Кластерная самоорганизация интерметаллических систем: кластеры-прекурсоры K3, K4, K6, K12 для самосборки кристаллических структур La8Ni40As24–oP72 и Ca12Fe32Pd4As24-oP72
- Authors: Шевченко В.Я.1, Илюшин Г.Д.2
-
Affiliations:
- Институт химии силикатов им. И. В. Гребенщикова РАН
- НИЦ «Курчатовский институт»
- Issue: Vol 50, No 3 (2024)
- Pages: 3-15
- Section: Articles
- URL: https://ogarev-online.ru/0132-6651/article/view/272119
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0132665124030019
- EDN: https://elibrary.ru/POJGIY
- ID: 272119
Cite item
Full Text
Abstract
С помощью компьютерных методов (пакет программ ToposPro) осуществлен комбинаторно-топологический анализ и моделирование самосборки кристаллических структур семейства и La8Ni40As24–oP72 (V= 1069.3 Å3, пр. группа Pnma) и Ca12Fe32Pd4As24-oP72 (V= 1155.89 Å3, пр. группа Pnma). Для кристаллической структуры La8Ni40As24–oP72 установлены 79 вариантов выделения кластерных структур с числом кластеров N=2 (1 вариант), 3 (18 вариантов), 4 (30 вариантов) и 6 (30 вариантов). Рассмотрен вариант самосборки кристаллической структуры с участием образующих упаковки кластеров-прекурсоров: сдвоенных тетраэдров-димеров K6(4a) = 0@6(La2Ni2As2) и K6(4b) = (Ni2As2Ni2) с симметрией g= –1, тетраэдров K4 = 0@4 (LaNi2As), колец K3 = 0@3(Ni2As), атомов-спейсеров Ni7 и As5. Для кристаллической структуры Ca12Fe32Pd4As24-oP72 установлены 93 варианта кластерного представления 3D атомной сетки с числом структурных единиц 2 (2 варианта), 3 (15 варианта), 4 (49 варианта) и 6 (29). Рассмотрен вариант самосборки кристаллической структуры Ca12Fe32Pd4As24-oP72 с участием образующих упаковки кластеров-прекурсоров: сдвоенных тетраэдров-димеров K6(4a) = 0@ 6 (Ca2Fe2As2) c симметрией g= –1, тетрамеров K12(4b) = 0@ 12 (CaFeFe2As2)2 с симметрией g= –1, тетраэдров K4 = 0@4(CaFe2As), колец K3 = 0@3(Fe2As), атомов-спейсеров Pd и As. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структур La8Ni40As24–oP72 и Ca12Fe32Pd4As24 -oP72 из кластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
Full Text
ВВЕДЕНИЕ
По данным [1–3] пространственная группа Pnma, установлена для 789 двойных соединений AnBn, 2925 тройных соединений AnBnCn и 886 четверных соединений AnBnCnDn. Большие кристаллохимические семейства, содержащие атомы P, As, Sb насчитывают 409, 279, 307 соединений. В таблице 1 приведены все двойные, тройные и четверные соединения с пространственной группой Pnma и 72 атомами в элементарной ячейке [4–14].
