Микробные ассоциации биотопов человека как фактор, определяющий возникновение полимикробных инфекций

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

С каждым годом накапливаются сведения об участии условно патогенных микроорганизмов в инициации воспалительных заболеваний человека, поддержании хронического воспалительного ответа и адаптации их таким образом к условиям существования в биотопах организма человека. В настоящем обзоре приводятся сведения о взаимодействиях микроорганизмов, имеющих значение в клинической практике, которые отражаются на вирулентности как условно патогенных видов, так и безусловных патогенов, что, вероятно, лежит в основе хронизации инфекционно-воспалительных процессов. Зачастую по отдельности условно патогенные виды не могут в полном объёме реализовать свой патогенный потенциал, что в условиях микробного симбиоза наблюдается в большинстве случаев. Требуется пересмотр подходов к интерпретации результатов микробиологических исследований, что предполагает учёт функциональной активности совокупной микрофлоры, а также поиск отдельных внехромосомных генетических элементов как маркер патогенности совокупности микроорганизмов.

Об авторах

Анатолий Петрович Годовалов

Пермский государственный медицинский университет имени академика Е.А. Вагнера

Автор, ответственный за переписку.
Email: AGodovalov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5112-2003
SPIN-код: 4482-4378

к.м.н

Россия, Пермь

Список литературы

  1. Шкарин В.В., Благонравова А.С., Чубукова О.А. Эпидемиологический подход к изучению сочетанной инфекционной патологии // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2016. № 6. С. 67–75.
  2. Гинцбург А.Л., Ильина Т.С., Романова Ю.М. «Quorum sensing» или социальное поведение бактерий // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2003. № 5. С. 86–93.
  3. Бухарин О.В. Симбиотические взаимоотношения микроорганизмов при инфекции // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013. № 1. С. 93–97.
  4. Бельский В.В., Шаталова Е.В. Взаимное влияние возбудителей при смешанной инфекции ожоговой травмы // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1999. № 4. С. 3–7.
  5. Roberts F.A., Darveau R.P. Microbial protection and virulence in periodontal tissue as a function of polymicrobial communities: symbiosis and dysbiosis // Periodontol 2000. 2015. Vol. 69, N 1. P. 18–27. doi: 10.1111/prd.12087
  6. Janda J.M., Abbott S.L. The Changing Face of the Family Enterobacteriaceae (Order: “Enterobacterales”): New Members, Taxonomic Issues, Geographic Expansion, and New Diseases and Disease Syndromes // Clin Microbiol Rev. 2021. Vol. 34, N 2. P. e00174-20. doi: 10.1128/CMR.00174-20
  7. Rodriguez-Medina N., Barrios-Camacho H., Duran-Bedolla J., Garza-Ramos U. Klebsiella variicola: an emerging pathogen in humans // Emerg Microbes Infect. 2019. Vol. 8, N 1. P. 973–988. doi: 10.1080/22221751.2019.1634981
  8. Hajjar R., Ambaraghassi G., Sebajang H., et al. Raoultella ornithinolytica: emergence and resistance. Infect Drug Resist // 2020. Vol. 13. P. 1091–1104. doi: 10.2147/IDR.S191387
  9. Keyes J., Johnson E.P., Epelman M., et al. Leclercia adecarboxylata: an emerging pathogen among pediatric infections // Cureus. 2020. Vol. 12. P. e8049. doi: 10.7759/cureus.8049
  10. Jun J.-B. Klebsiella pneumoniae liver abscess // Infect Chemother. 2018. Vol. 50, N 3. P. 210–218. doi: 10.3947/ic.2018.50.3.210
