Генетическое разнообразие патогенных лептоспир у мелких млекопитающих Северо-Западного федерального округа России

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Лептоспироз — опасная зоонозная инфекция, резервуаром которой являются мелкие млекопитающие. Изучение генетического разнообразия возбудителей в популяциях животных критически важно для эпидемиологического надзора.

Цель работы — выявление и молекулярно-генетическая характеристика возбудителей лептоспироза у мелких млекопитающих (грызунов, насекомоядных, рукокрылых) на территории Северо-Западного федерального округа (СЗФО) России для оценки их видового разнообразия и потенциальной эпидемиологической значимости.

Материалы и методы. В период с 2023 по 2025 г. было собрано 88 образцов мочи от рукокрылых и образцы органов от 773 грызунов и насекомоядных, отловленных в Архангельской, Ленинградской, Псковской областях, Республике Карелия и Санкт-Петербурге. Генетические маркеры патогенных лептоспир детектировали с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени. Генотипирование положительных образцов проводили путём секвенирования по Сэнгеру фрагмента гена secY с последующим филогенетическим анализом.

Результаты. Генетические маркеры Leptospira spp. были обнаружены в 11,4% образцов мочи летучих мышей и в 2,5% образцов органов грызунов и насекомоядных. Наибольший уровень инфицированности отмечен в Санкт-Петербурге (3,2%) и Республике Карелия (3,0%). Филогенетический анализ выявил циркуляцию трех видов патогенных лептоспир: L. kirschneri (доминирующий вид), L. interrogans и L. borgpetersenii. У рукокрылых обнаружены генетически обособленные варианты, а один изолят (PV807621) показал лишь 95% сходство с референсными штаммами L. interrogans, что указывает на возможное обнаружение нового, адаптированного к летучим мышам геноварианта.

Заключение. Впервые показано, что популяции мелких млекопитающих СЗФО являются резервуаром для широкого спектра патогенных лептоспир. Обнаружение потенциально новых генетических вариантов у рукокрылых подчёркивает их важную роль в поддержании и эволюции возбудителей лептоспироза и требует учёта данного фактора при оценке эпидемиологических рисков.

Об авторах

Екатерина Геннадьевна Рябико

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Автор, ответственный за переписку.
Email: riabiko@pasteurorg.ru
ORCID iD: 0000-0001-8738-3021

м. н. с. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Регина Равилевна Баимова

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Email: baimova@pasteurorg.ru
ORCID iD: 0000-0002-0145-2653

м. н. с. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Ислам Анатольевич Кармоков

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Email: karmokov@pasteurorg.ru
ORCID iD: 0000-0003-3820-7106

м. н. с. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Дарья Игоревна Гречишкина

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Email: grechishkina@pasteurorg.ru
ORCID iD: 0000-0001-7295-5736

м. н. с. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Гелена Анатольевна Лунина

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Email: lunina@pasteurorg.ru
ORCID iD: 0009-0006-5832-4966

м. н. с. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Иван Сергеевич Лызенко

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Email: lyzenko@pasteurorg.ru
ORCID iD: 0000-0001-8112-7879

м. н. с. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Ольга Александровна Фрейлихман

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Email: freilikhman@pasteurorg.ru
ORCID iD: 0000-0002-2850-728X

канд. биол. наук, с. н. с. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Эрик Серкалиевич Халилов

ФКУЗ «Северо-Западная противочумная станция» Роспотребнадзора

Email: erik.khalilov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-0599-4302

