Degradation of Dibutyl Phthalate by Halotolerant Strain Pseudarthrobacter sp. NKDBFgelt

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

Dibutyl phthalate (DBP) is the di-n-butyl ester of ortho-phthalic acid, widely used in the chemical industry as a plasticizer and is a common environmental pollutant. The ability of the halotolerant strain Pseudarthrobacter sp. NKDBFgelt (VKM Ac-3035) isolated from the rhizosphere soil of a salt mining area (Perm Krai, Russia) to use DBP as the sole source of carbon and energy was studied. The strain NKDBFgelt was capable of growth on DBP and ortho-phthalic acid (PA) at high salinity (up to 30 g/L and 50 g/L NaCl, respectively), as well as growth on DBP at a high concentration — up to 9 g/L. The strain degraded 75.2% DBP (initial concentration 200 mg/L DBP) by 72 h of cultivation in the absence of salt. With increased salinity of the medium (30–70 g/l NaCl), DBP degradation was recorded at a level of 66.95–27.8%. Analysis of the genome of the strain NKDBFgelt revealed clusters of genes involved in the degradation of DBP, PA, benzoic acid, as well as genes encoding enzymes of the main degradation pathways of aromatic compounds. The halotolerant strain Pseudarthrobacter sp. NKDBFgelt has a high degradative potential and is promising in the development of new biotechnologies for the restoration of soils contaminated with phthalic acid esters.

作者简介

O. Yastrebova

Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences

Email: olyastr@mail.ru
Perm, 614081 Russia

A. Pyankova

Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences

Perm, 614081 Russia

A. Nazarov

Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences

Perm, 614081 Russia

Yu. Nechaeva

Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences

Perm, 614081 Russia

E. Korsakova

Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences

Perm, 614081 Russia

E. Plotnikova

Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Ural Branch, Russian Academy of Sciences

