The prevalence of the human rhinoviruses and coronaviruses circulating in the Moscow region during 2007-2012

封面

如何引用文章

全文:

详细

The rhinoviruses and coronaviruses are the most common causative agents of the acute upper respiratory tract infection in humans. They include several species that vary in the pathogenicity, some causing severe respiratory tract diseases. in this work, the species prevalence of rhinoviruses and coronaviruses was studied in 92 virus-positive clinical patients that were collected at the area of the Moscow region during the period from 2007 to 2012. Using the real-time PCR the virus circulation has been established for all species common in humans, including three rhinoviruses, HRV A, HRV B, and HRV C, and four coronaviruses, HCoV-NL63, HCoV-229E, HCoV- OC43, and HCoV-HKU1. For eight patients, the identity of the rhinoviruses, including 4 cases of HRV-C, 3 cases of HRV-A, and a single case of hRv-B, was corroborated using partial sequencing of the 5 non-coding regions and phylogenetic analysis. The viruses of HRV-C, HCoV-NL63, and HCoV-OC43 were prevalent in children with severe respiratory diseases.

作者简介

S. Lobodanov

Federal State Budgetary Institution «I.I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera»; Federal Budget Institution of Science «Central Research Institute of Epidemiology» of the Federal Service on Customers’ Rights Protection and Human Well-Being Surveillance

编辑信件的主要联系方式.
Email: lobodanov84@gmail.com

Sergey Lobodanov, MD, PhD

105064, Moscow

111123, Moscow

俄罗斯联邦

I. Kiselev

Federal State Budgetary Institution «I.I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera»

Email: fake@neicon.ru
105064, Moscow 俄罗斯联邦

Y. Ammour

Federal State Budgetary Institution «I.I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera»

Email: fake@neicon.ru
105064, Moscow 俄罗斯联邦

A. Gorbalenya

Department of Medical Microbiology, Leiden University Medical Center; Faculty of Bioengineering and Bioinformatics, Lomonosov Moscow State University

Email: fake@neicon.ru

Leiden

119991, Moscow

荷兰

E. Claas

Department of Medical Microbiology, Leiden University Medical Center

Email: fake@neicon.ru
Leiden 荷兰

V. Zverev

Federal State Budgetary Institution «I.I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera»

Email: fake@neicon.ru
105064, Moscow 俄罗斯联邦

E. Faizuloev

Federal State Budgetary Institution «I.I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and Sera»

Email: fake@neicon.ru
105064, Moscow 俄罗斯联邦

参考

  1. Turner R.B. The common cold. In: Mandell G., Bennett J., Dolin R., eds. Principles and Practice of Infectious Diseases: Volume 1. 7th ed. Philadelphia: Churchill Livingstone; 2010: 809–14.
  2. Available at: http://www.niaid.nih.gov/topics/commonCold/Pages/cause.aspx.
  3. García-García M.L., Calvo C., Pozo F., Villadangos P.A., PérezBreña P., Casas I. Spectrum of respiratory viruses in children with community-acquired pneumonia. Pediatr. Infect. Dis J. 2012; 31(8): 808–13.
  4. Fielding B.C. Human coronavirus NL63: a clinically important virus? Future Microbiol. 2011; 6(2): 153–9.
  5. Lee W.M., Lemanske R.F.Jr., Evans M.D., Vang F., Pappas T., Gangnon R. et al. Human rhinovirus species and season of infection determine illness severity. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2012; 186(9): 886–91.
  6. Gaunt E.R., Hardie A., Claas E.C., Simmonds P., Templeton K.E. Epidemiology and clinical presentations of the four human coronaviruses 229E, HKU1, NL63 and OC43 detected over 3 years using a novel multiplex real-time PCR. J. Clin. Microbiol. 2010; 48(8): 2940–7.
  7. Available at: http://www.ictvonline.org/virusTaxonomy.asp.
  8. de Groot R.J., Baker S.C., Baric R.S., Brown C.S., Drosten C., Enjuanes L. et al. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV): announcement of the Coronavirus Study Group. J. Virol. 2013; 87(14): 7790–2.
  9. Eckerle I., Müller M.A., Kallies S., Gotthardt D.N., Drosten C. Invitro renal epithelial cell infection reveals a viral kidney tropism as a potential mechanism for acute renal failure during Middle East Respiratory Syndrome (MERS) Coronavirus infection. Virol. J. 2013; 10: 359.
  10. World Health Organization. Global alert and response. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) – update. 27 December 2013. Available at: www.who.int/csr/don/2013_12_27/en/index.html (accessed 9 January 2014).
  11. Лободанов С.А. Эффективность этиологической диагностики ОРВИ методом ПЦР с детекцией в режиме реального времени: Дисс. ... канд. биол. наук. М.; 2013.
  12. Файзулоев Е.Б., Лободанов С.А., Никонова А.А., Каира А.Н., Полухина Г.М., Трушакова С.В. и др. Дифференциальная диагностика ОРВИ методом мультиплексной ПЦР с детекцией в режиме реального времени. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2012; 1: 12–8.
  13. Boom R., Sol C.J., Salimans M.M., Jansen C.L., Wertheim van Dillen P.M., van der Noordaa J. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J. Clin. Microbiol. 1990; 28(3): 495–503.
  14. Lee W.M., Kiesner C, Pappas T, Lee I, Grindle K, Jartti T. et al. A diverse group of previously unrecognized human rhinoviruses are common causes of respiratory illnesses in infants. PLoS One. 2007; 2(10): e966.
  15. Kiang D., Kalra I., Yagi S., Louie J.K., Boushey H., Boothby J. et al. Assay for 5’-noncoding region analysis of all human rhinovirus prototype strains. J. Clin. Microbiol. 2008; 46(11): 3736–45.
  16. Savolainen C., Blomqvist S., Mulders M.N., Hovi T. Genetic clustering of all 102 human rhinovirus prototype strains: serotype 87 is close to human enterovirus 70. J. Gen. Virol. 2002; 83(Pt 2): 333–40.
  17. Linder J.E., Kraft D.C., Mohamed Y., Lu Z., Heil L., Tollefson S. et al. Human rhinovirus C: Age, season, and lower respiratory illness over the past 3 decades. J. Allergy Clin. Immunol. 2013; 131(1): 69–77.
  18. Bizzintino J., Lee W.M., Laing I.A., Vang F., Pappas T., Zhang G. et al. Association between human rhinovirus C and severity of acute asthma in children. Eur. Respir. J. 2011; 37(5): 1037–42.
  19. Abdul-Rasool S., Fielding B.C. Understanding human coronavirus HCoV-NL63. Open Virol. J. 2010; 4: 76–84.
  20. Jevšnik M, Uršič T, Zigon N, Lusa L, Krivec U, Petrovec M. Coronavirus infections in hospitalized pediatric patients with acute respiratory tract disease. BMC Infect. Dis. 2012; 12: 365.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML

版权所有 © Problems of Virology, 2015

Creative Commons License
此作品已接受知识共享署名 4.0国际许可协议的许可

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».