ГИГАНТСКИЕ ВИРУСЫ: ПРОИСХОЖДЕНИЕ, РАСПРОСТРАНЕНИЕ, ТАКСОНОМИЧЕСКИЕ, СТРУКТУРНО-МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ И МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В обзоре рассмотрены происхождение, эволюция, распространение, таксономические, структурно-морфологические и молекулярно-биологические характеристики гигантских вирусов, отнесённых к двум семействам Mimiviridae и Marseilleviridae и трем негруппированным родам Pithovirus, Pandoravirus и Mollivirus. Гигантские вирусы различимы под световым микроскопом, а количество генов в геноме сопоставимо с таковым у бактерий, что привело к переоценке признаков, отличающих вирусы от других микроорганизмов.

Об авторах

Д. К. Львов

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия

Т. Е. Сизикова

ФГБУ «48 Центральный научно-исследовательский институт» Министерства обороны Российской Федерации

Email: noemail@neicon.ru
Россия

В. Н. Лебедев

ФГБУ «48 Центральный научно-исследовательский институт» Министерства обороны Российской Федерации

Email: noemail@neicon.ru
Россия

С. В. Борисевич

ФГБУ «48 Центральный научно-исследовательский институт» Министерства обороны Российской Федерации

Email: 48cnii@mil.ru
Россия

Список литературы

  1. Abergel C., Legendre M., Claverie J.M. The rapidly expanding universe of giant viruses: Mimivirus, Pandoravirus, Pithovirus and Mollivirus. FEMS Microbiol. Rev. 2015; 39(6): 779-96.
  2. Lwoff A., Tournier P. The classification of viruses. Ann. Rev. Microbiol. 1966; 20: 45-74.
  3. Львов Д.К. Экология вирусов. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции. М.: МИА; 2013: 68-86
  4. Aherfi S., Colson P., La Scola B, Raoult D. Giant Viruses of Amoebas: An Update. Front. Microbiol. 2016; 7: 349.
  5. Claverie J.M., Abergel C. Family Mimiviridae. In: King A.M., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Academic Press; 2012: 223-8.
  6. Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю. Мимивирусы (Mimiviridae). В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 166
  7. La Scola B., Audic S., Robert C., Jungang L., de Lamballerie X., Drancourt M. et al. A giant virus in amoebae. Science. 2003; 299(5615): 2033.
  8. Raoult D., La Scola B., Birtles R. The discovery and characterization of Mimivirus, the largest known virus and putative pneumonia agent. Clin. Infect. Dis. 2007; 45(1): 95-102.
  9. Legendre M., Lartigue A., Bertaux L., Jeudy S., Bartoli J., Lescot M. et al. In-depth study of Mollivirus sibericum, a new 30,000-y-old giant virus infecting Acanthamoeba. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015; 112(38): 5327-35.
  10. Benamar S., Reteno D.G., Bandaly V., Labas N., Raoult D., La Scola B. Faustoviruses: Comparative Genomics of New Megavirales Family Members. Front. Microbiol. 2016; 7(3): 1-9.
  11. Iyer L.M., Aravind L., Koonin E.V. Common origin of four diverse families of large eukaryotic DNA viruses. J. Virol. 2001; 75(23): 11720-34.
  12. Verneau J., Levasseur A., Raoult D., La Scola B., Colson P. MG-Digger: An Automated Pipeline to Search for Giant Virus-Related Sequences in Metagenomes. Front. Microbiol. 2016; 7(428): 1-11.
  13. Balczun C., Scheid P.L. Free-Living Amoebae as Hosts for and Vectors of Intracellular Microorganisms with Public Health Significance. Viruses. 2017; 9(4): 1-18.
  14. Berger P., Papazian L., Drancourt M., La Scola B., Auffray J.P., Raoult D. Ameba-associated microorganisms and diagnosis of nosocomial pneumonia. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12(2): 248-55.
  15. Львов Д.К. Мимивирусная респираторная инфекция. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013: 598-9
  16. La Scola B., Marrie T.J., Auffray J.P., Raoult D. Mimivirus in pneumonia patients. Emerg. Infect. Dis. 2005; 11(3): 449-52.
  17. Raoult D., La Scola B., Birtles R. The discovery and characterization of Mimivirus, the largest known virus and putative pneumonia agent. Clin. Infect. Dis. 2007; 45(1): 95-102.
  18. Raoult D., Renesto P., Brouqui P. Laboratory infection of a technician by mimivirus. Ann. Intern. Med. 2006; 144(9): 702-3.
  19. Dare R.K., Chittaganpitch M., Erdman D.D. Screening pneumonia patients for mimivirus. Emerg. Infect. Dis. 2008; 14(3): 465-7.
  20. Monier A., Claverie J.M., Ogata H. Taxonomic distribution of large DNA viruses in the sea. Genome Biol. 2008; 9(7): R106.