Perm, 614081 Russia

参考

  1. Naveen K.V., Saravanakumar K., Zhang X., Sathiyaseelan A., Wang M.-H. // Environ. Res. 2022. V. 214. № 1. Article 113781. https://doi.org/10.1016/j.envres.2022.113781
  2. Das M.T., Kumar S.S., Ghosh P., Shah G., Malyan S.K., Bajar S. et al. // J. Hazard. Mater. 2021. V. 409. Article 124496. https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2020.124496
  3. Liang D.-W., Zhang T., Fang H.H.P., He J. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008. V. 80. № 2. P. 183–198. https://doi.org/10.1007/s00253-008-1548-5
  4. Kong X., Jin D.C., Tai X., Yu H., Duan G.L., Yan X.L. et al. // Sci. Total. Environ. 2019. V. 667. P. 691–700. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2019.02.385
  5. Zorníkova G., Jarosova A., Hrivna L. // Acta Univ. Agric. Et. Silvic. Mendel. Brun. 2011. V. 59. P. 233–238. https://doi.org/10.11118/actaun201159030233
  6. Yue D.M., Yu X.Z., Li Y.H. // Int. J. Environ. Sci. Technol. 2015. V. 12. P. 3009–3016. https://doi.org/10.1007/s13762-014-0704-y
  7. Gao M., Dong Y., Zhang Z., Song Z. // Environ. Pollut. 2020. V. 265. Article 114800. https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2019.114126
  8. Azaizeh H., Castro P.M.L., Kidd P. // Organic Xenobiotics and Plants. / Eds. P. Schröder, C. D. Collins. Plant Ecophysiology. V. 8. Springer, 2011. P. 191–215. https://doi.org/10.1007/978-90-481-9852-8_9
  9. Бачурин Б.А., Одинцова Т.А. Современные экологические проблемы Севера. Апатиты: Изд-во Кольского НЦ РАН, 2006. T. 2. С. 7–9.
  10. Корсакова Е. С., Шестакова Е. А., Хайрулина Е. А., Назаров А. В. // Российский иммунологический журнал. 2015. Т. 9 (18). № 2 (1). С. 591–593.
  11. Cheng J.J., Liu Y.A., Wan Q., Yuan, L., Yu X.Y. // Sci. Total Environ. 2018. V. 640. P. 821–829. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.05.336
  12. Patil, N.K., Karegoudar, T.B. // World J. Microbiol. Biotechnol. 2005. V. 21. № 8–9. P. 1493–1498. https://doi.org/10.1007/s11274-005-7369-0
  13. Jin D., Kong X., Liu H., Wang X., Deng Y., Jia M., Yu X. // Int. J. Mol. Sci. 2016. V. 17. Article 1012. https://doi.org/10.3390/ijms17071012
  14. Lu Y., Tang F., Wang Y., Zhao J., Zeng X., Luo Q., Wang L. // J. Hazard. Mater. 2009. V. 168. № 2–3. P. 938–943. https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2009.02.126
  15. Kumar V., Maitra S.S. // Biotech. 2016. V. 6. № 200. https://doi.org/10.1007/s13205-016-0524-5
  16. Liu T., Li J., Qiu L., Zhang F., Linhardt R.J., Zhong W. // Biotechnol. Bioeng. 2020. V. 117. P. 3712–3726. https://doi.org/10.1002/bit.27524
  17. Nandi M., Paul T., Kanaujiya D.K., Baskaran D., Pakshirajan K., Pugazhenthi G. // Water Supply. 2021. V. 21. № 5. P. 2084–2098. https://doi.org/10.2166/ws.2020.347
  18. Wen Z.D., Gao D.-W., Wu W.-M. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2014. V. 98. № 10. Р. 4683–4690. https://doi.org/10.1007/s00253-014-5568-z
  19. Chen F., Chen Y., Chen C., Feng L., Dong Y., Chen J., et al.. // Sci. Total Environ. 2021. V. 794. Article 148719. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.148719
  20. Shariati S., Ebenau-Jehle C., Pourbabaee A.A., Alikhani H.A., Rodriguez-Franco M., Agne M. et al. // Biodegradation. 2022. V. 33. P. 59–70. https://doi.org/10.1007/s10532-021-09966-7
  21. Ren C., Wang Y., Wu Y., Zhao H.-P., Li L. // Biodegradation. 2024. V. 35(1). P. 87–99. https://doi.org/10.1007/s10532-023-10032-7
  22. Eaton R.W. // J. Bacteriol. 2001. V. 183. № 12. P. 3689–3703. https://doi.org/10.1128/JB.183.12.3689-3703.2001
  23. Jin D., Kong X., Cui B., Bai Z., Zhang H. // Int. J. Mol. Sci. 2013. V. 14. P. 24046–24054. https://doi.org/10.3390/ijms141224046
  24. Xu X.-R., Li H.-B., Gu J.-D. // Ecotoxicol. Environ. Saf. 2007. V. 68. P. 379–385. https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2006.11.012
  25. Yang T., Ren L., Jia Y., Fan S., Wang J., Wang J. et al. // Int. J. Environ. Res. Public Health. 2018. V. 15. Article 964. https://doi.org/10.3390/ijerph15050964
  26. Корсакова Е.С., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. // Вестник Пермского университета. Серия Биология. 2023. № 4. С. 349‒355. https://doi.org/10.17072/1994-9952-2023-4-349-355
  27. Raymond R.L. // Developments in Industrial Microbiology. 1961. V. 2. № 1. P. 23–32.
  28. Нетрусов А.И. Практикум по микробиологии. М.: Академия, 2005. 608 с.
  29. Prjibelski A., Antipov D., Meleshko D., Lapidus, A., Korobeynikov A. // Current Protocols in Bioinformatics. 2020. V. 70. № 1. e102.
  30. Andrews S. FastQC: A Quality Control Tool for High Throughput Sequence Data; Babraham Bioinformatics, Babraham Institute: Cambridge, UK. 2010.
  31. Bolger A.M., Lohse M., Usadel B. // Bioinformatics. 2014. V. 30. № 15. P. 2114–2120. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu170
  32. Antipov D., Hartwick N., Shen M., Raiko M., Lapidus A., Pevzner P. // Bioinformatics. 2016. V. 32. № 22. P. 3380–3387. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw493
  33. Schwengers O., Jelonek L., Dieckmann M.A., Beyvers S., Blom J., Goesmann A. // Microbial Genomics. 2021. V. 7. № 11. Article 000685. https://doi.org/10.1099/mgen.0.000685.
  34. Tatusov R., Galperin M., Natale D., Koonin E. // Nucleic Acids Res. 2000. V. 28. № 1. P. 6–33. https://doi.org/10.1093/nar/28.1.33
  35. Kanehisa M., Goto S., Sato Y., Kawashima M., Furumichi M., Tanabe M. // Nucleic Acids Res. 2014. V. 42. № D1. P. D199–D205. https://doi.org/10.1093/nar/gkt1076
  36. Li C., Liu C., Li R., Liu Y., Xie J., Li B. //Toxics. 2022. V. 10. Article 532. https://doi.org/10.3390/toxics10090532
  37. Кашнер Д. Жизнь микробов в экстремальных условиях. М.: Мир, 1981. 365 с.
  38. Latif A., Ahmad R., Ahmed J., Shah M. M., Ahmad R., Hassan A. // Sci. Hortic. 2023. V. 319. Article 112115. https://doi.org/10.1016/j.scienta.2023.112115
  39. Issifu M., Songoro E.K., Onguso J., Ateka E.M., Ngumi V.W. // Bacteria. 2022. V. 1. P. 191–206. https://doi.org/10.3390/bacteria1040015
  40. Li J., Peng W, Yin X., Wang X., Liu Z., Liu Q. et al.// J. Hazard. Mater. 2024. V. 465. Article 133138. https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.133138
  41. Ren L., Lin Z., Liu H., Hu H. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2018. V. 102. № 3. P. 1085–1096. https://doi.org/10.1007/s00253-017-8687-5
  42. Iwata M., Imaoka T., Nishiyama T., Fujii, T. // J. Biosci. Bioeng. 2016. V. 122. № 2. P. 140–145. https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2016.01.008
  43. Stanislauskienė R., Rudenkov M., Karvelis L. // Biologija. 2011. V. 57. № 3. P. 45–54.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».