Таблица 1. Двойные, тройные и четверные соединения с пространственной группой Pnma и 72 атомами в элементарной ячейке
Соединение | Группа симметрии | Последовательность Вайкоффа | Параметры ячейки, Å | V, Å3 |
Ce2Ni7 [4] | P m c n | c18 | 4.877,8.529,29.626 | 1232.4 |
LaNi5As3 [6] | P n m a | c18 | 11.179,3.913,24.443 | 1069.3 |
Pb2Bi2S5 [7] | P b n m | c18 | 19.101,23.913,4.061 | 1854.9 |
Ca3Fe5Pd4As6 [8] | P n m a | c18 | 19.855,3.946,15.343 | 1202.2 |
Ca3Fe7Pd2As6 [8] | P n m a | c18 | 26.363,3.870,11.330 | 1155.9 |
Ca3Fe7Pt2As6 [8] | P n m a | c18 | 26.435,3.918,11.345 | 1174.9 |
RbNa8Ga3P6[9] | P n m a | c18 | 22.276,4.695,16.356 | 1710.5 |
RbNa8Ga3As6 [9] | P n m a | c18 | 22.843,4.789,16.861 | 1844.6 |
Ti4Ni Si4 [10] | P n m a | d3c12 | 15.639,5.083,12.752 | 1013.7 |
Hf6 Cr5Si7 [11] | P n m a | d3c12 | 16.385,5.170,13.309 | 1127.4 |
Lu3MnSn5 [12] | P n m a | d3c12 | 18.384,6.003,14.898 | 1644.1 |
Tm3MnSn5 [12] | P n m a | d3c12 | 18.449,6.013,14.933 | 1656.5 |
Ca6 Cd11 Pt [13] | P n m a | d3c12 | 18.799,5.986,15.585 | 1753.9 |
Sn8Co7 Zn3 [14] | P n m a | d6c6 | 12.591, 11.630,8.270 | 1211.0 |
K4Si4Te10 [15] | P n m a | d5c8 | 21.258,12.005,10.608 | 2707.2 |
Тройное соединение La8Ni40As24–oP72 не имеет кристаллохимических аналогов. Параметры ромбической ячейки: a = 11.179 Å, b = 3.913 Å, c = 24.443 Å, V= 1069.3 Å3. Набор элементов точечной симметрии для пространственной группы Pnma: –1(4a, 4b), m(4c). Последовательность Вайкоффа для 18 кристаллографически независимых атомов имеет вид c18. Рассчитанные значения координационных чисел атомов La = 19 (1 атом) и 17 (1 атом), Ni = 12 (9 атомов), 13 (1 атом), As = 9 (5 атомов) и 1(1 атом). Тип каркас-образующих кластеров-прекурсоров, образующих упаковки не известен.
Четверные соединения Ca12Fe32Pd4As24-oP72 и Ca12Fe32Pd4P24-oP72 образуют кристаллохимическое семейство (табл. 1). Параметры ромбической ячейки Ca12Fe32Pd4As24-oP72: a = 26.363 Å, b = 3.870 Å, c = 11.330 Å, V= 1155.90 Å3. Последовательность Вайкоффа для 18 кристаллографически независимых атомов имеет вид c18. Рассчитанные значения координационных чисел атомов Ca = 16 (1 атом) и 15 (2 атома), Fe = 12 (7 атомов), 13 (1 атом), Pd = 9 (1 атом), As = 9 (3 атома). Тип каркас-образующих кластеров-прекурсоров, образующих упаковки для этой группы соединений, не известен.
В настоящей работе проведен геометрический и топологический анализ кристаллических структур La8Ni40As24–P72 и Ca12Fe32Pd4As24-oP72. Установлены кластеры-прекурсоры K3, K4, K6, K12, участвующие в самосборке кристаллических структур. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур из образующих упаковки кластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
Работа продолжает исследования [15–18] в области моделирования процессов самоорганизации систем на супраполиэдрическом уровне и геометрического и топологического анализа кристаллических структур с применением компьютерных методов [3].
МЕТОДИКИ, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ПРИ КОМПЬЮТЕРНОМ АНАЛИЗЕ
Геометрический и топологический анализ осуществляли с помощью комплекса программ ToposPro [3], позволяющего проводить многоцелевое исследование кристаллической структуры в автоматическом режиме, используя представление структур в виде фактор-графов.
Данные о функциональной роли атомов при образовании кристаллической структуры получены расчетом координационных последовательностей, т. е. наборов чисел {Nk}, где Nk – число атомов в k-ой координационной сфере данного атома. В табл. 2 приведено локальное окружение атомов в кристаллической структуре и значения координационных последовательностей атомов для La8Ni40As24-oP72 и табл. 3 для Ca12Fe32Pd4As24-oP72.
