Биосинтез субериновой кислоты из глюкозы по обращенному β-окислению жирных кислот рекомбинантными штаммами Escherichia coli

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

С использованием направленно сконструированных производных ранее полученных адипат-продуцирующих штаммовEscherichia coliMG1655lacIQ, ∆ackA-pta, ∆poxB, ∆ldhA,∆adhE, PL-SDj10-atoB, Ptrc-ideal-4-SDj10-fadB, ∆fadE, PL-SDj10-tesB, ∆yciA, Ptrc-ideal-4-SDj10-fabI, PL-SDj10-paaJ,∆aceBAK,∆glcBи MG1655lacIQ, ∆ackA-pta, ∆poxB, ∆ldhA,∆adhE, PL-SDj10-atoB, Ptrc-ideal-4-SDj10-fadB, PL-SDj10-tesB, ∆yciA, Ptrc-ideal-4-SDj10-fadE, PL-SDj10-paaJ,∆aceBAK,∆glcBпродемонстрирована принципиальная возможность биосинтеза этой бактерией субериновой кислоты из глюкозы в результате обращения природного пути β-окисления жирных кислот. Конденсация ацетил-КоА с сукцинил-КоА и адипил-КоА обеспечивалась в рекомбинантах 3-оксоадипил-КоА тиолазой PaaJ, тогда как предполагаемая ацетил-КоА С-ацетилтрансфераза YqeF была неспособна к катализу соответствующих реакций. Биосинтез субериновой кислоты на уровне ~60 мкМ был достигнут при значительном усилении в штаммах экспрессии гена бифункциональной (S)-3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы/еноил-КоА-редуктазы,fadB. Последующая инактивация в штаммах сукцинатдегидрогеназы повышала внутриклеточную доступность сукцинил-КоА для инициации первого раунда обращения цикла и способствовала росту накопления рекомбинантами целевого соединения до ~75 мкМ. Полученные результаты создают основу для разработки высокоэффективных штаммов-продуцентов для биотехнологического производства субериновой кислоты из возобновляемого сырья.

Об авторах

А. Ю. Гулевич

Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Email: andrey.gulevich@gmail.com
Москва, 117312 Россия

А. Ю. Скороходова

Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Email: andrey.gulevich@gmail.com
Москва, 117312 Россия

В. Г. Дебабов

Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: andrey.gulevich@gmail.com
Москва, 117312 Россия

Список литературы

  1. Tarasava K.,Lee S.H.,Chen J.,Köpke M.,Jewett M.C.,Gonzalez R. // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2022. V. 49. № 2. kuac003. https://doi.org/10.1093/jimb/kuac003
  2. Fujita Y.,Matsuoka H.,Hirooka K. // Mol. Microbiol. 2007. V. 66. № 4. P. 829–839.
  3. Kim S.,Cheong S.,Chou A.,Gonzalez R. // Curr. Opin. Biotechnol. 2016. V. 42. P.206–215. https://doi.org/10.1016/j.copbio.2016.07.004
  4. Dellomonaco C.,Clomburg J.M.,Miller E.N.,Gonzalez R. // Nature. 2011. V. 476. P. 355–359. https://doi.org/10.1038/nature10333
  5. Gulevich A.Y.,Skorokhodova A.Y.,Sukhozhenko A.V.,Shakulov R.S.,Debabov V.G. // Biotechnol. Lett. 2012. V. 34. P. 463–469. https://doi.org/10.1007/s10529-011-0797-z
  6. Mehrer C.R.,Incha M.R.,Politz M.C.,Pfleger B.F. // Metab. Eng. 2018. V. 48. P. 63–71. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2018.05.011
  7. Chen J.,Gonzalez R. // Metab. Eng. 2023. V. 79. P. 173–181. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2023.07.006
  8. Kim S.,Clomburg J.M.,Gonzalez R. // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2015. V. 42. P. 465–75. https://doi.org/10.1007/s10295-015-1589-6
  9. Kim S.,Cheong S.,Gonzalez R. // Metab. Eng. 2016. V. 36. P. 90–98. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2016.03.005
  10. Gulevich A.Y.,Skorokhodova A.Y.,Debabov V.G. // Biomolecules. 2024. V. 14. 449. http://doi.org/10.3390/biom14040449
  11. Cheong S.,Clomburg J.M.,Gonzalez R. // Nat. Biotechnol. V. 34. № 5. P. 556–561. https://doi.org/10.1038/nbt.3505
  12. Lang M.,Li H. // ChemSusChem. 2022. V. 15. № 1. e202101531. https://doi.org/10.1002/cssc.202101531
  13. Liao Z.,Yeoh Y.K.,Parumasivam T.,Koh W.Y.,Alrosan M.,Alu’datt M.H.,Tan T.C. // RSC Adv. 2024.V. 14. № 24. P. 17008–17021. https://doi.org/10.1039/d4ra02598a
  14. Гулевич А.Ю.,Скороходова А.Ю.,Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2023. Т. 59. № 3. С. 235–243.
  15. Гулевич А.Ю.,Скороходова А.Ю.,Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2023. Т. 60. № 3. С. 28–35.
  16. Sambrook J.,Fritsch E.,Maniatis T. // Molecular Cloning: a Laboratory Manual, 2 nd Ed., N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989. 1659 р.
  17. Скороходова А.Ю.,Стасенко А.А.,Гулевич А.Ю.,Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2018. Т. 54. № 3. С. 244–252.
  18. Skorokhodova A.Y.,Gulevich A.Y.,Debabov V.G. // Biotechnol. Rep. 2022. V. 33. e00703. http://doi.org/10.1016/j.btre.2022.e00703
  19. Datsenko K.A.,Wanner B.L. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.2000. V. 97. № 12. Р. 6640–6645.
  20. Каташкина Ж.И.,Скороходова А.Ю.,Зименков Д.В.,Гулевич А.Ю.,Минаева Н.И.,Дорошенко В.Г.,Бирюкова И.В.,Машко С.В. // Молекулярная биология. 2005. Т. 39. № 5. С. 823–831.
  21. Гулевич А.Ю.,Скороходова А.Ю.,Ермишев В.Ю.,Крылов А.А.,Минаева Н.И.,Полонская З.М. и др. // Молекулярная биология. 2009. Т. 43. № 3. С. 547–557.
  22. Clark D.P.,Cronan J.E. // EcoSal Plus.2005. V. 1. 10.1128/ecosalplus.3.4.4. https://doi.org/10.1128/ecosalplus.3.4.4.
  23. Binstock J.F.,Schulz H. // Methods. Enzymol. 1981. V. 71. P. 403–411. https://doi.org/10.1016/0076-6879(81)71051-6
  24. Teufel R.,Mascaraque V.,Ismail W.,Voss M.,Perera J.,Eisenreich W.,Haehnel W.,Fuchs G. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. V. 107. № 32. P. 14390–14395. https://doi.org/10.1073/pnas.1005399107
  25. Deuschle U.,Kammerer W.,Gentz R.,Bujard H. // EMBO J. 1986. V. 5. P. 2987–2994. https://doi.org/10.1002/j.1460-2075.1986.tb04596.x

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).