  21. Pelletier N., Raoult D., La Scola B. Specific recognition of the major capsid protein of Acanthamoeba polyphaga mimivirus by sera of patients infected by Francisella tularensis. FEMS Microbiol. Lett. 2009; 297(1): 117-23.
  22. Parola P., Renvoise A., Botelho-Nevers E., La Scola B., Desnues C., Raoult D. Acanthamoeba polyphaga mimivirus virophage seroconversion in travelers returning from Laos. Emerg. Infect. Dis. 2012; 18(9): 1500-2.
  23. Dornas F.P., Khalil J.Y.B., Pagnier I., Didier R., Abrahao J., La Scola B. Isolation of new Brazilian giant viruses from environmental samples using a panel of protozoa. Front. Microbiol. 2015; 6(1086): 1-9.
  24. Klose T., Kuznetsov Y.G., Xiao C., Sun S., McPherson A., Rossmann M.G. The three-dimensional structure of Mimivirus. Intervirology. 2010; 53(5): 268-73.
  25. Sinclair R.M., Ravantti J.J., Bamford D.H. Nucleic and Amino Acid Sequences Support Structure-Based Viral Classification. J. Virol. 2017; 91(8): 1-13.
  26. Arslan D., Legendre M., Seltzer V., Abergel C., Claverie J.M. Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2011; 108(42): 17486-91.
  27. Yoosuf N., Yutin N., Colson P., Shabalina S.A., Pagnier I., Robert C. et al. Related giant viruses in distant locations and different habitats: Acanthamoeba polyphaga moumouvirus represents a third lineage of the Mimiviridae that is close to the megavirus lineage. Genome Biol. Evol. 2012; 4(12): 1324-30.
  28. Legendre M., Bartoli J., Shmakova L., Jeudy S., Labadie K., Adrait A. et al. Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2014; 111(11): 4274-9.
  29. Antwerpen M.H., Georgi E., Zoeller L., Woelfel R., Stoecker K., Scheid P. Whole-Genome Sequencing of a Pandoravirus Isolated from Keratitis-Inducing Acanthamoeba. Genome Announc. 2015; 3(2): 1-2.
  30. Claverie J.M., Abergel C. From extraordinary endocytobionts to pandoraviruses. Comment on Scheid et al.: Some secrets are revealed: parasitic keratitis amoebae as vectors of the scarcely described pandoraviruses to humans. Parasitol. Res. 2015; 114(4): 1625-7.
  31. Abergel C., Claverie J.M. Pithovirus sibericum: réveil d’un virus géant de plus de 30 000 ans. Médecine/sciences. 2014; 30(3): 329-31.
  32. Levasseur A., Andreani J., Delerce J., Bou Khalil J., Robert C., La Scola B. et al. Comparison of a Modern and Fossil Pithovirus Reveals Its Genetic Conservation and Evolution. Genome Biol. Evol. 2016; 8(8): 2333-9.
  33. Andreani J., Aherfi S., Bou Khalil J.Y., Di Pinto F., Bitam I., Raoult D. et al. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, is a Distant Relative of Pithoviruses. Viruses. 2016; 8(300): 1-11.
  34. Bekliz M., Verneau J., Benamar S., Raoult D., La Scola B., Colson P.A. New Zamilon-like Virophage Partial Genome Assembled from a Bioreactor Metagenome. Front. Microbiol. 2015; 6(1308): 1-12.
  35. Chelikani V., Ranjan T., Zade A., Shukla A., Kondabagil K. Genome segregation and packaging machinery in Acanthamoeba polyphaga mimivirus is reminiscent of bacterial apparatus. J. Virol. 2014; 88(11): 6069-75.
  36. Maumus F., Epert A., Nogué F., Blanc G. Plant genomes enclose footprints of past infections by giant virus relatives. Nat. Commun. 2014; 5(4268): 1-10.
  37. Suárez C., Welsch S., Chlanda P., Hagen W., Hoppe S., Kolovou A. et al. Open membranes are the precursors for assembly of large DNA viruses. Cell. Microbiol. 2013; 15(11): 1883-95.
  38. Maumus F., Blanc G. Study of Gene Trafficking between Acanthamoeba and Giant Viruses Suggests an Undiscovered Family of Amoeba-Infecting Viruses. Genome Biol. Evol. 2016; 8(11): 3351-63.
  39. Sharma V., Colson P., Chabrol O., Scheid P., Pontarotti P., Raoult D. Welcome to pandoraviruses at the ‘Fourth TRUC’ club. Front. Microbiol. 2015; 6(423): 1-11.
  40. Sun C., Feschotte C., Wu Z., Mueller R.L. DNA transposons have colonized the genome of the giant virus Pandoravirussalinus. BMC Biol. 2015; 13(38): 1-12.
  41. Claverie J.M., Abergel C. Giant viruses: The difficult breaking of multiple epistemological barriers. Stud. Hist. Philos. Biol. Biomed. Sci. 2016; 59: 89-99.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Львов Д.К., Сизикова Т.Е., Лебедев В.Н., Борисевич С.В., 2018

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».