Таблица 2. La8Ni40As24–oP72. Координационные последовательности и локальное окружение атомов в кристаллической структуре
Атом | Локальное окружение | Координационные последовательности |
N1 N2 N3 N4 N5 | ||
Ni1 | 7Ni + 4As + 1La | 12 46 112 198 322 |
Ni2 | 5Ni + 4As + 3La | 12 50 115 196 330 |
Ni3 | 5Ni + 4As + 3La | 12 54 103 202 323 |
Ni4 | 6Ni + 6As + 1La | 13 41 107 186 308 |
Ni5 | 5Ni + 4As + 3La | 12 48 120 204 333 |
Ni6 | 5Ni + 4As + 3La | 12 51 106 200 326 |
Ni7 | 5Ni + 4As + 3La | 12 54 112 221 335 |
Ni8 | 5Ni + 4As + 3La | 12 52 113 219 320 |
Ni9 | 8Ni + 5As | 13 39 114 192 316 |
Ni10 | 5Ni + 4As + 3La | 12 51 108 204 327 |
As1 | 7Ni + 2La | 9 48 108 189 322 |
As2 | 8Ni + 3La | 11 52 109 198 330 |
As3 | 7Ni + 2La | 9 45 109 192 315 |
As4 | 7Ni + 2La | 9 45 107 184 322 |
As5 | 7Ni + 2La | 9 45 104 195 315 |
As6 | 7Ni + 2La | 9 45 112 211 311 |
La1 | 12Ni + 7As | 19 53 114 219 344 |
La2 | 11Ni + 6As | 17 47 123 218 327 |
Таблица 3. Ca12Fe32Pd4As24-oP72. Координационные последовательности и локальное окружение атомов
Атом | Локальное окружение атома | Координационные последовательности |
N1 N2 N3 N4 N5 | ||
Ca1 | 8Fe + 6As+2Pd | 16 42 116 196 310 |
Ca2 | 7Fe + 6As+2Pd | 15 42 107 178 295 |
Ca3 | 7Fe + 6As+2Pd | 15 42 110 184 299 |
Fe1 | 3Ca + 5Fe +4As | 12 48 99 187 294 |
Fe2 | 3Ca + 5Fe +4As | 12 48 99 187 295 |
Fe3 | 4Ca + 4Fe + 4As | 12 49 108 207 305 |
Fe4 | 4Ca + 4Fe + 4As | 12 49 108 204 305 |
Fe5 | 3Ca + 5Fe + 4As | 12 45 92 177 282 |
Fe6 | 4Ca + 4Fe + 4As | 12 47 102 191 297 |
Fe7 | 1Ca + 7Fe + 4As | 12 42 88 156 263 |
Fe8 | 8Fe + 5As | 13 39 93 163 275 |
Pd9 | 6Ca + 3As | 9 49 96 191 284 |
As1 | 4Ca + 4Fe4 + Pd | 9 45 102 182 287 |
As2 | 2Ca + 7Fe7 | 9 41 89 166 273 |
As3 | 4Ca + 4Fe + 1Pd | 9 49 104 189 296 |
Алгоритм разложения в автоматическом режиме структуры любого интерметаллида, представленного в виде свернутого графа, на кластерные единицы основывается на следующих принципах: структура образуется в результате самосборки из нанокластеров-прекурсоров образующих каркас структуры, пустоты в котором заполняют спейсеры; кластеры-прекурсоры занимают высокосимметричные позиции; набор нанокластеров-прекурсоров и спейсеров включает в себя все атомы структуры.
СИММЕТРИЙНЫЙ И ТОПОЛОГИЧЕСКИЙ КОД (ПРОГРАММА) САМОСБОРКИ КРИСТАЛЛИЧЕСКИХ СТРУКТУР.
