Efficacy of first-line ART regimens based on tenofovir in HIV-infected patients with pre-existing A62V mutation in reverse transcriptase

Cover Page

Cite item

Abstract

Introduction. The amino acid substitution A62V in reverse transcriptase was identified as a mutation correlated with virologic failure in patients on first-line therapy including tenofovir (TDF) and tenofovir alafenamide (TAF). A62V is a typically polymorphic mutation in HIV-1 sub-subtype A6, which is the most widespread virus variant in Russia.

Materials and methods. The European EuResist (EIDB) database was queried to form two equivalent groups of patients: group 1 ‒ patients with A62V at baseline treated with TDF or TAF on the first-line therapy, group 2 ‒ patients without A62V at baseline treated with TDF or TAF on the first-line therapy. Each group included 23 patients.

Results. There was no statistical difference between the two groups in virologic efficacy in 4, 12, and 24 weeks after the start of antiretroviral therapy (ART) and in the frequency of virologic failures.

Conclusion. This study has some limitations, and the exact role of A62V in the efficacy of the first-line ART based on tenofovir deserves further investigation.

About the authors

Ekaterina N. Ozhmegova

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Author for correspondence.
Email: ozhmegova.eka@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-3110-0843

PhD, Researcher at the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

Anna I. Kuznetsova

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Email: a-myznikova@list.ru

PhD, Head of the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

Aleksey V. Lebedev

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Email: lebedevalesha236@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-6787-9345

PhD, Researcher at the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

Anastasia A. Antonova

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Email: anastaseika95@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9180-9846

PhD, Researcher at the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

Kristina V. Kim

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Email: kimsya99@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4150-2280

Junior Researcher at the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

Yana M. Munchak

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Email: yanka.zabavnaya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4792-8928

Junior Researcher at the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

Alexander S. Tumanov

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Email: desep@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-6221-5678

Researcher at the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

Elena V. Kazennova

National Research Center for Epidemiology and Microbiology named after the Honorary Academician N.F. Gamaleya of the Russian Ministry of Health

Email: kazennova@rambler.ru
ORCID iD: 0000-0002-7912-4270

D. Sc. (Biology), Leading Researcher at the Laboratory of Leukemia Viruses of the Department of the Institute of Virology named after. D.I. Ivanovsky

