Комплексы генотипов ряда цитокинов в конституциональной предрасположенности российских женщин европеоидного происхождения к развитию лейомиомы матки

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Цель: Сравнительный анализ распределения однонуклеотидных полиморфизмов (single nucleotide polymorphism, SNP) регуляторных участков генов ряда провоспалительных и противовоспалительных цитокинов среди пациенток с лейомиомой матки (ЛМ) и женщин контрольной группы без ЛМ в европеоидной популяции Западной Сибири с оценкой прогностической значимости генетических различий.

Материалы и методы: Проведено наблюдательное генетическое исследование «случай–контроль» с участием 180 женщин с ЛМ в возрасте 23–61 лет и 98 практически здоровых женщин аналогичного возраста c помощью ПЦР в реальном времени. Изучены 10 SNP генов провоспалительных цитокинов: фактора некроза опухоли (tumor necrosis factor, TNF) TNF-863C/A, TNF-308G/A, TNF-238G/A, интерлейкинов (interleukins, IL) IL1B-31T/C, IL6-174C/G, IL8-251T/A, IL17-197A/G и противовоспалительных цитокинов IL4-590C/T, IL10-592A/C, IL-10-1082A/G. Применялись стандартные методы генетико-статистического и биоинформационного анализа.

Результаты: При сравнительном исследовании частоты распределения 10 SNP генов цитокинов выявлено 587 статистически значимых, с учетом поправки Бонферрони, комплексных генотипов, позитивно или негативно ассоциированных с развитием ЛМ. Наиболее сильные позитивные ассоциации представлены комбинациями генотипов TNF-308G/G и IL17-197A/A (OR=7,03, p=0,0162), IL10-1082A/G и IL17-197A/A (OR=10,78, p=0,0423), TNF-308G/G, IL6-174G/C, IL10-592C/C и IL10-1082A/G (OR=12,81, p=0,0414) с прогностической ценностью развития ЛМ в пределах от 82 до 100%. С другой стороны, по сравнению с контрольной группой, выявлены комплексные генотипы, характеризующие резистентность к развитию ЛМ (p<0,01), имеющие прогностическую ценность для конкретной женщины c вероятностью от 87 до 100%.

Заключение: Полученные данные могут быть использованы для формирования комплекса персонифицированных прогностических показателей генетической предрасположенности или резистентности женщины к развитию ЛМ еще до развития заболевания.

Об авторах

Владимир Иосифович Коненков

Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии – филиал ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»

Email: vikonenkov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-7385-6270

д.м.н., профессор, академик РАН, заслуженный деятель науки РФ, заведующий лабораторией клинической иммуногенетики, научный руководитель

Россия, Новосибирск

Елена Георгиевна Королева

ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: korlex71@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-8522-4382

врач акушер-гинеколог, м.н.с. лаборатории клеточной биологии и фундаментальных основ репродукции ЦНИЛ

Россия, Новосибирск

Виктор Федорович Прокофьев

Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии – филиал ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»

Автор, ответственный за переписку.
Email: vf_prok@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-7290-1631

к.м.н., в.н.с. лаборатории клинической иммуногенетики

Россия, Новосибирск

Алла Владимировна Шевченко

Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии – филиал ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»

Email: vf_prok@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5898-950X

д.б.н., в.н.с. лаборатории клинической иммуногенетики

Россия, Новосибирск

Юлия Сергеевна Тимофеева

ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: dr.j.timofeeva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5379-9296

к.м.н., ассистент кафедры акушерства и гинекологии

Россия, Новосибирск

Светлана Владимировна Айдагулова

ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: asvetvlad@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7124-1969

д.б.н., профессор, заведующая лабораторией клеточной биологии и фундаментальных основ репродукции ЦНИЛ

Россия, Новосибирск

Игорь Олегович Маринкин

ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России

Email: rector@ngmu.ru
ORCID iD: 0000-0002-9409-4823

д.м.н., профессор, Заслуженный врач РФ, заведующий кафедрой акушерства и гинекологии, ректор