Использованный нами метод моделирования кристаллической структуры основан на определении иерархической последовательности ее самосборки в кристаллографическом пространстве. На первом уровне самоорганизации системы определяется механизм формирования первичной цепи структуры из нанокластеров 0-уровня, сформированных на темплатной стадии химической эволюции системы, далее – механизм самосборки из цепи слоя (2-й уровень) и затем из слоя – трехмерного каркаса структуры (3-й уровень).
Кристаллическая структура La8Ni40As24–oP72
Для LaNi5As3-oP72 установлены 79 вариантов выделения кластерных структур с числом кластеров N=2 (1 вариант), 3 (18 вариантов), 4 (30 вариантов) и 6 (30 вариантов) (таблица 4).
Таблица 4. La8Ni40As24–oP72. Варианты кластерного представления кристаллической структуры с 2, 3, 4, и 6 структурными единицами. Указан центральный атом полиэдрического кластера, число его оболочек (в первой скобке) и количество атомов в оболочке (во второй скобке)
Две структурные единицы |
Ni4(1)(1@14) Ni9(1)(1@14) |
Три структурные единицы |
Ni2(0)(1) Ni9(1)(1@14) Ni10(1)(1@12) |
Ni2(1)(1@12) Ni5(1)(1@12) Ni9(1)(1@14) |
Ni2(1)(1@12) Ni9(1)(1@14) As3(1)(1@9) |
Ni2(1)(1@12) Ni9(1)(1@14) Ni10(1)(1@12) |
Ni3(1)(1@12) Ni10(1)(1@12) As6(1)(1@9) |
Ni3(1)(1@12) Ni4(1)(1@14) As6(1)(1@9) |
Ni3(1)(1@12) Ni4(1)(1@14) Ni7(1)(1@12) |
Ni3(1)(1@12) Ni6(1)(1@12) As6(1)(1@9) |
Ni3(1)(1@12) Ni6(1)(1@12) Ni7(1)(1@12) |
Ni3(1)(1@12) Ni7(1)(1@12) As2(1)(1@11) |
Ni3(1)(1@12) Ni7(1)(1@12) Ni10(1)(1@12) |
Ni4(1)(1@14) As1(1)(1@9) La2(1)(1@18) |
Ni4(1)(1@14) Ni7(1)(1@12) As5(1)(1@9) |
Ni5(0)(1) Ni6(1)(1@12) Ni9(1)(1@14) |
Ni5(1)(1@12) Ni6(1)(1@12) Ni9(1)(1@14) |
Ni5(1)(1@12) Ni9(1)(1@14) As4(1)(1@9) |
Ni6(1)(1@12) Ni7(1)(1@12) As5(1)(1@9) |
Ni7(1)(1@12) Ni10(1)(1@12) As5(1)(1@9) |
Четыре структурные единицы |
As1(1)(1@9) As3(0)(1) As4(1)(1@9) La2(1)(1@18) |
As1(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) La2(1)(1@18) |
As1(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) La2(1)(1@18) |
Ni10(1)(1@12) As1(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni10(1)(1@12) As1(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
Ni10(1)(1@12) As1(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni2(1)(1@12) As1(1)(1@9) As3(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni2(1)(1@12) Ni10(1)(1@12) As1(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni3(1)(1@12) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni3(1)(1@12) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As6(1)(1@9) |
Ni3(1)(1@12) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni4(1)(1@14) As1(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni4(1)(1@14) As1(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
Ni4(1)(1@14) As1(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
Ni4(1)(1@14) As1(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni5(1)(1@12) As1(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Ni5(1)(1@12) As1(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Ni5(1)(1@12) Ni6(1)(1@12) As1(0)(1) As5(1)(1@9) |
Ni5(1)(1@12) Ni6(1)(1@12) As1(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Ni6(1)(1@12) As1(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni6(1)(1@12) As1(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
Ni6(1)(1@12) As1(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ni7(1)(1@12) As2(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Ni7(1)(1@12) As2(1)(1@11) As4(0)(1) As5(1)(1@9) |
Ni7(1)(1@12) As2(1)(1@11) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Ni9(1)(1@14) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Ni9(1)(1@14) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(0)(1) |
Ni9(1)(1@14) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(1)(1@9) |
Ni9(1)(1@14) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(0)(1) |
Ni9(1)(1@14) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Шесть структурных единиц |
As1(0)(1) As2(0)(1) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(0)(1) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@11) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Рассмотрен вариант самосборки кристаллической структуры с участием образующих упаковки кластеров-прекурсоров:
сдвоенных тетраэдров K6(4a) = 0@6(La2Ni2As2) и сдвоенных тетраэдров K6(4b) = (Ni2As2Ni2) с симметрией g= –1,
тетраэдров K4 = 0@4 (LaNi2As),
колец K3 = 0@3(Ni2As),
атомов-спейсеров Ni7 и As5 (рис. 1).
