A role of single nucleotide polymorphism in TNF, NOS3 and MMP9 genes at the risk of developing neonatal pneumonia

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Neonatal pneumonia is one of the most common causes of infant mortality. Moreover, the diagnosis of this pathology represents a difficult task and requires to seek for additional solutions in clinical and laboratory practice. One of the current and promising ways to diagnose rerlies on search of predictive markers among the innate and adaptive immunity genes involved in disease pathogenesis. We used bioinformatics analysis to select genes playing essential role developing neonatal pneumonia. Next, cord blood samples collected from 234 newborns were examined by real-time polymerase chain reaction for nine polymorphic markers in the TNF, IL10, IL17A, IL17F, IL6, NOS3, and MMP9 genes. The results of statistical analysis showed that heterozygous genotypes in the MMP9 and TNF genes were associated with the risk of developing early neonatal pneumonia, and also the protective role of homozygotes AA in the MMP9 gene and GG in the TNF gene. A search for associations with a risk of intrauterine pneumonia revealed an unfavorable role for heterozygous genotypes in the NOS3 and MMP9 genes. Thus, due to difficulties in diagnosis or in case of developing neonatal pneumonia, it may be recommended to add genetic analysis for assessing polymorphic markers in the MMP9 (rs17576), TNF (rs1800629) and NOS3 (rs1549758) genes along with standard test assays.

About the authors

E. A. Meremianina

I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera; Russian Medical Academy of Continuing Professional Education

Author for correspondence.
Email: ekatterine@gmail.com

Meremianina Ekaterina A. - PhD (Medicine), Junior Research Associate, Laboratory of Molecular Immunology; Senior Lecturer, Department of Virology

105064, Moscow, Maly Kazenny lane, 5a

Phone: 7 (926) 184-14-89

Russian Federation

O. A. Svitich

I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera; First Moscow State I. Sechenov Medical University (Sechenov University)

Email: fake@neicon.ru

PhD, MD (Medicine), Corresponding Member, Russian Academy of Sciences, Professor, Department of Microbiology, Virology and Immunology; Director

Moscow

Russian Federation

A. I. Alieva

Dagestan State Medical Academy

Email: fake@neicon.ru

PhD, MD (Medicine), Associate Professor, Dean, Faculty of Medicine and Prevention

Makhachkala, Republic of Dagestan

Russian Federation

V. V. Sobolev

I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera

Email: fake@neicon.ru

PhD (Biology), Senior Research Associate, Laboratory of Molecular Immunology

Moscow

Russian Federation

References

  1. Антонов А.Г., Арестова Н.Н., Байбарина Е.Н. Неонатология: национальное руководство / Под ред. Н.Н. Володина. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2009. 848 c. [Antonov A.G., Arestova N.N., Baybarina E.N. Neonatology: national guideline. Ed. by N.N. Volodin]. Мoscow: GOETAR-Media, 2009. 848 p.
  2. Журавлева Л.Н., Новикова В.И. Показатели врожденного иммунитета при пневмониях у новорожденных // Охрана материнства и детства, 2018. № 2 (32). С. 27-31. [Zhuravleva L.N., Novikova V.I. System of congenital immunity in pneumonia in newborns. Okhrana materinstva i detstva = Maternal and Child Health, 2018, no. 2 (32), pp. 27-31. (In Russ.)]
  3. Bellanti J.A., Zeligs B.J. Current concepts of immune interventions in children with respiratory diseases. Respiration, 1994, Vol. 61, no. 1, pp. 3-7.
  4. Fattakhov N., Smirnova L., Atochin D., Parshukova D., Skuratovskaia D., Painter Q., Zatolokin P., Semke A., Litvinova L., Ivanova S. Haplotype analysis of endothelial nitric oxide synthase (NOS3) genetic variants and metabolic syndrome in healthy subjects and schizophrenia patients. Int. J. Obes. (Lond), 2018, Vol. 42, no. 12, pp. 2036-2046.
  5. Feng B., Mao Z-R, Pang K., Zhang S-L., Li L. Association of tumor necrosis factor v -308G/A and interleukin-6 -174G/C gene polymorphism with pneumonia-induced sepsis. J. Crit. Care, 2015, Vol. 30, no. 5, pp. 920-923.
  6. GBD 2015 Mortality and Causes of Death Collaborators. Global, regional, and national life expectancy, allcause mortality, and cause-specific mortality for 249 causes of death, 1980-2015: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2015. Lancet, 2016, Vol. 388, no. 10053, pp. 1459-1544.
  7. Jeoung J.W., Kim D.M., Oh S., Lee J-S., Park S.S., Kim J.Y. The relation between endothelial nitric oxide synthase polymorphisms and normal tension glaucoma. J. Glaucoma, 2017, Vol. 26, no. 11, pp. 1030-1035.
  8. Qidwai T., Khan F. Tumour necrosis factor gene polymorphism and disease prevalence. Scand. J. Immunol., 2011, Vol. 74, no. 6, pp. 522-547.
  9. Wu M.Y., Wu Y., Zhang Y., Liu C.Y., Deng C.Y., Peng L., Zhou L. Associations between matrix metalloproteinase gene polymorphisms and glaucoma susceptibility: a meta-analysis. BMC Ophthalmol., 2017, Vol. 17, no. 1, 48. doi: 10.1186/s12886-017-0442-2.
  10. Zhang Y., Cao Y., Xin L., Gao N., Liu B. Association between rs1800629 polymorphism in tumor necrosis factor-v gene and dilated cardiomyopathy susceptibility: Evidence from case-control studies. Medicine (Baltimore), 2018, Vol. 97, no. 50, e13386. doi: 10.1097/MD.0000000000013386.
  11. Zhao F., Fan Z., Huang X. Role of matrix metalloproteinase-9 gene polymorphisms in glaucoma: a hospitalbased study in chinese patients. J. Clin. Lab. Anal., 2020, Vol. 34, no. 3, e23105. doi: 10.1002/jcla.23105.
  12. Zhou H., Zhu X. Association between matrix-metalloproteinase polymorphisms and prostate cancer risk: a meta-analysis and systematic review. Cancer Manag. Res., 2018, Vol. 10, pp. 5247-5259.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2020 Meremianina E.A., Svitich O.A., Alieva A.I., Sobolev V.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».