Россия, Новосибирск

Список литературы

  1. Адамян Л.В., Кузнецова М.В., Тоноян Н.М., Шаповаленко Р.А., Пивазян Л.Г., Трофимов Д.Ю. Генетические аспекты миомы матки: современный взгляд на проблему. Проблемы репродукции. 2023; 29(4-2): 29-39. [Adamyan L.V., Kuznetsova M.V., Tonoyan N.M., Shapovalenko R.A., Pivazyan L.G., Trofimov D.Yu. Genetic aspects of uterine fibroids: a modern view of the problem. Russian Journal of Human Reproduction. 2023; 29(4-2): 29-39. (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.17116/repro20232904229.
  2. Министерство здравоохранения Российской Федерации. Клинические рекомендации. Миома матки. 2020. [Ministry of Health of the Russian Federation. Clinical guidelines. Uterine fibroids. 2020. (in Russian)].
  3. Fedotova M., Barysheva E., Bushueva O. Pathways of hypoxia-inducible factor (HIF) in the orchestration of uterine fibroids development. Life (Basel). 2023; 13(8): 1740. https://dx.doi.org/10.3390/life13081740.
  4. Ramaiyer M.S., Saad E., Kurt I., Borahay M.A. Genetic mechanisms driving uterine leiomyoma pathobiology, epidemiology, and treatment. Genes (Basel). 2024; 15(5): 558. https://dx.doi.org/10.3390/genes15050558.
  5. Согоян Н.С., Кузнецова М.В., Донников А.Е., Мишина Н.Д., Михайловская Г.В., Шубина Е.С., Зеленский Д.В., Муллабаева С.М., Адамян Л.В. Семейная предрасположенность к развитию лейомиомы матки: поиск генетических факторов, повышающих риск развития заболевания. Проблемы репродукции. 2020; 26(5): 51-7. [Sogoyan N.S., Kuznetsova M.V., Donnikov A.E., Mishina N.D., Mikhailovskaya G.V., Shubina E.S., Zelenskii D.V., Mullabaeva S.M., Adamyan L.V. Familial predisposition to uterine leiomyoma: searching for genetic factors that increase the risk of leyomyoma development. Russian Journal of Human Reproduction. 2020; 26(5): 51-7. (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.17116/repro20202605151.
  6. Кудрявцева О.К., Барышева Е.М., Вдовина И.Н., Клиновская А.А., Новикова Е.А., Полоников А.В., Иванов В.П., Бушуева О.Ю. Ассоциация полиморфных вариантов генов, вовлеченных в метаболизм глутатиона, с риском развития миомы матки. Медицинская генетика. 2020; 19(6): 52-4. [Kudryavtseva O.K., Barysheva E.M., Vdovina I.N., Klinovskaya A.A., Novikova E.A., Polonikov A.V., Ivanov V.P., Bushueva O.Yu. Association of genetic variations in genes involved in glutathione metabolism with risk of development of uterine fibroids. Medical Genetics. 2020; 19(6): 52-4. (in Russian)].
  7. Saad E.E., Michel R., Borahay M.A. Immunosuppressive tumor microenvironment and uterine fibroids: role in collagen synthesis. Cytokine Growth Factor Rev. 2024; 75: 93-100. https://dx.doi.org/10.1016/j.cytogfr.2023.10.002.
  8. Zhou X., Li Z., Zhou J. Tumor necrosis factor α in the onset and progression of leukemia. Exp. Hematol. 2017; 45: 17-26. https://dx.doi.org/10.1016/ j.exphem.2016.10.005.
  9. Medikare V., Altaf A., Ananthapur V., Deendayal M., Nallari P. Susceptibility risk alleles of -238G/A, -308G/A and -1031T/C promoter polymorphisms of TNF-α gene to uterine leiomyomas. Recent Adv. DNA Gene Seq. 2015; 9(1): 65-71. https://dx.doi.org/10.2174/2352092210999151214155858.
  10. El-Tahan R.R., Ghoneim A.M., El-Mashad N. TNF-alpha gene polymorphisms and expression. Springerplus. 2016; 5(1): 1508. https://dx.doi.org/10.1186/s40064-016-3197-y.
  11. Хашукоева А.З., Хлынова С.А., Маркова Э.А., Каранашева А.Х. Миома матки: aлгоритм ведения и лечения. Акушерство и гинекология. 2021; 3(Приложение): 24-7. [Khashukoeva A.Z., Khlynova S.A., Markova E.A., Karanasheva A.Kh. Uterine myoma: algorithm for management and treatment. Obstetrics and Gynecology. 2021; (3 Suppl.): 24-7. (in Russian)].
  12. Simon R. Sensitivity, specificity, PPV, and NPV for predictive biomarkers. J. Natl. Cancer Inst. 2015; 107(8): djv153. https://dx.doi.org/10.1093/jnci/ djv153.