Рис. 1. LaNi5As3-oP72. Супракластер
Самосборка слоя S32. Образование слоя S32 происходит при связывании первичных цепей
S31(A) = (K6(4a) + 2Ni7) + (K6(4b) + 2As5) и
S31(B) = (K4 + 2 K3) + (K4 + 2 K3) (рис. 2).
Рис. 2. LaNi5As3-oP72. Слой S32 кристаллической структуры (две проекции)
Самосборка каркаса S33. Каркас формируется при связывании слоев S32 + S32 в направлении оси Y. Расстояние между двухслойными пакетами определяет длину вектора трансляции b = 3.913 Å (рис. 2).
Кристаллическая структура Ca12Fe32Pd4As24 -oP72
Для Ca12Fe32Pd4As24 -oP72 значения координационных чисел атомов Значения координационных чисел атомов Ca = 16 (1 атом) и 15 (2 атома), Fe = 12 (7 атомов), 13 (1 атом), Pd = 9 (1 атом), As = 9 (3 атома) (табл. 5).
Таблица 5. Ca12Fe32Pd4As24-oP72. Варианты кластерного представления кристаллической структуры. Указан центральный атом кластера (в первой скобке) и количество атомов в оболочке (во второй скобке)
Две структурные единицы |
Ca1(1)(1@16) Fe5(1)(1@12) |
Ca2(1)(1@15) Fe1(1)(1@12) |
Три структурные единицы |
Ca1(1)(1@16) Ca2(1)(1@15) As2(1)(1@9) |
Ca1(1)(1@16) Ca3(1)(1@15) As4(1)(1@9) |
Ca1(1)(1@16) Fe8(1)(1@13) As1(1)(1@9) |
Ca2(1)(1@15) Ca3(1)(1@15) As6(1)(1@9) |
Ca2(1)(1@15) Fe3(1)(1@12) As2(1)(1@9) |
Ca2(1)(1@15) Fe3(1)(1@12) Fe8(1)(1@13) |
Ca2(1)(1@15) Fe8(1)(1@13) As5(1)(1@9) |
Ca3(1)(1@15) Fe4(1)(1@12) As4(1)(1@9) |
Ca3(1)(1@15) Fe4(1)(1@12) Fe8(1)(1@13) |
Ca3(1)(1@15) Fe8(1)(1@13) As3(1)(1@9) |
Fe1(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) As3(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) As5(1)(1@9) |
Fe3(1)(1@12) Fe8(1)(1@13) As1(1)(1@9) |
Fe4(1)(1@12) Fe8(1)(1@13) As1(1)(1@9) |
Fe5(1)(1@12) As6(1)(1@9) Pd9(1)(1@9) |
Четыре структурные единицы |
As2(1)(1@9) As4(0)(1) As6(1)(1@9) Pd9(1)(1@9) |
As2(1)(1@9) As4(1)(1@9) As6(1)(1@9) Pd9(1)(1@9) |
Ca1(0)(1) Ca2(1)(1@15) Ca3(1)(1@15) Fe8(1)(1@13) |
Ca1(1)(1@16) As1(0)(1) As2(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Ca1(1)(1@16) As1(1)(1@9) As2(0)(1) As4(1)(1@9) |
Ca1(1)(1@16) As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As4(0)(1) |
Ca1(1)(1@16) As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Ca1(1)(1@16) Ca2(0)(1) Ca3(1)(1@15) Fe8(1)(1@13) |
Ca1(1)(1@16) Ca2(1)(1@15) Ca3(0)(1) Fe8(1)(1@13) |
Ca1(1)(1@16) Ca2(1)(1@15) Ca3(1)(1@15) Fe8(0)(1) |
Ca1(1)(1@16) Ca2(1)(1@15) Ca3(1)(1@15) Fe8(1)(1@13) |
Ca2(1)(1@15) As2(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ca2(1)(1@15) As2(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
Ca2(1)(1@15) As2(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
Ca2(1)(1@15) As2(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ca3(1)(1@15) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Ca3(1)(1@15) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As6(0)(1) |
Ca3(1)(1@15) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Fe1(0)(1) Fe4(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(0)(1) |
Fe1(0)(1) Fe4(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(1)(1@9) |