Russian Federation, Moscow

References

  1. Stanford University HIV Drug Resistance Database. Available at: http://hivdb.stanford.edu
  2. Wensing A.M., Calvez V., Ceccherini-Silberstein F., Charpentier C., Günthard H.F., Paredes R., et al. 2022 update of the drug resistance mutations in HIV-1. Top. Antivir. Med. 2022; 30(4): 559–74.
  3. Maldonado J.O., Mansky L.M. The HIV-1 reverse transcriptase A62V mutation influences replication fidelity and viral fitness in the context of multi-drug-resistant mutations. Viruses. 2018; 10(7): 376. DOI: https://doi.org/10.3390/v10070376
  4. Svarovskaia E.S., Feng J.Y., Margot N.A., Myrick F., Goodman D., Ly J.K., et al. The A62V and S68G mutations in HIV-1 reverse transcriptase partially restore the replication defect associated with the K65R mutation. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2008; 48(4): 428–36. DOI: https://doi.org/10.1097/QAI.0b013e31817bbe93
  5. Rhee S.Y., Varghese V., Holmes S.P., Van Zyl G.U., Steegen K., Boyd M.A., et al. Mutational correlates of virological failure in individuals receiving a WHO-recommended Tenofovir-containing first-line regimen: an international collaboration. EBioMedicine. 2017; 18: 225–35. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2017.03.024
  6. Wagner T., Zuckerman N.S., Halperin T., Chemtob D., Levy I., Elbirt D., et al. Epidemiology and transmitted HIV-1 drug resistance among treatment-naive individuals in Israel, 2010–2018. Viruses. 2021; 14(1): 71. DOI: https://doi.org/10.3390/v14010071
  7. Zhukova A., Dunn D., Gascuel O. Modeling drug resistance emergence and transmission in HIV-1 in the UK. Viruses. 2023; 15(6): 1244. DOI: https://doi.org/10.3390/v15061244
  8. Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Y., Vasilyev A.V., Bobkova M.R. Natural polymorphisms of HIV-1 IDU-A variant pol gene. VICh-infektsiya i immunosupressii. 2012; 4(4): 44–51. EDN: https://elibrary.ru/pjowuj (in Russian)
  9. Kirichenko A.A., Kireev D.E., Shlykova A.V., Lopatukhin A.E., Lapovok I.A., Saleeva D.V., et al. HIV-1 drug resistance in patients with virological inefficiency on ART in Russia in 2013–2021. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktual’nye voprosy. 2021; 11(3): 53–62. DOI: https://doi.org/10.18565/epidem.2021.11.3.53-62 EDN: https://elibrary.ru/uqiuni (in Russian)
  10. Ministry of Health of the Russian Federation. Clinical Guidelines «HIV Infection in Adults»; 2020. Available at: http://rushiv.ru/wp-content/uploads/2022/11/KR79.pdf (in Russian)
  11. Clinicalinfo. Guidelines for the Use of Antiretroviral Agents in Adults and Adolescents with HIV. Available at: https://clinicalinfo.hiv.gov/sites/default/files/guidelines/documents/adult-adolescent-arv/guidelines-adult-adolescent-arv.pdf
  12. Bbosa N., Kaleebu P., Ssemwanga D. HIV subtype diversity worldwide. Curr. Opin. HIV AIDS. 2019; 14(3): 153–60. DOI: https://doi.org/10.1097/coh.0000000000000534
  13. Kirichenko A., Lapovok I., Baryshev P., van de Vijver D., van Kampen J.J.A., Boucher C.A.B., et al. Genetic features of HIV-1 integrase sub-subtype A6 predominant in Russia and predicted susceptibility to INSTIs. Viruses. 2020; 12(8): 838. DOI: https://doi.org/10.3390/v12080838
  14. Kuznetsova A., Lebedev A., Gromov K., Kazennova E., Zazzi M., Incardona F., et al. Pre-existing singleton E138A mutations in the reverse transcriptase gene do not affect the efficacy of first-line ART regimens using rilpivirine in human immunodeficiency virus-infected patients. Clin. Case Rep. 2022; 10(2): e05373. DOI: https://doi.org/10.1002/ccr3.5373
  15. Sukhanova A.L., Rudinskii N.I., Bogoslovskaya E.V., Kruglova A.I., Bashkirova L.Yu., Tsyganova G.M., et al. Polymorphism of the genome region coding for protease and reverse transcriptase in HIV type 1 subtype a variants prevailing in CIS countries. Molekulyarnaya biologiya. 2005; 39(6): 934–41. DOI: https://doi.org/10.1007/s11008-005-0115-8 EDN: https://elibrary.ru/ljarmp
  16. Kolomeets A.N., Varghese V., Lemey P., Bobkova M.R., Shafer R.W. A uniquely prevalent nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor resistance mutation in Russian subtype A HIV-1 viruses. Aids. 2014; 28(17): F1–8. DOI: https://doi.org/10.1097/qad.0000000000000485
  17. Kirichenko A., Kireev D., Lopatukhin A., Murzakova A., Lapovok I., Saleeva D., et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS One. 2022; 17(1): e0257731. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0257731
  18. Shchemelev A.N., Ostankova Yu.V., Valutite D.E., Serikova E.N., Zueva E.B., Semenov A.V., et al. Risk assessment of first-line treatment failure in untreated HIV patients in Northwestern federal district of the Russian Federation. Infektsiya i immunitet. 2023; 13(2): 302–8. DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-RAO-2122 EDN: https://elibrary.ru/ciclmu (in Russian)
  19. Costa B., Vale N. Efavirenz: history, development and future. Biomolecules. 2022; 13(1): 88. DOI: https://doi.org/10.3390/biom13010088
  20. Lv Z., Chu Y., Wang Y. HIV protease inhibitors: a review of molecular selectivity and toxicity. HIV AIDS (Auckl.). 2015; 7: 95–104. DOI: https://doi.org/10.2147/hiv.S79956
  21. Salvaña E.M.T., Dungca N.T., Arevalo G., Li K., Francisco C., Penalosa C., et al. HIV-1 subtype shift in the Philippines is associated with high transmitted drug resistance, high viral loads, and fast immunologic decline. Int. J. Infect. Dis. 2022; 122: 936–43. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2022.06.048

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2. Figure. The dynamics of VLs during the follow-up period

Download (542KB)

Copyright (c) 2024 Ozhmegova E.N., Kuznetsova A.I., Lebedev A.V., Antonova A.A., Kim K.V., Munchak Y.M., Tumanov A.S., Kazennova E.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».