биолог вирусологической лаборатории

Россия, Санкт-Петербург

Николай Константинович Токаревич

ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора

Email: zoonoses@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6433-3486

д-р мед. наук, профессор, зав. лаб. зооантропонозных инфекций

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Транквилевский Д.В., Киселева Е.Ю., Корзун В.М. и др. Эпизоотолого-эпидемиологическая ситуация по лептоспирозам в Российской Федерации в период с 2013 по 2022 г. и прогноз на 2023 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2023;(3):43–50. Trankvilevsky D.V., Kiseleva E.Yu., Korzun V.M., et al. Epizootiological and epidemiological situation on leptospirosis in the Russian Federation over the period of 2013–2022 and the forecast for 2023. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2023;(3):43–50. DOI: https://doi.org/10.21055/0370-1069-2023-3-43-50 EDN: https://elibrary.ru/juxeds
  2. Инфекционная заболеваемость в Северо-Западном федеральном округе России. Закономерности и особенности эпидемического процесса в современный период: аналитический обзор. СПб.; 2007. Infectious morbidity in the Northwestern Federal District of Russia. Patterns and features of the epidemic process in the modern period: an analytical review. St. Petersburg; 2007.
  3. Dietrich M., Mühldorfer K., Tortosa P., Markotter W. Leptospira and bats: story of an emerging friendship. PLoS Pathogens. 2015;11(11):e1005176. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1005176
  4. Ананьина Ю.В. Лептоспирозы в Российской Федерации: современные особенности эпидемического проявления природных и техногенных очагов. Ветеринарная патология. 2004;(4):54–7. Anan'ina Yu.V. Leptospirosis in the Russian Federation: modern features of the epidemic manifestation of natural and technogenic foci. Veterinary Pathology. 2004;(4):54–7. EDN: https://elibrary.ru/hsqcoh
  5. Цвирко Л.С., Нараленков В.А. Роль мышевидных грызунов и насекомоядных в поддержании лептоспирозной инфекции в очагах припятского Полесья и сопредельных к нему землях. Здоровье для всех. 2009;(2):51–3. Tsvirko L.S., Naralenkov V.A. The role of murine rodents and insectivores in maintaining leptospiral infection in the foci of the Pripyat Polesye and adjacent lands. Health for All. 2009;(2):51–3. EDN: https://elibrary.ru/tvvufn
  6. Каршин С.П., Лоптева М.С., Веревкина М.Н. Мышевидные грызуны, насекомоядные и серые крысы. Их роль в формировании природных очагов лептоспироза на территории Ставропольского края. Сборник научных трудов Всероссийского научно-исследовательского института овцеводства и козоводства. 2015;2(8):160–7. Karshin S.P., Lopteva M.S., Verevkina M.N. Murine rodents, insectivores and gray rats. Their role in the formation of natural foci of leptospirosis in the Stavropol Territory. Collection of Scientific Papers of the All-Russian Scientific Research Institute of Sheep and Goat Breeding. 2015;2(8):160–7. EDN: https://elibrary.ru/vdwixh
  7. Azevedo I.R., Amamura T.A., Isaac L. Human leptospirosis: In search for a better vaccine. Scand. J. Immunol. 2023; 98(5):e13316. DOI: https://doi.org/10.1111/sji.13316
  8. Javati S., Guernier-Cambert V., Jonduo M., et al. Diversity of Leptospira spp. in bats and rodents from Papua New Guinea. Transbound. Emerg. Dis. 2022;69(6):4048–54. DOI: https://doi.org/10.1111/tbed.14725
  9. Viskontene A.L., Radyuk E.V., Shapkin O.A., et al. In search of pathogenic Leptospira species in Myotis and other vesper bats, Russia. Acta Trop. 2025;262:107506. DOI: https://doi.org/10.1016/j.actatropica.2024.107506
  10. Компанец Г.Г., Кузнецова Н.А., Иунихина О.В. Эколого-эпидемиологические проблемы сочетанных очагов ортохантавирусной инфекции и лептоспироза. Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2018;(3):175–9. Kompanets G.G., Kuznetsova N.A., Iunikhina O.V. Ecological and epidemiological problems of combined foci of orthohantavirus infection and leptospirosis. International Journal of Applied and Fundamental Research. 2018;(3):175–9. EDN: https://elibrary.ru/xofqqx
  11. Висконтене А.Л., Дегтярева А.В. Случаи обнаружения летучих мышей на территории Санкт-Петербурга и в населенных пунктах Ленинградской области в 2022–2023 гг. Труды Всероссийского НИИ экспериментальной ветеринарии имени Я.Р. Коваленко. 2023;83(4):16–21. Viskontene A.L., Degtyareva A.V. Cases of bat detection in St. Petersburg and settlements of the Leningrad region in 2022–2023. Proceedings of the Kovalenko All-Russian Research Institute of Experimental Veterinary Medicine. 2023;83(4):16–21. DOI: https://doi.org/10.31016/viev-2023-83-4-16
  12. Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации в 2024 году». М.;2025. State report «On the state of sanitary and epidemiological well-being of the population in the Russian Federation in 2024». Moscow;2025.
  13. Di Azevedo M.I.N., Lilenbaum W. An overview on the molecular diagnosis of animal leptospirosis. Lett. Appl. Microbiol. 2021;72(5):496–508. DOI: https://doi.org/10.1111/lam.13442
  14. Guernier V., Allan K.J., Goarant C. Advances and challenges in barcoding pathogenic and environmental Leptospira. Parasitology. 2018;145(5):595–607. DOI: https://doi.org/10.1017/S0031182017001147
  15. Cosson J.F., Picardeau M., Mielcarek M., et al. Epidemiology of leptospira transmitted by rodents in southeast Asia. PLoS Negl. Trop. Dis. 2014;8(6):e2902. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0002902
  16. Баимова Р.Р., Рябико Е.Г., Останкова Ю.В., Токаревич Н.К. Оптимизация способа детекции и генотипирования патогенных лептоспир в биологических образцах. Клиническая лабораторная диагностика. 2025;70(3):210–7. Baimova R.R., Riabiko E.G., Ostankova Yu.V., Tokarevich N.K. Optimization of the method for detection and genotyping of pathogenic leptospires in biological samples. Clinical Laboratory Diagnostics. 2025;70(3):210–7. DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2025-70-3-210-217 EDN: https://elibrary.ru/nzncgq
  17. Haarsma A.J., Kaal R. Predation of wood mice (Apodemus sylvaticus) on hibernating bats. Popul. Ecol. 2016;58(4):567–76. DOI: https://doi.org/10.1007/s10144-016-0557-y
  18. Vijayachari P., Sugunan A.P., Shriram A.N. Leptospirosis: an emerging global public health problem. J. Biosci. 2008;33:557–69. DOI: https://doi.org/10.1007/s12038-008-0074-z
  19. Баимова Р.Р., Рябико Е.Г., Гречишкина Д.И. и др. Выявление и генотипирование патогенных лептоспир, циркулирующих среди грызунов на территории Санкт-Петербурга. Проблемы особо опасных инфекций. 2025;(2):72–8. Baimova R.R., Riabiko E.G., Grechishkina D.I., et al. Identification and genotyping of pathogenic leptospira circulating among rodents in the city of St. Petersburg. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2025;(2):72–8. DOI: https://doi.org/10.21055/0370-1069-2025-2-72-78 EDN: https://elibrary.ru/lwspnc

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Рябико Е.Г., Баимова Р.Р., Кармоков И.А., Гречишкина Д.И., Лунина Г.А., Лызенко И.С., Фрейлихман О.А., Халилов Э.С., Токаревич Н.К., 2025

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).