Fe1(1)(1@12) As1(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Fe1(1)(1@12) Fe4(0)(1) Fe5(1)(1@12) Pd9(1)(1@9) |
Fe1(1)(1@12) Fe4(1)(1@12) As1(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Fe1(1)(1@12) Fe4(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(0)(1) |
Fe1(1)(1@12) Fe4(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(1)(1@9) |
Fe2(0)(1) Fe3(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(0)(1) |
Fe2(0)(1) Fe3(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) As1(0)(1) As2(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) Fe3(0)(1) As2(1)(1@9) Pd9(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) Fe3(0)(1) Fe5(1)(1@12) Pd9(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) Fe3(1)(1@12) As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) Fe3(1)(1@12) As2(1)(1@9) Pd9(1)(1@9) |
Fe2(1)(1@12) Fe3(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(0)(1) |
Fe2(1)(1@12) Fe3(1)(1@12) Fe5(1)(1@12) Pd9(1)(1@9) |
Fe3(1)(1@12) As1(1)(1@9) As2(0)(1) As4(1)(1@9) |
Fe3(1)(1@12) As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Fe3(1)(1@12) As2(1)(1@9) As4(1)(1@9) Pd9(1)(1@9) |
Fe4(1)(1@12) As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As4(0)(1) |
Fe4(1)(1@12) As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As4(1)(1@9) |
Fe4(1)(1@12) As2(1)(1@9) As4(0)(1) Pd9(1)(1@9) |
Fe4(1)(1@12) As2(1)(1@9) As4(1)(1@9) Pd9(1)(1@9) |
Fe5(1)(1@12) As3(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Fe5(1)(1@12) As3(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
Fe5(1)(1@12) As3(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
Fe5(1)(1@12) As3(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Fe8(1)(1@13) As1(1)(1@9) As3(0)(1) As5(1)(1@9) |
Fe8(1)(1@13) As1(1)(1@9) As3(1)(1@9) As5(0)(1) |
Fe8(1)(1@13) As1(1)(1@9) As3(1)(1@9) As5(1)(1@9) |
Шесть структурных единицы |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(0)(1) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(0)(1) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(0)(1) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(0)(1) As4(0)(1) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(0)(1) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(0)(1) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(0)(1) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(0)(1) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(0)(1) As6(1)(1@9) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(0)(1) |
As1(1)(1@9) As2(1)(1@9) As3(1)(1@9) As4(1)(1@9) As5(1)(1@9) As6(1)(1@9) |
Для кристаллической структуры Ca12Fe32Pd4As24-oP72 установлены 93 варианта кластерного представления 3D атомной сетки с числом структурных единиц 2 (два варианта), 3 (15 варианта), 4 (49 варианта) и 6 (29) (табл. 5). Рассмотрен вариант самосборки кристаллической структуры Ca12Fe32Pd4As24-oP72 с участием образующих упаковки кластеров-прекурсоров:
димеров K6(4a) = 0@ 6 (Ca2Fe2As2) c симметрией –1(4a позиция),
тетрамеров K12(4b)=0@12(CaFeFe2As2)2 с симметрией –1(4b позиция),
тетраэдров K4 = 0@4(CaFe2As), колец K3 = 0@3(Fe2As),
атомов-спейсеров Pd9 и As3.
