Экспресс-метод определения чувствительности возбудителей бактериальных осложнений к бактериофагам при COVID-19

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Обоснование. В последние годы наблюдается катастрофический рост резистентности штаммов бактерий к антибактериальным препаратам. Распространение пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19 привело к чрезмерному упредительному использованию антибиотиков, что вызвало ещё более широкое распространение резистентных штаммов в стационарах. Учитывая накопленный положительный опыт использования бактериофагов, целесообразно их применение у пациентов после определения чувствительности каждого штамма выделенных бактерий к бактериофагам. Учитывая, что чаще всего при осложнённых формах COVID-19 выделялись бактерии Klebsiella pneumoniae, возникла необходимость в быстром определении чувствительности этих и других грамотрицательных бактерий к соответствующим бактериофагам.

Цель исследования ― сокращение сроков определения чувствительности выделенной культуры микроорганизма к бактериофагам путём разработки экспресс-метода.

Материалы и методы. Объектами исследования служили 30 штаммов панрезистентных грамотрицательных микроорганизмов из коллекции музея лаборатории медицинской бактериологии НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера в Санкт-Петербурге: Klebsiella pneumoniae (n=10), Escherichia сoli (n=10), Pseudomonas aeruginosa (n=10), а также препараты бактериофагов производства АО «НПО “Микроген”»: Бактериофаг клебсиелл поливалентный очищенный; Бактериофаг колипротейный; Бактериофаг псевдомонас аеругиноза (синегнойный).

Результаты. Чувствительными к поливалентным препаратам бактериофагов оказались 4 из 10 исследуемых штаммов K. pneumoniae, 6 из 10 штаммов E. coli и 7 из 10 штаммов P. aeruginosa. Достоверные результаты были получены через 3 часа от момента постановки чувствительности выделенных культур к бактериофагам, что, несомненно, является важнейшей находкой проведённого исследования.

Заключение. Разработанный способ определения чувствительности грамотрицательных бактерий к бактериофагам позволяет сократить время исследования в 6 раз (до 3 часов), что сказывается на сроках подбора этиотропной терапии бактериофагами для каждого пациента.

Об авторах

Людмила Александровна Краева

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: lykraeva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9115-3250
SPIN-код: 4863-4001

д-р мед. наук, профессор

Россия, 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14

Лидия Сергеевна Конькова

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: lidia.kireeva@yandex.ru
ORCID iD: 0009-0007-5400-3513
SPIN-код: 3527-7121

 

 

Россия, 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14

Ольга Александровна Бургасова

Российский университет дружбы народов

Email: olgaburgasova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5486-0837
SPIN-код: 5103-0451

д-р мед. наук, профессор

Россия, Москва

Сергей Владимирович Долинный

Российский университет дружбы народов; Городская клиническая больница имени В.П. Демихова

Автор, ответственный за переписку.
Email: sdolinny.ru@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-0690-2174
SPIN-код: 7832-4832

MD

Россия, Москва; Москва

Список литературы

  1. Antimicrobial Resistance Collaborators. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: A systematic analysis // Lancet. 2022. Vol. 399, N 10325. P. 629–655. doi: 10.1016/S0140-6736(21)02724-0
  2. Blair J.M., Webber M.A., Baylay A.J., et al. Molecular mechanisms of antibiotic resistance // Nat Rev Microbiol. 2015. Vol. 13, N 1. Р. 42–51. doi: 10.1038/nrmicro3380
  3. Никифоров В.В., Суранова Т.Г., Миронов А.Ю., и др. Новая коронавирусная инфекция (COVID-19): этиология, эпидемиология, клиника, диагностика, лечение и профилактика. Учебное пособие. Москва, 2020. 48 с.
  4. Hill C., Mills S., Ross R.P. Phages & antibiotic resistance: Are the most abundant entities on earth ready for a comeback? // Future Microbiol. 2018. Vol. 13. P. 711–726. doi: 10.2217/fmb-2017-0261
  5. Брусина Е.Б., Дроздова О.М., Алешкин А.В. Проблемы комплексного применения бактериофагов для профилактики и лечения // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2018. № 3. С. 11–15. doi: 10.18565/epidem.2018.3.11-5
  6. Golkar Z., Bagasra O., Pace D.G. Bacteriophage therapy: A potential solution for the antibiotic resistance crisis // J Infect Dev Ctries. 2014. Vol. 8, N 2. P. 129–136. doi: 10.3855/jidc.3573
  7. Патент РФ на изобретение RU 2 785 461 C1. Краева Л.А., Конькова Л.С. Экспресс-метод определения чувствительности грамотрицательных бактерий к бактериофагам. Режим доступа: https://patenton.ru/patent/RU2785461C1. Дата обращения: 15.12.2022.
  8. Segall A.M., Roach D.R., Strathdee S.A. Stronger together? Perspectives on phage-antibiotic synergy in clinical applications of phage therapy // Curr Opin Microbiol. 2019. Vol. 51. P. 46–50. doi: 10.1016/j.mib.2019.03.005
  9. Chan B.K., Turner P.E., Kim S., et al. Phage treatment of an aortic graft infected with Pseudomonas aeruginosa // Evol Med Public Health. 2018. Vol. 2018, N 1. P. 60–66. doi: 10.1093/emph/eoy005
  10. Castillo D., Rørbo N., Jørgensen J., et al. Phage defense mechanisms and their genomic and phenotypic implications in the fish pathogen Vibrio anguillarum // FEMS Microbiol Ecol. 2019. Vol. 95, N 3. doi: 10.1093/femsec/fiz004
  11. Reyes-Robles T., Dillard R.S., Cairns L.S., et al. Vibrio cholerae outer membrane vesicles inhibit bacteriophage infection // J Bacteriol. 2018. Vol. 200, N 15. P. e00792-17. doi: 10.1128/JB.00792-17
  12. Montso P.K., Mlambo V., Ateba C.N. Efficacy of novel phages for control of multi-drug resistant Escherichia coli O177 on artificially contaminated beef and their potential to disrupt biofilm formation // Food Microbiol. 2021. Vol. 94. P. 103647. doi: 10.1016/j.fm.2020.103647
  13. Harper D.R. Criteria for selecting suitable infectious diseases for phage therapy // Viruses. 2018. Vol. 10, N 4. P. 177. doi: 10.3390/v10040177
  14. Kunz Coyne A.J., Stamper K., Kebriaei R., et al. Phage cocktails with daptomycin and ampicillin eradicates biofilm-embedded multidrug-resistant Enterococcus faecium with preserved phage susceptibility // Antibiotics (Basel). 2022. Vol. 11, N 9. P. 1175. doi: 10.3390/antibiotics11091175

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Таблица 1


© ООО "Эко-вектор", 2023


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».