  11. Rashid T., Ebringer A. Rheumatoid arthritis is linked to Proteus — the evidence // Clin Rheumatol. 2007. Vol 26, N 7. P. 1036–1043. doi: 10.1007/s10067-006-0491-z
  12. Cheung G.Y.C., Bae J.S., Otto M. Pathogenicity and virulence of Staphylococcus aureus. Virulence // 2021. Vol. 12, N 1. P. 547–569. doi: 10.1080/21505594.2021.1878688
  13. Laux C., Peschel A., Krismer B. Staphylococcus aureus Colonization of the Human Nose and Interaction with Other Microbiome Members // Microbiol Spectr. 2019. Vol. 7, N 2. doi: 10.1128/microbiolspec.GPP3-0029-2018
  14. Rasigade J.-P., Dumitrescu O., Lina G. New epidemiology of Staphylococcus aureus infections // Clin Microbiol Infect. 2014. Vol. 20, N 7. P. 587–588. doi: 10.1111/1469-0691.12718
  15. Tong S.Y., Davis J.S., Eichenberger E., et al. Staphylococcus aureus infections: epidemiology, pathophysiology, clinical manifestations, and management // Clin Microbiol Rev. 2015. Vol. 28, N 3. P. 603–661. doi: 10.1128/CMR.00134-14
  16. Achermann Y., Goldstein E.J., Coenye T., Shirtliff M.E. Propionibacterium acnes: from commensal to opportunistic biofilm-associated implant pathogen // Clin Microbiol Rev. 2014. Vol. 27, N 3. P. 419–440. doi: 10.1128/CMR.00092-13
  17. Baker J.M., Chase D.M., Herbst-Kralovetz M.M. Uterine Microbiota: Residents, Tourists, or Invaders? // Front Immunol. 2018. Vol. 9. P. 208. doi: 10.3389/fimmu.2018.00208
  18. Годовалов А.П., Карпунина Н.С., Карпунина Т.И. Moraxella osloensis в микробиоте репродуктивного тракта при бесплодии: случайные находки или маркеры патологии? // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021. Т. 98, № 1. С. 28–35. doi: 10.36233/0372-9311-53
  19. Sheppard S.K. Strain wars and the evolution of opportunistic pathogens // Curr Opin Microbiol. 2022. Vol. 67. P. 102138. doi: 10.1016/j.mib.2022.01.009
  20. Valm A.M. The Structure of Dental Plaque Microbial Communities in the Transition from Health to Dental Caries and Periodontal Disease // J Mol Biol. 2019. Vol. 431, N 16. P. 2957–2969. doi: 10.1016/j.jmb.2019.05.016
  21. Iwase T., Uehara Y., Shinji H., et al. Staphylococcus epidermidis Esp inhibits Staphylococcus aureus biofilm formation and nasal colonization // Nature. 2010. Vol. 465, N 7296. P. 346–349. doi: 10.1038/nature09074
  22. Zipperer A., Konnerth M.C., Laux C., et al. Human commensals producing a novel antibiotic impair pathogen colonization // Nature. 2015. Vol. 535, N 7613. P. 511–516. doi: 10.1038/nature18634
  23. Uehara Y., Kikuchi K., Nakamura T., et al. H(2)O(2) produced by viridans group streptococci may contribute to inhibition of methicillinresistant Staphylococcus aureus colonization of oral cavities in newborns // Clin Infect Dis. 2001. Vol. 32, N 10. P. 1408–1413. doi: 10.1086/320179
  24. Uehara Y., Nakama H., Agematsu K., et al. Bacterial interference among nasal inhabitants: eradication of Staphylococcus aureus from nasal cavities by artificial implantation of Corynebacterium sp // J Hosp Infect. 2000. Vol. 44, N 2. P. 127–133. doi: 10.1053/jhin.1999.0680
  25. Wollenberg M.S., Claesen J., Escapa I.F., et al. Propionibacterium-produced coproporphyrin III induces Staphylococcus aureus aggregation and biofilm formation // mBio. 2014. Vol. 5, N 4. P. e01286-14. doi: 10.1128/mBio.01286-14
  26. Salvadori G., Junges R., Morrison D.A., Petersen F.C. Competence in Streptococcus pneumoniae and Close Commensal Relatives: Mechanisms and Implications // Front Cell Infect Microbiol. 2019. Vol. 9. P. 94. doi: 10.3389/fcimb.2019.00094