Первичные цепи S31. Образование первичной цепи S31 -A происходит при связывании димеров K6(4a) с тетрамерами K12 (4b) в направлении оси Z в плоскости XZ (рис. 3). Образование второй первичной цепи S31 -B происходит при связывании тетраэдров K4 c кольцами K3 в направлении оси Z в плоскости XZ с участием атомов-спейсеров Pd9 и As3 (рис. 3).
Рис. 3. Ca12Fe32Pd4As24-oP72. Слой S32 кристаллической структуры (две проекции)
Расстояние между центрами кластеров K6(4a) в направлении оси Z соответствует значению вектора трансляции c = 11.329 Å (рис. 3).
Микрослой S32. Образование микрослоя происходит при связывании сдвоенных первичных цепей S31 -A +S31 в направлении оси X в плоскости XZ (рис. 3). Удвоенное расстояние между осями цепей S31-A в направлении оси X соответствует значению вектора трансляции a = 26.362 Å.
Микрокаркас S33. Микрокаркас структуры формируется при связывании двух микрослоев в направлении оси X. Расстояние между двухслойными пакетами определяет длину вектора трансляции b = 3.869 Å.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Используя метод разложения 3D атомной сетке на кластерные структуры (пакет программ ToposPro) получены данные о комбинаторно возможных типах кластеров участвующих в образовании кристаллической структуры. Для интерметаллида LaNi5As3-oP72 рассмотрен вариант самосборки кристаллической структуры с участием образующих упаковки кластеров-прекурсоров: сдвоенных тетраэдров K6(4a) = 0@6(La2Ni2As2) и сдвоенных тетраэдров K6(4b) = (Ni2As2Ni2) с симметрией g= –1, тетраэдров K4 = 0@4 (LaNi2As), колец K3 = 0@3(Ni2As), атомов-спейсеров Ni7 и As5. Для интерметаллида Ca12Fe32Pd4As24-oP72 рассмотрен вариант самосборки кристаллической структуры с участием образующих упаковки кластеров-прекурсоров: димеров K6(4a) = 0@ 6 (Ca2Fe2As2) c симметрией g= –1(4a позиции), тетрамеров K12 (4b) = 0@ 12 (CaFeFe2As2)2 с симметрией g= –1(4b позиции), тетраэдров K4 = 0@4(CaFe2As), колец K3 = 0@3(Fe2As), атомов-спейсеров Pd9 и As3. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки La8Ni40As24–oP72 и Ca12Fe32Pd4As24 -oP72 из кластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
Моделирование самосборки кристаллических структур выполнено при поддержке Минобрнауки РФ в рамках выполнения работ по государственному заданию НИЦ «Курчатовский институт», кластерный анализ выполнен при поддержке Российского научного фонда (РНФ № 21–73–30019).
КОНФЛИКТ ИНТЕРЕСОВ
Авторы данной работы заявляют, что у них нет конфликта интересов.
About the authors
В. Я. Шевченко
Институт химии силикатов им. И. В. Гребенщикова РАН
Author for correspondence.
Email: shevchenko@isc.nw.ru
Russian Federation, Санкт-Петербург
Г. Д. Илюшин
НИЦ «Курчатовский институт»
Email: ilyushin@mail.ru
Russian Federation, Москва
References
- Inorganic crystal structure database (ICSD). Fachinformationszentrum Karlsruhe (FIZ), Germany and US National Institute of Standard and Technology (NIST), USA.
- Pearson’s Crystal Data-Crystal Structure Database for Inorganic Compounds (PCDIC) ASM International: Materials Park, OH.
