпитализированных в одно из отделений инфекционного стационара. Цель работы - проведение расширенной этиологической диагностики среди пострадавших и оценка возможной роли выявленных патогенов в развитии летальных исходов. Этиологическая диагностика проводилась с применением методов амплификации нуклеиновых кислот и бактериологических методов исследований. Для характеристики патогенов наряду с фенотипическими методами использовали методы макрорестрикционного анализа с разделением продуктов рестрикции в пульсирующем электрическом поле (PFGE), полногеномного (next-generation sequencing - NGS) и сэнгеровского секвенирования. Эпидемиологические данные и результаты лабораторных исследований позволили рассматривать в качестве наиболее вероятной причины летальных исходов у пострадавших генерализованную HSV-1-инфекцию (Herpes simplex virus - вирус простого герпеса 1-го типа).

Об авторах

Наталья Владимировна Паркина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: parkina@cmd.su
мл. науч. сотр. ЛМДиЭ КИ ОМДиЭ ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Екатерина Викторовна Сакалкина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: evzayceva@cmd.su
мл. науч. сотр. ЛМДиЭ КИ ОМДиЭ ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Анна Николаевна Гусева

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: anna302bis@mail.ru
мл. науч. сотр. ЛМДиЭ КИ ОМДиЭ ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Константин Валерьевич Кулешов

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: konstantinkul@gmail.com
канд. мед. наук, науч. сотр., ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Татьяна Александровна Ольнева

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: epid-oki@pcr.ru
мл. науч. сотр., ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Ирина Александровна Гоптарь

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: IrinaGoptar@cmd.su
науч. сотр., ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Эльвира Алексеевна Домонова

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: elvira.domonova@pcr.ms
ст. науч. сотр., ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Светлана Владимировна Матосова

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: svetlana.matosova@cmd.su
мл. науч. сотр., ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Ольга Юрьевна Сильвейстрова

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: olga.silveystrova@pcr.ms
мл. науч. сотр., ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Наталья Анатольевна Хромова

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: hromova@cmd.su
врач КДЛ ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Александр Тихонович Подколзин

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: apodkolzin@mail.ru
доктор мед. наук, зав. лаб. молекулярной диагностики и эпидемиологии кишечных инфекций ФБУН «ЦНии эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Герман Александрович Шипулин

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: shipgerman@gmail.com
канд. мед. наук, руководитель ОМДиЭ ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии» Роспотребнадзора 111123, г. Москва, Россия, ул. Новогиреевская, д. 3а

Список литературы

  1. Connor T.R., Barker C.R., Baker K.S., Weill F.-X., Talukder K.A., Smith A.M. et al. Species-wide whole genome sequencing reveals historical global spread and recent local persistence in Shigella flexneri. Elife. 2015; 4:e07335.
  2. Kuleshov K.V., Kostikova A., Pisarenko S.V., Kovalev D.A., Tikhonov S.N., Savelievа I.V. et al. Comparative genomic analysis of two isolates of Vibrio cholerae O1 Ogawa El Tor isolated during outbreak in Mariupol in 2011. Infection, Genetics and Evolution. 2016; 44: 471-8.
  3. Rekabdar E., Tunbäck P., Liljeqvist J.-Å., Bergström T. Variability of the glycoprotein G gene in clinical isolates of herpes simplex virus type 1. Clinical and diagnostic laboratory immunology. 1999; 6(6): 826-31.
  4. Lamba K., Nelson J.A., Kimura A.C., Poe A., Collins J., Kao A.S. et al. Shiga Toxin 1-Producing Shigella sonnei Infections, California, United States, 2014-2015. Emerging infectious diseases. 2016; 22(4): 679.
  5. Gray M.D., Lacher D.W., Leonard S.R., Abbott J., Zhao S., Lampel K.A. et al. Prevalence of Shiga toxin-producing Shigella species isolated from French travellers returning from the Caribbean: an emerging pathogen with international implications. Clinical Microbiology and Infection. 2015; 21(8): 765. e9-. e14.
  6. Gray M.D., Lampel K.A., Strockbine N.A., Fernandez R.E., Melton-Celsa A.R., Maurelli A.T. Clinical isolates of Shiga toxin 1a-producing Shigella flexneri with an epidemiological link to recent travel to Hispañiola. Emerging infectious diseases. 2014; 20(10): 1669.
  7. Engelmann I., Gottlieb J., Meier A., Sohr D., Ruhparwar A., Henke-Gendo C. et al. Clinical relevance of and risk factors for HSV-related tracheobronchitis or pneumonia: results of an outbreak investigation. Critical Care. 2007; 11(6): R119.
  8. Скачкова Т.С., Сильвейстрова О.Ю., Ракчеева О.В., Шипулина О.Ю., Кисляков А.Н., Арчкова Х.М., Семина Ю.И. Применение полимеразной цепной реакции в режиме реального времени для выявления возбудителей инфекций в аутопсийном материале. Клиническая лабораторная диагностика. 2015; (9): 79-80.
  9. Anderson B. Managing herpes gladiatorum outbreaks in competitive wrestling: the 2007 Minnesota experience. Current sports medicine reports. 2008; 7(6): 323-7.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО "Эко-вектор", 2017


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».