Исследование тушения флуоресценции билирубином карбоцирнинового красителя в комплексе с ДНК. Влияние добавок Cu2+

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Изучено влияние билирубина на спектрально-флуоресцентные свойства катионного тиакарбоцианинового красителя Cyan 2 в присутствии ДНК. Краситель Cyan 2 образует с ДНК нековалентный комплекс, что приводит к росту флуоресценции красителя. Взаимодействие с билирубином приводит к эффективному тушению флуоресценции красителя в комплексе с ДНК (статический механизм), что может быть использовано для конструирования спектрально-флуоресцентного сенсора на билирубин. Результаты экспериментов in vitro проиллюстрированы экспериментами in silico по молекулярному докингу. Влияние добавок ионов Cu2+ способно дополнительно усиливать тушение флуоресценции красителя билирубином. Определены эффективные константы тушения и пределы обнаружения билирубина с помощью системы Cyan 2–ДНК (LOD и LOQ).

Об авторах

П. Г. Пронкин

Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук

Email: pronkinp@gmail.com
Москва, Россия

А. С. Татиколов

Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: pronkinp@gmail.com
Москва, Россия

Список литературы

  1. Pronkin P.G., Tatikolov A.S. // Molecules. 2022. V. 27. No. 19. P. 6367. https://doi.org/10.3390/molecules27196367
  2. Татиколов А.С., Пронкин П.Г., Шведова Л.А., Панова И.Г. // Хим. физика. 2019. Т. 38. № 12. С. 11. https://doi.org/10.1134/S0207401X19120185
  3. Kim S.Y., Park S.C. // Front. Pharmacol. 2012. V. 3, P. 45. https://doi.org/10.3389/fphar.2012.00045
  4. Татиколов А.С., Панова И.Г. // Хим. физика. 2024. T.43. № 11. С. 3. https://doi.org/10.1134/S1990793124701173
  5. Soto Conti C.P. // Arch. Argent. Pediatr. 2021. V. 119. No. 1. e18. https://doi.org/10.5546/aap.2021.eng.e18
  6. Tatikolov A.S., Pronkin P.G., Panova I.G. // Biophys. Chem. 2025. V. 318. P. 107378. https://doi.org/10.1016/j.bpc.2024.107378
  7. Singla N., Ahmad M., Mahajan V., Singh P., Kumar S. // Sens. Diagn. 2023. V. 2. P. 1574. http://dx.doi.org/10.1039/D3SD00157A
  8. Karmakar S., Das T.K., Kundu S., Maiti S., Saha A. // ACS Appl. Bio Mater. 2020. V. 3. P. 8820. https://doi.org/10.1021/acsabm.0c01165
  9. Xiao W., Liu J., Xiong Y. et al. // Anal. Bioanal. Chem. 2021. V. 413. P. 7009. https://doi.org/10.1007/s00216-021-03660-6
  10. Speck, W., Behrman, R. // Pediatr. Res. 1974. V. 8. P. 451. https://doi.org/10.1203/00006450-197404000-00665
  11. Velapoldi R.A., Menis O. // Clinical Chem. 1971. V. 17. No. 12. P. 1165. PMID: 5118155
  12. Asad S.F., Singh S., Ahmad A., Hadi S.M. // Biochim. Biophys. Acta. 1999. V. 1428. No. 2–3. P. 201. https://doi.org/10.1016/s0304-4165(99)00075-6
  13. Asad S.F., Singh S., Ahmad A., Hadi S.M. // Toxicology Lett. 2002. V. 131. № 3. P. 181. https://doi.org/10.1016/s0378-4274(02)00031-0
  14. Акимкин Т.М., Татиколов А.С., Ярмолюк С.М. // Химия высоких энергий. 2011. Т. 45. № 3. С. 252.
  15. Yarmoluk S.M., Lukashov S.S., Losytskyy M.Y., Akerman B., Kornyushyna O.S. // Spectrochim. Acta. Part A. 2002. V. 58. No. 14. P. 3223. https://doi.org/10.1016/S1386-1425(02)00100-2
  16. Xu C., Losytskyy M.Y., Kovalska V.B., Kryvorotenko D.V. et al. // J. Fluoresc. 2007. V. 17. P. 671. https://doi.org/10.1007/s10895-007-0215-z
  17. Tatikolov A.S., Akimkin T.M., Pronkin P.G., Yarmo­luk S.M. // Chem. Phys. Lett. 2013. V. 556. P. 287. https://doi.org/10.1016/j.cplett.2012.11.097