- Blatov V. A., Shevchenko A. P., Proserpio D. M. Applied Topological Analysis of Crystal Structures with the Program Package ToposPro // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. N7. P. 3576–3585. https://topospro.com/
- Filinchuk Y. E., Yvon K., Emerich H. Tetrahedral D atom coordination of nickel and evidence for anti-isostructural phase transition in orthorhombic Ce2 Ni7 D4. //Inorganic Chemistry. 2007. V. 46. P. 2914–2920
- Tkachuk A. V., Mar A. In search of the elusive amalgam Sr Hg8: a mercury-rich intermetallic compoundwith augmented pentagonal prisms. // DALTON TRANS. 2010 V. 39 P. 7132–7135
- Babizhetskii V., Guerin R., Simon A. A new ternary arsenide La Ni5 As3: preparation and crystal structure. //Zeitschrift fuer Naturforschung, Teil B. 2004. V. 59. P. 1103–1108
- Weitz G., Hellner E. Ueber komplex zusammengesetzte sulfidische Erze VII. Zur Kristallstruktur des Cosalits, Pb2 Bi2 S5. // Zeitschrift fuer Kristallographie. 1960. V. 113. P. 385–402
- Stuerzer T., Hieke C., Loehnert C., Nitsche F., Stahl J., Maak C., Pobel R., Johrendt D. Framework structures of interconnected layers in calcium iron arsenides. // Inorganic Chemistry. 2014. V. 53. P. 6235–6240.
- He Hua, Tyson Chauntae, Bobev Svilen. Synthesis and crystal structures of the quaternary Zintl phases Rb Na8 Ga3 Pn6 (Pn = P, As) and Na10 Nb Ga As6. // Crystals. 2012. V. 2. P. 213–223
- Chaia N., Francois M., Mathieu S., Elkaim E., Rouillard F., Vilasi M. Oxidation and crystallographic features of the new prototype structure Ti4 NiSi4. // Intermetallics. 2013. V. 40. P. 1–9.
- Yarmolyuk Ya.P., Akselrud L. G., Fundamenskii V. S. Crystal structure of Hf6 Cr5 Si7. // Kristallografiya. 1985. V. 30. P. 587–590
- Lei Xiaowu, Hu Chunli, Mao Jiang Gao. Syntheses and crystal structures of RE3 Mn Sn(5-x) (RE = Tm, Lu) with 3D Mn-Sn framework. // Journal of Solid State Chemistry Year. 2010. V. 183. P. 2032–2039
- Gulo Fakhili, Samal Saroj L., Corbett John D. Substantial Cd- Cd bonding in Ca6 Pt Cd11: A condensed intermetallic phase built of pentagonal Cd7 and rectangular Cd4/2 Pt pyramids. // Inorganic Chemistry. 2013. V. 52. P. 10112–118.
- Reynolds P. C., Stojanovic M., Latturner S. Flux growth of a new cobalt – zinc – tin ternary phase Co(7+x) Zn(3-x) Sn8 and its relationship to Co Sn. // Journal of Solid State Chemistry. 2011. V. 184. P. 1875–1881
- Shevchenko V. Y., Medrish I. V., Ilyushin G. D., Blatov V. A. From clusters to crystals: Scale chemistry of intermetallics. // Structural Chemistry. 2019. V. 30. P. 2015–2027.
- Ilyushin G. D. Intermetallic Compounds NakMn (М = K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb): Geometrical and Topological Analysis, Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2020. V. 65. N4. P. 539–545.
- Ilyushin G. D. Intermetallic Compounds KnMm (М = Ag, Au, As, Sb, Bi, Ge, Sn, Pb): Geometrical and Topological Analysis, Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2020. V. 65. N7. P. 1095–1105.
- Ilyushin G. D. Intermetallic Compounds CsnMk (М = Na, K, Rb, Pt, Au, Hg, Te): Geometrical and Topological Analysis, Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2022 Vol. 67. Issue 7. P. 1075–1087.
Supplementary files