  13. Наркевич А.Н., Виноградов К.А., Гржибовский А.М. Множественные сравнения в биомедицинских исследованиях: проблема и способы решения. Экология человека. 2020; 10: 55-64. [Narkevich A.N., Vinogradov K.A., Grzhibovskii A.M. Multiple comparisons in biomedical research: the problem and its solutions. Human Ecology. 2020; (10): 55-64. (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.33396/1728-0869-2020-10-55-64.
  14. Nourian M., Chaleshi V., Pishkar L., Azimzadeh P., Baradaran Ghavami S., Balaii H. et al. Evaluation of tumor necrosis factor (TNF)-α mRNA expression level and the rs1799964 polymorphism of the TNF-α gene in peripheral mononuclear cells of patients with inflammatory bowel diseases. Biomed. Rep. 2017; 6(6): 698-702. https://dx.doi.org/10.3892/br.2017.908.
  15. Keshavarzi F., Salimi S., Mohammadpour-Gharehbagh A., Teimoori B., Yazdi A., Farajian-Mashhadi F. et al. The -2549 insertion/deletion polymorphism of VEGF gene associated with uterine leiomyoma susceptibility in women from Southeastern Iran. Ginekol. Pol. 2017; 88(3): 115-9. https://dx.doi.org/10.5603/GP.a2017.0022.
  16. Nenu I., Toadere T.M., Topor I., Țichindeleanu A., Bondor D.A., Trella S.E. et al. Interleukin-6 in hepatocellular carcinoma: a dualistic point of view. Biomedicines. 2023; 11(10): 2623. https://dx.doi.org/10.3390/biomedicines11102623.
  17. Upadhyay S., Dubey P.K. Gene variants polymorphisms and uterine leiomyoma: an updated review. Front. Genet. 2024; 15: 1330807. https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2024.1330807.
  18. Королева Е.Г., Коненков В.И., Шевченко А.В., Прокофьев В.Ф., Орлов Н.Б., Тимофеева Ю.С., Айдагулова С.В., Маринкин И.О. Ассоциированность полиморфных вариантов генов цитокинов, фактора роста эндотелия и матричных металлопротеиназ с развитием миомы матки среди русских женщин. Сибирский научный медицинский журнал. 2024; 44(2): 113-22. [Koroleva Е.G., Konenkov V.I., Shevchenko A.V., Prokof’ev V.F., Orlov N.В., Timofeeva Yu.S., Aidagulova S.V., Marinkin I.О. Association of polymorphic variants of cytokines genes, endothelial growth factor and matrix metalloproteinases with the development of uterine fibroids among Russian women. Siberian Scientific Medical Journal. 2024; 44(2): 113-22. (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.18699/SSMJ20240214.
  19. Maltese G., Fontanella C., Lepori S., Scaffa C., Fucà G., Bogani G. et al. Atypical uterine smooth muscle tumors: a retrospective evaluation of clinical and pathologic features. Oncology. 2018; 94(1): 1-6. https://dx.doi.org/ 10.1159/000479818.
  20. Алтухова О.Б., Радзинский В.Е., Сиротина С.С., Чурносов М.И., Ефремова О.А., Батлуцкая И.В., Орлова В.С. Полиморфизм генов интерлейкинов и риск развития миомы матки. Акушерство и гинекология. 2022; 7: 81-7. [Altukhova O.B., Radzinskii V.E., Sirotina S.S., Churnosov M.I., Efremova O.A., Batlutskaya I.V., Orlova V.S. Interleukin gene polymorphism and risk of uterine fibroids. Obstetrics and Gynecology. 2022; (7): 81-7. (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.18565/aig.2022.7.81-87.
  21. Yu O., Scholes D., Schulze-Rath R., Grafton J., Hansen K., Reed S.D. A US population-based study of uterine fibroid diagnosis incidence, trends, and prevalence: 2005 through 2014. Am. J. Obstet. Gynecol. 2018; 219(6): 591.e1-591.e8. https://dx.doi.org/10.1016/j.ajog.2018.09.039.
  22. Laughlin-Tommaso S.K., Jacoby V.L., Myers E.R. Disparities in fibroid incidence, prognosis, and management. Obstet. Gynecol. Clin. North Am. 2017; 44(1): 81-94. https://dx.doi.org/10.1016/j.ogc.2016.11.007.
  23. Koltsova A.S., Efimova O.A., Pendina A.A. A view on uterine leiomyoma genesis through the prism of genetic, epigenetic and cellular heterogeneity. Int. J. Mol. Sci. 2023; 24(6): 5752. https://dx.doi.org/10.3390/ijms 24065752.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».