  18. Mukerjee P., Ostrow J.D., Tiribelli C. // BMC Biochemistry. 2002. V. 3. P. 17. https://doi.org/10.1186/1471-2091-3-17
  19. Baguley B.C., Falkenhaug E.M. // Nucl. Acids Res. 1978. V. 5. No. 1. P. 161. https://doi.org/10.1093/nar/5.1.161
  20. Lakowicz J.R. Principles of Fluorescence Spectroscopy, 3rd ed. Springer, 2006.
  21. ISBN: 978-0-387-31278-1
  22. Hubaux A., Vos G.// Anal. Chem. 1970. V. 42. No. 8. P. 849. https://doi.org/10.1021/ac60290a013
  23. MacDougall D., Crummett W.B. et al. // Anal. Chem. 1980. V. 52. P. 2242. https://doi.org/10.1021/ac50064a004
  24. Valdes-Tresanco M.S., Valdes-Tresanco, M.E., Valiente, P.A., Moreno E. // Biol. Direct. 2020. V. 15. P. 12. https://doi.org/10.1186/s13062-020-00267-2
  25. Drew H.R., Wing R.M., Takano T. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1981. V. 78. P. 2179. https://doi.org/10.1073/pnas.78.4.2179
  26. Dautant A., Langlois d’Estaintot B., Gallois B., Brown T., Hunter W.N. // Nucl. Acids Res. 1995. V. 23. P. 1710. https://doi.org/10.1093/nar/23.10.1710
  27. Yang Z., Lasker K., Schneidman-Duhovny D. et al. // J. Struct. Biol. 2012. V. 179. P. 269. https://doi.org/10.1016/j.jsb.2011.09.006
  28. Hanwell M.D., Curtis D.E., Lonie D.C. et al. // J. Cheminformatics. 2012. V. 4. P. 1. https://doi.org/10.1186/1758-2946-4-17
  29. Пронкин П.Г., Шведова Л.А., Татиколов А.С. // Хим. физика. 2024. Т. 43. № 3. С. 3. https://doi.org/10.31857/S0207401X24030016
  30. Пронкин П.Г., Татиколов А.С. // Химия высоких энергий. 2009. Т. 43. №. 6. С. 527.
  31. Пронкин П.Г., Татиколов А.С. // Химия высоких энергий. 2011. Т. 45. №. 2. С. 169.
  32. Пронкин П.Г., Татиколов А.С. // Хим. физика. 2021. T. 40. № 2. C. 3. https://doi.org/10.31857/S0207401X2102014X
  33. Пронкин П.Г., Татиколов А.С. // Хим. физика. 2022. T. 41. № 2. С. 3. https://doi.org/10.31857/S0207401X22020091
  34. Yarmoluk S.M., Lukashov S.S., Ogul’chansky T.Y., Losytskyy M.Y., Kornyushyna O.S. // Biopolym. (Biospectrosc.). 2001. V. 62. P. 219. https://doi.org/10.1002/bip.1016
  35. Galhano J., Marcelo G.A., Santos H.M. et al. // Chemosensors. 2022. V. 10. P. 80. https://doi.org/10.3390/chemosensors10020080
  36. Hanmeng O., Chailek N., Charoenpanich A. et al. // Spectrochim. Acta, Part A. 2020. V. 240. P. 118606. https://doi.org/10.1016/j.saa.2020.118606
  37. Chen X., Nam S.W., Kim G.H. et al. // Chem. Commun. 2010. V. 46. No. 47. P. 8953. http://dx.doi.org/10.1039/C0CC03398G
  38. Li J., Ge J., Zhang Z. et al. // Sens. Actuators, B. 2019. V. 296. P. 126578. https://doi.org/10.1016/j.snb.2019.05.055
  39. Krishna R.M., Gupta S.K. // Bull. Magn. Res. 1994. V. 16. No. 3. P. 239.
  40. Taniguchi M., Lindsey J.S. // J. Photochem. Photobiol. C. 2023. V. 55. P. 100585. https://doi.org/10.1016/j.jphotochemrev.2023.100585
  41. Ghosh D., Chattopadhyay N. // J. Lumin. 2015. V. 160. P. 223. https://doi.org/10.1016/j.jlumin.2014.12.018
  42. Achyuthan K.E., Bergstedt T.S., Chen L. et al. // J. Mater. Chem. 2005. V. 15. No. 27–28. P. 2648. https://doi.org/10.1016/10.1039/b501314c
  43. Полетаев А.И. // Хим. физика. 2023. Т. 42. № 9. C. 74. https://doi.org/10.31857/S0207401X23090091
  44. Терешкин Э.В., Терешкина К.Б., Лойко Н.Г., Коваленко В.В., Крупянский Ю.Ф. // Хим. физика. 2024. Т. 43. № 12. C. 84.
  45. Разумов В.Ф. // Хим. физика. 2023. T. 42. № 2. С. 14. https://doi.org/10.31857/S0207401X23020139

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».