PCR IDENTIFICATION OF FRAGMENTS OF GENES FOR PATHOGENICITY ISLANDS IN METHICILLIN-RESISTANT STAPHYLOCOCCUS AUREUS STRAINS


Cite item

Full Text

Abstract

The identification of fragments of pathogenicity islands (SAPI1, vSaα and vSaβ) in 11 clinical strains of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), referred on the basis of spa- sequence typing and the restriction-modification test to different genotypes, has been performed. A set of studied pathogenicity islands was shown to be strain-specific and be available for usage as an epidemiological marker of hospital strains of Staphylococcus aureus.

About the authors

A. E Goncharov

Federal State Budgetary Institution of Higher Professional Education"The St. Petersburg 1.1. Mechnikov State Medical Academy"

Email: phage1@yandex.ru
канд. мед. наук, доцент каф. эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии 47, Piskarevskiy prospekt, St. Petersburg, Russian Federation, 195067

L. P Zueva

Federal State Budgetary Institution of Higher Professional Education"The St. Petersburg 1.1. Mechnikov State Medical Academy"

Email: uzueva@mail.ru
доктор мед. наук, проф., зав. каф. эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии 47, Piskarevskiy prospekt, St. Petersburg, Russian Federation, 195067

A. E. Suvorov

State Budgetary Institution"Institute of Experimental Medicine of the NorthWest Branch of the Russian Academy of Medical Sciences"

Email: suvorov1@hotmail.com
доктор мед. наук, проф., зав. отд. молекулярной генетики патогенных микроорганизмов 12, Akad.Pavlov Str., St.Petersburg, Russian Federation, 197376

L. S Glazovskaya

State Budgetary Educational Institution of Higher Professional Education"Kemerovo state medical academy" of the Ministry of Health care

канд. мед. наук, доцент каф. эпидемиологии 22a, Voroshilova Str., Kemerovo, 650029

E. B Brusina

State Budgetary Educational Institution of Higher Professional Education"Kemerovo state medical academy" of the Ministry of Health care

Email: brusina@mail.ru
доктор мед. наук, проф., зав. каф. эпидемиологии 22a, Voroshilova Str., Kemerovo, 650029

I. S. Azizov

The Republican State Enterprise"Karaganda State Medical University"

Email: antibiotic@mail.kz
доктор мед. наук, гл. науч. сотр., зав. микробиологической лабораторией 40, Gogolya Str., Karaganda, The Republic of Kazakhstan, 100008

A. V Lavrinenko

The Republican State Enterprise"Karaganda State Medical University"

Email: lavrinenko.alena@gmail.com
канд. мед. наук, ассистент каф. микробиологии 40, Gogolya Str., Karaganda, The Republic of Kazakhstan, 100008

T. N Suborova

State Budgetary Educational Institution of Higher Professional Education"Kemerovo state medical academy" of the Ministry of Health care

доктор мед. наук, ст. на уч. сотр. научно-исследовательской лаб. военно-полевой хирургии каф. военно-полевой хирургии 22a, Voroshilova Str., Kemerovo, 650029

D. V Razumova

The Federal State Treasury Military Educational Institution of Higher Professional Education"Military-medical Academy named after S. M. Kirov" of the Ministry of Defense

мл. науч. сотр. научно-исследовательской лаб. военно-полевой хирургии каф. военно-полевой хирургии 6-Zh, Akademika Lebedeva Str., St.-Petersburg, Russian Federation, 194044

B. I Aslanov

Federal State Budgetary Institution of Higher Professional Education"The St. Petersburg 1.1. Mechnikov State Medical Academy"

Email: khoroshiloff@rambler.ru
канд. мед. наук, доцент каф. эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии 47, Piskarevskiy prospekt, St. Petersburg, Russian Federation, 195067

A. A Dolgiy

Federal State Budgetary Institution of Higher Professional Education"The St. Petersburg 1.1. Mechnikov State Medical Academy"

Email: batyra@mail.ru
канд. мед. наук, доцент каф. эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии 47, Piskarevskiy prospekt, St. Petersburg, Russian Federation, 195067

A. A Dolgiy

Federal State Budgetary Institution of Higher Professional Education"The St. Petersburg 1.1. Mechnikov State Medical Academy"

Email: zoy4@yandex.ru
очный аспирант каф. эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии 47, Piskarevskiy prospekt, St. Petersburg, Russian Federation, 195067

References

  1. Афанасьев М.В., Каракашев С.В., Ильина Е.Н., Салем А.-С.-А.-М., Сидоренко С.В., Говорун В.М. Молекулярно-генетическая характеристика метициллинустойчивых штаммов Staphylococcus aureus, выделенных в стационарах г. Москвы. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2010; 2: 20-4.
  2. Гончаров А.Е., Olsson-Liljequist B., Зуева Л.П. и др. Эпидемический штамм метициллинрезистентного Staphylococcus aureus в стационарах Санкт-Петербурга. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2010; 5: 24-9.
  3. Дмитренко О.А., Шагинян И.А., Прохоров В.Я., Матвеев С.М., Гинцбург А.Л. Молекулярно-генетическое типирование метициллинрезистентных штаммов Staphylococcus aureus, выделенных в разных регионах Российской Федерации, на основании изучения размеров продукта амплификации и последующего рестрикционного анализа коагулазного гена. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2005; 4: 46-52
  4. Cockfield J.D., Pathak S., Edgeworth J.D., Lindsay J.A. Rapid determination of hospital-acquired meticillin-resistant Staphylococcus aureus lineages. J. Med. Microbiol. 2007; 56(Pt 5): 614-9.
  5. Emori T.G., Gaynes R.P. An overview of nosocomial infections, including the role of the microbiology laboratory. Clin. Microbiol. Rev. 1993; 6(4): 428-42.
  6. Harmsen D., Claus H., Witte W. et al. Typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a university hospital setting by using novel software for spa repeat determination and database management. J. Clin. Microbiol. 2003; 41: 5442-8.
  7. Kuroda M. et al. Whole genome sequencing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Lancet. 2001;.357: 1225-40.
  8. Malachowa N., DeLeo F.R. Mobile genetic elements of Staphylococcus aureus. Cell. Mol. Life Sci. 2010; 67: 3057-71.
  9. Tendolkar P.M., Baghdayan A.S., Shankar N. Pathogenic enterococci: new developments in the 21-st century. Cell. Mol. Life Sci. 2003; 60: 3-15.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2013 Eco-vector


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».