  27. Kilian M., Poulsen K., Blomqvist T., et al. Evolution of Streptococcus pneumoniae and its close commensal relatives // PLoS One. 2008. Vol. 3, N 7. P. e2683. doi: 10.1371/journal.pone.0002683
  28. Martens E.C., Neumann M., Desai M.S. Interactions of commensal and pathogenic microorganisms with the intestinal mucosal barrier // Nat Rev Microbiol. 2018. Vol. 16, N 8. P. 457–470. doi: 10.1038/s41579-018-0036-x
  29. Deriu E., Liu J.Z., Pezeshki M., et al. Probiotic bacteria reduce salmonella typhimurium intestinal colonization by competing for iron // Cell Host Microbe. 2013. Vol. 14, N 1. P. 26–37. doi: 10.1016/j.chom.2013.06.007
  30. Maltby R., Leatham-Jensen M.P., Gibson T., et al. Nutritional basis for colonization resistance by human commensal Escherichia coli strains HS and Nissle 1917 against E. coli O157:H7 in the mouse intestine // PloS One. 2013. Vol. 8, N 1. P. e53957. doi: 10.1371/journal.pone.0053957
  31. Deasy A.M., Guccione E., Dale A.P., et al. Nasal Inoculation of the Commensal Neisseria lactamica Inhibits Carriage of Neisseria meningitidis by Young Adults: A Controlled Human Infection Study // Clin Infect Dis. 2015. Vol. 60, N 10. P. 1512–1520. doi: 10.1093/cid/civ098
  32. Kim W.J., Higashi D., Goytia M., et al. Commensal Neisseria Kill Neisseria gonorrhoeae through a DNA-Dependent Mechanism // Cell Host Microbe. 2019. Vol. 26, N 2. P. 228–239.e8. doi: 10.1016/j.chom.2019.07.003
  33. Breshears L.M., Edwards V.L., Ravel J., Peterson M.L. Lactobacillus crispatus inhibits growth of Gardnerella vaginalis and Neisseria gonorrhoeae on a porcine vaginal mucosa model // BMC Microbiol. 2015. Vol. 15. P. 276. doi: 10.1186/s12866-015-0608-0
  34. Wyatt T.D., Greer A. The influence of growth medium on the interactions between Bordetella pertussis and Staphylococcus aureus // J Med Microbiol. 1976. Vol. 9, N 2. P. 243–246. doi: 10.1099/00222615-9-2-243
  35. Antipov D., Raiko M., Lapidus A., Pevzner P.A. Plasmid detection and assembly in genomic and metagenomic data sets // Genome Res. 2019. Vol. 29, N 6. P. 961–968. doi: 10.1101/gr.241299.118
  36. Pellow D., Zorea A., Probst M., et al. SCAPP: an algorithm for improved plasmid assembly in metagenomes // Microbiome. 2021. Vol. 9, N 1. P. 144. doi: 10.1186/s40168-021-01068-z
  37. Ottman N., Smidt H., de Vos W.M., Belzer C. The function of our microbiota: who is out there and what do they do? // Front Cell Infect Microbiol. 2012. Vol. 2. P. 104. doi: 10.3389/fcimb.2012.00104
  38. Ng H.M., Kin L.X., Dashper S.G., et al. Bacterial interactions in pathogenic subgingival plaque // Microb Pathog. 2016. Vol. 94. P. 60–69. doi: 10.1016/j.micpath.2015.10.022
  39. Kin L.X., Butler C.A., Slakeski N., et al. Metabolic cooperativity between Porphyromonas gingivalis and Treponema denticola // J Oral Microbiol. 2020. Vol. 12, N 1. P. 1808750. doi: 10.1080/20002297.2020.1808750
  40. Cuthbert B.J., Hayes C.S., Goulding C.W. Functional and Structural Diversity of Bacterial Contact-Dependent Growth Inhibition Effectors // Front Mol Biosci. 2022. Vol. 9. P. 866854. doi: 10.3389/fmolb.2022.866854
  41. Morou-Bermudez E., Elias-Boneta A., Billings R.J., et al. Urease activity in dental plaque and saliva of children during a three-year study period and its relationship with other caries risk factors // Arch Oral Biol. 2011. Vol. 56, N 11. P. 1282–1289. doi: 10.1016/j.archoralbio.2011.04.015

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО "Эко-вектор", 2023


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».